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关键词： 金芪清疏颗粒   社区获得性肺炎   网络药理学   炎症反应   氧化应激  

摘要： 目的采用网络药理学方法及分子对接技术探究金芪清疏颗粒(JQQSG)治疗社区获得性肺炎(CAP)的可能作用机制。方法利用TCMSP数据库和Swiss Target Prediction数据库获取和筛选JQQSG的活性成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库检索CAP预测靶点,两者靶点映射后,导入STRING数据库构建PPI网络筛选关键靶点,利用DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析,并通过AutoDock Tools软件进行分子对接。结果筛选后得到JQQSG 209个活性成分,1041个作用靶点;与CAP共同作用靶点312个,经PPI网络筛选后,得到64个核心靶点。GO富集分析共571个生物过程、68个细胞组分、199个分子功能,KEGG通路富集分析共165条通路,主要涉及蛋白作用,细胞凋亡,MAPK信号通路等。分子对接提示核心靶点与核心成分均具有较好结合能力。结论JQQSG治疗CAP的作用机制可能与其调控Akt、MAPK信号通路、改善氧化应激等作用途径,发挥抗炎、抗氧化作用有关,为后续进一步深入研究其具体作用机制奠定基础。

关键词： 补阳还五汤   多发性硬化症   网络药理学   Janus激酶/信号转导子和转录激活子通路   芒柄花黄素  

摘要： 目的:基于网络药理学、分子对接技术和动物实验,探讨补阳还五汤治疗多发性硬化症(MS)的作用机制及其单体成分治疗效果的验证。方法:通过TCMSP、HERB数据库收集补阳还五汤的药物活性成分,通过口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18、血脑屏障透过性(BBB)≥-0.3为标准筛选有效药物活性成分;使用SwissADME和SwissTargetPrediction平台预测有效药物活性成分作用靶点,运用UniProt校正作用靶点基因名;利用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获取MS的相关疾病靶点。取有效药物活性成分作用靶点和MS的相关疾病靶点做交集靶点韦恩图;使用Cytoscape3.9.1软件构建“药物-活性成分-疾病靶点基因网络图”;通过Metascape数据库对交集靶点进行GO和KEGG通路富集分析,借助微生信平台将其可视化,分析得到JAK-STAT通路为补阳还五汤药物成分的关键作用通路,做“药物关键作用靶点-靶点通路图”,采用STRING11.5在线数据库和Cytoscape3.9.1软件构建蛋白质互作网络(PPI);结合PPI网络结果再用分子对接技术进行测试,发现小分子药物活性成分芒柄花黄素与受体蛋白能自发结合。使用双环己酮草酰二腙(Cuprizone,CPZ)诱导的髓鞘脱失模型验证活性成分芒柄花黄素是否抑制髓鞘脱失。将30只C57BL/6雄性小鼠随机分为正常对照组、模型对照组和芒柄花黄素30 mg/kg组,每组10只。正常对照组小鼠给予正常饲料,造模组喂养含0.2%CPZ饲料6 w,第5 w开始,给药组腹腔注射芒柄花黄素治疗2 w。采用高架十字迷宫试验、旷场试验评价其对小鼠行为学的影响;采用黑金染色、免疫荧光染色检测小鼠胼胝体区域髓鞘脱失情况和MBP、IBA1、GFAP蛋白表达的变化;采用ELISA法检测脑组织液TNF-α、IL-1β、IL-6、IL-10含量;微量酶标法检测LPO、GSH的含量。结果:共获得162个补阳还五汤治疗MS的关键靶点。KEGG富集得到三条和MS有关的通路为Janus激酶(JAK)/信号转导子和转录激活子(STAT)信号通路、核因子κB(NF-κB)信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARs)信号通路,可能的主要作用通路为JAK-STAT,主要作用靶点为STAT3、STAT1、JAK2;使用分子对接技术最终筛选得到有效小分子药物单体为芒柄花黄素。动物实验证明芒柄花黄素改善CPZ模型狂躁和焦虑的行为学表现、抑制髓鞘脱失,降低CPZ模型脑组织TNF-α、IL-1β、IL-6、LPO含量,升高IL-10、GSH含量,促进小胶质细胞(MG)活化,抑制星形胶质细胞(AST)的活化。结论:本文通过网络药理学对补阳还五汤作用机制进行分析,通过分子对接预测有效单体芒柄花黄素,并首次用动物实验证明芒柄花黄素可显著改善CPZ模型的行为学、抑制髓鞘脱失,其治疗机制可能与其抑制CPZ模型的炎症反应和氧化应激、调控MG和AST的活化有关。

关键词： 亚麻木酚素   轮状病毒   氧化应激   网络药理学   分子对接   磷酸肌醇3-激酶/蛋白激酶B/叉头框蛋白O1信号通路  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接和体外细胞实验探讨亚麻木酚素抗轮状病毒的作用机制。方法利用TCMSP、SwissTarget Prediction、PharmMapper数据库收集亚麻木酚素的作用靶点,利用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获取轮状病毒的作用靶点。构建韦恩图并获得交集靶点,并利用Metascape数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用Pymol、AutoDock软件进行分子对接验证。采用轮状病毒感染MA104细胞模型研究亚麻木酚素的抗轮状病毒吸附、直接抑制轮状病毒和抗轮状病毒生物合成作用。测定细胞丙二醛(MDA)、谷胱甘肽(GSH)含量表达,研究亚麻木酚素对轮状病毒引起的氧化应激的影响。利用RT-qPCR和Western blotting探讨亚麻木酚素对轮状病毒感染的磷酸肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)/叉头框蛋白O1(FoxO1)信号通路的影响。结果通过网络药理学分析,共获取369个亚麻木酚素靶点,445个轮状病毒靶点,38个交集靶点,KEGG富集分析获得144条富集通路。分子对接表明靶蛋白受体与亚麻木酚素配体可以稳定结合。实验表明亚麻木酚素具有抗轮状病毒生物合成作用,无抗轮状病毒吸附和直接抑制轮状病毒作用。与模型组相比,亚麻木酚素药物2.0、4.0μmol/L组MDA显著含量下降、GSH含量升高(P<0.05、0.01)。RT-qPCR和Western blotting结果显示,亚麻木酚素可以上调PI3K/Akt/FoxO1信号通路中相关基因和蛋白的表达,降低VP6蛋白表达(P<0.05、0.01、0.001)。结论亚麻木酚素可以通过PI3K/Akt/FoxO1信号通路抑制轮状病毒诱导的氧化应激,从而发挥抗轮状病毒作用。

关键词： 菊花-槐花   网络药理学   分子对接   RAW264.7   抗炎  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接和细胞实验探讨菊花-槐花的抗炎效果和作用机制。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取菊花-槐花的活性成分以及相关靶点,利用GeneCards、Drugbank、OMIM、TTD数据库获取乙型肝炎(HBV)相关靶点,Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点网络,STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点,DAVID平台对靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,Auto Dock Vina进行分子对接,预测核心成分与关键靶点的结合能力。利用脂多糖(LPS)刺激RAW264.7细胞产生急性炎症反应构建体外炎症研究模型,设置对照组(CK)、模型组(LPS)、菊花水提物组(J)、槐花水提物组(H)、菊花-槐花水提物组(J+H),采用CCK-8细胞活力检测以及Griess法、酶联免疫吸附法(ELISA)对NO、TNF-α、ILs等进行测定,以此验证菊花-槐花的抗炎效果和作用机制。结果PPI拓扑参数分析得到AKT1、TP53、IL-6、TNF-α、CASP3前5个关键靶点,“药物成分-靶点-通路-疾病”网络拓扑参数分析筛选出前5个核心成分是槲皮素、山萘酚、β-甾醇、异鼠李素与木犀草素,分子对接结果显示5个核心成分与IL-6、TNF-α关键靶点具有较高的亲和力。CCK-8检测显示菊花-槐花水提物可明显促进RAW264.7细胞的增殖,炎症因子检测显示菊花-槐花水提物能显著降低NO、TNF-α、IL-6、IL-1β的水平。结论菊花-槐花共用具有明显的抗炎效果,其机制具有多成分-多靶点-多途径的特点,可能与作用于TNF-α、IL-6靶点从而抑制细胞炎症因子的发生有关。

关键词： 黄连   多囊卵巢综合征   2型糖尿病   网络药理学  

摘要： 目的通过网络药理学探究黄连治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)与2型糖尿病(type 2 diabetes,T2DM)共同分子机制。方法使用中药系统药理学数据库及分析平台TCMSP获取黄连有效成分和作用靶点蛋白信息。利用Uniprot数据库将作用靶点名称转换成通用基因名。通过GeneCards数据库筛选PCOS和T2DM相关基因,并与黄连作用靶点对应基因名进行匹配。采用Cytoscape 3.8.0软件构建黄连-成分-靶点网络,利用功能注释生物信息学分析平台(DAVID)数据库进行相关基因富集分析。结果共筛选出黄连14种有效活性成分。预测黄连对PCOS和T2DM均有治疗作用的靶点基因共127个,分别在甲状腺激素信号通路,炎症性肠病,胰岛素信号通路,脂肪细胞因子信号通路等KEGG通路显著富集。其中AKT1、IL-6、TP53、VEGFA、TNF为黄连有效成分作用前5的重要靶点基因。结论PCOS和T2DM有共同的致病基因。黄连可以通过多基因、多途径治疗PCOS合并T2DM。

关键词： 白附子   独角莲   胰腺癌   网络药理学  

摘要： 目的采用网络药理学方法研究白附子抗胰腺癌的潜在作用机制,并通过分子对接技术进行验证。方法2022年9―12月利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和本草组鉴数据库(HERB)收集白附子的有效成分和靶点,在人类基因信息数据库(GeneCards)中获取胰腺癌相关靶点信息后将药物靶点和疾病靶点进行比对分析获得交集靶点。将交集靶点导入STRING数据库进行靶点之间的蛋白相互作用(PPI)分析,随后采用Metascape数据库对靶点蛋白进行聚类后再进行基因本体(GO)与京都基因和基因组百科全书(KEEG)富集分析,并利用Cytoscape 3.7.2软件构建白附子治疗胰腺癌有效活性成分-靶点-通路网络的相互作用关系。最后用Autodock Vina结合PyMOL对白附子抗胰腺的关键靶点和主要活性成分进行对接验证。结果通过筛选获得白附子中17个有效活性成分及12个抗胰腺癌的潜在靶点。白附子中可能发挥抗胰腺癌的主要成分乌索酸,β-谷甾醇,谷甾醇和齐墩果酸作用于核心靶点JUN、TNF、INS、CASP3和PTGS2,并可能通过调节癌症通路和癌症中的蛋白聚糖等代谢通路发挥抗胰腺癌的作用。分子对接数据表明所筛选的核心靶点与对应的有效活性成分均有较好的结合能力。结论白附子通过多成分和多靶点发挥抗胰腺癌的作用。这为进一步开发白附子作为治疗胰腺癌的药物提供了理论依据。

关键词： 益肾清利活血方   慢性肾脏病   肾纤维化   UHPLC-Q-TOF-MS   网络药理学  

摘要： 目的采用UHPLC-Q-TOF-MS结合网络药理学探讨益肾清利活血方延缓慢性肾病大鼠肾纤维化的潜在作用机制。方法运用UHPLC-Q-TOF-MS对益肾清利活血方含药血清进行定性分析。采用SwissTargetPrediction、OMIM及GeneCards等数据库获取入血成分及疾病相关靶点,取交集后构建蛋白互作(PPI)网络,筛选关键靶点并进行GO功能和KEGG通路富集分析。采用Cytoscape软件构建“药物-入血成分-关键靶点-通路”网络,预测益肾清利活血方抗纤维化的作用靶点与信号通路,并构建肾纤维化模型对益肾清利活血方抗纤维化靶点和通路蛋白进行验证。结果共鉴定益肾清利活血方入血成分56个。化合物-疾病共有靶点97个,PPI网络分析筛选出关键靶点33个。KEGG富集与PPI网络分析发现,益肾清利活血方可能通过PI3K/Akt等通路发挥抗纤维化作用。动物实验结果表明,益肾清利活血方可降低纤维化大鼠的血肌酐(Scr)和尿素氮(BUN)水平,改善纤维化病变区域,抑制肿瘤坏死因子α(TNF-α)表达,降低PI3K/Akt通路蛋白表达。结论益肾清利活血方可能通过调控PI3K/Akt信号通路从而发挥抗纤维化作用。

关键词： 脑缺血/再灌注损伤   β-石竹烯   网络药理学  

摘要： 目的:采用网络药理学方法探索β-石竹烯(β-caryophyllene,BCP)在脑缺血/再灌注损伤(cerebral ischemia-reperfusion injury,CIRI)中发挥作用的潜在机制,并对关键通路中的关键靶点进行验证。方法:通过PharmMapper(pharmmapper server)数据库获得BCP相关靶点;通过人类基因数据库(https://***/,GeneCards)和在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)数据库获得CIRI的相关靶点;利用VENNY 2.1.0数据库比对筛选BCP抗CIRI的潜在作用靶点,并利用软件Cytoscape 3.7.1绘制相互图;利用软件R语言中的clusterProfiler包对BCP抗CIRI的潜在靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集通路分析;建立大鼠CIRI模型,用western blot法验证BCP抗CIRI的潜在靶点。结果:筛选出BCP相关靶点194个,CIRI相关靶点1144个,共同靶点102个。BCP主要作用于白细胞介素6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、肿瘤蛋白p53(tumor protein p53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、信号转导子和转录激活子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、半胱天冬酶3(caspase 3,CASP3)等关键靶点,通过过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptors,PPAR)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)、P53(tumor protein p53,P53)等信号通路途径,对CIRI发挥抗炎、抗氧化、抗凋亡、神经保护作用。结论:BCP在CIRI治疗中的作用主要涉及抗凋亡、神经保护作用,其他还与抗炎、抗氧化等多靶点、多通路相关,体现出我国中医药多靶点、多环节发挥作用的特点。

关键词： 《温病条辨》   人参   数据挖掘   网络药理学   用药规律  

摘要： 目的探索吴鞠通在《温病条辨》中运用人参方药治疗温病的核心药物组合及配伍规律,以期为后续研究与应用提供参考依据。方法以“人参”为关键词,整理选取《温病条辨》中含有人参的方剂并记录。运用中医传承计算平台(TCMICS)对所提取的中药数据进行频次统计、性味归经统计、药物功效分析、聚类分析及关联规则分析,并总结出核心药物组合。运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、本草组鉴数据库(HERB)、PubChem数据库、Swiss Target Prediction数据库分析治疗温病药物的活性成分及靶点,使用Cytoscape软件构建核心药物-活性成分-靶点之间的网络图。通过DAVID数据库分析其相互作用关系及相关通路。结果共筛选出目标方剂43首。用药药性以温为主,其次为寒、平。药味以甘为主,其次为苦、辛。归经主要归脾、肺、心、肾经。中药功效频次最高的为补虚类,其次为收涩类、清热类。与人参组合的核心药物4味,频次由高到低分别为麦冬、炙甘草、当归、阿胶。药物组合中的活性成分共116个、靶点949个。ESR1、ESR2、CYP19A1、PTPN1等为较重要的靶点。核心药物活性成分主要涉及蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性、蛋白酪氨酸激酶活性、核受体活性、配体激活的转录因子活性等分子功能。潜在的作用靶点主要位于膜筏、膜微区、膜区等位置。共涉及199条通路,主要有神经活性配体-受体相互作用、钙信号、cAMP信号等通路。结论《温病条辨》中43首使用人参治疗温病的方剂药性以温为主,使用补虚类药物频次最高,其中人参-麦冬-炙甘草-当归-阿胶为核心药物组合,通过核心药物的主要活性成分及其潜在靶点,可得出人参治疗温病注重阴液与脾肺之气在温病逐渐变化中的影响,以调节人体阴阳与脏腑精气血津的虚实,达到扶正祛邪的目的。

关键词： 中国药理学会   弋矶山医院   皖南医学院   定量药理学   治疗学   中国临床药理学   特聘教授  

摘要： 《中国临床药理学与治疗学》是由中国科学技术协会主管、中国药理学会主办、皖南医学院弋矶山医院承办的国家级学术性月刊(ISSN 1009-2501,CN 34-1026/R),创刊于1996年6月,创刊人是全国著名定量药理学家孙瑞元教授,现任主编为国家杰出青年基金获得者复旦大学特聘教授黄志力。