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关键词： 金纳多   病理性瘢痕   网络药理学   分子对接   信号通路  

摘要： 目的:采用网络药理学-分子对接-实验验证的方法探讨银杏叶提取物金纳多的物质基础与在病理性瘢痕治疗中的潜在机制。方法:在DGIdb、DrugBank、Swiss Target Prediction和TCMSP数据库中输入关键词“银杏叶”,获得金纳多的作用靶点;从GeneCards、DisGeNET、OMIM和DrugBank数据库获得病理性瘢痕病变疾病相关靶点,取上述靶点交集即为金纳多抗病理性瘢痕作用靶点。将该靶点上传至STRING数据库,所得数据导入Cytoscape 3.9.1,构建蛋白互作网络,筛选出核心作用靶点;使用DAVID数据库对金纳多抗病理性瘢痕作用靶点基因进行GO和KEGG富集分析,对核心作用靶点与金纳多结合力进行分子对接验证,建立小鼠病理性瘢痕模型并验证金纳多抗病理性瘢痕生成的作用。结果:共获得金纳多抗病理性瘢痕作用靶点38个,并筛选出核心靶基因7个,分别为MAPK1、JUN、IL6、FOS、TNF、MAPK14和AKT1。KEGG途径分析富集的信号通路包括:糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、脂质和动脉粥样硬化、IL-17信号通路等。分子对接显示,核心靶基因MAPK1、MAPK14和AKT1与金纳多亲和力较好,尤其与槲皮素、木犀草素、山奈酚具有强烈的结合活性。小鼠病理性瘢痕模型给药实验显示,与模型组相比,静脉推注20 mg/(kg·d)金纳多的小鼠病理性瘢痕组织转移生长因子(transforming growth factor-β1,TGF-β1)表达显著下降(P<0.05)。结论:金纳多抗病理性瘢痕生成具有多靶点、多途径的特点。金纳多主要通过作用于MAPK1、MAPK14及AKT1等核心靶点基因,影响PI3K/AKT/mTOR通路和MAPK信号通路等发挥对病理性瘢痕的治疗作用。

关键词： 土茯苓   文献计量学   网络药理学   抗痛风   抗炎   免疫调节   落新妇苷   新落新妇苷  

摘要： 土茯苓Smilacis Glabrae Rhizoma为百合科植物光叶菝葜的干燥根状茎,具有解毒除湿、通利关节的功效。主要用于治疗银屑病、痛风、慢性肾炎等疾病。研究表明,土茯苓的活性成分主要包括黄酮类、苯丙素类、甾体类、有机酸类、挥发油类等。大量研究证实土茯苓具有抗炎、免疫调节、抗氧化、抗肿瘤等药理作用。通过对近年来国内外关于土茯苓化学成分和药理作用研究报道进行总结,为土茯苓的开发利用提供理论基础,以期获得更好的实用价值。

关键词： 蚕茸柱天胶囊   少精子症   弱精子症   网络药理学   分子对接模拟  

摘要： 目的通过网络药理学以及分子对接技术探索蚕茸柱天胶囊对少弱精子症发挥药效的作用机制。方法通过TCMSP数据库收集蚕茸柱天胶囊中的有效成分及相关靶点蛋白,采用PubMed与中国知网并结合HERB数据库对成分进行补充收集,通过SwissADME平台及Swiss Target Prediction平台筛选成分并预测靶点;少弱精子症的疾病靶点于GeneCards和OMIM数据库中进行检索。通过Cytoscape软件构建成分-交集靶点互作网络;利用STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络;应用Metascape数据库GO功能及KEGG通路富集分析;最终采用CB-DOCK2对筛选得到的核心成分与核心靶点进行分子对接。结果共收集了209种成分,相关靶点447个。共检索到680个疾病靶点,映射取交集后,获得交集靶点49个。分子对接结果则表明蚕茸柱天胶囊的活性成分与少弱精子症潜在靶点具有良好的结合能力,说明网络药理学结果可靠。结论木犀草素、20-羟基蜕皮甾酮等作为蚕茸柱天胶囊主要成分,作用于TP53、ALB、TNF等潜在靶点,调节癌症通路、MAPK信号通路等发挥抗少弱精子症的作用。

关键词： 三阴性乳腺癌   网络药理学   白花蛇舌草  

摘要： 三阴性乳腺癌(TNBC)在乳腺癌中预后较差且治疗手段有限。本研究采用网络药理学方法,以白花蛇舌草为对象探究其对 TNBC 的抑制机制。结果 显示,白花蛇舌草的黄酮类、蒽醌类等多种化学成分对应多个活性成分靶点,与 TNBC 靶点交集后获得关键靶点如 ABCB1、ABCG2 等。其参与的生物学过程包括 icosanoid 代谢、跨上皮转运等,涉及 ABC 转运蛋白通路、化学致癌-DNA 加合物通路等信号通路。表明白花蛇舌草通过多成分、多靶点、多通路的协同作用对 TNBC 产生抑制效果,为 TNBC 的中医药治疗提供了科学依据与新思路,也为后续进一步研究其具体作用机制及药物研发奠定了基础。

关键词： 金藤清痹颗粒   网络药理学   膝骨关节炎   炎症因子   软骨损伤  

摘要： 目的基于网络药理学探讨金藤清痹颗粒对大鼠膝骨关节炎(knee osteoarthritis,KOA)的影响及与促进线粒体自噬改善铁死亡的相关性。方法通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库搜集金藤清痹颗粒的活性成分及靶点,利用人类基因数据库(Gene Cards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online Mendelian inheritance in Man,OMIM)等数据库搜集KOA及金藤清痹颗粒药物作用靶点,构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络和“中药-活性成分-靶点”网络。应用Autodock软件对筛选出的有效成分和关键靶点进行分子对接。将大鼠随机分为对照组、假手术组、模型组、双氯芬酸钠(5 mg/kg)组和金藤清痹颗粒高、中、低(5.4、2.7、1.4 g/kg)剂量组,各组ig相应药物,1次/d,给药4周后取材。ELISA检测白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、IL-6、肿瘤坏死因子α(tumornecrosisfactor-α,TNF-α)的含量;苏木素-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色评估软骨病理变化;蛋白免疫印迹(Western blotting,WB)法检测半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-1(cystein-asparate protease-1,Caspase-1)、核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)、磷酸酶及张力蛋白同源物诱导的蛋白激酶1(PTEN-induced putative kinase 1,Pink1)、帕金抗体(Parkinson disease,Parkin)、泛素结合蛋白(sequestosome 1,SQSTM1/p62)、膜铁转运蛋白1(ferroportin 1,FPN1)、谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxidase 4,GPX4)、酰基辅酶A合成酶长链家族成员4(acyl-CoA synthetase long chain family member 4,ACSL4)、铁蛋白(ferritin)、转铁蛋白受体蛋白1(transferrin receptor protein 1,TFR1)、过氧化还原酶3重组蛋白(recombinant peroxiredoxin 3,PRDX3)的表达。结果数据库共检索到金藤清痹颗粒116种活性成分、268个作用靶点,共有靶点107个,关键靶点涉及NF-κB信号通路、线粒体自噬信号通路等;分子对接结果提示靶蛋白与小分子之间存在结合位点且结合能较低,提示有较强的结合活性。动物实验结果表明,与对照组比较,模型组大鼠IL⁃1β、IL⁃6、TNF⁃α水平显著升高(P<0.01、0.001);膝关节软骨病理组织增生明显;Pro-Caspase-1、p-NF-κB、NF-κB、p62、ASL4、TFR1、PRDX3表达量显著上升(P<0.05);Pink1、Parkin、FPN1、GPX4、ferritin表达量显著下降(P<0.05),自噬蛋白Beclin、LC3BII/I的值显著下降(P<0.05);与模型组比较,金藤清痹颗粒各组病理形态损伤减轻;IL-1β、IL-6、TNF-α,Pro-Caspase-1、p-NF-κB、NF-κB、p62、ASL4、TFR1、PRDX3、NCOA4显著降低(P<0.05);Pink1、Parkin、FPN1、GPX4、ferritin及自噬蛋白表达量Beclin、LC3BⅡ/Ⅰ显著升高(P<0.05)。结论金藤清痹颗粒可能与增强线粒体自噬,改善铁死亡,抑制NF-κB炎症信号等实现对膝骨关节炎的治疗。

关键词： 泽漆   肺癌   网络药理学   生物信息学  

摘要： 目的基于网络药理学与生物信息学,探究泽漆抗肺癌的物质基础及分子机制。方法通过TCMSP平台,以“泽漆”为关键词,检索药物的活性成分和相应靶标,整合GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank、TCGA数据库获取肺癌基因。将肺癌基因与药物靶点取交集得到“药物—疾病”靶点,并将其导入Cytoscape数据库构建PPI网络,经拓扑分析筛选出核心成分和核心靶标。使用ClusterProfiler包进行核心靶点的GO功能和KEGG通路富集分析。利用单因素COX回归筛选预后相关靶标。最后利用AutoDockVina和Gromacs 2023对预后靶点进行分子对接和分子动力学模型验证。结果通过匹配获得“药物—疾病”潜在靶标109个,对应9种活性成分,拓扑分析筛选出32个核心基因和5种核心成分槲皮素、木犀草素、山柰酚、β-谷甾醇、柚皮素。GO分析和KEGG富集分析表明,泽漆通过T细胞增殖、B细胞活化、CD+4T细胞产生细胞因子等生物学过程中及TNF、P53、HIF-1等信号通路发挥抗肺癌作用。单因素COX分析发现6个预后相关靶点,CDK1、BIRC5、PPARG、IGFBP3、CAV1的表达与患者的不良预后相关,CAT可能是抑癌因素。分子对接和分子动力学模拟结果表明,泽漆核心成分与预后靶标蛋白具有良好的结合作用。结论泽漆可能通过山柰酚、柚皮素、木犀草素、槲皮素等核心成分作用于CDK1、BIRC5、PPARG、IGFBP3、CAV1、CAT6等靶点促进免疫激活,调控TNF、P53等信号通路发挥抗肺癌作用。

关键词： 刺五加   苷类化合物   黄酮   多糖   神经保护   免疫调节   综述  

摘要： 系统地挖掘和梳理近年来国内外刺五加相关的文献资料,从化学成分和药理作用两方面进行归纳总结,认为刺五加含苷类、多糖类、黄酮类、木脂素类等多种化学成分,具有神经保护、免疫调节、抗疲劳、抗肿瘤等广泛的药理作用。临床上刺五加常用于改善神经损伤,治疗失眠、抑郁、高血压、结肠炎等疾病。

关键词： 糖尿病症状   药物治疗方案   慢性并发症   2型糖尿病   临床结局   生存质量   代谢性疾病   治疗学  

摘要： 2型糖尿病是一组由多病因引起的代谢性疾病,严重影响患者生存质量,增加病死率。2型糖尿病及其慢性并发症的规范化综合管理尤为重要,治疗以管控高血糖和相关代谢紊乱来逆转糖尿病症状及延缓慢性并发症等。2型糖尿病相关的个性化药物治疗方案以及中医药综合干预方案有利于改善2型糖尿病患者的临床结局。有关2型糖尿病的基础研究更加深入,临床循证证据不断提升,中西医协同发展更好结合,有效推动了2型糖尿病精准防治。

关键词： 地格达-8味散   胆汁淤积型肝炎   网络药理学   分子对接   炎症   生物信息学  

摘要： 目的 结合网络药理学和分子对接技术研究地格达-8味散治疗α-萘异硫氰酸酯(ANIT)诱导大鼠胆汁淤积型肝炎模型的机制。方法 建立ANIT致大鼠胆汁淤积型肝炎模型,观察地格达-8味散对大鼠胆汁淤积型肝炎的影响;利用Cytoscape软件建立“疾病-药物-靶点”网络,确定生物学过程和信号通路;结合生物信息学方法,对其中的活性物质和作用靶标进行分子对接,初步验证其作用机制。结果 地格达-8味散可治疗大鼠ANIT致胆汁淤积型肝炎,并改善肝脏病理损伤。网络药理学预测地格达-8味散主要成分对应565个靶基因,胆汁淤积型肝炎相关基因885个,二者共有靶点131个;其中,STAT3、TNF、TP53、AKT1、SRC、VEGFA、IL1B、CASP3、PIK3R1、MAPK8等为关键蛋白。地格达-8味散的主要化学成分能与预测的靶点良好对接。结论 地格达-8味散通过AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化、流体切应力和动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子等信号通路发挥作用,且可能通过调控TNF、AKT1、TP53、SRC、STAT3蛋白起到防治胆汁淤积型肝炎的作用。

关键词： 杞菊地黄丸   失眠   抑郁症   焦虑症   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接技术,探求杞菊地黄丸治疗失眠、抑郁症、焦虑症的药理作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选杞菊地黄丸的中药活性成分,在PubChem、SEA、SwissTargetPrediction、Batman-TCM数据库获取其作用靶点;在GeneCard、CTD数据库获取疾病作用靶点,利用UniProt数据库规范靶点名称。将杞菊地黄丸中药物与疾病的靶点取交集,导入STRING平台搭建蛋白互作(PPI)网络,使用基因本体(GO)功能及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用Cytoscape 3.9.1软件构建“中药化学成分-作用靶点”网络图,最后进行分子对接试验。结果:检索到杞菊地黄丸中药物有效成分138个,作用靶点1682个,疾病靶点97个,交集靶点68个,其中CYP3A4、MAOA、NOS2、BAX、GSK3B、APP、VEGFA、IL-2、ABCB1、PARP1为核心疾病靶点,与活性成分山奈酚、槲皮素、7-O-甲基木犀草素-6-C-β糖苷等分子对接良好;GO功能富集分析得到生物过程586个、细胞组成77个、分子功能110个,其中生物过程包括对药物的反应、细胞对氮化合物的反应、细胞对有机氮化合物的反应等,细胞组成包括突触后膜、树突、树状突触等,分子功能包括神经递质受体活性、胺结合、5-羟色胺结合等;KEGG途径共292条,其中人类物种154条。GO功能及KEGG通路富集分析发现,杞菊地黄丸“异病同治”的传导通路主要涉及TNF信号通路、细胞凋亡、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路。结论:杞菊地黄丸通过一系列靶点和途径调节酶活性、激素水平、细胞凋亡,修复神经系统以及炎症,对失眠、抑郁症和焦虑症具有“异病同治”的作用。