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关键词： 网络药理学   分子对接   舒肝宁注射液   黄芩苷   作用机制  

摘要： 目的利用网络药理学和分子对接技术探讨舒肝宁注射液治疗非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)的潜在作用机制。方法2024年5月23日—28日通过检索多个公共数据库收集舒肝宁注射液活性成分及其作用靶点、NAFLD相关疾病靶点的信息,进行蛋白相互作用网络分析、通路富集分析等。构建舒肝宁注射液治疗NAFLD的“中药-成分-靶点-疾病”多层次网络,并对“核心靶点-活性成分”网络中的度中心性评分排名前5位的关键活性成分与核心作用靶点进行分子对接。结果最终获得舒肝宁注射液的140个活性成分及其486个潜在作用靶点,得到1058个NAFLD相关靶点和舒肝宁注射液治疗NAFLD的154个共有靶点。共有靶点蛋白相互作用网络的拓扑分析筛选出包括蛋白激酶B1、过氧化物酶体增殖物激活受体α、过氧化物酶体增殖物激活受体γ、甾醇调节元件结合蛋白1、白细胞介素-6和基质金属蛋白酶-9等的16个关键作用靶点蛋白。其基因本体富集分析显示,共涉及179个生物学过程、13个细胞组分和48个分子功能;京都基因与基因组数据库富集分析显示,共涉及癌症、脂质与动脉粥样硬化、NAFLD和胰岛素抵抗等99条通路。构建的“中药-成分-靶点-疾病”多层次网络由102个节点和208条边组成。分子对接结果显示,黄芩苷、刺槐黄素、谷甾醇、β-谷甾醇和灵芝酸A这5个关键活性成分与核心作用靶点蛋白的亲和力均较高。结论舒肝宁注射液可能通过黄芩苷、刺槐黄素、谷甾醇、β-谷甾醇和灵芝酸A等成分作用于蛋白激酶B1、过氧化物酶体增殖物激活受体α、过氧化物酶体增殖物激活受体γ、甾醇调节元件结合蛋白1、白细胞介素-6和基质金属蛋白酶-9等关键靶点蛋白,参与调控脂质与动脉粥样硬化、NAFLD和胰岛素抵抗等通路,从而对NAFLD发挥治疗作用。

关键词： 藤黄酸   药理作用   分子机制   毒理学  

摘要： 藤黄酸为来源于藤黄中的一种笼状呫吨酮类化合物,被证明是藤黄发挥药理作用的重要物质基础,近年来凭借其广泛且显著的药理活性持续受到关注。现代药理学研究表明,藤黄酸具有抗炎抗氧化、抗肿瘤、改善视网膜病变、脏器保护、抗微生物感染、骨保护与缓解神经病理疼痛等多种治疗活性。然而,目前尚缺乏对藤黄酸药理作用及机制研究的系统总结与整合,而该部分内容对于促进其临床转化具有重要的意义。此外,目前的研究发现藤黄酸在使用过程中具有潜在的安全性风险如器官毒性、发育毒性以及溶血性等。因此,该文对藤黄酸的药理学作用和机制以及毒理学相关信息进行系统梳理和总结,旨在为促进藤黄酸的临床转化提供参考和数据支撑。

关键词： 荜铃胃痛颗粒   功能性消化不良   网络药理学   分子对接   槲皮素   黄柏酮   黄藤素   β-谷甾醇  

摘要： 目的采用网络药理学和分子对接探究荜铃胃痛颗粒治疗功能性消化不良的作用靶点及分子机制。方法通过TCMSP、SymMap、SwissTargetPrediction、PharmMapper、UniProt、GeneCards数据库收集荜铃胃痛颗粒、功能性消化不良的有效成分、靶点和疾病相关基因。采用Cytoscape 3.9.1软件构建“中药-成分-交集靶点”网络图,并对其网络中的核心化合物和靶点进行了筛选。利用DAVID数据库对交集靶点进行了基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组的百科全书(KEGG)通路分析,并通过分子对接验证了关键靶点。结果共获得荜铃胃痛颗粒的有效化学成分131种,通过287个靶点对功能性消化不良疾病产生治疗作用,其中非受体酪氨酸激酶(SRC)、β-连环蛋白(CTNNB1)、热休克蛋白90α型1(HSP90AA1)、蛋白激酶B1(Akt1)、信号转导与转录激活子3(STAT3)为核心靶点。分子对接结果表明,这5个核心靶点与荜铃胃痛颗粒中的槲皮素、黄柏酮、黄藤素、β-谷甾醇等结合情况良好。结论荜铃胃痛颗粒可能通过抑制磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/Akt信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路的激活,加强胃肠道蠕动,浸润胃黏膜等,从而达到治疗功能性消化不良的作用,为后续研究提供参考依据。

关键词： 去甲二氢愈创木酸   氧化应激   抗肿瘤   抗血管生成   抗纤维化  

摘要： 去甲二氢愈创木酸(NDGA)是从植物常青灌木分叉拉瑞阿中提取的一种化合物。NDGA因其具有抗氧化性而被用于食品加工业。NDGA还被证实具有免疫调节、抗菌、抗病毒、抗肿瘤、抗血管生成、抗生殖和抗纤维化等药理作用,提示NDGA在疾病治疗中具有重要潜在价值。关于NDGA在疾病治疗中的作用及机制尚无系统总结。该文对NDGA药理作用及机制的研究进展作一综述。

关键词： 银屑病   逆向网络药理学   分子对接  

摘要： 目的应用逆向网络药理学及分子对接技术研究银屑病发病机制。方法从genecards和NCBI数据库获取银屑病相关基因,取交集基因,构建PPI网络,确定核心差异基因,进行GO和KEGG富集分析,构建靶点信号通路网络图。利用TCMSP和symmap平台反向采集潜在治疗中药及相关活性成分,构建预测药物-活性成分网络图,筛选核心靶点和核心成分进行分子对接验证。结果获262个银屑病基因,GO、KEGG分析得多条生物条目及通路。结合PPI网络,确定7个关键基因。逆向收集20种中药和264种成分,构建网络图。分子对接验证7个基因和前5种成分。结论本研究通过分子对接验证白花蛇舌草、虎杖等中药及成分可调控IL1B、CXCL8等靶点,为中药组分治疗银屑病提供参考。

关键词： 黄精   阿尔兹海默症   网络药理学   作用机制   分子对接  

摘要： 为了从多成分、多靶点、多通路的角度探究黄精治疗阿尔兹海默症的潜在作用机制,从TCMSP数据库检索黄精的活性成分以及对应的作用靶点,并且在GeneCards数据库中以“Alzheimer′s disease”为关键词检索阿尔兹海默症的相关靶点.将检索到的2类靶点相互映射得到交集靶点,通过STRING平台构建交集靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,依据degree值选取PPI网络中的核心靶点并在Cytoscape3.8中进行可视化分析.借助David 6.8数据库,对交集靶点进行GO与KEGG富集分析.最后使用Schrodinger软件对核心靶点与关键活性成分进行分子对接验证.结果显示:①从黄精中筛选出了黄芩素、β-谷甾醇和甘草素3个关键活性成分,从GeneCards数据库中筛选出了阿尔兹海默症的3个核心靶点,即AKT1、CASP3和TP53;②GO与KEGG富集分析发现,靶点多集中于癌症通路、细胞凋亡以及PI3K-Akt信号通路;③依据分子对接部分的对接分数判断出黄芩素和甘草素与AKT1和TP53的对接效果更好.以上结果表明,黄精中的有效成分黄芩素和甘草素更有可能靶向AKT1和TP53,并通过调节细胞凋亡以及PI3K-Akt等信号通路达到抗阿尔兹海默症的效果.

关键词： 乳腺增生   肝郁   调肝理气   疏通乳络   中医药治疗   周仲瑛   临床经验   数据挖掘   网络药理学  

摘要： 目的总结国医大师周仲瑛治疗乳腺增生的用药规律,预测核心中药组合治疗乳腺增生的潜在作用机制。方法整理周仲瑛教授诊治乳腺增生的门诊电子病历,对纳入中药的使用频次、性味归经进行统计,并对其进行关联规则分析和系统聚类分析,总结用药规律及挖掘核心中药组合。利用网络药理学和分子对接技术探究核心中药组合治疗乳腺增生的潜在作用机制。结果共纳入145例患者、386首处方和270味中药。频次统计分析发现周仲瑛教授治疗乳腺增生用药性味以寒、苦为主,归经以肝经为主;关联规则和系统聚类分析获得核心中药组合为香附-柴胡-夏枯草。用网络药理学方法获得核心中药组合的活性成分37个,治疗乳腺增生的潜在作用靶点122个。通过蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)分析确定了10个核心靶点,包括信号转导及转录激活因子3(STAT3)、磷酸肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)、雌激素受体1(ESR1)等。京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析发现,核心中药组合的活性成分主要通过PI3K-Akt、Ras、EGFR等信号通路作用于乳腺增生,并与癌症中的中心碳代谢和蛋白聚糖等途径密切相关。分子对接结果显示,ESR1、SRC、AKT1与β-谷甾醇,ESR1与木犀草素具有良好的结合能力及稳定性。结论周仲瑛教授辨治乳腺增生时抓住“肝郁”的本质,治法以调理肝气,疏通乳络为主,兼以清火、化痰、行瘀。核心中药组合香附-柴胡-夏枯草的主要成分以木犀草素、β-谷甾醇为代表,作用于AKT1、ESR1等靶点,通过PI3K-Akt、Ras、EGFR以及癌症相关信号通路等途径发挥治疗乳腺增生的作用。

关键词： 原花青素A2   前列腺癌   人前列腺癌细胞系   迁移增殖   PI3K/AKT信号通路  

摘要： 目的:基于网络药理学和体外细胞实验探讨原花青素A2(Proanthocyanidin A2,PCA2)对人前列腺癌细胞系(PC-3细胞)增殖和迁移能力的作用及其抗癌潜在的分子机制。方法:采用CCK8实验检测不同浓度PCA2对PC-3细胞的细胞增殖的影响,克隆形成实验和划痕实验检测PCA2对PC-3细胞增殖与迁移的影响。通过Similarity Ensemble Approach等数据库获取PCA2和前列腺癌的预测靶点,应用String构建蛋白相互作用网络,根据OmicShare Tools数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析以预测其作用机制。结果与结论:研究发现PCA2能显著抑制PC-3细胞的增殖和迁移,且抑制作用与PCA2浓度呈正相关。并使用网络药理学方法筛选出PCA2与前列腺癌疾病的交集靶点共95个,其中EGFR、ALB、HSP90AA1和MMP9等是PCA2抗前列腺癌的核心靶点。GO和KEGG富集分析发现其相关的主要机制与磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路有关。

关键词： 桑叶   指纹图谱   HPLC   主成分分析   网络药理学   分子对接   功能成分  

摘要： 目的:建立桑叶指纹图谱,并通过联合网络药理学及分子对接技术,预测桑叶中的潜在功能成分。方法:采用高效液相色谱(HPLC)技术建立桑叶指纹图谱,并进行相似度评价和主成分分析。进一步,结合网络药理学构建“成分-靶点-通路”网络,并通过分子对接进行虚拟验证。结果:通过HPLC技术建立了13批桑叶指纹图谱,并在13个共有峰中指认出1号峰为新绿原酸、3号峰绿原酸、4号峰隐绿原酸、6号峰芦丁、7号峰异槲皮苷、9号峰异绿原酸B、10号峰紫云英苷、11号峰异绿原酸A、12号峰异绿原酸C。主成分分析发现,桑叶指纹图谱中的13个共有峰均可作为特征化学成分参与质量控制过程。网络药理学分析预测得到异绿原酸A、异绿原酸B、异绿原酸C、芦丁、异槲皮苷、紫云英苷可作为桑叶的潜在功能成分,作用于肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、胱天蛋白酶1/3/8(CASP1/3/8)等7个潜在靶点,并通过调节脂质与动脉粥样硬化、癌症和血清素能突触等信号通路发挥抗衰老、保护神经和心血管的效用。分子对接的结果进一步验证了这些核心成分与潜在靶点间具有良好的结合性能。结论:通过HPLC指纹图谱及网络药理学预测了桑叶的潜在功能成分及作用机制,为桑叶的质量控制与功效应用开发提供了科学依据。