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关键词： 心脉舒一号口服液   心脏病   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的探讨心脉舒一号口服液治疗心脏病的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取生地黄、天冬、麦冬、酸枣仁、柏子仁、丹参、当归、太子参、茯苓、白芍、五味子11味中药材的活性成分,并进行蛋白质靶点预测;通过GeneCards数据库获取心脏病的相关疾病靶点,通过Venny 2.1.0平台筛选出心脉舒一号口服液活性成分与心脏病的共有靶点;通过Cytoscape 3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点网络图及活性成分-疾病靶点网络图,并分析其核心成分;通过String 11.0数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,经Cytoscape 3.9.1软件筛选出关键靶点及核心靶点;通过Metascape数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析及基因生物过程(GO)功能分析;对核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果共收集到活性成分169种,关键靶点37个,疾病靶点1097个,活性成分-疾病共有靶点197个。核心成分为槲皮素、木犀草素、熊果酸,核心靶点为环氧合酶2(PTGS2)、钠电压门控通道α亚基5(SCN5A)、溶质载体家族6成员2(SLC6A2)。共获得KEGG信号通路17条,主要涉及蛋白解旋酶癌、人类巨细胞病毒感染、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物多配体受体(AGE-RAGE)信号通路等;GO功能分析条目1205条,包括生物学过程(BP)944条、分子功能(MF)146条和细胞组分(CC)115条,主要涉及正调控血管内皮细胞迁移、老化、炎性反应、转录阳性调控-DNA模板化、基因表达的负调控、正调控细胞增殖等。分子对接结果显示,核心成分与其核心靶点均有较好的结合活性。结论心脉舒一号口服液可通过多成分、多靶点、多通路治疗心脏病。

关键词： 扁瘊   扁平疣   紫兰方   网络药理学  

摘要： 目的 基于网络药理学的方法探讨紫兰方治疗扁平疣的作用机制。方法 通过TCMSP检索紫兰方中所含中药的主要化学成分,并收集其相对应靶点;通过GeneCards数据库获得与扁平疣相关的疾病靶点;构建PPI网络。利用Bio-conductor数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果 根据筛选条件获得药物靶点238个,获得疾病靶点437个,核心靶标62个;PPI蛋白作用网络分析,核心蛋白涉及细胞肿瘤抗原p53(TP53)、Rac-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1);GO功能富集分析发现主要参与了T细胞活化、上皮细胞增殖;KEGG通路主要涉及人乳头状瘤病毒感染、NF-κB信号通路等。结论 紫兰方治疗扁平疣是多成分、多靶点、多途径的,为进一步研究其作用机制提供依据。

关键词： 姜黄素   胃癌   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 通过网络药理学和分子对接技术探讨姜黄素治疗胃癌的作用机制。姜黄素靶点通过Super Pred与Swiss Target Prediction数据库进行筛选,胃癌作用靶点通过Dis GeNET、Therapeutic Target Database和Gene Cards数据库进行筛选,将姜黄素靶点与胃癌靶点取交集,上传至STRING数据库中构建PPI网络,利用Metascape数据库对核心靶点进行GO和KEGG富集分析,明确其可能的治疗机制。利用TCMSP和PDB数据库获取姜黄素的三维分子结构及核心靶点的三维晶体结构,采用分子对接技术进行对接验证。结果显示,筛选出姜黄素的作用靶点149个,胃癌作用靶点1447个,取交集得到的姜黄素治疗胃癌的核心靶点69个。经过GO及KEGG通路分析,姜黄素通过PI3K/AKT和HIF-1等信号通路对胃癌发挥治疗作用。研究结果表明,姜黄素可能通过AKT1、EGFR、STAT3、HIF1A、EP300等核心靶点以及PI3K/AKT和HIF-1等信号通路对胃癌发挥治疗作用。本研究初步探索了姜黄素治疗胃癌所涉及的相关靶点及通路,为进一步临床实验研究提供了理论依据。

关键词： 网络药理学   柴胡-黄芩   功能性消化不良   抑郁症   作用机制  

摘要： 目的运用网络药理学方法探讨柴胡-黄芩“异病同治”功能性消化不良和抑郁症的作用机制。方法通过TCMSP数据库和SuperPred数据库获取柴胡-黄芩的活性化合物和作用靶点,通过GeneCards数据库和OMIM数据库获取功能性消化不良和抑郁症的靶点,同时得到柴胡-黄芩异病同治的共同靶点。通过Cytoscape 3.9.1软件和String数据库构建“药对-活性成分-共同靶点”网络、蛋白互作网络,找出关键靶点和核心成分;对共有靶点进行GO和KEGG通路富集分析,运用Autodock软件进行分子对接验证。结果筛选出柴胡-黄芩53个化学成分,其治疗两种疾病共有靶点93个,获得2091条GO功能条目和135条KEGG通路,包括HIF-1、内分泌抵抗等通路;最后,分子对接结果表明关键活性成分与核心靶点之间具有很强的亲和力。结论柴胡-黄芩可能是通过调节炎症反应、改善胃肠功能发挥“异病同治”作用。

关键词： 霍山石斛   化学成分   药理作用   质量标志物  

摘要： 霍山石斛位于“九大仙草”之首,具有益胃生津、滋阴清热等功效,现代药理学研究表明霍山石斛具有抗肿瘤、降血糖、抗炎、保肝等多种作用。随着研究的深入,其化学成分、药理作用等方面备受关注,该文对霍山石斛的化学成分、药理作用进行综述,并根据中药质量标志物(Q-marker)的概念,从植物亲缘与溯源、成分与药效关联、成分可测性以及栽培模式等多方面对霍山石斛的质量标志物进行预测分析,为霍山石斛的资源开发及质量控制提供科学的选择依据。

关键词： 石斛酚   奥沙利铂   肝损伤   网络药理学   分子对接  

摘要： 应用网络药理学和分子对接技术探讨石斛酚对奥沙利铂(oxaliplatin,OXA)化疗致药物性肝损伤(Drug-inducedliverinjury,DILI)的潜在治疗机制。方法 利用Genecards和OMIM数据库获取与OXA化疗致DILI相关的靶点,并借助Pubchem、Similarityensembleapproach、SwissTargetPrediction数据库预测石斛酚的作用靶点。通过韦恩图筛选出了石斛酚与OXA化疗致DILI的交集靶点,并将其输入STRING数据库进行PPI蛋白质互作网络分析,随后利用Cytoscape软件筛选出了核心靶点。应用DAVID数据库进行了GO与KEGG富集分析。最后,使用Chem3D、AutoDockTools以及Pymol软件对石斛酚及其核心靶点进行了分子对接验证。结果 通过筛选得到OXA致DILI靶点1512个,石斛酚作用靶点128个,石斛治疗OXA化疗致DILI靶点34个。GO和KEGG富集分析结果涉及调控细胞生长、增殖、分化和抗凋亡的相关通路,包括PI3K-Akt、MAPK、Ras和ErbB等信号通路。PPI蛋白网络互作分析获得HSP90AA1、HSP90AB1、ERBB2等10个核心靶点。分子对接结果显示石斛酚与核心靶蛋白之间存在良好的结合活性。结论 石斛酚对OXA化疗致DILI具有潜在护肝作用,石斛酚可能通过多靶点、多途径治疗OXA化疗致DILI。

关键词： 天然萜类木脂素   植物来源   结构类型   药理作用  

摘要： 萜类木脂素是自然界中一类由萜与木脂素骈合而成的天然化学成分,主要来源于木兰科木兰属和芸香科花椒属植物,按照结构特征主要可分为半萜木脂素、单萜木脂素、倍半萜木脂素三种类型。现代研究发现,萜类木脂素具有神经保护、抗肿瘤、抗炎、抗2型糖尿病、抗菌、抗氧化和杀虫等药理作用。本文对天然萜类木脂素的植物来源、结构类型以及药理作用进行了系统综述,以期为该类成分的进一步研究开发提供有益参考。

关键词： 黄连   厚朴   幽门螺杆菌感染   网络药理学   体外抑菌   动物实验  

摘要： 目的 基于网络药理学及实验验证的方法探究黄连-厚朴药对抗幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染的作用机制。方法利用TCMSP数据库筛选出黄连、厚朴的主要活性成分以及作用靶点,通过Drugbank、 Genecards、DisGeNET数据库筛选出Hp感染的相关靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-潜在靶点网络图。利用String数据库构建蛋白互作网络,筛选出核心靶点。借助Metascape数据库对交集靶点进行GO和KEGG的富集分析。通过Autodock Vina 1.1.2软件对黄连-厚朴药对的主要活性成分和对应的关键靶点进行分子对接。最后通过体外抑菌试验验证黄连-厚朴的抑菌效力,动物实验采用ELISA及Western blotting对大鼠胃黏膜相关炎症因子及蛋白进行验证。结果 黄连和厚朴主要活性成分23种,作用靶点185个,与疾病交集靶点73个,核心成分为槲皮素、小檗碱、厚朴酚、和厚朴酚等,核心作用靶点为TP53、IL-6、VEGFA、TNF、AKT1。富集分析结果显示黄连-厚朴药对抗Hp感染主要涉及TNF信号通路、IL-17信号通路、Toll样受体信号通路、C型凝集素受体信号通路。分子对接显示,槲皮素、小檗碱、厚朴酚、和厚朴酚与核心靶点TP53、IL-6、VEGFA、TNF、AKT1均具有较好的结合活性。体外抑菌试验发现黄连-厚朴药对的抑菌圈与克拉霉素相近,最小抑菌浓度为31.3 mg·mL^(-1),其具有较强的体外抑菌效果;动物实验结果显示,与模型组相比,黄连-厚朴组血清中IL-1β、IL-6、TNF-α的含量显著下降(P<0.05或P<0.01),同时黄连-厚朴组中P53、AKT1、TNF-α蛋白表达均明显下降趋势(P<0.05)。结论 本研究证实了黄连-厚朴药对抗Hp感染多成分、多靶点、多途径的作用机制,主要是通过抑制细菌生长、参与炎症反应、细胞迁移和增殖等途径来发挥其效用,为黄连-厚朴药对抗Hp感染的机制研究提供依据。

关键词： 益肾强骨合剂   骨质疏松症   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨益肾强骨合剂治疗肾阳虚型骨质疏松症(OP)的作用机制。方法:利用DrugBank等数据库,检索OP相关靶点,通过中药系统药理学与分析平台(TCMSP)等数据库,挖掘益肾强骨合剂药物活性成分及作用靶点。获取药物-疾病交集靶点后,构建蛋白质互作(PPI)网络,对交集靶点进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)、基因本体(GO)富集分析,并将富集结果进行可视化处理。根据PPI网络的Degree值,筛选出关键成分和靶点,进行分子对接和分子动力学模拟。结果:益肾强骨合剂的活性化合物包括槲皮素、豆固醇、叶黄素、山奈酚等,药物与OP交集靶点149个。通过PPI分析,得到益肾强骨合剂治疗OP的核心靶点,包括苏氨酸激酶1(AKT1)、白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子(TNF)、肿瘤蛋白53(TP53)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、基质金属蛋白酶9(MMP9)及雌激素受体1(ESR1)等。KEGG信号通路富集主要包括缺氧诱导因子1(HIF-1)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等。GO富集分析中的生物过程主要包括RNA聚合酶Ⅱ的正向调节、细胞增殖的正向调节等。通过分子对接及分子动力学模拟发现,MMP9-槲皮素复合物最稳定,其次是ESR1-豆固醇、AKT1-叶黄素及AKT1-山奈酚。结论:益肾强骨合剂中有效成分槲皮素、豆固醇、叶黄素、山奈酚等作用于AKT1、IL-1β、TNF、TP53等关键靶点,发挥治疗肾阳虚型OP的作用。

关键词： 三阴性乳腺癌   西黄解毒胶囊   网络药理学   机制   细胞   动物  

摘要： 目的通过网络药理学的方法探索西黄解毒胶囊抗三阴性乳腺癌(TNBC)的机制,并通过体内和体外实验进行验证。方法通过检索中草药系统药理学平台(TCMSP)数据库和查阅文献,获得西黄解毒胶囊中所含药物的有效活性成分,并在靶点筛选栏和SwissTargetPrediction数据库筛选活性成分对应的人类基因靶点。将药物靶点与在GEO数据库(GSE38959)中获得的TNBC差异表达基因相映射取交集,获得西黄解毒胶囊治疗TNBC的靶点,将交集靶点导入String在线数据库构建PPI网络,根据度值筛选西黄解毒胶囊治疗TNBC的核心靶点,在DAVID数据库对西黄解毒胶囊治疗TNBC的核心靶点进行GO和KEGG富集分析,以探索西黄解毒胶囊治疗TNBC的可能机制。在体内和体外分别采用蛋白免疫印迹和荧光定量PCR实验检测信号通路上关键信号分子的表达情况。结果网络药理学部分获得西黄解毒胶囊抗TNBC的核心靶点有HIF1A、VEGFA等,生物过程主要涉及信号转导、转录调控、增殖调节等,参与的信号通路主要有癌症信号通路、PI3K-Akt信号通路、NF-κB信号通路等。实验部分发现西黄解毒胶囊能抑制4T1细胞和移植瘤中EGFR、AKT(pan)、p-AKT(Ser473)、NF-κBp65、p-NF-κBp65、PI3Kp85、PI3Kp110α蛋白的表达,基因层面荧光定量PCR试验得出一致得结果。结论西黄解毒胶囊可能通过抑制PI3K/AKT/NF-κB信号通路发挥抗TNBC的作用。