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关键词： 刺梨黄酮   溃疡性结肠炎   网络药理学   分子对接   花生四烯酸代谢  

摘要： 运用网络药理学方法和分子对接技术探讨刺梨黄酮干预溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的核心成分和作用机制。用乙醇-纤维素酶法提取刺梨黄酮,并采用液相色谱-质谱法鉴定刺梨黄酮提取物主要的化学成分,然后通过分析平台筛选得到刺梨黄酮中34个活性成分和146个干预溃疡性结肠炎作用的靶点,构建“刺梨黄酮-活性成分-交集靶点-溃疡性结肠炎”网络。基因本体通路分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析结果显示,刺梨黄酮干预UC主要涉及花生四烯酸代谢通路、核因子κB信号通路、癌症通路等信号通路;对网络筛选的主要活性成分和关键靶点做分子对接,对接能均小于-6.0kcal/mol,显示刺梨黄酮筛选的核心活性成分和治疗UC的关键靶点有较强的亲和能力,说明网络分析结果可靠。动物实验结果显示刺梨黄酮干预可有效缓解小鼠体质量下降与结肠组织病变,并可显著抑制模型组炎症因子肿瘤坏死因子α、白细胞介素-1β和白细胞介素-6的表达(P<0.05),且Westernblot结果显示刺梨黄酮可有效地抑制花生四烯酸代谢通路的关键靶点蛋白环氧合酶-2和5-脂氧合酶的表达。综上,刺梨黄酮通过多成分-多靶点-多通路协同作用干预UC,研究结果可为刺梨功能性食品的开发与利用提供理论依据。

关键词： 中药复方   阿尔茨海默病   网络药理学   信号通路   分子机制   研究进展  

摘要： 近年来,随着人口老龄化不断加重,阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)的患病率逐年上升。AD在中医学称老年痴呆,是一种以进行性认知功能障碍和行为损害为特征的中枢神经系统退行性病变,临床主要表现为记忆障碍、失语、失用、失认,以及视空间机能障碍、人格行为改变和执行功能障碍。目前西药无法有效阻止疾病进展,且存在不良反应及耐药问题,而中药复方在治疗AD方面具有疗效显著、不良反应小等明显优势。网络药理学因其整体性、系统性与中医整体观念相契合,有助于阐释中药复方通过多靶点、多通路防治AD的作用机制,目前已在中医药研究领域广泛应用。该文详细综述了网络药理学近5年来中药复方治疗AD的研究进展,为中药复方防治AD的分子机制研究提供新思路、新策略和新方法。

关键词： 糖尿病心肌病   网络药理学   黄芩   心肌细胞   纤维化  

摘要： [目的]探讨黄芩有效成分在改善糖尿病心肌病(DCM)纤维化中的作用及机制。[方法]通过TCMSP数据库及小分子药物靶点预测在线平台(Swiss Target Prediction)挖掘黄芩有效成分及所对应的靶点,利用GeneCards、Disgenet、UniProt、OMIM数据库收集并筛选DCM相关的疾病基因靶点,获取交集基因后导入String 11.5数据库中,构建药物-疾病蛋白互作网络图,利用Cytoscape 3.9.1软件对关键靶点网络进行可视化。运用Metascape在线平台挖掘黄芩有效成分抗DCM的分子靶点,并通过KEGG数据库绘制通路图。H9c2和AC16心肌细胞经5.5 mmol/L D-葡萄糖刺激为正常糖对照组,以35 mmol/L D-葡萄糖刺激为高糖组,以10μmol/L黄芩苷进行干预,采用RT-qPCR检测转化生长因子β1(TGF-β1)、胶原蛋白Ⅰ(COLⅠ)和胶原蛋白Ⅲ(COLⅢ)的mRNA表达水平,Western blot检测Smad2/3、p-Smad2/3、COLⅠ和COLⅢ的蛋白表达水平,ELISA测定上清中TGF-β1水平。[结果]通过上述平台共检索得到包括黄芩苷在内的33个有效成分、441个核心靶点和1884个DCM疾病基因,取交集后得到黄芩治疗DCM的150个核心基因,经String-PPI得到药物疾病基因间相互作用的TGF-β1、TP53、MMP-9及IL-6等基因;KEGG富集到MAPK、PI3K/Akt等信号通路。体外实验显示,高糖刺激H9c2和AC16心肌细胞导致TGF-β1、COLⅠ、COLⅢmRNA表达水平、p-Smad2/3、COLⅠ、COLⅢ蛋白表达水平上调及显著增加上清中TGF-β1含量,黄芩苷显著减弱其表达。[结论]黄芩多活性成分通过多靶点发挥抗DCM作用,其中活性成分黄芩苷通过抑制TGF-β1/Smad信号改善高糖诱导的心肌细胞纤维化而在DCM中发挥保护作用。

关键词： 罗布麻   PTSD   作用机制   网络药理学  

摘要： 基于网络药理学和分子对接研究罗布麻对创伤性应激障碍( Post-traumatic stress disorder,PTSD)机制。方法 通过数据库检索文献获取罗布麻活性成份、作用靶点、PTSD相关靶点,采用String数据库构建蛋白网络,Cytoscape 3.9.1软件构建成份—靶点—疾病网络,metascape生物信息软件进行GO功能富集和KEGG通路分析。结果 共得到了6种活性成份和95个靶点,TNF、ALB、AKT1、IL6、TP53、CASP3、PTGS2、BCL2、IFNG、MMP9。结论 GO功能富集分析得到分子功能功能条目,主要涉及蛋白激酶结合、丝氨酸水解酶活性、膜筏、分泌颗粒腔、神经元细胞体、异生刺激的反应、磷酸化的正向调节、对激素的反应、炎症反应的调节等方面;KEGG通路富集分析分别对95个潜在靶点进行KEGG功能富集分析,筛选P值排名靠前的20条信号通路进行分析,罗布麻叶防治PTSD主要涉及脂质和动脉粥样硬化、癌症的通路、NF-κB信号通路等通路。

关键词： 不换金正气散   网络药理学   新型冠状病毒感染   分子对接   2019-nCoV 3CL水解酶  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接法探讨不换金正气散治疗新型冠状病毒(2019-nCoV)感染的活性成分。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得不换金正气散中药物相关的成分和作用靶点,通过UniProt数据库查询靶点对应的基因;运用Cytoscape(3.6.0)构建“药物-化学成分-靶点”网络;DAVID进行基因本体论功能富集分析(GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析(KEGG)。使用Autodock Vina(1.1.2)软件对不换金正气散核心化学成分与2019-nCoV 3CL水解酶进行分子对接验证。结果共获得有116个活性化学成分,对应150个靶点,主要涉及槲皮素、山奈酚、葛花苷元等化学成分。DAVID分析主要涉及多个生物学过程,KEGG通路涉及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、甲型流感、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路等。分子对接结果显示槲皮素、山奈酚、葛花苷元等主要化合物与2019-nCoV 3CL水解酶的结合能均与参照药物相近。结论初步预测了不换金正气散干预新型冠状病毒感染(COVID-19)的化学成分可与2019-nCoV 3CL水解酶结合,作用雌激素受体1(ESR1)、过氧化物酶体增殖物激活的受体γ(PPARG)、前列腺素G/H合酶1(PTGS1)等靶点,多通路协同干预,对COVID-19具有潜在治疗作用。

关键词： 网络药理学   肾间质纤维化   铁死亡   作用机制   苏黄泻浊丸  

摘要： 目的:基于网络药理学探究苏黄泻浊丸治疗肾间质纤维化(Renal Interstitial Fibrosis,RIF)及调控铁死亡的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、STRING、OMIM、Gene Cards、DisGeNet等筛选苏黄泻浊丸的中药活性成分及RIF关联靶标,借助Cytoscape 3.6.0软件构建苏黄泻浊丸活性成分-RIF靶标网络,结合STRING数据库构建方药与RIF关联靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用FerrDb数据库获取铁死亡调控基因,最终获取公共靶标基因,构建苏黄泻浊丸活性成分-RIF、铁死亡共同靶标网络,结合STRING数据库构建共同靶蛋白相互作用网络;利用DAVID数据库进行KEGG通路富集分析。结果:筛选出药物活性成分102个,与RIF关联的靶基因177个,经基因本体论(GO)、KEGG分析,苏黄泻浊丸治疗RIF的生物过程与RNA聚合酶Ⅱ促进转录的正调控、转录因子活性、序列特异性DNA结合等有关,通过调节脂质与动脉粥样硬化、白细胞介素(Interleukin,IL)-17信号通路、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、辅助性T细胞17(T Helper Cells 17,Th17)细胞分化、细胞衰老发挥作用。调控铁死亡共同基因有34个,可能参与IL-17信号通路、缺氧诱导因子-1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路、ErbB信号通路、脂质代谢、Th17细胞分化、C型凝集素受体信号通路、TNF信号通路等。结论:本研究预测了苏黄泻浊丸治疗RIF及其调控铁死亡的主要化合物、靶标及通路,为后续深入研究苏黄泻浊丸治疗RIF的作用机制提供理论参考。

关键词： 痛风性关节炎   栀黄止痛颗粒   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的通过网络药理学和分子对接技术研究栀黄止痛颗粒治疗痛风性关节炎(GA)的科学原理及作用机制。方法通过HERB数据库查找栀黄止痛颗粒的主要活性成分和作用靶点,利用UniProt数据库进行靶点名称规范及转化,通过GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库总结GA相关疾病靶点,将疾病靶点与药物靶点取交集,利用Cytoscape3.8.0软件生成“药物-活性成分-靶点网络”,通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用网络,使用Cytoscape进行拓扑分析,获得核心基因;运用Metascape网页、R软件构建的数据包对核心基因进行基因本体(GO)功能和基因组数据库(KEGG)通路富集分析,最后选取核心靶点与药物活性成分进行分子对接验证。结果筛选出栀黄止痛颗粒活性成分88种,作用靶点212个;GA疾病靶点312个,疾病与药物交集靶点43个。GO富集分析共包含56条富集通路,其中生物过程4条、分子功能21条、细胞组成31条;KEGG通路富集分析得到133条通路,涉及脂质和动脉粥样硬化、IL-17信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、流体剪切应用与动脉粥样硬化等通路。分子对接结果表明药物主要活性成分与核心基因之间能相互结合并有较好的亲和力。结论栀黄止痛颗粒是通过多成分、多靶点、多途径对GA产生药理作用,这为探索该方剂药效药理作用机制建立了基础。

关键词： 地龙   溃疡性结肠炎   网络药理学  

摘要： 通过网络药理学手段研究地龙对溃疡性结肠炎治疗的效果和原理。方法 利用Batman-TCM数据库来筛选出地龙的有效活性成分,并探寻其可能的目标信息。利用GeneCards和OMIM获得治疗溃疡性结肠炎的相关作用靶点;通过STRING构建蛋白质-蛋白质互动网络,以实现成分目标与溃疡性结肠炎治疗目标的融合。利用DAVID的数据库,我们对地龙的抗UC目标进行了GO和KEGG的聚类分析。结果 我们已经找到301个地龙的有效成分目标,并且,我们使用PPI网络交叉分析方法找到了主要的治疗基因,还对蛋白质群体做了生物学上的功能解读。另一方面,KEGG的通道聚合研究揭示,地龙治疗UC的过程中,存在着与代谢、免疫反应以及炎症反应有关的众多相关途径。结论 地龙活性调控多条炎症、免疫及代谢相关通路,能多途径、多成分、多靶点治疗UC。

关键词： 课程思政   医学教育   药理学   专业必修课程   教学设计与实践   立德树人  

摘要： 药理学是医学和药学专业的专业必修课程,是基础医学和临床医学的桥梁学科。当前社会的发展离不开高水平高素质医药人才培养。课程思政是在专业课程中融入思想道德教育的新教育理念,有利于全方位培养专业人才。本教学改革研究以镇静催眠药这一章节为例,通过挖掘专业课程知识相关思政案例及价值范式,适当融入药理学教学过程中,从学生的真实反馈获得研究评价。通过分析结果发现将思政案例融入药理学教学后,显著提高了学生学习兴趣和思想道德品质,提升了专业课教学效果,还可以润物细无声地助力实现高校“立德树人”的人才培养目标,对后续推进药理学课程思政改革可提供一定的参考价值。

关键词： 加味不忘散   阿尔茨海默病   网络拓扑分析   分子对接  

摘要： 目的通过网络药理学与分子对接技术探究加味不忘散治疗阿尔茨海默病(AD)的作用机制。方法通过中药系院药理学数据库与分析平台(TCMSP)等数据库及文献查阅的方法收集加味不忘散活性成分,预测药物活性成分对应靶点,在DrugBank、在线人类孟德尔遗传(OMIM)、药物基因组学知识库(PharmGKB)、GeneCards数据库检索AD的疾病靶点,绘制韦恩图获取药物-疾病交集靶点。用Cytoscape3.9.0软件构建“中药-活性成分-靶点”作用网络并利用STRING平台绘制蛋白互作网络关系图。用R语言对交集靶点进行基因本体论(GO)和京都基因组百科全书(KEGG)分析。利用DiscoveryStudio2019软件进行分子对接验证。结果获得加味不忘散治疗AD的活性成分59个,疗靶点381个。核心靶点包括蛋白激酶B(AKT)1、TP53、JUN蛋白(c-Jun)、肿瘤坏死因子(TNF)、胱天蛋白酶(CASP)3等。生物过程主要涉及氧水平及缺氧反应、神经元的死亡、老化等;在细胞组成中膜筏、膜微域等相关性最为显著;在分子功能中转录因子结合、内肽酶活性影响因素靠前。KEGG分析结果富集在动脉粥样硬化信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、白细胞介素(IL)-17信号通路等。分子对接分析表明结合程度较好。结论加味不忘散通过多个成分作用于多个靶点,多途径改善AD。