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关键词： 三七总皂苷   脓毒症   网络药理学   分子对接   炎症反应   细胞凋亡   凝血反应  

摘要： 目的基于网络药理学与分子对接技术探讨三七总皂苷治疗脓毒症的作用机制。方法通过检索TCMSP、Swiss Target Prediciton和PharmMapper数据库得到三七总皂苷的作用靶点;在Genecard、Drugbank、Disgenet和OMIM数据库检索脓毒症的疾病相关靶点;将筛选出的三七总皂苷作用靶点与脓毒症疾病相关靶点取交集,作为三七总皂苷治疗脓毒症的潜在作用靶点。通过STRING数据库构建潜在作用靶点的蛋白互作(PPI)网络,并筛选关键靶点;对潜在作用靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析,构建药物-疾病-靶点-通路网络;利用AutoDock Vina软件对三七总皂苷5种单体皂苷成分与三七总皂苷治疗脓毒症的关键靶点进行分子对接验证。结果获得三七总皂苷治疗脓毒症的潜在作用靶点206个;筛选得到AKT1、TP53、SRC、STAT3、JUN、TNF、IL6、MAPK1、PIK3R1和IL1B等关键靶点。潜在作用靶点GO功能富集分析得到2548项生物过程(BP)条目,174项分子功能(MF)条目,47项细胞组分(CC)条目;KEGG通路富集分析共得到171条信号通路。三七总皂苷主要活性成分三七皂苷R1、人参皂苷Rg1、人参皂苷Re、人参皂苷Rb1、人参皂苷Rd与关键靶点AKT1、TP53、STAT3、SRC、JUN具有较强的结合活性。结论三七总皂苷可能通过AKT1、TP53、SRC、STAT3、TNF等关键靶点,作用于PI3K-Akt、AGE-RAGE等主要信号通路,进而影响脓毒症的炎症反应、细胞凋亡和凝血反应等生理过程,发挥治疗脓毒症的作用。

关键词： 零陵香   本草考证   化学成分   药理作用   开发应用  

摘要： 零陵香是我国传统中草药,来源于报春花科植物灵香草的带根全草,其主要化学成分包括挥发油、黄酮类、皂苷类、甾醇类、香豆素等,具有抗炎、抗氧化、抗肿瘤、抑菌等药理作用。近现代临床上多以复方制剂形式出现,具有较高的药用价值及经济效益。从本草考证、化学成分、药理作用及现代开发与应用等方面对零陵香展开综述,为其进一步资源利用提供参考。

关键词： 偏头痛   川芎-红花-桃仁   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接研究川芎-红花-桃仁治疗偏头痛的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取川芎、红花、桃仁的有效成分及药物靶点,并通过TCMSP、PubChem数据库获取有效成分2D结构图,将其导入PharmMapper数据库中预测相关药物靶点。运用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点”网络关系图。通过GeneCard、PharmGKB、Therapeutic Target Database、DrugBank数据库预测疾病靶点,然后通过Venny平台筛选药物与疾病交集靶点。通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并结合Cytoscape和R软件筛选出核心靶点。运用Cytoscape软件构建“药物-成分-核心靶点-疾病”网络关系图。通过Metascape数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,然后在微生信平台进行可视化分析。运用Cytoscape软件构建“成分-核心靶点-通路”网络关系图。最后运用Autodock vina软件对有效成分与核心靶点进行分子对接。结果:共筛选出有效成分52个,主要为β-谷甾醇、槲皮素、川芎萘呋内酯等。筛选出药物靶点560个、疾病靶点2 290个,交集靶点196个;核心靶点29个,主要为前列腺素内过氧化物酶2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(Caspase-3,CASP3)、JUN原癌基因(JUN Proto-Oncogene,JUN)等。GO富集分析获得7 018个条目,其中生物过程5 548个、细胞组分514个、分子功能956个。KEGG富集分析获得283个信号通路,主要为癌症通路、环磷酸腺苷(Cyclic Adenosine Monophosphate,c AMP)信号通路、钙信号通路等。分子对接显示,有效成分川芎萘呋内酯和β-谷甾醇与核心靶点(PTGS2、CASP3、JUN)结合活性良好。结论:川芎-红花-桃仁能够通过多成分、多靶点、多通路共同发挥治疗偏头痛作用。

关键词： 小檗碱   抗胰腺癌作用   药理机制  

摘要： 小檗碱是一种具有广泛药理作用的生物活性物质,除了抗炎、抗菌、抗病毒、抗高血压、抗缺氧、降血糖、降血脂等作用外,还具有抗肿瘤作用。近年来,国内外科研团体对小檗碱在抗胰腺癌领域的作用进行了诸多深入研究,取得不少重要成果。因此,该文主要就小檗碱的抗胰腺癌作用及其药理机制进行了综述,并对相关研究做了分析。

关键词： 陈皮苷   溃疡性结肠炎   葡聚糖硫酸钠   网络药理学   短链脂肪酸  

摘要： 目的分别采用网络药理学及动物实验两种方式,初步探究陈皮苷治疗溃疡性结肠炎(UC)的作用机制。方法通过SwissTargetPrediction数据库筛选出陈皮苷的相关作用靶点。使用OMIM、GeneCards数据库查找与溃疡性结肠炎对应的靶点信息。利用STRING在线数据库,将药物靶点与疾病靶点匹配后取交集靶点,构建蛋白相互作用(PPI)网络模型。利用Metascape数据库对交集靶点进行GO富集以及KEGG通路富集分析。将50只SPF级ICR小鼠随机分为对照组、模型组、美莎拉嗪组、陈皮苷低剂量组(200 mg/kg)、陈皮苷高剂量组(400 mg/kg),每组10只。使用葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导小鼠成为UC模型并按分组不同给药,于给药第7天处死小鼠并取材。取材后对各组小鼠进行疾病活动指数(DAI)评分,并比较各组小鼠体重变化及结肠长度差异;苏木素-伊红(HE)染色观察各组小鼠结肠组织病理学变化;通过ELISA法检测小鼠血清中白细胞介素6(IL⁃6)、肿瘤坏死因子-α(TNF⁃α)水平;采用气相质谱-色谱联用法检测小鼠肠内容物中短链脂肪酸(SCFAs)的含量。结果网络药理学结果显示,陈皮苷治疗UC的相关靶点有15个,通过PPI网络模型可得出ESR1、ALB、ACE等可能是陈皮苷治疗UC的主要靶点,并通过GO及KEGG富集分析获得陈皮苷治疗UC的核心信号通路。动物实验结果证明,陈皮苷干预后的UC小鼠模型DAI评分降低,体重减轻程度有所缓解,结肠长度增长,差异均有统计学意义(F=4.725、11.990、109.400,P均<0.05)。与模型组相比,陈皮苷干预后的UC小鼠血清IL⁃6、TNF⁃α水平降低(F=167.700、154.800,P均<0.05),肠内容物乙酸、丁酸、丙酸、己酸、戊酸、异丁酸、异戊酸数量均有不同程度的增加,且丁酸、戊酸含量的增加较为显著(F=3.440、8.374,P均<0.05)。结论陈皮苷可通过调节主要靶点、增加小鼠肠内容物SCFAs的数量等来改善UC症状。

关键词： 石崖茶   质量标志物   指纹图谱   化学模式识别分析   网络药理学   山茶苷A   表儿茶素   儿茶素   槲皮苷   芹菜素  

摘要： 目的基于HPLC指纹图谱数据的化学模式识别方法和网络药理学技术,预测石崖茶潜在质量标志物(Q-Marker),为提升其药材质量标准提供参考。方法建立10批次广西不同产地石崖茶HPLC指纹图谱,对其进行化学模式识别分析,筛选不同批次间差异的主要标志性成分,并进行成分质谱鉴定;通过网络药理学对筛选鉴定出的成分构建“成分-核心靶点-通路”网络,分析预测石崖茶的Q-Marker,基于可测性原则对Q-Marker进行定量测定。结果不同批次石崖茶指纹图谱共标定出12个共有峰,经化学模式识别,筛选出批次间5个主要差异性成分,分别鉴定为山茶苷A、表儿茶素、儿茶素、槲皮苷、芹菜素。网络药理学分析提示5种差异成分直接相关靶点211个,其映射的KEGG信号通路显著富集在脂质与动脉粥样硬化、内分泌抵抗、甲状腺激素信号通路、人巨细胞病毒感染、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、癌症的中心碳代谢等,映射的161个信号通路与石崖茶主要功效和现代药理作用密切相关。含量测定结果显示,不同批次石崖茶中山茶苷A、表儿茶素、儿茶素、槲皮苷和芹菜素质量分数分别为41.56~96.90、85.45~101.01、7.39~12.96、5.74~15.22、2.65~12.43 mg·g^(-1)。根据Q-Marker的五原则,初步预测山茶苷A、表儿茶素、儿茶素、槲皮苷、芹菜素为石崖茶的Q-Marker。结论初步预测了石崖茶的Q-Marker,为其药材质量标准的提升提供参考。

关键词： 金丹附延颗粒   慢性盆腔炎   网络药理   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨金丹附延颗粒的主要成分和其治疗慢性盆腔炎的作用靶点与途径。方法使用TCMSP、PubChem和Swiss Target Prediction等数据库找到有效成分和作用靶点后,借助Cytoscape 3.10.1软件绘制“药物-成分-靶点”和关键靶点的PPI网络图,再找出Degree值靠前的重要成分和关键靶点进行分子对接。结果本研究得到了63个有效成分,慢性盆腔炎和化合物的交集靶点58个。选取Degree值大于平均值的靶点作为核心靶点,得到20个核心靶点。利用Cytocsape 3.10.1绘制成分-靶点PPI网络图,找出Degree值为前20的有效成分和核心靶点。筛选出排名前三的成分Mairin、Hyndarin、Dihydrochelerythrine和排名前四核心靶点TNF、IL6、AKT1、IL1B,并进行分子对接,得到的分子结合能均在-4以下,说明靶点与药物分子间有良好的结合活性。结论金丹附延颗粒对治疗慢性盆腔炎有很好的治疗效果,作用途径与炎症反应有关。

关键词： 流感病毒   固表防感加减方   免疫功能抑制   网络药理学  

摘要： 目的:运用网络药理学方法探讨固表防感加减方调节免疫抑制小鼠防御A型流感病毒的作用靶点及信号通路,并通过免疫抑制小鼠模型进行关键靶点验证。方法:利用TCMSP数据库检索固表防感加减方药物的有效成分,利用GeneCard、OMIM、PharmGkb数据库获得有效成分预防流感的潜在靶点,取其交集靶点;运用STRING11.5数据库制作蛋白质-蛋白质相互作用网络,分析并找到核心靶点;利用Cytoscape3.8.1构建中药-成分-疾病靶点网络,并进行GO富集分析和KEGG富集分析。腹腔注射环磷酰胺构建免疫功能抑制小鼠模型,设置正常组、模型对照组、固表防感加减方组、奥司他韦组,随后预防性给药,第4天进行流感病毒干预,药物灌胃治疗7 d后,通过小鼠脾脏指数、HE染色、RT-qPCR、免疫组化法验证关键靶点。结果:固表防感加减方中5味中药共含82个活性成分,IL-6、TNF-α、IL-2等72个药物与疾病的共同靶点,主要涉及IL-17、TNF及AGE-RAGE信号通路等。固表防感加减方可以提高脾脏指数,显著降低小鼠脾组织中IL-6及TNF-α的mRNA和蛋白表达(P<0.05或P<0.01)。结论:固表防感加减方可能通过IL-6和TNF-α等靶点调控机体免疫功能,从而预防流感病毒感染。

关键词： 抽动障碍   白芍-柴胡   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学方法及分子对接技术研究“白芍-柴胡”药对治疗儿童抽动障碍(TD)的有效成分、靶点、信号通路和作用机制。方法:利用TCMSP数据库筛选出“白芍-柴胡”药对的有效成分及相关靶点,利用GeneCards、OMIM、DruGBank和TTD等数据库获取与儿童TD相关的疾病靶点。利用STRING数据库和CytoScape 3.7.2软件构建药物-疾病靶点网络,并进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。通过分子对接技术对核心靶点和相关化合物进行验证,计算结合能,初步验证“白芍-柴胡”药对治疗儿童TD的作用机制。结果:“白芍-柴胡”药对治疗儿童TD的核心靶点为Akt1、IL-6、TNF、IL-1β,核心成分为槲皮素、山柰酚和β-谷甾醇。生物学通路主要作用于PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路、MAPK信号通路、TNF信号通路等。分子对接结果显示,核心成分与核心靶点具有较好的结合活性。结论:“白芍-柴胡”药对具有多成分、多靶点、多途径的特点,为其在儿童TD后续研究和临床应用提供启示。

关键词： 网络药理学   分子对接   灵芝   鸡   免疫  

摘要： 为探究灵芝增强鸡免疫功能的作用机制,通过TCMSP等数据库获得鸡免疫功能相关基因与灵芝主要有效成分靶点,并利用Cytoscape 3.10.0软件可视化分析灵芝-靶点-免疫蛋白质互作网络(PPI),进而通过David数据库进行GO和KEGG通路富集分析,利用AutoDock软件进行分子对接验证关键有效成分与关键靶点的结合活性。结果显示:共获得灵芝有效成分42个,包括环氧灵芝醇B、赤芝孢子内酯B、灵芝醛B等10个关键有效成分,免疫相关基因332个。PPI包括白细胞介素-6 (IL-6)、白细胞介素-1β (IL-1β)、非受体酪氨酸激酶(SRC)等7个关键靶点。GO功能富集分析涉及生物过程23个、细胞组分22个以及分子功能23个;KEGG通路富集分析获得11条相关信号通路。分子对接的最小结合能均小于-20.9 kJ/mol,表明对接结果良好。研究表明,灵芝增强鸡免疫功能的关键有效成分为10个,关键靶点为7个,相关信号通路为11条,研究结果可为灵芝作为饲料添加剂的应用提供参考。