课程文献中心 更多>>

关键词： 黄芩-白术-茯苓   糖尿病   网络药理学   作用机制   靶点  

摘要： 目的:基于网络药理学的方法筛选石志乔主任常用药组黄芩-白术-茯苓中的活性成分,构建核心成分-疾病-靶点网络,探讨其治疗糖尿病的分子作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),筛选得到黄芩-白术-茯苓中的活性化合物成分及相关靶点,通过检索Genecard、OMIM等数据库查找糖尿病靶点,对两者之间取交集,绘制韦恩图,通过Cytoscape 3.9.2构建药物-成分-靶点网络信息。基于生物信息学开源软件Bioconductor和R语言对黄芩-白术-茯苓的核心靶点进行基因本体论(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。选取度值排靠前的关键靶点和活性成分作为受体蛋白和配体小分子,采用Auto Dock Tools 1.5.6对配体和受体进行分子对接,并借助Py MOL将分子对接结果可视化。结果:黄芩-白术-茯苓中的主要活性成分baicalein(黄芩素)、hederagenin(常春藤皂苷元)、wogonin(汉黄芩素)、stigmasterol(豆甾醇)、rivularin(半枝莲种素)等可通过丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、Jun原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)、前列腺素氧化环化酶2(Prostaglandin-endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、FOS原癌基因(Fos Proto-Oncogene,FOS)、缺氧诱导因子-1α(Hypoxia Inducible Factor-1 Subunit Alpha,HIF1A)、雌激素受体1(Estrogen Receptor1,ESR1)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)等靶蛋白介导糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Product,AGE)-AGE受体(Receptor for Advanced Glycation End Product,RAGE)信号通路、IL-17信号通路、小细胞肺癌癌症信号通路、非酒精性脂肪肝信号通路、TP53信号通路治疗糖尿病。结论:该研究基于网络药理学多通路、多靶点、多成分的研究特点预测黄芩-白术-茯苓治疗糖尿病的作用机制,初步阐明黄芩-白术-茯苓中的活性成分与糖尿病的关系,为黄芩-白术-茯苓配伍的药效物质基础研究提供科学依据。

关键词： 高粱泡叶   网络药理学   分子对接   抗炎   分子机制  

摘要： 目的:本研究旨在采用网络药理学与分子对接技术,揭示高粱泡叶在抗炎治疗中的潜在作用机制。方法:通过网络药理学数据库筛选识别出高粱泡叶关联的抗炎靶点,并进行蛋白互作网络(PPI)、基因本体论(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;同时,利用Autodock软件对关键靶点进行分子对接模拟。结果:从高粱泡叶中鉴定了30种活性成分,涉及493个潜在靶点和2004个疾病相关靶点,其中直接参与抗炎治疗的核心靶点共计131个,如IL-6、TNF-α、IL-1β、ALB、AKT1、EGFR、SRC、TP53、ATAT3、PTGS2等。GO功能富集与KEGG通路分析表明,高粱泡叶抗炎效应可能与PI3K-AKT信号通路、MAPK信号传导途径以及cAMP信号通路在内的170条生物通路密切相关。分子对接实验证实这些主要活性成分与相应靶蛋白间具有良好的结合亲和力。结论:高粱泡叶可能通过多种成分、多靶点、多信号通路发挥抗炎作用与机制,为深入研究高粱泡叶及其活性成分抗炎的作用机制提供实验依据和理论参考。

关键词： 中国药理学会   弋矶山医院   皖南医学院   定量药理学   治疗学   中国临床药理学   特聘教授  

摘要： 《中国临床药理学与治疗学》是由中国科学技术协会主管、中国药理学会主办、皖南医学院弋矶山医院承办的国家级学术性月刊(ISSN 1009-2501,CN 34-1026/R),创刊于1996年6月,创刊人是全国著名定量药理学家孙瑞元教授,现任主编为国家杰出青年基金获得者复旦大学特聘教授黄志力。

关键词： 慢性阻塞性肺疾病   翘芩清肺剂   靶点   信号通路   网络药理学  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨翘芩清肺剂治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)作用机制。方法借助TCMSP、GeneCard、OMIM、PharmGKB数据库获取翘芩清肺剂活性成分及治疗COPD的潜在作用靶点,运用Cytoscape3.9.1软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络图,于STRING平台构建蛋白质相互作用(PPI)图,通过Cytoscape3.9.1软件MCC算法识别图中关键靶点。通过DAVID平台进行GO功能、KEGG通路富集分析;运用Autodock Vina软件将重要靶点及有效成分进行分子对接。结果翘芩清肺剂治疗COPD的潜在作用靶点共167个,重要活性成分为槲皮素、木犀草素,PPI网络中的关键基因为AKT1、TP53、STAT3、JUN、TNF、MAPK3等;GO功能生物过程富集方面涉及对雌二醇的反应、对脂多糖的反应、对乙醇的反应等;KEGG通路富集分析筛选出173条通路,主要富集于PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路、癌症通路等。分子对接验证其重要靶点MAPK3、EGFR、IL6与有效成分槲皮素、木犀草素均具有一定的结合能力。结论翘芩清肺剂治疗COPD的机制主要与抗炎、改善气道重塑、抗肺纤维化相关,且经过多靶点、多通路发挥作用。

关键词： 黄精   皂苷   化学成分   生物合成   药理活性   抗氧化活性  

摘要： 黄精(Polygonatum spp.)是药食同源植物,其活性成分如多糖、黄酮和皂苷具有显著的药理作用。近年来的研究主要集中在从黄精中提取具有抗疲劳、抗氧化、降血糖、降血脂及增强免疫力的皂苷类成分。尽管对黄精皂苷的结构解析取得了一定进展,但其生物合成途径尚需深入研究。黄精中的皂苷通过甲羟戊酸途径和2-C-甲基-D-赤藓醇-4-磷酸途径合成,涉及多个酶催化步骤。本研究提出,黄精皂苷在抗肿瘤、抗菌抗炎、抗病毒及提高免疫调节方面具有多种生物功效,并在药品、食品、化妆品等领域有广泛应用。然而,当前研究还存在以下不足:结构解析不够深入、生物合成途径未完全阐明及药理作用机制不明。未来的研究应加强黄精皂苷的分离、结构解析、合成生物学及药理学研究,以推动其科学研究和产品开发,为新型治疗药物的开发提供科学依据。

关键词： 肺结节   升降散   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接方法研究升降散治疗肺结节的作用机制。方法通过数据库筛选升降散活性成分和靶点以及肺结节靶点,通过Venny 2.1获取交集靶点,Cytoscape 3.6.0软件筛选核心靶点。采用Metascape进行GO和KEGG基因富集分析,得到升降散治疗肺结节作用通路;最终筛选出的前5个靶点与前5名化合物通过AutoDock Tools 1.5.6和PyMOL进行验证与可视化。结果升降散中筛选得到44个活性化合物,涉及208个靶点。肺结节共2175个靶点,交集靶点共97个。KEGG富集显示关键靶点主要富集在Pathways in cancer、PI3K-Akt等20个通路上。分子对接验证结果显示,大部分靶点与成分的结合能均小于-6,提示结合活性较好。结论基于网络药理学探讨升降散治疗肺结节,为进一步研究提供新的思路和方法。

关键词： 数字化   药理学课程   质量建设   实践研究  

摘要： 教育数字化是教育高质量现代化发展的重要支撑。高等学校课程质量的提升是关乎国家发展和人才培养的重要任务。数字化赋能高校课程建设对推进我国高校高质量发展具有重要意义。本研究以数字化改革为背景,探讨药理学课程质量建设的实践策略。通过分析当前药理学课程的现状,提出数字化赋能药理学课程质量建设的方案,旨在为提高我国药理学教育质量提供有益参考。

关键词： 独活寄生汤   神经根型颈椎病   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接技术研究独活寄生汤治疗神经根型颈椎病的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选独活寄生汤的活性成分及其靶点,利用GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库筛选与神经根型颈椎病相关的疾病靶点。通过对这些靶点进行映射,得到潜在的治疗靶点。使用STRING数据库进行蛋白质相互作用分析,并利用Cytoscape软件绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络图。利用微生信进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,以深入了解潜在治疗靶点的功能和通路。最后,使用Autodock软件对活性成分进行分子对接验证,以评估其与目标蛋白的结合亲和力。结果:独活寄生汤含有129种活性成分,与神经根型颈椎病相关的交集靶点有285个。通过蛋白质-蛋白质相互作用网络分析筛选出治疗神经根型颈椎病的关键靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、肿瘤坏死因子、核因子-κB亚基1。GO功能和KEGG通路分析显示,关键靶点涉及磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路、细胞凋亡和细胞增殖的调节。结论:独活寄生汤可能通过抑制炎症、促进细胞存活等方式改善神经根型颈椎病症状,为临床应用和未来治疗该疾病提供新思路。

关键词： 非甾体抗炎药(NSAIDs)   呼吸道合胞病毒(RSV)   网络药理学   分子对接   机制研究  

摘要： 目的:通过网络药理学方法探寻非甾体抗炎药(nonsteroidal anti-inflammatory drugs,NSAIDs)作为抗炎止痛药对呼吸道合胞病毒(RSV)的潜在作用机制,通过网络药理学研究筛选抗RSV的最有影响力的NSAIDs药物。方法:将美国食品和药物管理局(FDA)批准的NSAIDs(19种活性药物和一种前药)用于本研究。通过Swiss Target Prediction和PubChem数据库收集NSAIDs的靶点,在GeneCards数据库中检索疾病RSV靶标。利用韦恩网绘制NSAIDs靶点蛋白与RSV靶点蛋白的交集,在STRING数据库对药物-疾病交集靶蛋白进行蛋白互作分析,在Cytoscape 3.9.0中对该网络进行美化。在DAVID数据库中对交集靶蛋白进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用微生信在线绘图工具绘制KEGG通路富集分析的气泡图,通过Cytoscape 3.9.0进行通路-靶点-成分网络分析,最后通过分子对接(AutoDock Vina)确定NSAIDs对靶蛋白的结合亲和力。结果:共搜集到421个NSAIDs靶点,391个与RSV相关的靶点,39个重叠的靶蛋白,基因组富集分析显示了37条抗RSV的信号通路,探索出MAPK1、AKT1和MAP2K1是与B细胞受体信号通路相关性最大的靶蛋白。结论:三种NSAIDs(舒林酸、罗非昔布、双氯芬酸)可能通过使MAPK1、AKT1和MAP2K1等相关靶蛋白失活来阻断B细胞受体信号通路,从而缓解RSV引起的支气管炎和肺炎。

关键词： 安宫牛黄丸   缺血性脑卒中   网络药理学   动物实验  

摘要： 目的基于网络药理学及动物实验探究安宫牛黄丸对缺血性脑卒中的治疗作用。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台、中医药综合数据库、中国天然产物化学成分库及文献检索获取活性成分,SwissTargetPrediction数据库预测药物的作用靶点,GeneCards、PubMed-Gene数据库获取缺血性卒中相关靶点。药物与疾病靶点相交集后,导入STRING数据库进行蛋白互作关系分析,筛选关键作用靶点,DAVID数据库进行GO功能富集、KEGG通路富集分析,Schrodinger软件对活性分子与潜在关键靶点进行分子对接。采用大脑中动脉栓塞(MCAO)法构建大鼠脑缺血/再灌注损伤模型,给予安宫牛黄丸干预5 d,对神经功能、脑梗死率和脑组织病理学改变进行评估,RT-qPCR、Western blot法验证安宫牛黄丸对脑组织中部分关键靶点的调控作用。结果筛选出16种活性成分及940个与缺血性卒中相关的靶点,并得到交集靶点318个。富集分析表明,安宫牛黄丸主要与MAPK、cAMP、PI3K/Akt、细胞凋亡等信号通路的调控相关。分子对接显示,安宫牛黄丸活性成分与核心靶点CDC42、SIRT1、PARP1和MAPK3均有较好的结合活性。动物实验显示,安宫牛黄丸能够降低MCAO大鼠脑梗死率,改善神经功能缺损和脑组织病理损伤状态,上调MAPK3、SIRT1表达,下调CDC42、PARP1表达。结论安宫牛黄丸对缺血性卒中的改善作用具有多成分、多靶点的特征,本研究为其临床应用提供了科学的实验依据。