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关键词： 大黄灵仙胶囊   网络药理学   胆石症   靶点   信号通路  

摘要： 目的:通过网络药理学方法分析大黄灵仙胶囊治疗胆石症的作用机制。方法:使用中药系统药理分析平台提取大黄灵仙胶囊的有效活性成分及对应作用靶点,结合UniProt数据库对靶点进行标准化。通过GeneCards数据库检索得到胆石症相关靶点,借助R语言筛选大黄灵仙胶囊与胆石症的交集靶点,借助Perl语言映射出交集靶点对应的有效活性成分,构建药物治疗疾病的“有效活性成分-靶点”数据库,利用Cytoscape软件对数据库绘制可视化图并筛选出核心有效成分;借助STRING数据库对交集靶点进行蛋白相互作用分析,DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果:得到160个大黄灵仙胶囊有效活性成分,116个对应作用靶点,其中与胆石症的共同靶点28个。大黄灵仙胶囊治疗胆石症的核心成分有槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、异鼠李素等,治疗的主要核心靶点有白细胞介素6、血管内皮生长因子A、表皮生长因子受体等,主要通过细胞增殖调控、一氧化氮生物合成过程调控等生物作用在细胞核浆、内吞体膜、胞外间隙等细胞位置,发挥类固醇结合、酶结合、转录因子结合等分子功能参与调控癌变通路、缺氧诱导因子1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路等,发挥治疗胆石症的效用。结论:网络药理学构建了大黄灵仙胶囊治疗胆石症多活性成分、多基因靶点、多治疗通路相互作用的特点,筛选出大黄灵仙胶囊作用于胆石症的基因靶点和信号通路,为进一步探索大黄灵仙胶囊治疗胆石症的作用机制提供参考依据。

关键词： 桑白皮-地骨皮   急性肺损伤   网络药理学   分子对接   机制   小鼠  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接结合动物实验验证桑白皮-地骨皮药对干预急性肺损伤(ALI)的作用机制。方法利用TCMSP数据库获取桑白皮-地骨皮药对的活性成分,运用SwissTargetPrediction数据库进行活性成分靶点预测;应用GeneCards、DisGeNET数据库收集ALI疾病靶点;通过构建蛋白相互作用(PPI)网络筛选关键靶点,对关键靶点进行GO及KEGG通路富集分析;采用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点-通路网络;采用AutoDock和PyMOL软件对核心活性成分及靶点进行分子对接。利用脂多糖建立ALI小鼠模型,对主要靶点和通路进行实验验证。结果获得桑白皮-地骨皮药对活性成分44个,作用靶点138个,其中干预ALI的潜在作用靶点26个,主要为TNF、EGFR、NFKB1、MPO、TNFRSF1A、NOX4等,关键通路为MAPK信号通路、IL-17信号通路、NF-κB信号通路等;分子对接结果显示,核心活性成分与主要靶点具有较强的结合活性;动物实验结果表明,中、高剂量桑白皮-地骨皮药对可有效改善ALI小鼠肺组织病理损伤,降低血清白细胞介素(IL)-6、肿瘤坏死因子(TNF)-α含量(P<0.01),升高IL-10含量(P<0.01);抑制肺组织EGFR、PI3K、AKT、NF-κB p65蛋白表达(P<0.01)。结论桑白皮-地骨皮药对中的槲皮素、蒙花苷等成分,作用于EGFR、TNF等靶点,通过EGFR/PI3K/NF-κB信号通路等多途径干预ALI。

关键词： 膝骨关节炎   四妙汤   网络药理学   富集分析   作用机制  

摘要： 应用网络药理学探究四妙汤治疗膝骨关节炎的作用机制。方法 首先,我们借助TCMSP、SwissTarget和PubChem数据库,全面搜集了四妙汤中药物的主要活性成分及其对应的预测靶点。随后,利用Genecards和OMIM数据库,我们确定了与膝骨关节炎(KOA)紧密关联的疾病靶点,并通过与药物预测靶点的交集运算,识别出潜在的治疗靶点。接下来,我们利用Cytoscape3.9.1软件,构建了“药物-成分-靶点”的相互作用网络,这一网络直观地展示了药物、其活性成分以及治疗靶点之间的复杂关系。为了进一步筛选核心靶点,我们利用String软件分析了蛋白质之间的相互作用(PPI),从而确定了在KOA治疗中起关键作用的靶点。最后,我们借助David平台(https://***/),对这些核心靶点进行了基因本体(GO)和京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路的富集分析。结果 得到四妙汤中有效活性成分72个、相应预测靶点804个,排名前7的有效活性成分为棕榈碱、甘露聚糖、蓝堇碱、7-去氢槐胺碱、四氢小檗碱、槲皮素、甲基黄连碱;得到387个疾病相关靶点,取交集后得到66个治疗膝骨关节炎的潜在靶点,其中的核心靶点为TNF、AKT1、MMP9、PPARG、PTGS2;GO富集分析结果显示有465个条目;KEGG通路分析得到了包括IL-17、TNF信号通路在内的122条通路。结论 四妙汤通过多成分、多靶点、多通路实现对膝骨关节炎的治疗作用。

关键词： 淫羊藿   朝藿定A   药理学  

摘要： 淫羊藿为我国传统常用中药,朝藿定A是淫羊藿的主要成分之一。目前研究显示具有抗骨质疏松、抗炎、抗氧化、抗菌、抗阿尔茨海默病、神经保护等药理活性。本文结合文献对朝藿定A的药理学活性作用进行综述,为该化合物的基础研究及临床应用提供借鉴。Epimedium is a traditional Chinese medicine commonly used in China, and Epimedin A is one of the main components of Epimedium. Current studies have shown that it has pharmacological activities such as anti-osteoporosis, anti-inflammatory, antioxidant, antibacterial, anti-Alzheimer’s and neuroprotection. This article reviews the pharmacological activity of Epimedin A based on the literature, and provides a reference for the basic research and clinical application of Epimedin A.

关键词： 马鞭草   炮制   历史沿革   化学成分   药理作用   挥发油   黄酮类   研究进展  

摘要： 马鞭草为我国中药材,其药用历史悠久,临床应用广泛,具有活血散瘀、清热解毒、利水消肿、退黄、截疟等功效。马鞭草炮制历史悠久,早在唐代就有“捣”法的记载,其后出现了酒制、炒制、盐制、蜜制等多种炮制方法,现代马鞭草炮制较之古时简化。马鞭草炮制加工后可减弱药物不良反应,增强药物功效,使之药性专一,利于临床应用。现代研究表明,马鞭草的主要化学成分有挥发油类、黄酮类、三萜类、二萜类、环烯醚萜糖苷类、苯丙素糖苷类、甾醇类等,具有抗肿瘤、抗早孕、抗炎镇痛、神经保护、调节免疫、抗真菌、抗氧化、镇咳以及防治尿石症等药理作用。通过查阅历代本草、医药典籍以及相关文献资料,从马鞭草的炮制历史沿革、化学成分及药理作用等多方面进行论述,以期为马鞭草的相关研究提供参考。

关键词： 白兰花   化学成分   药理作用   应用  

摘要： 白兰花广植于我国福建、广东、广西、云南等省区,其化学成分主要为芳樟醇,药理作用主要为抗炎、抗癌、抑菌、抗氧化等,其被广泛应用于园林、植物生长发育调节剂、日化用品等产品中。综述了白兰花的化学成分、药理作用及应用等,以期为后续研究白兰花提供参考。

关键词： 淫羊藿苷   急性溃疡性结肠炎   MAPK信号通路   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学与实验验证探讨淫羊藿苷治疗急性溃疡性结肠炎的作用机制。方法通过TCMSP数据库评估淫羊藿苷药动学;采用STRING平台和Cytoscape软件构建淫羊藿苷-潜在靶点PPI网络,并对网络进行拓扑分析,获取淫羊藿苷治疗急性溃疡性结肠炎的核心靶点;对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析;使用AutoDock软件分子对接模拟淫羊藿苷与核心基因的结合活性,预测淫羊藿苷治疗急性溃疡性结肠炎的作用机制。通过小鼠和RAW264.7细胞实验对网络药理学研究结果进行验证,构建急性溃疡性结肠炎模型,并对富集分析筛选出的相关信号通路中关键蛋白的表达进行分析。结果网络药理学分析表明,淫羊藿苷治疗急性溃疡性结肠炎潜在核心基因为Akt1、ERK、TP53、HSP90AA1、BCL2L1、TNF、JNK、EGFR,并且可能与MAPK信号通路相关,且分子对接的结果显示淫羊藿苷与JNK、HSP90AA1、ERK、TP53具有较好的结合活性。体内体外实验结果表明,淫羊藿苷可通过抑制MAPK信号通路,降低TNF-α、IL-1β、iNOS等炎性因子的分泌,减弱肠道免疫反应。结论淫羊藿苷可能通过调节MAPK信号通路改善小鼠急性溃疡性结肠炎的症状,抑制小鼠炎症反应。

关键词： 网络药理学   姜黄素   宫颈癌   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术,探讨姜黄素治疗宫颈癌的作用机制和关键靶点。方法分别鉴定出姜黄素靶点和宫颈癌相关基因,并获取姜黄素与宫颈癌的交集靶点。使用Metascape对交集靶点进行富集分析。利用STRING平台和Cytoscape软件构建蛋白互作(PPI)网络。以CytoHubba插件的12项算法筛选出关键靶点。通过分子对接验证姜黄素与关键靶点之间的相互作用。结果确定了140个姜黄素治疗宫颈癌的潜在靶点。基因本体论(GO)分析富集了378个术语,包括对激素的反应和蛋白质磷酸化等。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析富集了138条信号通路,包括癌症中蛋白多糖和病毒致癌等多个癌症相关通路。PPI网络得到包含139个节点和3420条边的拓扑网络。Cytohubba插件筛选出5个关键靶点,分别为丝氨酸和苏氨酸激酶(AKT)1、雌激素受体(ESR)1、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)、肿瘤坏死因子(TNF)和前列腺素内过氧化物合酶(PTGS)2。结论分子对接技术验证了姜黄素可以自发地与AKT1、SRC、TNF和PTGS2结合,表明姜黄素对宫颈癌中的多个靶点和通路表现出药理作用。

关键词： 原发性肝癌   槲芪散   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨槲芪散治疗原发性肝癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库获取槲芪散的活性成分,利用GeneCards、OMIM及PharmGkb数据库筛选原发性肝癌相关基因,并采用R软件获取药物-疾病交叉靶点。采用Cytoscape3.7.2软件对药物-疾病交叉靶点与活性成分进行槲芪散活性成分-靶点-原发性肝癌网络构建,筛选出核心成分。采用STRING平台对于药物-疾病交叉靶点进行蛋白质–蛋白质相互作用(PPI)网络分析,通过MCODE插件进行聚类分析以获得与原发性肝癌患者预后相关的关键靶点,并通过TCGA数据库的原发性肝癌队列对关键靶点进行预后分析。采用R语言软件包对作用靶点进行基因本体论(GO)生物功能分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并利用AutoDock Vina1.1.2软件对主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果:共筛选出槲芪散活性成分113个,作用靶点226个,1765个疾病靶点,预测得到116个抗原发性肝癌靶点。槲芪散治疗原发性肝癌的关键成分有槲皮素、山柰酚、木犀草素、柚皮素、丹参酮ⅡA等。PPI网络显示,雌激素受体1(ESR1)、半胱氨酶蛋白酶3(CASP3)、肿瘤蛋白53(TP53)、B细胞淋巴瘤2(BCL2)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、细胞周期蛋白D1(CCND1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、Fos原癌基因(FOS)、蛋白激酶B1(AKT1)和热休克蛋白90α家族A成员1(HSP90AA1)为槲芪散治疗原发性肝癌的关键靶点。预后分析显示,ESR1、CASP3、MAPK3、AKT1以及HSP90AA1的表达与原发性肝癌患者的生存时间密切相关。富集分析揭示,槲芪散主要富集在化学应激的细胞反应、活性氧化物的反应、脂多糖的反应以及对异物刺激的反应等细胞过程中发挥作用,能够调控磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等多条信号通路发挥治疗作用。分子对接显示,关键靶点TP53、AKT1、STAT3、ESR1、MAPK1与柚皮素、山柰酚、槲皮素以及木犀草素能够稳定结合。结论:槲芪散中的柚皮素、山柰酚、槲皮素及木犀草素等成分能够作用于AKT1、ESR1、CASP3、MAPK3等多靶点,通过调控PI3K-AKT信号通路、IL-17信号通路等发挥治疗原发性肝癌的作用。

关键词： 清心莲子饮   网络药理学   分子对接   肾性蛋白尿  

摘要： 目的采用网络药理学和分子对接技术探讨清心莲子饮治疗肾性蛋白尿的潜在作用机制。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等及相关文献,获取清心莲子饮复方活性成分及作用靶点;通过GeneCards等获取肾性蛋白尿相关靶点。筛选复方治疗疾病的活性成分及作用靶点,用Cytoscape 3.9.0软件构建“复方-成分-靶点-疾病”相互作用网络,构建PPI网络并筛选核心靶点,对关键靶点进行基因本体论(GO)富集及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。最后,将复方关键成分和核心靶点进行分子对接。结果通过构建相互作用网络发现,复方中118个活性成分可作用于疾病相关的144个靶点,其中槲皮素等成分是关键药效成分。筛选得到核心靶点5个,包括TP53等。GO富集分析得到条目2409个,KEGG分析得到条目183个。分子对接结果显示,关键成分和关键靶点均能实现自发结合。结论复方清心莲子饮中,槲皮素等活性成分可能通过PI3K/Akt等信号通路实现对疾病的治疗。