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关键词： 尿石素A   结肠癌   网络药理学   分子对接   信号通路   表皮生长因子受体   胱天蛋白酶3   雌激素受体1  

摘要： 目的 通过网络药理学及分子对接探究尿石素A治疗结肠癌的主要生物过程和信号通路,阐明其作用机制。方法 通过SwissTargetPrediction、Targets SUP-PRED和Cbligand等数据库预测尿石素A药物潜在作用靶点,检索DisGeNET、OMIM、GeneCards等数据库获得结肠癌相疾病靶点;通过Venn图获得相关交集靶点。运用STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用(PPI)网络;使用Cytoscape软件对STRING数据库筛选的靶点进行网络拓扑分析筛选关键靶点;运用David数据库对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,最后通过分子对接明确尿石素A治疗结肠癌的作用机制。结果 预测得到尿石素A靶点260个,筛选、去重得到结肠癌疾病靶点3 289个,最后得到交集靶点106个。核心靶点21个,得到蛋白激酶B1(Akt1)、表皮生长因子受体(EGFR)、胱天蛋白酶3(CASP3)、雌激素受体1(ESR1)、环加氧酶2(PTGS2)等10个核心靶点。GO和KEGG分析表示,尿石素A可能通过癌症通路、癌症相关蛋白聚糖通路等治疗结肠癌的作用。分子对接结果显示尿石素A与核心靶点对接结合能均小于-6.9 kcal/mol。结论 尿石素A可通过多靶点和多通路的途径发挥治疗结肠癌的功效。

关键词： 李氏接骨散   骨折   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学方法预测李氏接骨散治疗骨折的作用机制,并通过动物实验进行验证。方法:通过中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)、文献报道以及Swiss Target Prediction筛选李氏接骨散主要活性成分及靶点,利用GeneCards数据库收集骨折靶点,再使用String数据库和Cystoscope 3.7.2软件构建蛋白相互作用(PPI)网络,同时筛选核心靶点,建立“李氏接骨散–活性成分–骨折–靶点”网络,并对潜在核心靶点进行基因本体(geneontology, GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析。最后通过动物实验对李氏接骨散治疗骨折进行疗效分析,对部分靶点进行验证。结果:共筛选获得李氏接骨散活性成分20个及其相应靶点514个,骨折靶点5264个,两者交集靶点306个。李氏接骨散治疗骨折潜在核心靶点包括肿瘤蛋白p53 (TP53)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶AKT (AKT1)、激活蛋白1 (JUN)、白介素6 (IL6)、表皮生长因子受体(EGFR)、肿瘤坏死因子(TNF)等。通路富集分析中与李氏接骨散治疗骨折密切相关的通路主要涉及癌症中的通路(Pathways in cancer)、血脂与动脉粥样硬化(Lipid and atherosclerosis)、化学致癌作用-受体活化(Chemical carcinogenesis-receptor activation)、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、MAPK信号通路(MAPK signaling pathway)、小细胞肺癌(Small cell lung cancer)。结论:该研究以网络药理学分析李氏接骨散治疗骨折的作用机制,为李氏接骨散在临床治疗骨折研究提供了初步依据。Objective: This study explores the mechanism of Li’s Jiegu San in treating fractures using network pharmacology validated by animal experiments. Methods: The research identified the main active components and targets of Li’s Jiegu San through the Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP), literature reports, and Swiss Target Prediction. Fracture-related targets were collected from the GeneCards database. Using the String database and Cytoscape 3.7.2 software, we constructed a protein-protein interaction (PPI) network and identified core targets. The study then established a “Li’s Jiegu San-Active Components-Fracture-Targets” network, performing Gene Ontology (GO) functional enrichment analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis on the potential core targets. Animal experiments further assessed the therapeutic effects of Li’s Jiegu San on fractures with validation of specific targets. Results: The study identified 20 active components of Li’s Jiegu San and 514 corresponding targets. Additionally, 5264 fracture-related targets were collected, wi

关键词： 喹诺酮   抗菌药物   临床合理用药  

摘要： 观察喹诺酮类抗菌药物的药理作用和临床合理应用。方法 选取我院收治的使用喹诺酮类抗菌药物进行治疗的患者共80例作为研究对象,以随机数字表法分为观察组及对照组,对照组应用常规措施用药治疗,观察组应用药学服务制定临床合理用药措施干预,对比两组的血清炎症因子水平、不合理用药现象和不良反应。结果 观察组的血清炎症因子水平降低程度大于对照组(P<0.05),观察组临床不合理用药现象显著低于对照组(P<0.05),观察组不良反应发生率低于对照组(P<0.05)。结论 喹诺酮类抗菌药物具有较强的抗菌效果,且抗菌谱广,在应用过程中可显著减轻患者的炎症反应,有助于降低不良反应发生率。

关键词： 复方丹参滴丸   骨关节炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接方法预测复方丹参滴丸(CDDP)治疗骨关节炎(OA)的作用机制。方法利用TCMSP数据库筛选CDDP主要化合物及靶点信息;查询GeneCards、OMIM、DisGenet数据库搜集OA相关蛋白靶点;利用Venn在线工具构建药物和疾病共同靶点;利用String 11.0平台构建蛋白质相互作用网络;采用Cytoscape 3.9.1软件构建药物-成分-靶点-疾病网络;使用R包clusterProfiler进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用AutoDock Vina进行分子对接。结果CDDP与OA交集靶点有44个,KEGG通路富集发现,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B及白细胞介素-17信号通路等与药物作用通路相关;分子对接显示槲皮素、芹菜素和木犀草素与11个核心靶点结合良好,尤其槲皮素与金属蛋白酶9。结论CDDP可能通过多成分、多靶点、多通路共同发挥抗OA的作用.

关键词： 川楝子   网络药理学   急性髓细胞性白血病  

摘要： 目的基于网络药理学及生物信息方法,分析川楝子治疗急性髓细胞性白血病(AML)的可能作用靶点与分子机制。方法通过TCMSP、Drugbank、Uniprot、SwissTargetPrediction等数据库分别获取川楝子与AML的相关靶点,经韦恩分析获取川楝子作用于AML的潜在靶点,并结合KEGG和GO分析,探讨川楝子发挥抗AML的作用机制;基于STRING数据库构建蛋白互作网络图,筛选其核心作用基因,采用分子对接技术分析小分子药物与疾病核心靶点的作用方式,并通过GEPIA数据库分析与患者预后密切相关的蛋白。结果网络药理学分析发现,川楝子可能通过作用于185个蛋白发挥抗AML的作用;GO分析和KEGG通路富集分析提示,川楝子通过影响细胞凋亡等生物过程,以及调控PI3K-Akt和MAPK等信号通路,影响AML的发生和发展;川楝子的有效成分与6个核心蛋白靶点均具有一定的结合活性,靶向作用于这些核心蛋白靶点可发挥抗AML的作用;GEPIA数据库分析发现人原癌基因酪氨酸蛋白激酶(proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src,SRC)基因的表达与AML患者的预后密切相关,低表达SRC的患者预后较好,可能是川楝子抗AML的潜在作用靶点之一。结论川楝子中的有效成分可通过调控多靶点蛋白影响细胞凋亡,调控PI3K-Akt、MAPK信号分子等多种途径发挥抗AML的作用,SRC可能成为川楝子改善AML预后的潜在作用靶点之一。

关键词： 华蟾素注射液   结直肠癌   网络药理学   伪异沙蟾毒精   蟾毒它灵   PI3K/Akt/mTOR信号通路  

摘要： 采用网络药理学、分子对接技术和细胞实验探究华蟾素注射液(Huachansu Injection,HCSI)抗结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的作用机制。课题组前期采用LC-MS/MS检测HCSI中16种蟾蜍内酯类成分的含量,以大于10 ng·mL-1为标准,筛选出10种蟾蜍内酯类成分,通过SwissTargetPrediction数据库收集其潜在作用靶点;利用GeneCards、OMIM、TTD、PharmGKB数据库预测CRC相关靶点,通过Venny获得HCSI治疗CRC的交集靶点,并使用Cytoscape软件构建“活性成分-靶点-疾病”网络及靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,根据度值筛选关键靶点;对关键靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,并通过AutoDock软件对主要蟾蜍内酯活性成分和关键靶点进行分子对接;检测不同浓度的HCSI、伪异沙蟾毒精(psi-bufarenogin,BUF)和蟾毒它灵(bufotalin,BFT)对结直肠癌HCT116细胞的细胞活力、迁移能力和凋亡率的影响,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测HCT116细胞PI3K/Akt/mTOR信号通路相关蛋白的表达。筛选出HCSI的主要活性成分沙蟾毒精(arenobufagin)、BUF和BFT等8种,HCSI抗CRC的关键靶点EGFR、IL6和mTOR等20个,结合KEGG通路富集分析和分子对接结果,选择PI3K/Akt/mTOR信号通路进行验证。细胞实验结果表明,HCSI、BUF和BFT对HCT116细胞的增殖能力和迁移能力具有显著抑制作用,可诱导HCT116细胞凋亡,下调PI3K/Akt/mTOR通路相关蛋白表达,说明HCSI、BUF和BFT可通过mTOR和PIK3CA等靶点调控PI3K/Akt/mTOR信号通路,发挥抗CRC的作用。该研究为探究HCSI的抗肿瘤活性成分和作用机制提供理论依据。

关键词： 六味地黄丸   四妙丸   股骨头坏死   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨六味地黄丸合四妙丸治疗股骨头坏死的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出六味地黄丸合四妙丸的活性成分;利用UniProt数据库预测活性成分作用靶点,通过GeneCards和OMIM数据库预测股骨头坏死疾病靶点。通过STRING数据库构建潜在作用靶点和蛋白质-蛋白质相互作用网络并通过Cytoscape 3.10.1软件筛选出关键靶点。通过DAVID工具进行潜在靶点的基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:六味地黄丸合四妙丸治疗股骨头坏死的有效成分主要为槲皮素、汉黄芩素、山柰酚;作用的核心靶点为白细胞介素(Interleukin,IL)-6、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、IL-1B、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3(Caspase-3,CASP3)、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)、雌激素受体1(Estrogen Receptor 1,ESR1)、基质金属蛋白酶(Matrix Metallopeptidase,MMP)9、缺氧诱导因子-1A(Hypoxia Inducible Factor-1A,HIF-1A)、过氧化物酶体增殖物激活受体重组蛋白(Peroxisome Proliferator Activated Receptor,PPAR)γ等。关键作用通路为晚期糖基化终末产物-受体(Advanced Glycation End-Products,AGE-RAGE)信号通路、IL-17信号通路、脂质与动脉粥样硬化通路、癌症信号通路等。分子对接显示核心成分与核心靶点有较好的结合活性。结论:本研究初步揭示了六味地黄丸合四妙丸的核心活性成分及其多成分、多靶点、多通路治疗股骨头坏死的作用机制,为临床上股骨头坏死保髋治疗提供用药思路和依据。

关键词： 山奈酚   阿尔茨海默病   钙信号通路   网络药理学   分子对接   细胞凋亡  

摘要： 目的 基于网络药理学和细胞实验探讨山奈酚治疗阿尔茨海默症的作用机制。方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取山奈酚相关靶点,基因表达综合数据库(GEO)获取阿尔茨海默病(GSE5281)的差异表达基因。使用DAVID数据库进行两者交集靶点的基因本体(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过Autodock Vina实现分子对接。将SH-SY5Y细胞分为对照组、Aβ组和山奈酚组。对照组未经任何处理,Aβ组使用10μmol/L Aβ1-42干预处理,山奈酚组使用10μmol/Aβ1-42处理后再使用10μmol/L山奈酚干预处理。AnnexinⅤ-PI双染色法检测细胞凋亡,实时定量PCR和Western blot检测细胞中钙调蛋白1(CALM1)、毒蕈碱型乙酰胆碱受体M1(CHRM1)和蛋白磷酸酶3催化亚基α(PPP3CA)的表达水平。结果 共得到山奈酚相关靶点60个,阿尔茨海默病差异表达基因2 155个,山奈酚治疗阿尔茨海默病的潜在作用靶点6个。山奈酚治疗阿尔茨海默病潜在作用靶点的GO功能富集分析主要涉及磷蛋白磷酸酶活性的正向调节,突触后膜电位的调节,对钙离子的反应和G蛋白偶联受体信号通路的生物过程。KEGG通路富集分析主要包括钙信号通路,阿尔茨海默病和神经退行性疾病等。分子对接结果显示,山奈酚与CHRM1,CALM1和PPP3CA的结合能均<-5.0 kcal/mol。与对照组相比,Aβ组细胞凋亡增加(P<0.05);与Aβ组相比,山奈酚组细胞凋亡减少(P<0.05)。与Aβ组相比,山奈酚组细胞中CHRM1,CALM1和PPP3CA的mRNA和蛋白表达显著上调(P<0.05)。结论 山奈酚可能通过调节钙信号通路中的关键基因(CHRM1,CALM1和PPP3CA)改善SH-SY5Y细胞凋亡,从而发挥治疗阿尔茨海默病的作用。

关键词： 结肠癌   蚕茧   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学及分子对接模拟法,探索中药蚕茧治疗结肠癌的可能作用机制。方法检索相关文献,得到蚕茧中的主要化学成分,筛选出药物有效成分并预测其作用靶点,构建蚕茧成分-靶点网络图。通过检索得到结肠癌疾病靶点,进行蛋白互作网络(PPI)分析,筛选出药物-疾病交集靶点,作交集靶点基因图。行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,作相关图行可视化处理。最后对关键化合物和基因进行分子对接模拟,得到其对接结合能。结果本研究共得到蚕茧药物成分18种,预测靶点128个;结肠癌相关靶点1453个,药物-疾病共同靶点19个。通过PPI分析,得出7个关键作用靶点基因。分子对接结果提示,关键化合物和靶点基因具有良好亲和力。结论蚕茧治疗结肠癌可通过多靶点、多通路发挥作用。

关键词： Traditional Chinese medicine   Quality markers   Huo-Luo-San   Network pharmacology   Chemometrics  

摘要： Traditional Chinese medicine(TCM)has garnered significant global interest owing to its multi-component and multi-target theoretical framework and extensive therapeutic ***,the identification of quality markers(Q-markers)remains a formidable challenge in ***,this study aimed to integrate network pharmacology and chemometrics to identify Q-markers in Chinese patent medicine,with a focus on Huo-Luo-San(HLS)as a case ***,a widely used powdered Chinese patent medicine in China,comprises a complex formula of 10 herbs,initially formulated during the Qing dynasty for treating ***,13 components,chlorogenic acid,typhaneoside,isorhamnetin-3-O-neohesperidoside,cynaroside,notoginsenoside R_1,ginsenoside Rg_1,baicalin,berberine hydrochloride,ginsenoside Rb_1,dehydrocostus lactone,dioscin,imperatorin,and costunolide,were selected as phytochemical markers for each herb based on the Chinese Pharmacopoeia(2020 version),forming the“Herbs-Compounds-targets”network of HLS using network ***,employing network pharmacology,the 13 HLS components were quantified using *** conditions were optimized on a Waters Cortecs C_(18)column(2.1 mm×100 mm,1.6μm)with a gradient elution comprising 0.1%formic acid in water and *** detection was performed in the multiple-reaction monitoring mode,and the method underwent validation for linearity,detection limit,precision,repeatability,stability,and *** validated method was then utilized to analyze the 13 components in 15 batches of HLS *** techniques,including hierarchical cluster analysis,principal component analysis,orthogonal partial least squares projection discriminant analysis,and box map analyses,were subsequently employed to identify the ***,six components,baicalin,notoginsenoside R_1,berberine hydrochloride,dioscin,imperatorin,and chlorogenic acid,were selected as Q-markers for *** integration of netwo