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关键词： GEO   网络药理学   半枝莲   白花蛇舌草   乳腺癌肺转移及骨转移  

摘要： 目的:利用GEO数据库及网络药理学研究半枝莲、白花蛇舌草治疗乳腺癌肺转移和骨转移分子机制。方法:采用R语言差异分析GEO芯片获取疾病靶点;检索TCMSP、PubChem、SwissTargetPrediction数据库筛选药物有效成分的作用靶点;将药物靶点与疾病靶点取交集,通过STRING数据库构建PPI网络,并用Cytoscape进行可视化和拓扑分析,最后利用Web Gestalt数据库进行GO、KEGG富集分析。结果:经筛选后半枝莲主要包括28个有效成分,如黄芩素、木犀草素、槲皮素等,白花蛇舌草包括7个有效成分,如槲皮素、2,3-二甲氧基-6-甲基蒽醌等,半枝莲靶基因504个,白花蛇舌草靶基因313个。GEO数据库中分别筛选到364、4674个乳腺癌肺转移、骨转移差异基因。PPI网络各筛选出10个核心靶点。GO和KEGG富集分析表明,半枝莲、白花蛇舌草可通过影响转录调节复合物、转移酶复合物等细胞组分,调节β-catenin聚集等分子功能,干预Wnt、细胞周期、TGF-β等信号通路,参与调控细胞周期、T细胞活化等生物进程,治疗乳腺癌肺转移、骨转移则可能通过影响蛋白激酶复合物等细胞组分,调节类固醇结合、氧化还原酶活性等分子功能,干预细胞周期、P53、PI3K/Akt、FoxO等信号通路,参与类固醇代谢等进程。结论:初步揭示半枝莲、白花蛇舌草抗乳腺癌肺转移、骨转移的作用靶标和潜在机制,发现其作用是多成分、多靶点、多途径的,为今后分子生物学实验奠定基础。

关键词： 葛根   心肌缺血再灌注损伤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:探究葛根治疗心肌缺血再灌注损伤的作用靶点和机制。方法:首先利用TCMSP数据库筛选葛根的有效成分,然后通过TCMSP、HERB和PharmMapper数据库检索有效成分治疗疾病的潜在作用靶点。利用DAVID数据库对葛根治疗心肌缺血再灌注损伤的治疗靶点进行GO和KEGG富集分析。最后利用分子对接技术进一步分析有效成分与核心靶点之间的作用关系。结果:以DL≥30%,OB≥0.18作为筛选条件,最终确定8个有效成分。通过TCMSP、HERB和PharmMapper数据库检索得到8个有效成分的461个治疗疾病的潜在作用靶点和887个致病靶点,最终确定107个葛根治疗心肌缺血再灌注损伤的潜在作用靶点。利用Cytosacpe软件筛选出26个核心靶点,根据中心度值对核心基因进行排序,排序前五的基因分别为:EGFR、PPARC、IGF1、ESR1和BCL2。GO和KEGG富集结果表明,AGE-RAGE信号通路、HIF-1信号通路、Relaxin信号通路和IL-17信号通路可能是葛根治疗心肌缺血的主要通路。分子对接结果表明,有效成分与核心靶点的对接结合能均小于-5 kcal/mol。结论:网络药理学和分子对接在一定程度上阐明了葛根治疗心肌缺血再灌注损伤的作用机制,为心肌缺血再灌注损伤机制的研究提供参考。

关键词： 益气温阳   中药   网络药理学   冠状动脉疾病   冠状动脉微循环功能障碍   药理机制  

摘要： 目的 通过网络药理学技术预测益气温阳药治疗冠状动脉微循环功能障碍(coronary microvascular dysfunction,CMD)的作用靶点,了解益气温阳药治疗CMD的作用机制。方法 2022年7月至2023年7月,通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)获得益气温阳药物活性成分,利用PubChem和Novopro数据库获取药物成分的SMILES值,通过SwissADME平台筛选药物成分,利用Target Prediction获取对应成分的靶点,筛选Probability> 0.1的靶点。利用GeneCards和在线人类孟德尔遗传(OnlineMendelianInheritanceinMan,OMIM)数据库分别获取CMD的疾病靶点,利用Venny在线平台获取药物成分靶点和CMD疾病靶点的交集靶点。将交集靶点数据导入STRING网站,获得蛋白质互作网络,并导入Cytoscape 3.10.1软件,筛选核心靶点,进行可视化,将核心靶点导入David数据库,进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,并进行可视化。结果 筛选出药物活性成分34个,对应靶点552个,CMD靶点1 171个,药物靶点和疾病靶点的交集靶点175个,通过STRING和Cytoscape 3.10.1筛选核心靶点33个,主要包括肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine kinase proteins 1,AKT1)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3(cysteinyl aspartate specific proteinase,CASP3)等;GO富集分析表明,益气温阳药可能影响镉离子细胞反应、一氧化氮生物合成正向调节等生物过程,影响一氧化氮合成反应、转录位点调控等分子功能,及膜筏、受体复合物等细胞成分;KEGG富集分析表明,益气温阳药主要通过PI3K/Akt信号通路、雌激素信号通路等发挥生物学效应。结论 益气温阳药可能通过多成分、多靶点、多途径治疗CMD。

关键词： 周围神经病理性疼痛   带状疱疹后神经痛   补阳还五汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的采用网络药理学方法及分子对接技术探讨补阳还五汤治疗周围神经病理性疼痛(PNP)的作用机制。方法通过ETCM、SwissTargetPrediction数据库获取补阳还五汤的活性成分和作用靶点;通过GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库筛选PNP相关靶点,并利用R语言ggvenn包绘制交集靶点韦恩图。使用Cytoscape软件构建“组方药物-活性成分-疾病靶点”网络,STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI),R语言clusterProfiler包进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集通路分析,AutoDock软件对关键活性成分和核心靶点进行分子对接。结果共获得257种有效成分和844个作用靶点,3143个PNP相关靶点和478个交集靶点。PPI分析显示蛋白激酶Src(SRC)、信号转导及转录激活因子3(STAT3)、蛋白激酶B(AKT1)、表皮生长因子受体(EGFR)等为核心靶点。GO功能富集分析得到3659个GO条目,覆盖了3206个生物过程、143个细胞组分和310个分子功能。KEGG富集分析识别303条信号通路,涵盖EGFR-TKI、AGE-RAGE、HIF-1、PI3K-Akt等信号通路。结论本研究通过网络药理学及分子对接技术发现,补阳还五汤可通过多成分、多靶点、多通路从系统水平调节多个生物过程发挥治疗PNP的作用。

关键词： 麝香   脑梗死   网络药理学   分子对接技术   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术探究麝香治疗脑梗死的潜在作用机制。方法:通过BATMAN-TCM数据库收集麝香的活性成分,从GeneCards、OMIM数据库中筛选脑梗死疾病的靶点,应用Venny 2.1.0数据库获得麝香与脑梗死交集靶点韦恩图。使用Cytoscape 3.8.2构建麝香-有效成分-靶点网络图与蛋白质-蛋白质相互作用网络图,获得核心成分与靶点。利用DAVID数据库进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用Auto Dock vina将5种核心成分与5个核心靶点进行对接,通过PyMOL软件进行可视化分析。结果:麝香治疗脑梗死的活性成分有胆固醇、脱氢表雄酮、雌二醇等共16种,靶点共372个,脑梗死疾病靶点共4404个,药物活性成分与疾病的交集靶点有261个。GO功能富集分析显示交集靶点共有1219个生物功能条目。KEGG富集分析显示交集靶点涉及的信号通路共有192条,包括脂质和动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路等。核心成分与核心靶点有较好的结合活性。结论:麝香中高密度脂蛋白胆固醇、脱氢表雄酮、雌二醇、甘氨酸、睾酮等核心成分可能通过作用于肿瘤抑制蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine-Threonine Protein Kinase 1,AKT1)、信号转导与转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)等靶点与脂质和动脉粥样硬化等信号通路治疗脑梗死。

关键词： BOPPPS教学模式   音乐课堂   药理学  

摘要： 目的探索BOPPPS与“音乐课堂”相结合的教学模式在药理学课程教学中的应用效果。方法以韶关学院2020级临床医学专业两个班的学生为研究对象。实验组采用BOPPPS与“音乐课堂”相结合的教学模式,对照组采用以教师讲授为主的传统教学模式。教学后对学生进行理论考试,同时对实验组进行问卷调查。结果实验组考试成绩明显优于对照组(P<0.05),且实验组学生对BOPPPS与“音乐课堂”相结合的教学模式认可度较高。结论BOPPPS与“音乐课堂”相结合的教学模式教学效果较好,可在药理学教学中应用和推广。

关键词： 心肌缺血损伤   新塔花-丹参-降香   天香丹   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨“新塔花-丹参-降香”改善心肌缺血损伤的药效物质基础和分子作用机制。方法 借助TCMSP、UniProt和PubChem数据库及文献补充获得“新塔花-丹参-降香”的主要活性成分,并将与活性成分相联系的靶基因借助UniProt数据库翻译成相应基因。利用GeneCards、OMIM和TTD数据库得到疾病相关靶点,对主要活性成分与疾病靶点取交集后采用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后通过AutoDock Vina软件对关键靶点和主要活性成分进行分子对接验证。结果 筛选“新塔花-丹参-降香”针对心肌缺血损伤的101个活性成分和338个潜在作用靶点。蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络拓扑分析筛选得到关键靶点白细胞介素-17(IL-17)、HIF-1、核转录因子-κB(NF-κB)、TNF等。GO功能分析发现“新塔花-丹参-降香”生物过程集中在RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录正调控、基因表达的正向调控、凋亡过程的负调控、对外源刺激的反应等多个方面。KEGG信号富集分析显示涉及血脂与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、细胞凋亡、IL-17信号通路、前列腺癌、HIF-1信号通路、cAMP信号通路、NF-κB信号通路、mTOR信号通路等。分子对接显示活性物质与靶点蛋白之间存在较强的结合力,其中槲皮素与TNF的结合力最强。结论“新塔花-丹参-降香”配伍治疗心肌缺血损伤具有多成分、多靶点、多通路相互协同的特点,可为防治心肌缺血损伤的研究提供参考。

关键词： 肾苏合剂   糖尿病肾病   网络药理学   分子对接  

摘要： [目的]基于网络药理学和分子对接技术探究名老中医曹式丽教授“辛通畅络法”的代表方剂—肾苏合剂治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。[方法]通过TCMSP、BATMAN平台筛选肾苏合剂的活性成分,通过R studio软件获取活性成分的相关靶点,并添加靶点名称的缩写,将方剂的靶点信息与Uniprot数据库信息进行规范化。通过Gene Cards、OMIM、CTD数据库获取DN的相关靶点。运用韦恩图在线绘制平台获取药物、疾病的交集靶点,通过Cytoscape软件将“药物活性成分、疾病、靶点”可视化。将交集靶点输入STRING数据库进行分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,对交集靶点进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。[结果]共获得肾苏合剂活性成分66个,靶点504个,DN靶点2646个,交集靶点243个。共获得PPI靶点241个(2个游离节点被删去),包括清蛋白基因(ALB)、AKT丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT1)、白介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、胰岛素基因(INS)、白介素-1β(IL-1β)等。GO富集分析主要涉及:DNA-转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ-特异性DNA-转录因子结合、受体配体活性等。KEGG富集分析主要涉及:脂质和动脉粥样硬化、人巨细胞病毒感染、流体剪切应力与动脉粥样硬化等。[结论]肾苏合剂可能通过多个靶点、通路治疗DN,本研究为肾苏合剂的临床使用提供了理论依据。

关键词： 心血管疾病   川芎   药理作用   化学成分   综述  

摘要： 综述川芎在防治心血管系统疾病的药理作用及临床应用,以期能够为川芎的进一步研发应用提供相关依据。川芎是中医药临床辨证论治应用当中极为常见、组方广泛、使用最频繁的活血化瘀药之一,主要的功效有活血止痛、祛风除湿、行气等,外用可以促进人体经络气血循环、消肿止痛。川芎化学成分主要包含挥发油类、有机酸类、生物碱类以及多糖类等,在防治心血管系统的相关疾病方面具有独特应用。This paper reviews the pharmacological effects and clinical application of Ligusticum chuanxiong in the prevention and treatment of cardiovascular diseases, in order to provide relevant basis for the further development and application of Ligusticum chuanxiong. Chuanxiong is one of the most common, widely used and most frequently used drugs for promoting blood circulation and removing blood stasis in the clinical application of traditional Chinese medicine. Its main effects include promoting blood circulation and relieving pain, dispelling wind and removing dampness, and promoting qi circulation. External use can promote the circulation of qi and blood in human meridians, relieve swelling and relieve pain. The chemical constituents of Ligusticum chuanxiong mainly include volatile oils, organic acids, alkaloids and polysaccharides, which have unique applications in the prevention and treatment of cardiovascular diseases.

关键词： 补益类中药   发酵菌种   发酵技术   发酵工艺   发酵产品   药理作用  

摘要： 发酵是中药炮制的方法之一,随着发酵工程、生物工程和微生物技术的发展,发酵方式从传统自然发酵转向现代发酵,发酵工艺趋向精准可靠,生产成本低,效率高,可以实现工业化。补益类中药在临床应用较为广泛,发酵菌种包括细菌、真菌、药食两用菌,发酵技术包括固体发酵、液体发酵、双向发酵。已有研究发现,经发酵后,补益类中药化学成分含量的变化以及新化合物的出现,使其在抗氧化、增强免疫、抗肿瘤、抗菌、降压等方面药效显著提升。补益类中药多为药食两用中药,酒、醋、酸奶等发酵产品的研发,进一步丰富其药食价值。发酵补益类中药不仅应用于医药领域,而且还应用于食品和畜牧领域,应用前景广阔。鉴于此,本文从发酵菌种、发酵技术、发酵工艺、发酵产品、发酵对补益类中药药理作用的影响以及应用研究为出发点综述补益类中药发酵方面的研究进展,以期为补益类中药发酵的后续研究和开发利用提供参考和依据。