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关键词： 网络药理学   三物黄芩汤   结直肠癌   靶点   作用机制  

摘要： 目的:运用网络药理学方法探讨三物黄芩汤治疗结直肠癌的物质基础和作用机制。方法:利用TCMSP、TCMID、TCMMesh数据库筛选三物黄芩汤的组成中药的有效化合物及对应靶蛋白。利用Cytoscape3.7.2构建三物黄芩汤有效化合物-靶蛋白网络并进行网络拓扑学分析。借助STRING在线数据库进行蛋白互作(PPI)网络构建并进行分析。结果:共获得81个候选化合物,包含了槲皮黄酮、木犀草素、汉黄芩素、黄芩黄素、芒柄花黄素、β-谷固醇类、豆甾醇等有效组分;181个靶点,关键靶点是AKT1、TP53、IL6、VEGFA、JUN、CASP3、EGFR等;共收集生物过程162个,此过程涵盖了多个方面,例如细胞信号转导、促进细胞增殖与抵抗凋亡的机制、炎症反应的发生、免疫系统的响应、蛋白质分解作用、新血管的生成,以及转录和翻译等生物学过程。结论:三物黄芩汤中的槲皮黄酮、木犀草素、汉黄芩素、黄芩黄素等有效组分与靶点(TP53、VEGFA、CASP3、EGFR、JUN、IL6、AKT1等等)产生作用,对直肠癌细胞增殖产生抑制作用,加速其凋亡,对肿瘤血管进行调节,促进免疫反应,对肿瘤相关炎症(CRI)等生物过程产生抑制作用,改变肿瘤微环境,发挥其抗肿瘤价值,抑制肿瘤相关性炎症(CRI)等生物过程,影响肿瘤微环境,从而发挥抗肿瘤作用,体现了多成分、多靶点的特点。

关键词： 中药   非药用部位   《中药大辞典》   《中华人民共和国药典》   化学成分   药理作用   临床应用   现代研究  

摘要： 目的:统计并分析2020年版《中华人民共和国药典》中药非药用部位的现代研究和综合应用情况,为非药用部位的进一步研究和开发利用提供数据支持。方法:根据《中华人民共和国药典》中药及其药用部位记载,从《中药大辞典》筛选出非药用部位,统计中药非药用部位基原、化学成分、药理作用、临床应用,并进行频次分析。结果:196味中药具有非药用部位,其科属以菊科、蔷薇科、豆科植物多见,非药用部位以根、叶、花多见,化学成分以黄酮类、酚类、挥发油多见,药理作用以抗氧化、抗肿瘤、抗炎频次最高,临床多用于消化内科、皮肤科、神经内科疾病治疗。结论:我国非药用资源丰富,非药用部位中药应用潜力及开发价值巨大,但其存在现代研究不足,且多数非药用部位的开发利用尚未形成产业模式等问题。应加大非药用部位中药的现代研究及综合应用,建立非药用部位中药质量标准,完善非药用部位中药产业链,促进非药用部位中药高质量发展。

关键词： 首乌藤   药物性肝损   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学及分子对接技术探究首乌藤的潜在肝毒性机制。方法:根据文献数据,利用TCMSP、TCMID、HIT等数据库检索首乌藤主要活性成分以及相关靶点、药物性肝损的疾病靶点。对首乌藤靶点及疾病靶点进行交集分析,得核心交集靶点。利用核心交集靶点信息进行蛋白互作网络分析、KEGG及GO富集分析。采用AutoDock 1.5.7版进行分子对接,并应用PyMOL软件对对接结果进行可视化示例;最后利用体外试验、毒理数据库以及体内试验对筛选出的结果进行初步验证。结果:网络药理学确定首乌藤可以结合BCL2和EGFR等靶点通过癌症信号通路、PI3K-AKT等信号通路导致药物性肝损,大黄酚、大黄素和大黄素甲醚苷为重要活性成分。分子对接结果显示活性成分与核心靶点之间的结合力较稳定。体外验证试验结果表明大黄素与大黄素甲醚苷具有细胞毒性,体内验证试验表明大黄素存在一定的潜在肝毒性,与网药筛选结果一致。结论:应用网络药理学及分子对接技术对首乌藤致肝毒成分、机制、靶点、通路进行了初步探索,为进一步对首乌藤的临床应用研究和效应机制提供数据支持。

关键词： 蚕茸柱天胶囊   早泄   网络药理学   分子对接模拟  

摘要： 目的运用网络药理学、分子对接技术将蚕茸柱天胶囊对早泄发挥的药效作用特点进行研究。方法在TCMSP、BATMAN-TCM数据库检索蚕茸柱天胶囊活性成分,在GeneCards、Disgenet数据库检索早泄靶点,绘制活性成分与早泄的交集靶点Vene图,在Cytoscape构建活性成分交集靶点互作网络。在STRING构建交集靶点的PPI互作网络并用Metascape对靶点进行GO功能富集、京都基因与KEGG富集分析。在CB-DOCK2进行分子对接。结果收集到178种活性成分,1597个作用靶点,1296个早泄靶点,440个交集靶点。蚕茸柱天胶囊可能通过蚕蛾激素、淫羊藿苷、山茱萸新苷、金丝桃苷等成分,作用于TP53、AKT1、STAT3等潜在靶点发挥治疗作用;分子对接显示活性成分与早泄潜在靶点结合良好,说明网络药理学结果可靠。结论蚕茸柱天胶囊的多种活性成分可通过多途径、多靶点对早泄发挥药效作用。

关键词： 清肺排毒汤   急性呼吸窘迫综合征   网络药理学   肺动脉血气   丝裂原活化蛋白激酶信号通路  

摘要： 目的:基于网络药理学的方法研究清肺排毒汤对油酸(OA)+脂多糖(LPS)诱导的急性呼吸窘迫综合征(Acute respiratory distress syndrome,ARDS)的作用机制,并通过动物实验进行验证。方法:通过TCMSP、TCMID数据库筛选出清肺排毒汤活性成分及靶点;利用GEO和CTD数据库筛选出ARDS相关潜在靶点;根据韦恩图获取清肺排毒汤与ARDS的交集靶点;利用String数据库构建交集靶点的蛋白互作网络(PPI);通过David数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)分析和基因组百科全书通路(KEGG)富集分析;采用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点-通路网络图,选择一条关键通路进行动物实验验证。结果:筛选出清肺排毒汤治疗ARDS的化学成分442个,关键蛋白105个。GO分析得到2790个条目,发现潜在靶点可以作用于活性氧代谢过程的调节、细胞对化学的应激反应、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性的调节等生物过程;KEGG通路分析共富集到182条通路,其中包括丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、PI3K-AKT信号通路、Kaposi肉瘤相关疱疹病毒感染、脂质和动脉粥样硬化等。动物实验结果显示,清肺排毒汤对ARDS大鼠模型动脉血气指标有明显改善,肺系数、肺通透指数、肺病理评分显著降低,ARDS大鼠肺组织中p-ERK及p-P38MAPK蛋白的表达下调(P<0.05或P<0.01)。结论:清肺排毒汤对ARDS大鼠模型具有很好的保护作用,可通过抑制MAPK信号通路活化缓解大鼠ARDS。

关键词： 厚朴三物汤   腹痛   网络药理学   分子对接   有效成分  

摘要： 为研究厚朴三物汤治疗腹痛的作用机制,通过网络药理学和分子对接技术探究了厚朴三物汤的活性成分、作用靶点及信号通路机制。首先使用相关软件筛选厚朴三物汤的活性成分及腹痛相关靶点,接着利用绘图工具构建“药物成分-靶点”网络图及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,然后使用用于注释、可视化和集成发现的数据库(database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)进行生物信息学富集分析,最后进行蛋白分子对接。结果表明,厚朴三物汤治疗腹痛的核心蛋白为AKT1、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、ESR1、BCL2等;有效活性成分为3,4,5,7-四甲氧基黄酮、三甲氧基黄酮、木犀草素、香蜂草苷、异橙黄酮和去氢二松柏醇等;涉及的信号通路包括癌症相关途径、EGFR耐药性、HIF-1信号通路等。分子对接结果揭示了活性成分与靶点之间的高效结合潜力,厚朴三物汤可通过多成分、多靶点、多途径发挥治疗腹痛的作用。该研究为厚朴三物汤的临床应用提供了依据。

关键词： 白芍总苷   药理作用   临床应用   慢性病   自身免疫性疾病  

摘要： 白芍总苷(TGP)是芍药中提取的有效部位,具有抗炎、免疫调节、抗氧化、循环系统调整、保肝和抗肺损伤等多重药理作用,在多种慢性病和自身免疫性疾病的治疗中显示出显著效果。本文综述了近年来TGP的药理作用及在糖尿病肾病、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、强直性脊柱炎和原发性干燥综合征等疾病治疗中的作用机制和临床应用研究进展。

关键词： 当归四逆汤   稳定型心绞痛   网络药理学   分子对接   张仲景   《伤寒论》  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接研究当归四逆汤治疗稳定型心绞痛(stable angina pectoris,SAP)的作用机制。方法:使用SyMmap数据库和中药系统药理学数据库与分析平台检索当归四逆汤组方中药甘草、大枣、当归、桂枝、细辛、通草和白芍的化学成分及相关靶点;在GeneCards数据库获取SAP相关疾病靶点;取SAP疾病相关靶点和当归四逆汤组方中药活性成分相关靶点的交集,即为当归四逆汤治疗SAP的潜在靶点,并绘制韦恩图。利用STRING 11.5数据库对潜在靶点进行蛋白质相互作用(protein protein interaction,PPI)网络分析并筛选核心靶点。采用Cytoscape 3.10.1构建“中药-活性成分-潜在靶点”网络,并筛选关键成分。采用Matascape对潜在靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。利用PyMOL4.6.0对关键靶点和成分进行分子对接。结果:从当归四逆汤组方中药共筛选得到155种化学成分及1728个相关靶点;在GeneCards数据库获得SAP相关靶点1089个;取交集得到当归四逆汤治疗SAP的潜在靶点121个。PPI网络分析发现信号传导及转录激活蛋白3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、B细胞淋巴因子2(B cell lymphoma 2,BCL2)、蛋白激酶B1(protein kinase B1,PKB1,又称AKT1)等为核心靶点;“中药-活性成分-潜在靶点”网络分析筛选出槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等为关键成分。GO分析得到4688个生物过程,404个细胞组分和715个分子功能;KEGG分析得到磷脂酰肌醇3-激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)-AKT、缺氧诱导因子1(hypoxia-inducible factor 1,HIF1)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)等200条信号通路。分子对接显示活性成分与靶点对接良好。结论:当归四逆汤中的多个化学成分通过调控多个相关靶点参与多条信号通路发挥治疗SAP的作用。

关键词： 原发性痛经   中药   代谢组学   网络药理学   药效物质基础  

摘要： 原发性痛经是一种普遍影响育龄女性的妇科疾病,具有较高的患病率。尽管非甾体抗炎药和激素是常用的一线用药,但不良反应大。中药以其良好的疗效和低不良反应,在临床上获得广泛应用。然而,中药复杂的“多成分-多靶点-多途径”作用特点导致其作用机制尚不明确。代谢组学提供了一种全局分析生物体内源性代谢物变化的方法,而网络药理学通过系统生物学和网络分析手段,揭露了药物的多靶点作用机制。作为新兴研究领域,代谢组学和网络药理学符合中医药的“整体观”和“系统论”,成为探究中药作用机制的有力工具,在揭示中药治疗原发性痛经作用机制方面发挥了重要作用。通过对代谢组学和网络药理学在阐明中药治疗原发性痛经作用机制进行综述,为中药的临床治疗提供更系统的科学依据。

关键词： 肾间质纤维化   冬肾丸   作用机制   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的:基于网络药理学方法和分子对接技术探讨冬肾丸治疗肾间质纤维化的作用机制。方法:通过TCMSP、HERB获取冬肾丸的药物活性成分,利用SwissTargetPrediction预测活性成分的作用靶点,检索GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获取疾病相关靶点,利用Venny 2.0得到药物与疾病交集靶点,采用STRING数据库构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.10.0筛选核心靶点,借助DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:获得冬肾丸药物活性成分250种,作用靶点676个,肾间质纤维化相关靶点2069个,交集靶点240个,核心靶点43个。主要活性成有黄芩苷、4',5-二羟基黄酮、木犀草定、槲皮素、白玉兰素B、海风藤酮等,核心靶点包括蛋白激酶B1(AKT1)、表皮生长因子受体(EGFR)、转录激活蛋白3(STAT3)、肿瘤坏死因子(TNF)、胱天蛋白酶3(CASP3)、氨基末端激酶(JUN)、B细胞淋巴瘤2(BCL2)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)等。GO功能主要涉及细胞凋亡、炎症、氧化磷酸化等,KEGG通路主要涉及核因子κB(NF-κB)、钙通道、环磷酸鸟苷-蛋白激酶G(cGMP-PKG)等。结论:冬肾丸可能通过AKT1、EGFR、STAT3等靶点来调控NF-κB等信号通路而发挥抗炎、抗氧化、调节细胞凋亡、抑制EMT、脂质代谢等药理作用,从而改善肾纤维化。