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关键词： 牛膝   化学成分   药理作用   质量标志物  

摘要： 牛膝在《神农本草经》中被列为上品,近几年研究证实牛膝的化学成分主要包括甾体、三萜皂苷、多糖、挥发油等化合物,具有抗炎镇痛、调节免疫、抗骨质疏松、保护心血管等药效。本文从牛膝的植物亲缘性,牛膝特有性、有效性、可测性化学成分和炮制后化学成分等方面,对牛膝的质量标志物(quality marker,Q-Marker)进行预测分析,牛膝甾酮A、25 S-牛膝甾酮、25 R-牛膝甾酮、齐墩果酸-3-O-β-D-(6′-丁酯)-吡喃葡萄糖醛酸苷、齐墩果酸-3-O-β-D-(6′-甲酯)-吡喃葡萄糖醛酸苷、β-蜕皮甾酮等可作为牛膝质量标志物,为建立牛膝质量评价体系和深入研究其药理作用提供依据。

关键词： 加味逍遥丸   网络药理学   分子对接   作用机制   围绝经期综合征  

摘要： 目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨加味逍遥丸治疗围绝经期综合征的作用机制。方法通过TCMSP数据库收集加味逍遥丸组方药物的活性成分,检索GeneCards、OMIM、PharmGKB及DrugBank数据库获得围绝经期综合征相关靶点,使用R4.0.2软件程序包将药物活性成分与疾病靶点取交集作为关键靶点,上传至STRING平台构建蛋白相互作用网络;使用R4.0.2软件程序包进行GO及KEGG通路富集分析;应用Cytoscape3.9.1软件构建中药-活性成分-靶点网络,使用CytoNCA插件进行网络拓扑分析;运用AutoDock Vina 1.1.2软件进行分子对接。结果 加味逍遥丸治疗围绝经期综合征的主要活性成分共127种,包括槲皮素、木犀草素、山柰酚、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、β-谷甾醇、甘草查尔酮A、豆甾醇、柚皮素、芒柄花黄素等;核心靶点包括PTGS2、ESR1、AR、NOS2、PPARG、NCOA2、SCN5A、ADRB2等;GO富集结果包括对外源性刺激的反应、对氧化应激的反应、腺体发育等,KEGG富集分析主要涉及PI3K/Akt、脂质和动脉粥样硬化、AGE-RAGE、MAPK等信号通路;分子对接显示,核心靶点与主要活性成分对接活性较强。结论 加味逍遥丸可通过多成分、多靶点、多通路治疗围绝经期综合征。

关键词： 白藜芦醇   青光眼   眼压   炎症反应   氧化应激反应   细胞凋亡   视神经修复   线粒体生物合成  

摘要： 青光眼是一种神经退行性疾病,是全球范围内导致失明的主要原因。早期诊断和正确治疗对于防治青光眼、预防视力障碍非常重要。白藜芦醇是一种天然成分,具有多种活性,可通过降低眼压,降低炎症反应,降低氧化应激反应,阻止细胞凋亡,促进视神经修复,改善线粒体生物合成对青光眼视网膜损伤发挥保护作用。总结了白藜芦醇防治青光眼的药理作用研究进展,分析其降低视网膜损伤的作用机制,为白藜芦醇的临床应用提供支持。

关键词： 臭灵丹   网络药理学   炎症   分子对接   LC-MS分析  

摘要： 基于LC-MS和网络药理学对臭灵丹乙酸乙酯部位(ethyl acetate fraction of Laggerae Herba,ELH)进行成分和靶点通路分析,并通过LPS(lipopolysaccharides,LPS)诱导RAW 264.7炎症模型探讨ELH抗炎的作用机制。通过Griess实验,比较臭灵丹不同萃取部位的抗炎活性;利用LC-MS对ELH的化学成分进行分析;基于网络药理学预测和筛选ELH发挥抗炎的核心成分,靶基因和主要通路,并用分子对接和蛋白免疫印迹(Western blot)对靶点和通路进行验证。Griess实验结果表明,ELH可显著抑制LPS诱导的RAW 264.7细胞释放NO,抑制率达103.07%,是臭灵丹发挥抗炎作用的活性部位;LC-MS分析得到ELH中23个化学成分,包括21个倍半萜,1个黄酮,1个有机酸体;基于4个数据库,获得66个共同靶点;蛋白互作网络(protein-protein interaction,PPI)分析发现获得白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等degree值大于40的6个核心靶点;GO、KEGG富集分析发现,核心靶点可能通过PI3K-Akt、IL-17、NF-κB和TNF等信号通路发挥抗炎作用;分子对接结果显示23个化学成分与核心靶点具有良好的结合能力;Western blot实验结果显示ELH处理后Akt的磷酸化水平和NF-κB表达显著下降(P<0.05)。综上,ELH能抑制AKT磷酸化,在一定程度上抑制LPS诱导的RAW 264.7细胞中NF-κB信号通路的激活,从而发挥抗炎作用。

关键词： 痰瘀病机   山慈菇-莪术   胃癌前病变   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的通过网络药理学与分子对接技术,在“痰瘀”病机理论下,探究化痰消瘀法典型代表药对山慈菇-莪术治疗胃癌前病变(PLGC)的作用靶点及有效活性成分,进一步探讨其潜在作用机制。方法本研究通过TCMSP、TCMID及BANTMAN-TCM数据库并结合文献研究获取山慈菇-莪术的主要活性成分及其对应靶点,利用UniProt数据库查询靶点蛋白对应的人类基因;同时,通过OMIM、TTD、Genecards检索PLGC疾病靶点,映射至山慈菇-莪术药对活性成分靶点基因,构建山慈菇-莪术药对活性成分-靶点网络,再针对山慈菇-莪术与PLGC的交集靶点,构建蛋白相互作用网络(PPI),构建“药物-共同靶点-疾病”网络图,进而通过Metascape数据库进行GO与KEGG富集分析。最后采用AutoDock软件对重要活性成分和关键靶点进行分子对接验证试验。结果共检索出14个活性成分,筛选得到山慈菇-莪术药对靶点230个,PLGC相关靶点1232个,药物-疾病交集靶点42个,重要活性成分包括2-甲氧基-9,10-二氢菲-4,5-二醇、β-谷甾醇、莪术二酮等,关键靶点有JUN、PIK3R1、ESR1、CASP3等;GO富集分析共获得560个相关条目,KEGG通路共112条,涉及癌症通路、IL-17、MicroRNAs、NOD样受体、Wnt等信号通路;分子对接结果显示重要活性成分和关键靶点之间具有较好的结合活性。结论“痰瘀”病机理论下,化痰消瘀法代表药对山慈菇-莪术可能通过多成分、多靶点、多途径参与调控肿瘤细胞增殖与凋亡等多种生理过程,发挥其对PLGC的重要干预作用,为后续开展实验研究以进一步阐释其作用机制提供了科学依据。

关键词： 系统性红斑狼疮   数据挖掘   关联规则   网络药理学   富集分析  

摘要： 目的:基于数据挖掘分析中医药治疗系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)的用药规律并筛选核心药对,通过网络药理学方法和分子对接技术探讨核心药对治疗SLE的作用机制。方法:收集2012年6月—2022年12月在安徽中医药大学第一附属医院风湿病科住院治疗的SLE患者的资料进行分析,共获得472名患者的完整处方,运用Excel 2016对用药规律进行统计分析,通过IBM SPSS Modeler 18.0软件对中药进行关联规则分析;通过TCMSP数据库检索药物活性成分和靶点,以“systemic lupus erythematosus”为关键词,检索DrugBank、GeneCards、TTD、OMIM数据库获取疾病相关靶点,构建药物-疾病交集靶点韦恩图;采用Cytoscape 3.7.1软件构建蛋白相互作用网络图和“药物-活性成分-靶点”网络图,通过Hubba插件获得药物治疗SLE的核心靶点;通过Metascape数据库进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能富集分析及京都基因及基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome,KEGG)通路富集分析;利用AutoDock 4.2.6软件对核心靶点与主要成分进行分子对接,通过PyMOL 2.5.2进行可视化分析。结果:SLE患者益气健脾化湿(茯苓、山药、黄芪等)及滋阴清热(知母、青蒿、地骨皮等)中药使用频次较高,甘味药、寒性药以及归肝、脾、肾经的中药使用频次较高。知母-黄柏组合具有较高的支持度(41.31%)和置信度(71.79%),可能在SLE的治疗中发挥重要作用。网络药理学结果表明,知母-黄柏共有34个活性成分,97个潜在作用靶点,该药对治疗SLE的5个核心靶点包括肿瘤坏死因子(tumornecrosis factor,TNF)、蛋白激酶B(protein kinase B,Akt1)、白细胞介素-6(interleukin 6,IL-6)、白细胞介素-1β(interleukin1β,IL-1β)、肿瘤蛋白p53(tumor protein p53,TP53)。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,知母-黄柏组合治疗SLE与平滑肌适应、发热、丝氨酸蛋白酶抑制剂复合物等生物过程以及IL-17、TNF、MAPK等信号通路密切相关。分子对接显示核心靶点和活性成分具有良好的对接活性。结论:中医药治疗SLE以益气健脾化湿、滋阴清热药物为主,知母-黄柏是治疗SLE的关键药对,可能通过多成分、多靶点、多通路发挥对SLE的治疗作用。

关键词： 黄精多糖   药理作用   综述  

摘要： 黄精多糖是黄精中的一种主要有效成分,其药理活性显著。现代研究显示,黄精多糖主要有抗氧化、抗炎抑菌、调节免疫等药理作用。国内外报道了大量关于黄精多糖的药理研究,本文全面综述了黄精多糖药理作用相关文献,以期为黄精多糖的开发利用和研究提供参考。

关键词： 四妙勇安汤   银屑病   网络药理学   机制  

摘要： 目的基于网络药理学方法探讨四妙勇安汤治疗银屑病的物质基础和作用机制。方法通过中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)获取四妙勇安汤的有效成分和靶点,利用GeneCards数据库检索银屑病的有关靶点,运用Jvenn在线作图工具平台绘制韦恩图,得到药物与疾病共同靶点。应用String数据库绘制蛋白质-蛋白质互相作用(PPI)网络,将PPI网络导入Cytoscape3.8.2,进行拓扑结构分析,筛选核心靶点,构建活性成分-靶点网络图。通过GO和KEGG对核心靶点进行富集分析。结果共筛选出四妙勇安汤274个药物活性成分,353个作用靶点,银屑病相关靶点1364个,交集靶点136个。主要活性成分有槲皮素、熊果酸、山柰酚等;核心靶点包括AKT1、TP53、IL6等;GO功能富集分析得到356个条目,BP主要富集于细菌来源分子的反应,多肽反应,蛋白质磷酸化正调控等;KEGG通路富集分析得到165条相关信号通路,包括血脂与动脉粥样硬化,表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂抵抗,癌症发病途径等通路。结论四妙勇安汤通过槲皮素、山柰酚、芹黄素等高黄酮类成分,作用于AKT1、TP53、IL6等靶点,调控血脂与动脉粥样硬化,表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂抵抗,癌症发病途径等通路,发挥调节炎症、血脂、免疫微环境等药理作用治疗银屑病。

关键词： 补肾启智方   血管性痴呆   铁死亡   网络药理学   分子对接   HIF-1α/SLC7A11/GPX4信号通路   大鼠  

摘要： 目的:采用网络药理学方法和分子对接技术并结合体内实验,分析并验证补肾启智方调控海马神经元铁死亡改善血管性痴呆(vascular dementia,VD)认知功能的作用机制。方法:在TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库、ETCM数据库筛选补肾启智方的活性成分及其作用靶点;在GeneCards数据库、OMIM数据库、DisGeNET数据库筛选血管性痴呆的潜在靶点;在FerrDB数据库筛选铁死亡的相关靶点,以上所有靶点均经Uniprot数据库规范,并在微生信-免费在线绘制韦恩图——Venn Diagrams网站获得三者的交集靶点。采用Cytoscape 3.9.1软件绘制“补肾启智方药物-活性成分-潜在靶点”网络、“补肾启智方-血管性痴呆-铁死亡靶点”的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并进行拓扑学分析以获得核心成分与核心靶点;在DAVID数据库进行交集靶点的基因本体(Gene Ontology,GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。采用AutoDock 4软件进行分子对接,并利用PyMol 2.5软件对分子对接结果进行可视化分析。通过动物实验验证关键靶点及信号通路。将32只SD雄性大鼠随机分为假手术组、模型组、补肾启智方高剂量组(14.4 g·kg^(-1))、补肾启智方低剂量组(3.6 g·kg^(-1)),每组8只。除假手术组外,其余大鼠采用双侧颈总动脉永久结扎(2-vessel occlusion,2-VO)法建立血管性痴呆模型。采用Morris水迷宫实验评估大鼠的空间学习与记忆能力;Western blot法检测大鼠海马组织中缺氧诱导因子1α(hypoxia inducible factor-1α,HIF-1α)、细胞溶质载体家族7成员11(solute carrier family 7 member 11,SLC7A11)、谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxidase 4,GPX4)的蛋白表达;生化法检测大鼠海马组织中丙二醛(malondialdehyde,MDA)、谷胱甘肽(glutathione,GSH)水平。结果:筛选得到补肾启智方调控海马神经元铁死亡治疗VD的活性成分40种,有效靶点30个,核心成分是槲皮素、茉莉酮、马兜铃酮,核心靶点是肿瘤蛋白P53(tumor protein P53,TP53)、核因子E2相关因子2(nuclear factor erythroid 2-related factor 2,Nrf2)、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,MTOR)、HIF-1α;GO功能富集分析结果显示,补肾启智方可能通过改善细胞对过氧化氢、缺氧、氧化应激的反应及促进血管生成等方面治疗VD,KEGG通路富集分析表明,其可能通过调控缺氧诱导因子1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路、细胞衰老、活性氧、叉头盒蛋白O(forkhead box protein O,FoxO)信号通路、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)信号通路等治疗VD。经补肾启智方干预后,VD大鼠的空间学习与记忆能力得到改善,海马组织MDA表达降低(P<0.01)、GSH水平升高(P<0.01),HIF-1α与铁死亡核心调控蛋白SLC7A11和GPX4蛋白表达水平显著升高(P<0.01,P<0.05,P<0.01)。结论:补肾启智方可通过多成分、多靶点改善VD认知功能,其关键机制可能与激活HIF-1α/SLC7A11/GPX4信号通路、抑制海马神经元铁死亡相关。

关键词： 黄蜀葵花   碘对比剂所致急性肾损伤   网络药理学   分子对接   中药   靶点   信号通路  

摘要： 目的探讨黄蜀葵花防治碘对比剂所致急性肾损伤(CI-AKI)的药效物质和作用机制。方法根据中药系统药理数据库及已发表文献收集并筛选出黄蜀葵花有效活性成分及药物作用靶点,运用疾病靶点数据库筛选CI-AKI相关靶点,并获取药物与疾病交集靶点。利用CytoscaPe 3.9.1软件构建黄蜀葵花活性成分-靶点网络、蛋白相互作用(PPI)网络。使用R语言进行基因本体论(GO)生物过程分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用AutoDock Vina1.1.2软件对活性成分与CI-AKI相关疾病靶点进行分子对接验证结合活性。结果黄蜀葵花活性成分中5-羟基-7,8,4’-三甲氧基黄酮、槲皮素、9,12-二烯十八酸等活性成分对于CI-AKI治疗有较强的靶向作用,核心靶点包括IL-6、AKT1、SRC、EGFR、MAPK3、ESR1等。GO及KEGG富集分析显示,黄蜀葵花活性成分参与多种生物学过程及通路的调控,主要涉磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B信号通路、缺氧诱导因子-1信号通路、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用等。分子对接结果显示黄蜀葵花多种活性成分与疾病靶点具有较好地对接能力,预测结果具有一定的可靠性。结论黄蜀葵花中多种活性成分可能通过调控炎症、氧化应激、糖脂代谢、抗纤维化、新生血管生成、免疫应答等多条通路发挥治疗CI-AKI的作用。