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关键词： 泮托拉唑   肺癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学、分子对接方法探索泮托拉唑治疗肺癌的关键靶点及分子作用机制。方法通过Swiss TargetPrediction数据库预测泮托拉唑治疗肺癌的作用靶点,采用GeneCards、OMIM等数据库搜索肺癌的相关靶点,取2者的交集靶点获得潜在靶点;应用STRING数据库找出靶点的作用关系,使用Cytoscape3.10.0软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络并筛选核心靶点。利用DAVID网站进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,利用AutoDock软件进行分子对接。结果获得105个泮托拉唑的作用靶点、2180个肺癌相关靶点,两者取交集后共得到41个泮托拉唑治疗肺癌的作用靶点。在PPI网络中,EGFR、ERBB2、PIK3CA、MMP9等13个靶点处于核心位置。GO富集分析和KEGG通路分析显示,泮托拉唑调控的核心靶点与细胞信号通路激活、肿瘤进展、肿瘤耐药等机制密切相关;分子对接结果显示,泮托拉唑与核心靶点均有较强的相互作用。结论泮托拉唑可能通过EGFR、ERBB2、PIK3CA、MMP9等靶点及多条信号通路治疗肺癌。

关键词： 类风湿性关节炎   雷公藤多苷   甲胺蝶呤   网络药理学   机器学习  

摘要： 目的:本研究旨在通过网络药理学和机器学习方法,探讨雷公藤多苷联合甲氨蝶呤治疗类风湿性关节炎的潜在机制,旨在揭示其协同作用及分子基础。方法:本研究利用CTD数据库(http://***/)检索甲氨蝶呤和雷公藤多苷的主要成分,识别相关靶基因。随后,通过分析GEO数据库(https://***/geo/)中的类风湿性关节炎数据集,确定差异表达基因,并通过韦恩图识别药物与疾病的共享基因。利用机器学习算法筛选核心共享基因,并通过临床样本验证其作用。该方法结合网络药理学与机器学习,提供了系统的分析框架。结果:通过系统性分析和机器学习方法,我们确定了IGFBP4和CASP7是雷公藤多苷联合甲氨蝶呤治疗类风湿性关节炎的潜在靶点。临床实验显示,治疗24周后,患者IGFBP4上调和CASP7下调的失调状态得到改善,且DS28指数显著下降。这表明,雷公藤多苷联合甲氨蝶呤可能通过调控IGFBP4和CASP7的表达,降低类风湿性关节炎的严重程度。结论:本研究通过系统性分析和机器学习揭示了雷公藤多苷和甲氨蝶呤在类风湿性关节炎治疗中的分子机制,并确定了新的潜在治疗靶点,为个体化治疗策略提供了科学依据,具有重要的临床应用价值。

关键词： 防风   疫病   药理学   防治作用  

摘要： 防风,药性辛、甘,微温,具有养护正气、解表、祛风胜湿之效,临床广泛应用于预防疫病的滋生及治疗寒疫、风疫、湿疫等症,具有良好的防治效果。近年来,随着对防风药理作用的研究逐渐深入,发现该药材具有解热、镇痛、抗炎抗菌、调节免疫等多重作用。通过对疫病治疗理论、防风性味及功效溯源、治疫作用和现代药理学研究等方面进行回顾与分析,以期为防风的开发运用提供参考。

关键词： 荆芥   防风   支气管哮喘   网络药理学   分子对接  

摘要： 本研究旨在通过网络药理学和分子对接方法,探讨荆芥-防风药对在治疗支气管哮喘中的功效,以期为其在实际医疗中的使用提供参考。 方法 利用TCMSP数据库查找药对的化学成分和药物靶点,并通过GeneCards、OMIM、DisGeNET等数据库来筛选哮喘治疗相关靶点,构建韦恩图,从而找出药物与疾病的交集靶点。使用Cytoscape3.7.2 软件构建“靶点-成分”网络,并利用STRING数据库对PPI 蛋白互作网络进行分析,筛选出关键的有效活性成分和核心靶蛋白,通过 R 语言程序对交集靶点进行 GO 及 KEGG 通路富集分析,最后利用AutoDock- Tools-1.5.6软件进行分子对接试验。结果 荆芥-防风药对主要的有效成分包括槲皮素、木犀草素、汉黄芩素、β-谷甾醇、豆甾醇等;其主要作用于TP53、AKT1、ESR1、IL6等关键靶蛋白。GO 与 KEGG 通路富集分析表明,药对主要通过调节 PI3K-Akt信号通路、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的应用、脂质与动脉粥样硬化、人巨细胞病毒感染以及MAPK信号通路等,对支气管哮喘起到治疗效果。主要活性成分与核心靶点分子对接结果表明吻合度较高。结论 荆芥-防风药对治疗支气管哮喘涉及多个信号通路及生物学过程,达到调控炎症同通路、调节免疫、抗氧化的作用,从而干预支气管哮喘,对后续药物的研究和应用提供了依据。

关键词： 黄芪仙灵脾汤   IgA肾病   网络药理学   分子对接技术   王永钧   国医大师  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接方法探究黄芪仙灵脾汤治疗免疫球蛋白A(IgA)肾病的作用机制。方法:在TCMSP数据库中收集黄芪仙灵脾汤各中药的活性成分及其蛋白作用靶点,通过UniProt数据库转化为基因靶点;在GeneCards、OMIM数据库中获取IgA肾病相关靶点;将黄芪仙灵脾汤与IgA肾病的交集基因,利用Cytoscape软件进行药物-成分-靶点网络构建及分析,筛选核心靶点及主要活性成分;通过STRING数据库获取蛋白相互作用(PPI)网络关系数据,用Cytoscape软件绘制出PPI网络图并进行网络拓扑学分析;通过R语言对核心靶点进行基因本体(GO)分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,筛选出具有显著性差异的的生物学过程及信号通路,并构建靶点-信号通路网络;最后通过AutoDockTools软件,对重要的化学成分和靶点分子进行分子对接。结果:获得黄芪仙灵脾汤药物靶点与IgA肾病靶点的交集共63个。槲皮素、山柰酚、木犀草素等是黄芪仙灵脾汤的主要活性成分,白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-1β(IL-1β)等是其关键靶点,在糖尿病并发症中的作用(AGE−RAGE signaling pathway in diabetic complications)、流体剪切应力和动脉粥样硬化(fluid shear stress and atherosclerosis)、脂质和动脉粥样硬化(lipid and atherosclero⁃sis)等是关键通路。关键活性成分与关键靶点的对接亲和力介于-8.4~-7.0 kcal/mol。结论:本研究初步验证了黄芪仙灵脾汤治疗IgA肾病的药理学作用机制,揭示黄芪仙灵脾汤治疗IgA肾病具有多成分、多靶点的作用特点。

关键词： 山奈素   药理作用   吸收   纳米制剂  

摘要： 山奈素是一种具有多种生物活性和药理作用的天然产物,已被广泛应用于炎症性肠病、动脉粥样硬化、糖尿病、恶性肿瘤、骨关节炎和神经退行性疾病等的治疗研究。但因水溶性小、生物利用度低、化学稳定性差等缺点限制了山奈素的临床应用。包括无机纳米粒、聚合物纳米粒、脂质纳米粒等的纳米递送载体,已经成为提高山奈素药理活性、靶向性以及生物利用度的有效方法,为临床相关疾病的治疗提供了更优质的选择。本文将归纳总结山奈素及其纳米制剂的应用及疗效,以期为山奈素的临床转化奠定理论与技术基础。

关键词： 泽兰   泽泻   心力衰竭   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的采用网络药理学和分子对接探讨泽兰能否替代泽泻治疗心力衰竭。方法利用TCMSP筛选泽兰及泽泻有效成分, 通过SwissTargetPrediction数据库预测有效成分潜在靶点。通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库收集心力衰竭相关靶点, 利用Venny 2.1.0构建泽兰/泽泻与心力衰竭的交集靶点韦恩图, 用STRING数据库构建交集靶点PPI网络, Cytoscape 3.9.1软件筛选得到泽兰/泽泻治疗心力衰竭的关键靶点, 并构建"成分-交集靶点"网络。使用Metascape对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。采用分子对接技术评价活性成分与关键靶点的亲和力。结果泽兰主要作用于HMGCR、CYP27B1等关键靶点, 而泽泻作用靶点更为广泛, 如PPARA、JAK2等。两者共有关键靶点包括HMGCR、ESR1等, 主要参与胆固醇合成、类固醇激素合成等生物学机制。富集通路分析显示, 两者在类固醇代谢等方面具有共性, 而泽泻更倾向通过调节蛋白磷酸化、调控PI3K-Akt信号通路等治疗心力衰竭, 泽兰治疗心力衰竭特有靶点CHRM4, 显示出泽兰治疗心力衰竭的特有机制可能为调节血压、心肌保护等。结论泽兰和泽泻在心力衰竭治疗中具有一定共性, 但泽泻作用于更多靶点和信号通路, 因此可能具有更广泛的药效。鉴于泽泻的肾毒性, 建议治疗心力衰竭合并肾功能不全、早期心力衰竭方面可考虑以泽兰替代泽泻。

关键词： 山药   糖尿病   活性靶点   虚拟筛选   药效学试验  

摘要： 运用虚拟筛选和分子对接方法筛选出山药治疗糖尿病的活性成分并进行药效学试验验证,揭示山药药效物质基础。把山药中所含已知的12种化学成分构建为分子库,与根据其功效确定的各作用靶点模型进行虚拟对接,再考查筛选出的多靶点活性成分对四氧嘧啶糖尿病动物模型的影响。结果表明,①对11β-羟基类固醇脱氢酶(11β-HSD1)、环氧合酶(PTGS2)、丝氨酸蛋白酶(PRSS1)有理论活性的成分远多于其他靶点;②部分成分对多个靶点均显示较强的理论活性;③药效学试验结果表明,虚拟筛选所确定的活性成分中薯蓣皂苷元(Diosgenin)、豆甾醇(Stigmasterol)、菜油甾醇(Brassinosteroids)、熊果苷对硝酸四氧嘧啶糖尿病动物模型有明显影响。为阐释食药同源物质药效物质基础提供了新的视角和快捷途径。

关键词： 槐角苷   药理作用   临床应用  

摘要： 槐角苷是中国传统中草药槐角中含量最多的异黄酮苷,也是槐角发挥各种临床作用的基础物质,具有多种药理活性,有良好的药用价值。文章对其抗生育,抗过敏,抗炎症,抗心肌肥厚,调节脂肪生成等药理作用及药动学研究进行阐明,以期可以为针对槐角苷的后续实验提供一个参考,并对其开发前景进行了展望,以期对其开发利用提供参考依据。

关键词： 柯伊利素   胰腺癌   网络药理学   分子对接   生存分析  

摘要： 目的运用网络药理学探讨柯伊利素抗胰腺癌作用机制。方法在GeneCard、DisGeNET数据库获取胰腺癌的作用靶点,在Swiss Target Prediction数据库获取柯伊利素的人类靶点,利用韦恩图获取药物—疾病共同靶点,利用DAVID数据库进行富集分析,将共同靶点导入Cytoscape 3.10.2软件STRING APP获取关键靶点,并构建柯伊利素—胰腺癌网络图,利用AutoDock vina 1.1.2做关键靶点与柯伊利素分子对接,利用Kaplan-Meier Plotter在线数据库绘制关键靶点KM曲线。结果最终获取柯伊利素—胰腺癌共同靶点62个,其中PTGS2、EGFR等10个靶点为关键活性靶点,富集分析结果富集了包括RAS信号通路、PI3K-Akt信号通路、内分泌抵抗等,药物靶点分子对接热能良好,关键靶点PTGS2、EGFR低表达对胰腺癌生存具有获益。结论柯伊利素具有潜在抗胰腺癌作用,其机制可能通过多靶点、多途径发挥抗胰腺癌作用。