课程文献中心 更多>>

关键词： 高血压病   胡毓恒降压方   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨“胡毓恒降压方”治疗高血压病的作用机制。方法:借助数据库获取“胡毓恒降压方”靶基因与高血压病发病基因的交集基因,利用Cytoscape 3.9.1软件构建中药化合物-靶点网络及蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络筛选关键靶点,对关键靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选获得木犀草素、槲皮素、山柰酚和黄芩素等主要功效成分23个,获得“胡毓恒降压方”治疗高血压病的潜在靶点117个,PPI分析筛选得到类固醇受体共激活因子基因(SRC)、磷脂酰肌醇-3-激酶p85基因(PI3KR1)、蛋白酪氨酸磷酸酶非受体型11基因(PTPN11)、蛋白激酶B基因(AKT1)等59个核心基因。GO分析得出生物过程29条,涉及靶点较多的生物过程有G蛋白偶联受体信号通路、蛋白质磷酸化、蛋白激酶B信号的正向调节、正调节MAP激酶活性、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路、炎症反应等。KEGG分析获得相关信号通路44条,涉及靶点较多的信号通路有神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、氮代谢、内分泌抵抗等。结论:“胡毓恒降压方”主要通过木犀草素、槲皮素、山柰酚和黄芩素等成分经多靶点、多途径、多通路发挥降血压的作用,该方治疗高血压病的机制可能与神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路相关。该结论仍需通过细胞实验、动物实验等予以进一步验证。

关键词： 快胃片   慢性非萎缩性胃炎   网络药理学   分子对接   槲皮素   山柰酚   芒柄花素  

摘要： 目的利用网络药理学及分子对接技术探索快胃片治疗慢性非萎缩性胃炎的作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和HERB数据库获取快胃片的活性成分及其靶点,从GeneCards、OMIM数据库中获取慢性非萎缩性胃炎的疾病靶点,取快胃片活性成分及慢性非萎缩性胃炎的交集靶点。通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白质互作分析,Metascape对交集靶点进行基因本体(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用AutodockTools对快胃片的关键成分及核心靶点进行分子对接初步验证。结果网络药理学研究共获取152个快胃片有效活性成分,包括槲皮素、山柰酚、糖蛋白、芒柄花素等,385个成分靶点,1082个慢性非萎缩性胃炎靶点,取交集获得共同靶点112个,其中核心靶点为肿瘤蛋白p53(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)、蛋白激酶B1(Akt1)、JUN、白细胞介素-1β(IL-1β)。GO富集分析显示生物过程(BP)有1650条,主要包括积极调节细胞迁移、对细菌源性分子的反应、细胞程序性死亡的正向调节;生物功能(MF)有141条,主要包括蛋白激酶结合、激酶调节器活性、细胞因子受体结合;细胞组成(CC)有66条,主要包细胞外基质、膜筏和分泌颗粒腔。KEGG富集分析得到通路188条,主要包括癌症的发病途径、流体剪切应力与动脉粥样硬化、IL-17信号通路、癌症中的蛋白聚糖、化学致癌–活性氧等通路。分子对接结果显示快胃片有效成分与核心靶点能够稳定结合。结论快胃片可通过多成分、多靶点、多通路来对慢性非萎缩性胃炎发挥作用,防止其向慢性萎缩性胃炎转变。

关键词： 荜茇   药理作用   文献计量学   CiteSpace   VOSviewer  

摘要： 目的:分析荜茇的药理作用研究现状和研究趋势。方法:分别从CNKI数据库与Web of Science数据库核心合集,导出主题为荜茇的药理作用的中英文文献,并使用CiteSpace、VOSviewer、Excel软件分别对中英文文献发文量、关键词等进行分析。结果:筛选后得到文献271篇,其中中文文献224篇,英文文献47篇。可视化分析结果表示,荜茇的药理作用相关文章年发文量总体呈现增长趋势。研究热点为荜茇的降血脂、抗肿瘤、抗癌、抗炎功能及其作用机制。结论:荜茇的主要化学成分荜茇宁、荜茇酰胺、胡椒碱等用于治疗高血脂症、抗肿瘤、抗癌、抗炎等作用机制的研究以及数据挖掘、组方规律的探究为目前的研究热点。荜茇治疗高血脂症、抗肿瘤、抗癌及其作用机制的研究为未来的重点研究趋势。

关键词： 黄芩咳喘散   支气管哮喘   临床疗效   网络药理学靶点   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学研究黄芩咳喘散防治支气管哮喘的有效性及其效应物质探讨。方法选取符合纳入标准的患者共94例,随机分为治疗组和对照组各47例。所有患者均接受常规药物治疗。治疗组给予黄芩咳喘散三伏贴,对照组给予其模拟剂三伏贴。对比两组患者治疗前后中医症候积分评分情况、ACT评分、半年内疾病发作次数、血清嗜酸性粒细胞(EOS)等情况。基于网络药理学和分子对接等探讨黄芩咳喘散与支气管哮喘可能的效应物质及作用机制。结果数据显示:①治疗组患者临床治疗总有效率高于对照组(P<0.05);②治疗组患者咳嗽气促、喘息咯痰、食少便溏、神疲乏力单项症状评分、ACT评分、半年内疾病发作次数均低于对照组(均P<0.05);③两组患者EOS水平均降低,且治疗组各指标值明显低于对照组(均P<0.05);④网络药理学筛选黄芩咳喘散有效活性成分潜在作用靶点与支气管哮喘的交集靶点26个,关键有效成分包括四羟基黄酮、亚油酸乙酯、棕榈酸等,涉及核心靶点包括SIRT1、STAT3、ESR1、PPARA等,可能涉及免疫、脂肪酸代谢、激素类反应、细胞坏死因子反应等生物过程。⑤分子对接显示黄芩咳喘散中有效活性成分四羟基黄酮(5,7,2′,6′-Tetrahydroxyflavone)通过氢键分别与支气管哮喘关键靶点SIRT1的氨基酸ILE411、GLU410、LYS408、SER370、LYS375,与STAT3的氨基酸ASP334、LYS574,与ESR1的氨基酸LEU346及PPARA的氨基酸MET320、LEU331、THR334结合。结论黄芩咳喘散治疗支气管哮喘肺脾气虚证患者具有可靠的临床疗效,在改善临床症状、减少疾病发作次数等具有积极作用。经网络药理学分析黄芩咳喘散可能通过SIRT1、STAT3、ESR1等靶点作用于PI3K-Akt、JAK-STAT、NF-κB等通路从减轻气道炎症反应、抑制气道重塑等方面发挥治疗作用,进一步分子对接后提示该药的有效活性成分四羟基黄酮与哮喘疾病靶点SIRT1、STAT3、ESR1及PPARA具有良好的结合能力。

关键词： 网络药理学   分子对接   葛花   酒精性肝炎  

摘要： 目的探讨葛花治疗酒精性肝炎(AH)的作用机制。方法收集葛花活性成分、作用靶点及AH相关靶点,对交集靶点进行蛋白质相互作用分析并获取关键核心靶点,进行功能富集分析,构建葛花成分-交集靶点-疾病-通路网络,并进行分子对接。结果获得17种葛花主要成分及其靶点166个,AH相关靶点699个,葛花与AH的交集靶点70个;葛花的主要活性成分是槲皮素、山柰酚、葛花苷元、芒柄花黄素及β-谷甾醇,关键核心靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6、肿瘤蛋白p53、IL1B;主要信号通路为TNF、IL-17和丝裂原活化蛋白激酶。结论葛花可能通过槲皮素等活性成分激活AKT1、TNF蛋白,调控TNF等信号通路治疗AH。

关键词： 网络药理学   萹蓄–瞿麦   尿路感染   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学方法探讨萹蓄–瞿麦药对治疗尿路感染的作用机制。方法:运用TCMSP数据库和Unit Prot数据库筛选萹蓄–瞿麦药对的活性成分和对应靶点,从GeneCards、Drug Bank和TTD数据库获取尿路感染的疾病靶点。利用Venny (韦恩)平台获取药物活性成分与疾病交集靶点。通过Cytoscape软件,建立“中药–活性成分–靶点–疾病”的网络模型。利用String数据库构建蛋白质相互作用网络,筛选核心靶点,建立核心靶点网络图。在David数据库中进行交集靶点的GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:获得10个萹蓄–瞿麦药对主要活性成分及169个对应靶点;尿路感染对应靶点1170个,交集靶点104个,核心靶点26个。主要活性成分有(+)–儿茶素、槲皮素、山奈酚等。核心靶点有AKT1、TNF、IL6等。GO功能富集分析结果主要涉及细胞增殖正调控、基因表达正调控、凋亡过程负调控等过程;KEGG通路富集分析主要集中于癌症通路、糖基化终末产物–β–淀粉样蛋白信号通路与糖尿病并发症、脂质与动脉粥样硬化等多条信号通路。结论:本研究初步揭示了“萹蓄–瞿麦”药对以结合多成分、多靶点,多通路调控的特征发挥治疗UTI作用。Objective: Exploring the mechanism of action of Bianxu-Qumai medication in the treatment of urinary tract infections through a network pharmacology approach. Method: The TCMSP and Unit Prot databases were used to screen the active ingredients and corresponding targets of Bianxu-Qumai drug pair, and the Gene Cards, Drug Bank and TTD databases were used to obtain the disease targets of urinary tract infections. The Venny platform was utilized to obtain drug active ingredients and disease intersecting targets. Using Cytoscape software, the network model of “TCM-active ingredient-target-disease” was established. The String database was used to construct the protein interaction network, screen the core targets, and establish the core target network diagram. Conduct GO function enrichment analysis and KEGG pathway enrichment analysis of the intersected targets in David database. Result: Ten main active ingredients of Bianxu-Qumai pairs and 169 corresponding targets were obtained;1170 corresponding targets acting on urinary tract infections, 104 intersecting targets and 26 core targets. The main active ingredients were (+)-catechin, quercetin, and kaempferol. The core targets were AKT1, TNF, IL6, etc. The results of GO functional enrichment analysis mainly involved the positive regulation of cell value-added, positive regulation of gene expression, negative regulation of apoptotic process, etc. The KEGG pathway enrichment analysis mainly focused on multiple sign

关键词： 温经汤   肝纤维化   网络药理学   动物实验   大鼠  

摘要： 目的通过网络药理学方法探讨温经汤治疗肝纤维化的作用机制,并对核心靶点进行动物实验验证。方法检索TCMSP筛选温经汤组方药物活性成分及相关靶点,利用UniProt数据库获取温经汤活性成分对应靶点,采用Cytoscape 3.7.2构建“中药-成分-靶点”网络,检索GeneCards数据库筛选肝纤维化相关靶点,使用STRING数据库构建PPI网络,筛选肝纤维化核心成分和关键靶点,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。对结果进行动物实验验证,选取10只作为空白组,其余45只采用四氯化碳诱导肝纤维化大鼠模型。造模结束后,将40只造模成功大鼠按随机数字表法分为模型组和温经汤高、中、低剂量组,每组10只。温经汤高、中、低剂量组灌胃1.5×3.18、3.18、0.5×3.18 g/kg温经汤,空白组灌胃等体积蒸馏水,1次/d,连续灌胃8周。采用HE染色观察大鼠肝组织病理形态,全自动生化仪检测大鼠血清GPT、GOT水平,Western blot检测大鼠肝组织TNF、Akt、IL-6蛋白表达。结果获得温经汤有效成分188个,度值较高的有效成分为β-谷甾醇、槲皮素、柚皮素等,收集肝纤维化基因靶点799个,PPI网络核心靶点为TNF、AKT、IL6等,通过GO功能和KEGG通路富集得到抗肝纤维化相关通路包括癌症通路、TNF及PI3K-Akt等信号通路。动物实验结果显示,模型组大鼠肝组织有明显炎症浸润、胶原纤维及假小叶生成,温经汤高、中、低剂量组大鼠肝组织炎症与纤维化水平较模型组均不同程度改善;与模型组比较,温经汤高、中、低剂量组大鼠血清GPT、GOT水平降低(P<0.05),TNF、Akt、IL-6蛋白表达下降(P<0.05)。结论温经汤可能通过干预TNF、AKT、IL6靶点,调节癌症通路及TNF、PI3K-Akt等信号通路,发挥抗肝纤维化作用。

关键词： 天山雪莲   肌少症   网络药理学   分子对接   机制研究   民族药  

摘要： 以网络药理学为主要研究手段,并结合分子对接技术,分析天山雪莲治疗肌少症的分子机制。利用传统中药数据库(TCMID)及中药系统药理学数据库(TCMSP)来筛选天山雪莲的相关靶点及其活性成分,采用UniProt数据库标准化靶点,并利用Cyto scape可视化软件构建活性成分-靶点网络,在数据库Gene cards中检索和肌少症有关的基因,使用STRING数据库建立蛋白质相互作用网络,同时进行基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后通过分子对接技术对接天山活性成分与靶位置。通过类药性(DL)和口服生物利用度(OB)参数筛选得出天山雪莲成分12个;检索疾病数据库得到肌少症疾病相关靶点435个,47个天山雪莲-肌少症共同靶点;生物学过程主要与调节AKT1、TNF-α、IL-6、TP53和VEGFA等蛋白有关,主要作用于MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路和IL-17信号通路等通路;分子对接表明木犀草素、槲皮素、黄芩素-7-甲醚等关键活性化合物与AKT1、IL6、TNF、TP53和VEGFA等关键靶点有较好的结合能力。研究初步揭示了天山雪莲多层次、多环节治疗肌少症的物质基础及作用机制,为治疗肌少症提供科学依据。

关键词： 辟瘟丹   新冠病毒   网络药理学  

摘要： 目的运用网络药理学方法探讨辟瘟丹预防新型冠状病毒感染(COVID-19)的作用机制。方法通过TCMSP数据库检索辟瘟丹的化学成分及作用靶点;通过GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD和DrugBank数据库查询COVID-19的相关靶点;借助STRING网站进行蛋白质互相作用分析;利用Cytoscape3.9.0软件构建药物成分-靶点网络,分析获得辟瘟丹预防COVID-19的核心靶点;利用R语言和KOBAS数据库分别进行GO和KEGG富集分析。结果辟瘟丹化学成分共115个,靶点共2378个,辟瘟丹和COVID-19有重叠靶点101个,核心靶点为TP53、HSP90AA1、AKT1、MAPK3;KEGG富集分析得到信号通路102条,主要涉及IL-17信号通路、TNF信号通路、P53信号通路、AGE-RAGE信号通路等;GO分析后共得到生物学过程2359个、细胞组成423个、分子功能161个。结论辟瘟丹能够通过TP53、HSP90AA1、AKT1、MAPK3靶点,IL-17、TNF、P53、AGE-RAGE信号通路途径达到调节细胞凋亡、促进机体免疫、抗病毒等作用,发挥预防COVID-19的药理作用。

关键词： 逍遥散   黄褐斑   网络药理学   机制   基因   实验验证  

摘要： 目的基于网络药理学技术及实验验证分析逍遥散治疗黄褐斑的作用机制。方法应用TCMSP等数据库和相关的文献资料,检索逍遥散的生物活性成分及相关作用靶点,构建逍遥散的药物-有效成分-作用靶点网络。基于Drugbank和Genecards等数据库建立与黄褐斑相关的疾病靶点,与逍遥散的有效成分靶点匹配获得潜在治疗靶点。根据Metascape数据库和DAVID数据库对潜在的治疗靶点进行GO生物过程、KEGG信号通路和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,PPI网络的拓扑分析用Cytoscape软件进行。并用实验验证上述结果。结果逍遥散中有效化学成分有928种,包括白芍85种,白术55种,柴胡349种,当归125种,茯苓34种,甘草280种,有效成分作用靶点基因155个。在药物-有效成分-靶点网络内重要性前10的有效成分中,来源自柴胡4种,白芍3种,白术1种,甘草2种。共收集到49个黄褐斑相关疾病靶点,其中有24个是逍遥散治疗黄褐斑的潜在靶点基因。KEGG富集分析表明,在全部的20调信号通路中得到10条较为靠前的信号通路。GO功能富集分析显示,前10个生物过程包括分子调节功能、磷酸化等;前10个分子功能包括细胞传递部分、生物膜等;前10个细胞定位包括核苷酸、嘌呤核苷酸等。PPI网络经提取后获得了包含36个节点的核心网络,其中HSP90AA1、HSP90AB1、NTRK1、CUL3、APP、EGFR、TP53、UBC、MCM2、PRKACA基因是核心靶点。实验验证表明,逍遥散可显著改善大鼠黄褐斑情况;能升高血清SOD水平,降低血清Tyr和MDA含量;改善黄褐斑处皮肤组织结构和皮肤HMB45表达情况。结论逍遥散可通过多成分、多靶点和多通路治疗黄褐斑,起治疗作用的有效成分主要来源自柴胡、白芍、白术和甘草,而核心靶点主要有HSP90AA1等基因。