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关键词： 大补元煎   阿尔茨海默病   网络药理学   AMPK/SIRT1信号通路  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术探究大补元煎防治阿尔茨海默病(AD)的作用机制,并利用动物实验验证所发现的分子机制。方法:网络药理学分析大补元煎抗AD的有效成分及作用靶点。利用AutoDock和PyMOL软件对药物的核心成分与核心蛋白进行分子对接验证。AD模型小鼠给予大补元煎治疗,并验证所发现的核心通路。结果:共筛选出80个有效活性成分和107个疾病作用靶点。大补元煎治疗AD的作用靶点有95个,其中核心靶点有35个。GO富集发现主要涉及程序性细胞死亡过程、细胞凋亡和信号转导调节等。KEGG信号通路富集发现主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路、Wnt信号通路、腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)信号通路等。Morris水迷宫实验显示,大补元煎可减少AD小鼠的平台潜伏期,并增加小鼠的穿越平台次数和目标象限时间。免疫组化实验(IHC)结果显示,大补元煎可增加AD小鼠海马CA3区神经元核抗原(NeuN)标记的阳性细胞数。免疫荧光(IF)结果显示,大补元煎可抑制AD小鼠海马CA3区胶质纤维酸性蛋白(GFAP)、离子钙结合蛋白1(IBA1)的表达水平。Western blot实验显示,大补元煎可增加AD小鼠海马中磷酸化的腺苷酸活化蛋白激酶α(AMPKα)和沉默信息调节因子1(SIRT1)的表达水平。结论:本研究探讨了大补元煎抗AD的作用机制,并发现大补元煎可通过激活AMPK/SIRT1信号通路改善AD认知损伤、神经元丢失和神经炎症。

关键词： 乳腺增生   白术   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:利用网络药理学、分子对接和实验验证的方法来研究白术对乳腺增生的治疗机制。方法:采用TCMSP、Swiss Target Prediction、GeneCards和OMIM等数据库来预测白术的活性成分和乳腺增生症相关疾病靶点,取交集后构建蛋白互作网络,使用Cytoscape3.7.1分析平台绘制“药物-有效成分-潜在靶点”PPI网络图。使用David数据库来进行GO和KEGG通路的集成分析,并借助Pymol和AutoDock软件来预测分子的结合能力。在HMG实验的大鼠模型里,使用苯甲酸雌二醇与黄体酮联合进行诱导,同时利用HE染色法研究了大鼠乳腺的病理改变,对大鼠的血清E 2和PRL含量进行了测定。结果:筛选得到白术活性成分7个,潜在靶点89个,“药物-有效成分-潜在靶点”网络提示3β-乙酞氧基苍术酮、白术内酯III等为白术治疗HMG的主要成分,蛋白质互作网络提示PTGS2、ESR1、MAPK14等靶点为关键靶点;得到GO富集条目178条(P<0.05),KEGG富集条目24条(P<0.05);主要涉及VEGF信号通路、钙离子信号通路和催乳素信号通路,通过对白术的主要活性成分及其目标的分子对接分析发现,它们之间存在良好的亲合能力。体内药理实验结果表明,白术可显著降低HMG大鼠乳头直径,缓解乳腺组织的损害情况,同时使血清中E_(2)和PRL水平显著下降(P<0.05)。结论:大鼠乳腺增生症的改善可以通过白术的有效应用,这种应用可能与调整性激素的水平存在一定关联。

关键词： 心脉安片   心律失常   心力衰竭   异病同治   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 应用网络药理学方法和分子对接技术揭示心脉安片治疗心律失常和心力衰竭的作用机制。通过TCMSP、BATMAN-TCM、Swiss Target Prediction和Stitch数据库收集心脉安片化学成分及其相关靶点,并结合GeneCards、TTD、OMIM和DrugBank数据库获取心律失常和心力衰竭疾病靶点。采用Cytoscape软件获得心脉安片“异病同治”的共同靶点,并绘制中药有效成分共同靶点疾病网络图,利用STRING数据库对疾病成分靶点构建蛋白蛋白互作(PPI)分析,通过Cytoscape软件分析PPI网络的核心靶点,并运用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。同时将核心靶点与关键活性成分进行分子对接验证。本研究从心脉安片中筛选出146个活性化合物,其“异病同治”的共同靶点178个,核心靶点11个,分别是STAT3、AKT1、IL-6、TNF、MAPK3、TP53、EGFR、HSP90AA1、VEGFA、EDN1和PPARA。关键活性成分有槲皮素、山柰酚、木犀草素、人参皂苷Rg1、人参皂苷Re、人参皂苷Rb1和毛蕊异黄酮葡萄糖苷等成分。关键生物通路包括HIF-1信号通路和TNF信号通路等。分子对接结果显示,槲皮素、山柰酚、木犀草素、人参皂苷Rg1、人参皂苷Re、人参皂苷Rb1和毛蕊异黄酮葡萄糖苷等成分与STAT3、TNF、IL-6和VEGFA等靶点稳定对接。心脉安片“异病同治”心律失常和心力衰竭多成分、多靶点、多通路的作用机制,为进一步研究心脉安片效应机制,探索其新的临床应用提供科学依据。

关键词： 网络药理学   糖平散   2型糖尿病   机制研究  

摘要： 目的糖平散治疗2型糖尿病(T2DM)在临床上疗效确切,本文运用网络药理学的方法探索其潜在活性成分、靶点和机制研究。方法基于软件筛选糖平散的有效成分、找到T2DM疾病相关的基因、找出中药活性化合物与疾病的交叉点,进行网络拓扑学分析,做蛋白相互作用网络图(PPI),对京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能和基因本体(GO)进行富集分析。结果糖平散主要有效成分共有33种,糖平散药物有效成分作用靶点有364个靶点;T2DM靶点基因有13790个;中药活性化合物-作用靶点-疾病的交集靶点共348个。结论糖平散有可能对T2DM产生疗效是由于其能够综合多种物质、多个目标并利用各种路径来协同工作所致,为进一步的研究提供了有力的依据。

关键词： 甲硝唑   卵巢癌   网络药理学   分子对接   MDH2  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术分析甲硝唑治疗卵巢癌潜在可能性及作用机制。方法通过化学数据库PubChem查找甲硝唑的分子信息和分子结构,通过PharmMapper数据库获得甲硝唑潜在的药效团靶点,通过OMIM、PharmGkb、TTD、GeneCards四大数据库收集卵巢癌相关靶点。运用R语言(4.3.1),最终筛选出甲硝唑与卵巢癌的交集靶点基因。应用String在线平台获得蛋白相互作用(PPI)网络,再通过Cytoscape软件进行拓扑分析,找到核心靶点。利用R(4.3.1)对潜在靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。借助在线数据库GEPIA2深入分析核心靶点在卵巢癌中的表达及预后。利用Autodock Vina软件进行药物与核心靶点的分子对接。结果共筛选出甲硝唑的潜在作用靶点68个,卵巢癌相关作用靶点12255个,其中交集靶点56个,GO分析共富集到309个条目,KEGG分析则富集到24条信号通路,最终确定治疗卵巢癌的核心靶点2个,分别为HSP90AA1和MDH2。通过核心靶点基因表达及预后分析,显示MDH2在治疗中具有关键作用。分子对接显示,MDH2与甲硝唑结合活性强。结论甲硝唑能够通过调控多条信号通路而发挥治疗卵巢癌的作用,MDH2是其治疗卵巢癌的核心与关键靶点。

关键词： 血根碱   药理作用   动物保健   应用  

摘要： 随着国家全面禁用促生长抗生素以来,植物提取物因其安全、无耐药性等优点,成为动物保健行业中理想的替抗产品。血根碱是一种主要存在于罂粟科植物中的含氮有机化合物,具有抗菌消炎、提高免疫力等作用。本文通过对血根碱的提取方法、主要性质、药理作用及其在动物保健行业中的应用现状进行综述,以期为血根碱在养殖生产中的应用和产品升级提供参考依据。

关键词： 网络药理学   分子对接   保肾灵丸   糖尿病肾病  

摘要： 目的:基于系统网络药理学与分子对接技术探讨保肾灵丸治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。方法:查询中药药理学数据库获取保肾灵丸活性成分及作用靶点,与疾病靶点取交集。对交集靶点进行蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络构建,并进行GO和KEGG富集分析,得到关键靶点和小分子进行分子对接验证。结果:共预测到活性成分60个及治疗DN靶点112个。关键成分为香芹甾醇、3,9-二-O-甲基尼索林、香芹酚、棕榈苷A和16α-羟基脱氢曲霉醇酸,尤其是香芹甾醇、棕榈苷A和16α-羟基脱氢曲霉醇酸。关键靶点为PIK3CA、MAPK1、AKT1、PIK3R1、BCL2等,与多种癌症相关通路及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、内分泌抵抗、脂质与动脉粥样硬化等通路密切相关。结论:保肾灵丸治疗DN的作用机制具有多成分、多靶点、多通路的特点,各中药之间有协同作用,为保肾灵丸药理作用研究提供依据。

关键词： 2型糖尿病   补肾健脾方   网络药理学   生物信息学  

摘要： 目的 基于生物信息学和网络药理学探讨补肾健脾方治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制。方法 通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库筛选补肾健脾方活性成分及作用靶点,通过GEO数据库获取T2DM相关数据集GSE18732和GSE19420,通过Mfuzz分析筛选与糖尿病同步变化的基因,作为T2DM疾病靶点。获取补肾健脾方与T2DM疾病靶点交集靶点,作为补肾健脾方治疗T2DM的作用靶点,通过STRING数据库构建靶点蛋白相互作用网络,筛选网络中的关键靶点,通过GO功能和KEGG通路富集分析其生物功能,对关键靶点进行单因素Logistic回归,筛选Hub基因,基于Hub基因构建T2DM预测模型。结果 获取补肾健脾方药物靶点1 837个,T2DM疾病靶点983个,药物-疾病交集靶点115个,主要富集于内分泌抵抗、胰岛素抵抗、胰岛素信号通路、非酒精性脂肪性肝病、细胞凋亡、细胞衰老、AMPK信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路和HIF-1信号通路。Hub基因有NFKB1和SREBF1,预测模型曲线下面积=0.829,具有良好的预测性能。结论 本研究综合生物信息学和网络药理学研究发现,补肾健脾方可能通过调控AMPK通路和AGE-RAGE等通路,发挥延缓T2DM进展作用,但仍需进一步实验验证。

关键词： 胃癌   生物信息学   关键基因   网络药理学   中药活性成分  

摘要： 目的:本研究旨在利用生物信息学方法探索驱动胃癌进展的关键基因,并结合网络药理学分析筛选潜在的中药活性成分,以期为预防和治疗胃癌提供依据。方法:从NCBI的GEO数据库下载基因表达谱芯片(GSE191275),利用GEO2R筛选出胃癌实验组VS肠上皮化生组,肠上皮化生VS非萎缩性胃炎的差异表达基因(Differentially Exprsssed Gense,DEGs),并使用维恩图搜索“非萎缩性胃炎-肠上皮化生-胃癌”进程中变化规律一致的基因。通过STRING数据库构建蛋白质的相互作用网络,用CytoScape来筛选出关键基因。采用ROC曲线分析进一步筛选胃癌治疗的潜在靶点。从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘潜在中药活性成分。临床纳入厦门市中医院脾胃科门诊收治的40例胃癌前病变患者作为研究对象,按随机数字表法将患者分为常规对照组和槲皮素补充组各20例。观察两组患者治疗效果、血清学指标、靶点抑制以及不良反应情况。结果:在胃癌病程中共鉴定出49个持续上调和39个持续下调的基因。通过双重筛选和鉴别确定了前蛋白转化酶枯草溶菌素1(Recombinant Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 1,PCSK1)、前列腺素氧化环化酶(Prostaglandin-endoperoxide Synthase,PTGS)2、基质金属蛋白酶(Matrix Metallopeptidase,MMP)3和C-C基序趋化因子(C-C Motif Chemokine,CCL)20作为预防和治疗胃癌的潜在基因靶点。从TCMSP挖掘靶向基因靶点的潜在中药活性成分,经过多项筛选规则鉴别出槲皮素为PTGS2/MMP3双重抑制剂。通过临床观察证实槲皮素补充显著提高了常规治疗的总有效率,差异有统计学意义(P<0.05)。同时槲皮素补充还显著下调了血清胃黏膜环氧合酶(Cyclooxygenase,COX)-2、p53水平和胃黏膜的PTGS2和MMP3 mRNA表达(P<0.05)。两组不良反应发生率的差异无统计学意义(P>0.05)。结论:本研究认为PCSK1、PTGS2、MMP3和CCL20是“非萎缩性胃炎-肠上皮化生-胃癌”进程中的关键基因,而槲皮素靶向抑制PTGS2/MMP3有望应用于临床预防和治疗胃癌。

关键词： 早临床问题导学   药理学新教学模式  

摘要： 目的本研究旨在探索并建构一种新型的药理学实践教学模式,即早临床问题导学,以提升学生的临床思维和实践能力。方法通过设计早临床问题导学实践案例,学生小组讨论药物应用分析等医疗问题。针对教学效果,进行及时的反馈和评估。结果实践案例表明,早临床问题导学有效激发了学生对于医学问题的深入思考,促使其更好地理解和运用所学知识,且学生反馈新模式教学各维度满意度评分均优于传统教学模式,差异有统计学意义(P<0.01)。结论早临床问题导学模式为药理学实践教学提供了一种新途径,突出对实际问题的解决,培养了学生的临床思维,为其将理论知识应用于实践打下了坚实基础。