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关键词： UPLC-Q-TOF-MS   HS-GC-MS   网络药理学   胆汁制陈皮   化痰止咳   质量标志物   作用机制  

摘要： 目的:系统分析孟河医派特色饮片胆汁制陈皮的化学成分,探讨其化痰止咳的质量标志物和作用机制。方法:通过UPLC-Q-TOF-MS和HS-GC-MS技术对胆汁制陈皮进行定性分析并构建成分库,采用网络药理学技术筛选质量标志物,分析潜在作用机制,通过分子对接技术对结果进行验证。结果:通过UPLC-Q-TOF-MS鉴定得到67个化学成分,HS-GC-MS分析得到39个化学成分,共鉴定出106个化学成分。通过“药物-成分-靶点”网络筛选得到5个潜在质量标志物(Q-marker):黄柏酮、异橙黄酮、Naringenin、(+/–)-Naringenin及甜橙黄酮。通过分子对接筛选3个核心靶点:NOS3、EGFR、PTGS2。通过GO富集分析得到BP 502条,CC 85条,MF 146条,共计733条信号通路,KEGG富集分析得到162条信号通路。结论:该研究初步建立了胆汁制陈皮的化学成分库,明确了潜在Q-maker的裂解规律,探讨了其化痰止咳的作用机制,为胆汁制陈皮药效物质研究奠定了基础,为特色饮片的推广应用提供了科学依据。

关键词： 芹菜素   前列腺癌   生物信息学   网络药理学   分子对接   B细胞淋巴瘤因子-2   低氧诱导因子-1A   肿瘤坏死因子  

摘要： 目的 利用生物信息学结合网络药理学及分子对接系统性探索芹菜素抗前列腺癌的分子机制。方法 通过ETCM、HERB、HIT2.0及SwissTargetPrediction数据库预测芹菜素靶点。计算TCGA和GEO数据集差异基因作为前列腺癌预测的疾病靶点,并检索GeneCards和OMIM数据库作为补充。应用STRING数据库和Cytoscape软件构建靶点蛋白相互作用(PPI)网络,并筛选核心靶点。采用Metascape数据库进行富集分析,使用PyMOL、AutoDock Tools、AutoDock Vina软件以及PDB数据库进行分子对接。结果 共预测到236个芹菜素抗前列腺癌作用靶点,主要与激素反应、细胞死亡调控及激酶调节有关,且京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集通路与前列腺癌密切相关。筛选得到70个核心靶点,分子对接发现B细胞淋巴瘤因子-2(Bcl-2)、V-Jun肉瘤病毒癌基因同源物(JUN)、低氧诱导因子-1A(HIF-1A)、肿瘤坏死因子(TNF)、ERG、雌激素相关受体α(ESRRA)与芹菜素有良好结合力。结论 芹菜素通过多靶点和多通路实现抗前列腺癌作用。

关键词： 香蜂草苷   非酒精性脂肪肝   代谢组学   网络药理学   高分辨液相色谱—质谱   鞘脂代谢通路   胰岛素抵抗  

摘要： 目的:利用非靶向代谢组学联合网络药理学研究香蜂草苷改善非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)脂代谢的作用机制。方法:将大鼠随机分为正常组、模型组和香蜂草苷组。模型组与香蜂草苷组给予高脂饮食(HFD)8周诱导NAFLD动物模型。灌胃给药,连续8周。采用苏木精—伊红(HE)、油红染色观察细胞形态和脂质堆积情况。用高分辨液相色谱—质谱(UPLCQTOF/MS)对大鼠肝组织进行代谢组学检测,并利用KEGG数据库分析代谢通路。采用网络药理学对香蜂草苷与NAFLD共同作用的靶点进行预测,并联合代谢组学进一步分析潜在的靶点。结果:香蜂草苷明显减轻大鼠肝损伤、抑制肝脏脂质的过度沉积;正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)分析显示组间的代谢物有显著差异,火山图显示正常组与模型组存在404个差异代谢物(上调293个,下调111个),模型组与香蜂草苷组存在147个差异代谢物(上调95个,下调52个);代谢通路分析显示差异代谢物主要富集于鞘脂代谢通路;网络药理学筛选药物与疾病共同靶点共139个,联合代谢组学和网络药理学分析显示,香蜂草苷可通过调节TNF、Bcl2、Mapk8、Pik3ca、Akt1、mTOR、Gsk3β来调控鞘脂代谢通路和胰岛素抵抗。结论:香蜂草苷能够通过鞘脂代谢通路和胰岛素抵抗调节脂质代谢紊乱从而发挥治疗NAFLD的作用。

关键词： 蒙药   诃子   药理作用  

摘要： 蒙药诃子是蒙医三子汤(以诃子、川楝子、栀子为等剂量的蒙药方子)等经典方中常用的传统植物药物,有“药中之王”之称,成分丰富多样,主要含鞣质类、酚酸类和三萜酸类物质。诃子具有抗菌,抗病毒,抗氧化、清除自由基,降血糖,降酶保肝,抗肿瘤等药理作用。蒙药诃子在蒙医方剂配伍、蒙药炮制、蒙医临床用药中扮演着不可缺少的角色。本文基于诃子的最新实验研究浅述了诃子的药理作用并完善其整体功效。为诃子在方剂配伍规律及临床应用研究提供参考和借鉴。

关键词： 冬虫夏草   慢性阻塞性肺疾病   网络药理学   分子对接   花生四烯酸   啤酒甾醇   β-谷甾醇   麦角醇  

摘要： 目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨冬虫夏草干预慢性阻塞性肺疾病的物质基础及作用机制。方法 通过TCMSP等数据库筛选冬虫夏草活性成分并预测其作用靶点。采用GeneCards、OMIM数据库筛选慢性阻塞性肺疾病靶点,合并后去重,与活性成分靶点取交集。运用String数据库构建交集靶点的蛋白质相互作用(PPI)网络图,利用Cytoscape 3.8.2软件进行拓扑分析和可视化处理。采用Metascape数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用SwissDock、Pymol软件进行分子对接验证。结果 筛选得到冬虫夏草14个主要活性成分,包括花生四烯酸、啤酒甾醇、β-谷甾醇、麦角醇、黄豆黄素、棕榈酸胆固醇酯、胆固醇、乙酸亚油酯、豆甾醇、过氧麦角甾醇、菜油甾醇、腺苷、D-甘露醇和麦角甾醇。冬虫夏草活性成分与慢性阻塞性肺疾病相关的交集靶点有91个,核心靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、肿瘤蛋白p53(TP53)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、非受体蛋白酪氨酸激酶(SRC)等。GO和KEGG分析结果显示,冬虫夏草干预慢性阻塞性肺疾病的作用机制主要涉及癌症通路、癌症相关蛋白聚糖、脂质和动脉粥样硬化通路、Ca2+信号通路、VEGF信号通路、TRP通道的炎症介质调节通路等。分子对接结果显示,冬虫夏草活性成分啤酒甾醇与核心靶点MMP9具有较高亲和力。结论 本研究发现冬虫夏草可能通过其有效成分花生四烯酸、啤酒甾醇、β-谷甾醇、棕榈酸胆固醇酯、乙酸亚油酯、腺苷、麦角甾醇等作用于TNF、TP53、CASP3、EGFR、MMP9、SRC等慢性阻塞性肺疾病相关靶点,通过调控癌症通路、癌症相关蛋白聚糖等发挥干预慢性阻塞性肺疾病的作用。

关键词： 胶质母细胞瘤   知母皂苷AⅢ   基质金属蛋白酶   网络药理学   分子对接   中药研究  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接和体外实验验证探索知母皂苷AⅢ(TIA)治疗胶质母细胞瘤(GBM)的潜在靶点及其信号通路。方法利用Pharmmapper数据库预测TIA的作用靶点,通过GeneCards数据库获得GBM相关的疾病靶点;通过STRING数据库得到交集靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图,并使用Cytoscape 3.6.0软件进行筛选和分析;交集靶点通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能注释分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用分子对接技术考察TIA与关键靶点的结合能力。最后,采用GBM细胞U-87MG、U251进行体外细胞实验,运用细胞计数试剂盒(CCK-8)实验检测细胞存活率、Transwell迁移测定实验检测细胞迁移能力,采用Western blot实验、实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)实验及药物亲和反应的靶点稳定性(DARTS)实验等验证网络药理学分析结果。结果网络药理学预测结果显示,TIA作用靶点与GBM疾病靶点存在65个潜在共用靶点;GO分析结果主要集中在炎症应答、细胞增殖的正向调节等过程;KEGG富集分析显示,TIA通过免疫球蛋白G Fcγ受体(FcγR)介导的吞噬作用、谷胱甘肽代谢等信号通路发挥作用;分子对接分析结果显示,TIA与基质金属蛋白酶-2(MMP-2)的结合潜能最强。体外细胞实验结果显示,TIA呈选择性和剂量依赖性抑制人GBM细胞U-87MG和U251的体外增殖和迁移,并通过靶向亲和MMP-2,抑制其表达而发挥作用。结论TIA可能通过靶向结合MMP-2并抑制其表达而抑制GBM细胞的体外增殖和迁移。

关键词： 桃红四物汤   动静脉内瘘   网络药理学   分子对接   分子动力学模拟  

摘要： 动静脉内瘘(AVF)失功与血液透析患者的临床预后呈负相关。本研究旨在通过网络药理学探索桃红四物汤改善AVF通畅性的潜在机制,并通过分子对接及分子动力学模拟技术进行验证。通过TCMSP、TCMIP以及Swiss Target Prediction数据库获取桃红四物汤的活性成分及其潜在靶点,AVF失功相关的靶点则通过OMIM、Dis Ge NET及Gene Cards数据库筛选。利用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点网络,并通过STRING平台构建蛋白质相互作用网络。GO与KEGG信号通路富集通过Metascape数据库实现。采用Auto Dock软件进行核心成分与疾病靶点的分子对接,并通过Py MOL实现图像可视化。利用GROMACS软件对核心成分-靶点复合物进行分子动力学模拟以验证其稳定性。共获得桃红四物汤66个活性成分与769个潜在靶点,以及疾病相关靶点87个,筛选的核心化学成分为gibberellin A120、gibberellin A30、kaempferola、paeoniflorin,主要作用靶点为TNF-α、IL6、VEGFA和MMP9。信号通路富集表明桃红四物汤改善AVF失功的潜在机制主要为减轻炎症、调节流体剪切应力、以及改善细胞外基质重塑。分子对接提示核心成分与治疗靶点能自发结合,分子动力学模拟同样证实成分-靶点复合物的稳定性。研究表明,桃红四物汤可能通过改善炎症、流体剪切力、以及细胞外基质重塑改善AVF通畅性,为桃红四物汤的临床应用提供了分子学基础。

关键词： 新三中心   以学为中心   药理学   教学模式  

摘要： 从“老三中心”(教师、教室、教材)向“新三中心”(学生、学习、学习效果)转变,已成为新时代高等学校“教与学”模式改革的主要方向。以药理学课程为例,文章遵循“新三中心”教学范式,研究如何设置学习目标主导、设计层层问题引导、组织团队活动任务、翻转虚-实实验课堂、评定多元学习成效,构建基于“新三中心”的、以“明学、引学、思学、用学、评学”为进阶流程的五步进阶教学模式,为推动“以学为中心”教学改革提供借鉴。

关键词： 芪丹糖肾颗粒   糖尿病肾病   网络药理学   作用机制   动物实验   PI3K/Akt信号通路  

摘要： 目的探讨芪丹糖肾颗粒治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。方法通过TCMSP和HERB数据库获取芪丹糖肾颗粒的主要成分,利用SwissTargetPrediction数据库获得芪丹糖肾颗粒的作用靶点。通过OMIM,GeneCards,TTD数据库获得疾病作用靶点,采用Venny 2.1软件得到药物作用靶点和疾病作用靶点的共有靶点;使用Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络,使用STRING数据库对共有靶点进行蛋白相互作用(PPI)分析,并使用Cytoscape软件的Network Analyzer功能分析芪丹糖肾颗粒治疗DN的核心成分和核心靶点。利用DAVID数据库对共有靶点进行基因本体论(GO)功能富集及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。以药理学实验验证DN模型大鼠中PI3K/Akt信号通路相关蛋白的表达情况。结果共检索出药物主要成分121个,药物作用靶点909个,疾病作用靶点997个,共有靶点107个,拓扑分析得药物治疗DN的核心成分17个。GO功能富集分析得相关功能条目825个,包括生物过程646个,细胞组分81个,分子功能98个,主要包括基因表达的正调控、细胞质膜、蛋白结合等。KEGG通路富集分析共得到通路147条,主要涉及癌症通路、AGE-RAGE信号通路、HIF-1信号通路、PI3K/Akt信号通路等。在药物作用下,DN模型大鼠肾组织匀浆中p-PI3K/PI3K及p-Akt/Akt蛋白表达水平均显著降低(P<0.05)。结论芪丹糖肾颗粒可经过多个作用靶点和多条信号通路干预DN,通过调控PI3K/Akt信号通路改善肾损伤可能是其作用机制之一。