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关键词： 气滞血瘀   不孕症   组方规律   数据挖掘   网络药理学  

摘要： 目的:本研究旨在通过中医传承辅助平台(V3.0)和网络药理学方法,深入探究刘艳巧教授在治疗女性不孕症方面的用药规律。方法:本研究回顾性分析了刘艳巧教授治疗女性不孕症的100首门诊处方,并依托中医传承辅助平台(V3.0)建立了中药处方数据库。通过对用药频次、药物的四气、五味、归经分布等数据的统计分析,系统总结了刘教授的用药特点。同时,构建了“药物–活性成分–靶点”网络,利用STRING数据库对PPI网络进行了深入分析,进行了GO和KEGG通路富集分析。结果:在纳入的100首处方中,共涉及112种中药,其中使用频次超过45次的中药有10种。这些中药的药味以甘、苦为主,药性以温性居多,多归入肝肾脾经,主要具有补血行气、活血化瘀的功效。关联规则分析显示,“茯苓–柴胡–当归”为具有显著关联性的核心药物组合,通过药物–疾病靶点分析,共发现59个交集靶点。GO功能富集分析揭示了364个生物过程、35个细胞组分和60个分子功能条目。KEGG通路富集分析则指出了99条相关通路,主要涉及癌症中的蛋白聚糖信号通路和神经活性配体–受体相互作用信号通路等。结论:刘艳巧教授在治疗女性不孕症时,常将“气滞血瘀”视为临床常见症候,并擅长应用活血化瘀类药物进行治疗。核心药物组合“茯苓–柴胡–当归”通过调和气血、疏通经络等多种途径,改善女性生殖系统的功能,从而辅助治疗不孕不育症。此外,中药治疗不孕症的作用通路主要富集在癌症中的蛋白聚糖信号通路和神经活性配体–受体相互作用通路上,这两个通路的异常可能与不孕症的发生有关,而中药可能通过调节这两个通路中的关键分子,来恢复生殖系统的正常功能。Objective: This study aims to deeply explore the medication patterns of Professor Liu Yanqiao in treating female infertility through the Traditional Chinese Medicine Inheritance Support System (V3.0) and network pharmacology methods. Methods: A retrospective analysis was conducted on 100 outpatient prescriptions of Professor Liu Yanqiao for female infertility, and a traditional Chinese medicine prescription database was established using the Traditional Chinese Medicine Inheritance Support System (V3.0). Through statistical analysis of medication frequency, the four properties, five flavors, and meridian tropism distribution of the herbs, the medication characteristics of Professor Liu were systematically summarized. Additionally, a “drug-active component-target” network was constructed, and the PPI network was analyzed in depth using the STRING database for further GO and KEGG pathway enrichment analysis. Results: Among the 100 prescriptions included, 112 traditional Chinese medicines were involved, with 10 herbs used more than 45 times. These herbs primarily had sweet and bitter flavors, warm properties, and were mainly attributed to the liver, kidney, and spleen meridians, exhibiting significant blood-enriching, qi-moving, and blood-activating effects. Association rule analysis indicated tha

关键词： 重楼   抗肿瘤   药理作用   综述  

摘要： 中医常以扶正解毒法治疗癌症。清热解毒类中药重楼常与其他中药配伍进行抗肿瘤治疗。研究表明重楼复方可抑制肿瘤生长、侵袭及转移、逆转多药耐药、提高免疫水平、调节肠道菌群及癌细胞代谢发挥抗肿瘤作用。重楼复方在临床上已被应用于多种癌症的治疗。重楼复方可单独应用改善患者症状,也可通过联合化疗、放疗、常规治疗等提高治疗效果。

关键词： 冬虫夏草   非小细胞肺癌   生物信息学   网络药理学   分子动力学   虫草甾醇   花生四烯酸   过氧化物酶体增殖物激活受体γ   1型血管紧张素Ⅱ受体  

摘要： 目的利用生物信息学、网络药理学、分子对接、动力学模拟方法探讨冬虫夏草治疗非小细胞肺癌的关键靶点及其分子机制。方法利用TCMSP数据库检索冬虫夏草的活性成分和靶点,并利用GEO数据库获取与非小细胞肺癌相关的数据集,使用R语言软件进行差异分析,获取差异表达基因(DEGs)。通过WGCNA分析确定与肿瘤发生密切相关的基因模块,并取交集获取非小细胞肺癌的枢纽基因,将这些枢纽基因与药物靶点进行映射,利用Cytoscape软件构建“活性成分-疾病枢纽靶点”网络图。使用String数据库和Cytoscape构建靶标蛋白相互作用(PPI)网络,筛选出关键靶点。利用Enrihr在线工具进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用CB-Dock2平台和Discovery Studio 2021Client软件对关键成分和靶点进行分子对接验证和可视化。最后利用Gromacs v2022.03软件对分子对接所得的复合物进行100 ns分子动力学模拟分析。结果共筛选得到冬虫夏草活性成分10个,自身靶点276个和作用于非小细胞肺癌的靶点9个,通过对虫草甾醇和花生四烯酸2个核心成分富集分析提示,主要涉及氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路、神经活性配体与受体的相互作用、脂肪细胞的脂肪分解调节、腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)信号通路、叉头框转录因子(FoxO)信号通路等。分子对接结果显示,虫草甾醇和花生四烯酸与过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、1型血管紧张素Ⅱ受体(AGTR1)和内皮PAS结构域蛋白1(EPAS1)这3个核心靶点具有良好的结合能力,动力学模拟进一步验证虫草甾醇与PPARG、AGTR1复合物结合稳定。结论冬虫夏草可能通过调控巨噬细胞极化、神经活性配体与受体、脂质代谢、氧化应激、免疫调节等过程,多种协同作用发挥抗非小细胞肺癌作用。

关键词： 桑叶   牛   乳腺炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 研究以网络药理学和分子对接结合的方法,共同探讨桑叶中有效活性成分对牛乳腺炎的作用机制。通过网络药理学分析平台(TCMSP)、PubChem和Swiss Target Prediction收集到桑叶中的有效活性成分及其对应的靶基因,利用DisGeNET和GENECARDS找到“乳腺炎(mastitis)”对应的靶基因,使用Cytoscape软件、STING数据库分析得到桑叶有效活性成分与乳腺炎的蛋白互作网络(PPI),对收集到的靶基因进行GO和KEGG分析,最后运用分子对接技术对桑叶有效活性成分和核心靶基因进行对接验证。结果显示,桑叶中的四甲氧基丁醇、去甲介素、山柰酚、槲皮素等29种有效成分作用于673个靶点,其中Janus激酶2 (JAK2)、表皮生长因子受体(EGFR)、连环蛋白β1 (CTNNB1)、非受体酪氨酸激酶(SRC)、生长因子受体结合蛋白2 (GRB2)、Janus激酶1(JAK1)、磷酸肌醇-3-激酶调节亚基1 (PIK3R1)、酪氨酸激酶受体2 (ERBB2)、信号传感器和转录激活剂3(STAT3)和蛋白酪氨酸磷酸酶非受体11型(PTPN11)为核心靶点。GO和KEGG分析显示这些核心靶点与炎症相关。分子对接结果显示,桑叶中的氯烯甾醇、槲皮素等与JAK2、EGFR等具有较强的结合能力。研究表明,桑叶能够通过JAK2、EGFR、CTNNB1等多个与乳腺炎相关的靶点,以及核因子κB (NF-κB)信号通路、缺氧诱导因子-1 (HIF-1)信号通路等多个与炎症相关的信号通路对牛乳腺炎起作用。

关键词： 质谱分析   网络药理学   健脑固本方   脑小血管病性认知障碍   Notch-1信号通路   炎症反应  

摘要： 目的运用质谱分析、网络药理学和动物实验探讨健脑固本方治疗脑小血管病性认知障碍(cerebral small vessel disease,CSVCI)的作用机制。方法通过质谱分析得出主要活性成分,TCMSP检索其相应作用靶点;通过GeneCards、OMIM数据库检索CSVCI疾病靶点;通过String数据库和Cytoscape软件构建药物疾病作用靶点网络可视化;利用DAVID数据库对交集靶点进行GO功能和KEGG信号通路富集分析。结果健脑固本方的有效活性成分有山奈酚、薯蓣皂苷,作用于丝裂原活化蛋白激酶8、蛋白激酶B1等核心靶点,可能通过磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B等信号通路涉及炎症反应。蛋白免疫印迹法检测结果表明健脑固本方抑制Notch-1、RBP-Jκ以及Hes-1的表达。结论本研究初步表明健脑固本方能够通过多靶点、多通路、多途径治疗CSVCI,具体作用机制可能是抑制Notch-1信号通路,进而抑制炎症反应。

关键词： 清金益气颗粒   抗疲劳   网络药理学   分子对接   能量代谢   氧化应激  

摘要： 目的探究清金益气颗粒抗疲劳的作用及潜在作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、高通量中药实验和参考指南数据库(HERB)、PubChem、Swiss Target Prediction等数据库获取药物活性成分和作用靶点;通过GeneCards、OMIM数据库收集疲劳的作用靶点;利用VENNY 2.1获取药物与疾病交集靶点,再联合Cytoscape 3.9.1软件构建药物-活性成分-疲劳交集靶点相互关系网络;将交集靶点导入STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测清金益气颗粒抗疲劳的作用机制;选取关键活性成分和核心靶点进行分子对接。通过负重力竭游泳实验观察小鼠负重力竭游泳时间;非负重游泳实验测定小鼠血清乳酸(BLA)、尿素氮(BUN)、乳酸脱氢酶(LDH)、丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)、肝糖原(LG)、肌糖原(MG)、葡萄糖(GLU)等指标评价清金益气颗粒抗疲劳药效。结果网络药理学和分子对接结果显示清金益气颗粒抗疲劳的210个潜在作用靶点主要富集在磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、缺氧诱导因子1(HIF-1)、叉头框蛋白O(FoxO)等信号通路上,其主要活性成分和关键靶点蛋白结合能力较好。动物实验结果表明,清金益气颗粒可通过延长小鼠负重5%力竭游泳时间,降低非负重游泳小鼠血清中BLA、BUN、MDA水平,增加机体LG、MG、GLU水平储存和LDH、SOD、GSH-Px活性发挥抗疲劳作用。结论清金益气颗粒可能通过调节PI3K-AKT、MAPK、HIF-1、FoxO等信号通路影响机体能量代谢和氧化应激发挥抗疲劳的作用。

关键词： 索罗西汤   网络药理学   PPAR-γ   BMPR2   纤维化  

摘要： 目的基于网络药理学研究索罗西汤(SBT)干预MCT诱导的大鼠肺动脉高压(PAH)的作用机制。方法以SBT入血成分为研究对象,采用Swiss Target Prediction数据库预测其潜在靶点,绘制“入血成分-靶点”网络图,应用David平台进行GO、KEGG富集分析。用野百合碱制作PAH大鼠模型,通过血流动力学、形态学方法评价SBT的干预效果。利用Western Blot法检测肺组织中的PPAR-γ、Smad3、α-SMA、Cyclind1、P27、CDK4、BMPR2蛋白表达水平。结果GO、KEGG富集分析结果显示,SBT主要通过PPAR-γ等信号通路发挥作用。动物实验结果证实,SBT能有效降低PAH大鼠肺动脉压力并缓解肺血管重构状况。机制验证显示,SBT能够上调蛋白PPAR-γ、下调蛋白Smad3表达,抑制增殖相关蛋白Cyclin d1的表达,上调蛋白P27的表达。结论SBT通过激活BMPR2/PPAR-γ/Smad3信号通路抑制肺动脉平滑肌细胞增殖,改善肺血管重构。

关键词： 系统性红斑狼疮   网络药理学   中医药   作用机制   研究进展  

摘要： 系统性红斑狼疮是一种自身免疫性疾病,中医药具有副作用少,价格便宜等优势,在治疗系统性红斑狼疮具有很好的治疗效果,在当今人工智能、医药大数据的背景下,基于网络药理学在中医药治疗系统性红斑狼疮方面具有重要价值。本文综述了网络药理学在中医药治疗系统性红斑狼疮的研究成果,以期对系统性红斑狼疮的治疗起到一定的借鉴作用。

关键词： 二陈汤   癫痫   作用机制   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学及分子对接探究二陈汤抗癫痫的作用机制。方法采用中药系统药理学数据库(TCMSP)获取二陈汤的有效成分和作用靶点,应用GeneCards、OMIM、TTD及DrugBank数据库检索癫痫相关靶点,使用韦恩图获得二陈汤-癫痫共有靶点。借助Cytoscape 3.8.0及STRING数据库对共有靶点构建二陈汤抗癫痫成分-靶点网络图,进行蛋白质互作网络(PPI)分析及拓扑分析,并筛选核心靶基因。通过R语言软件对共有靶点进行基因本体论(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析以获取相关生物过程及通路等。最后使用Amtodock将前5的核心靶点与核心成分进行分子对接。结果最终获得肿瘤抑制蛋白P53(TP53)、信号传导和转录激活因子3(STAT3)、B淋巴细胞瘤-2基因(BCL2)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)等8个核心靶点以及相对应的槲皮素、山奈酚、柚皮素等7个核心成分。GO富集分析主要涉及对异生素刺激的反应、金属离子响应、氧化应激反应等生物学过程,膜筏、含胶原蛋白的细胞外基质等细胞组成。KEGG富集通路主要有MAPK、IL-17、TNF等信号通路。分子对接结果显示排名前5靶点与核心成分稳定结合。结论二陈汤可能通过槲皮素、山奈酚、柚皮素等多种主要活性成分作用于TP53、STAT3、BCL2等核心靶点,调控MAPK、IL-17、TNF等信号通路发挥抗癫痫作用。

关键词： 网络药理学   银屑病   地黄   紫草   作用机制  

摘要： 本文旨在通过网络药理学探讨地黄-紫草药对在银屑病治疗中的活性成分和作用机制。从文献和中药系统药理学数据库(TCMSP)检索了地黄-紫草的化学成分,从UniProt获得了这些成分的靶点,从GeneCards和DisGeNET获得了与银屑病相关的靶点,然后使用Cytoscape构建了化学成分-药理靶点、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)和化学成分-银屑病靶点网络。基于DAVID数据库进行了基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果显示,地黄-紫草药对中有11种化合物,在银屑病治疗中这一药对有19个共同靶点。这19个共同靶点主要涉及生物过程,如干扰素-γ介导的信号通路的负调控(GO:0060336)、炎症反应的负调控(GO:0050728)、细胞内受体信号通路(GO:0030522)、PPAR信号通路(hsa03320)、化学致癌-受体激活(hsa05207)和癌症通路(hsa05200)。根据PPI分析,EGFR可能是银屑病治疗的关键靶点。本研究初步揭示了地黄-紫草药对在银屑病治疗中的多成分、多靶点和多途径机制,为深入研究该药对在银屑病治疗中的机制提供了理论依据。