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关键词： 对分课堂   亮考帮   重点   难点   药理学  

摘要： 文章讨论的是将对分课堂引入药理学本科教学中的实践和改进.笔者将对分课堂引入药理学教学实践,从对分课堂的5个组成部分入手进行了融合与改进,特别是对讨论环节进行了转化.实践发现对分课堂的讨论环节"亮考帮"如果只是照搬总结"亮点",用"帮帮我"和"考考你"进行讨论时,教学中出现的重点和难点学生往往抓不到,教师也难以达成教学目的.针对此情况,实际应用笔者进行了改进,通过重难点转化,提高了学生学习动力和效率,使得对分课堂更好地匹配药理的教学实践,达到更优质的教学效果.

关键词： 网络药理学   分子对接   黄芪   阿尔兹海默病   作用机制  

摘要： 为了研究黄芪中活性成分治疗阿尔兹海默病的作用机制,采用网络药理学与分子对接模拟方法,利用相关数据库确定疾病靶点,构建靶点相互作用和药物-成分-靶蛋白-疾病网络,在DAVID数据库进行基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书数据库通路富集分析,并对靶点进行分子对接模拟验证。结果表明:筛选到20种黄芪抗阿尔兹海默病的活性成分,其中槲皮素、山奈酚、异鼠李素、刺芒柄花素、 7-O-甲基-异微凸剑叶莎醇为关键成分;筛选出118个交集靶点,含6个关键靶点,各靶点富集于炎症反应细胞凋亡等生物过程;分析得到180条信号通路,作用机制主要与TNF、 PI3K-Akt、 IL-17等通路相关。

关键词： 功能性便秘   六味安消颗粒   超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱技术   网络药理学   分子对接   物质基础   作用机制  

摘要： 目的探讨六味安消颗粒治疗功能性便秘(FC)的药效物质基础及作用机制。方法采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)技术分析六味安消颗粒的化学成分,并通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、DrugBank数据库筛选六味安消颗粒中各药物的活性成分;利用PubChem、Swiss Target Prediction数据库检索活性成分对应靶点,采用在线人类孟德尔遗传(OMIM)、Gene-Cards、DrugBank数据库检索FC疾病靶点,成分靶点与疾病靶点取交集后获得六味安消颗粒治疗FC的潜在靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件构建“药物-成分-靶点”及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并分析其核心成分及核心靶点。对潜在作用靶点进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用Cytoscape 3.7.1软件构建“成分-靶点-通路”相互作用网络。利用AutodockVina.2.0对获得的核心成分及核心靶点进行分子对接验证。结果六味安消颗粒中共鉴定出化学成分61个;网络药理学分析结果显示,山柰酚、对甲氧基肉桂酸乙酯、大黄酸、异土木香内酯、鞣花酸、芦荟大黄素可能通过细胞肿瘤抗原(TP53)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)等核心靶点,调节磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路发挥治疗FC的作用;分子对接结果进一步证实上述核心成分与核心靶点间均具有良好的结合性能。结论该研究初步阐明了六味安消颗粒治疗FC的药效物质基础及作用机制,为后续的临床应用及药物开发提供了依据。

关键词： 益母草   宫腔粘连   microRNA   网络药理学   分子拼接  

摘要： 目的通过microRNAs差异分析、网络药理学及分子对接技术,探讨益母草治疗宫腔粘连(intrauterine adhesion,IUA)的潜在作用靶点及相关机制。方法基于GEO(gene expression omnibus)数据库筛选IUA与健康者的差异miRNA,经multiMiR进行靶基因预测。通过TCMSP(traditional Chinese medicine systems pharmacology)数据库检索益母草有效活性成分及相关靶点,并与miRNA靶基因取交集。利用String平台进行蛋白质互作分析,利用cytoNCA筛选关键靶点。基于R语言进行基因本体(gene ontology,GO)和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。利用CB-dock2对关键靶点和活性成分进行分子对接。结果共筛选出与IUA相关的差异miRNA 43个,经靶基因预测后与IUA共有13个交集靶点,GO及KEGG富集分析结果显示,益母草治疗IUA作用机制主要与细胞衰老、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路、PI3K-Akt信号通路等有关。益母草3个特征性活性成分是花生四烯酸、山奈酚、槲皮素,可与蛋白互作网络中相对应的靶点蛋白细胞周期蛋白依赖性激酶4(cyclin-dependent kinase 4,CDK4)、芳香烃受体(aryl hydrocarbon receptor,AHR)、原癌基因c-myc编码转录因子、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)进行分子对接,主要活性成分能够与核心靶点结合,并展现出较好的亲和力。结论益母草治疗IUA是多成分、多靶点、多通路相互作用的结果,进一步证实了益母草治疗IUA的科学性及有效性,为后续实验提供了研究思路。

关键词： 胆木   化学成分   药理作用   质量标志物  

摘要： 胆木是一种药用价值较高的中药材,含有生物碱类、五环三萜及其皂苷类、有机酚酸及其苷类、环烯醚萜类、黄酮类等多种类型化学成分,具有抗病毒、抗菌、解热镇痛、抗炎、免疫调节等作用。该文对胆木已报道的化学成分和药理作用进行系统性综述,并根据质量标志物的概念,从植物亲缘性、化学成分特有性、传统药性药效、化学成分可测性、入血成分及不同产地和采收时期几方面对胆木的质量标志物进行预测分析,以期为胆木的质量评价研究提供依据。

关键词： 丹灯通脑软胶囊   中风   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术,探讨丹灯通脑软胶囊治疗中风的活性成分和作用机制。方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台、中国台湾中医药资料库、BATMAN-TCM数据库以及文献,筛选丹灯通脑软胶囊相关成分,在成分靶点预测数据库中预测其作用靶点,结合药物与疾病数据库、人类孟德尔遗传综合数据库、治疗靶点数据库和DisGeNET数据库中得到的中风靶点构建网络,通过STRING数据库对共同靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,筛选关键靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并利用Autodock Tools 1.5.7软件进行分子对接,预测核心成分和关键靶点间的结合活性。结果:共检索到丹灯通脑软胶囊相关成分161个,对应靶点856个,中风相关靶点234个,取交集得到86个共有靶点,构建PPI网络并进行拓扑学分析得到30个关键靶点,其富集分析得到2712个GO功能进程和122条KEGG通路。分子对接结果显示,核心成分槲皮素、木犀草素可以与核心靶点前列腺素内过氧化物合酶2、蛋白激酶B、基质金属蛋白酶(MMP)9、半胱天冬酶-3和MMP2稳定结合。结论:本研究预测了丹灯通脑软胶囊可能是通过调节炎症反应,改善糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(AGE)-AGE受体信号通路等途径治疗中风,表明丹灯通脑软胶囊通过多成分介导多靶点、作用于多通路来治疗中风的复杂机制,为进一步深入研究奠定了基础。

关键词： 沙棘多酚   阿尔兹海默症   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学—分子对接技术的方法初步探讨沙棘多酚治疗阿尔兹海默症(Alzheimer’s disease,AD)的作用机制。方法检索中国知网、万方数据库查找目前报道的沙棘多酚化学成分,获得沙棘多酚有效活性成分及预测靶基因。通过Cytoscape 3.8.2软件构建中药—化合物—靶点(基因)网络;采用Gencards、OMIM、DisGeNET等数据库获取AD主要作用靶点,并与化合物基因靶点作韦恩图、明确交集靶点,运用String平台构建蛋白相互作用(PPI)网络模型并挖掘网络中潜在的蛋白质功能模块;通过Metascape平台进行基因本体(GO)功能富集分析及基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其生物过程及作用通路。应用Cytoscape3.8.2软件构建“药物成分-作用靶点-作用通路”网络,运用AutoDock vina软件对核心成分及关键靶点进行分子对接。结果共获得12个沙棘多酚候选化合物、142个成分靶点以及95个沙棘多酚与AD的共同靶点。网络分析结果显示,沙棘多酚调治AD的核心活性成分为阿魏酸、藜芦酸、咖啡酸等,核心靶点包括ALB、EGFR、PTGS2、STAT3、CTNNB1、MMP9、ESR1、TLR4、ICAM1和PPARA。GO和KEGG分析显示,沙棘多酚治疗AD的通路主要富集在化学致癌-受体活化、癌症的通路和糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等。其功能主要为氧化还原酶活性、丝氨酸水解酶活性和金属蛋白酶活性等。分子对接研究显示,沙棘多酚的5个关键治疗AD的化合物可与5个核心基因的对接口袋相匹配。结论沙棘多酚可通过多个化合物作用于多个分子靶点和通路发挥对AD的治疗作用。

关键词： 茅莓   皂苷   茅莓总皂苷   黄酮类化合物   抗肿瘤   神经保护   黑色素瘤  

摘要： 茅莓Rubus parvifolius为蔷薇科悬钩子属落叶小灌木,其提取物及有效部位具有抗肿瘤、保护神经、保护肝损伤等药理作用。抗肿瘤是其研究热点,在体内外实验中,茅莓提取物对人恶性黑色素瘤、白血病、肝癌均表现出明显的抗肿瘤作用,可显著抑制肿瘤细胞生长、侵袭和迁移,以及诱导细胞凋亡,其抗肿瘤的主要有效部位为茅莓总皂苷。茅莓提取物对脑缺血-再灌注损伤也有神经保护作用,作用机制为增加Bcl-2表达和降低Bax表达,主要有效部位为茅莓总皂苷。茅莓提取物的抗氧化能力与清除羟自由基、超氧负离子、有机自由基及抑制丙二醛等有关,主要有效部位为茅莓总黄酮。茅莓提取物对肝脏损伤也有保护作用,与清除自由基活性相关,主要有效部位为酚类化合物。茅莓提取物及有效部位的其他药理作用还有抗炎、抗骨吸收、抗菌、抗疲劳等。综述了茅莓提取物及有效部位的药理作用及研究现状,以期为茅莓的进一步研究及新药开发提供参考。

关键词： 祛痰合剂   祛痰镇咳   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学方法,探讨祛痰合剂的祛痰镇咳作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台、Symmap数据库和BATMAN数据库获取祛痰合剂的成分,以口服生物利用度≥30%、化合物类药性≥0.18为标准筛选出药物中的有效成分,利用PubChem数据库和SwissTargetPrediction数据库筛选活性成分并预测其作用靶点,通过Cytoscape构建疾病-药物-成分-靶点网络;利用STRING数据库对靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,并通过R语言计算核心靶点,最后采用DAVID数据库对药物作用疾病相关靶点进行基因本体功能富集分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。结果:通过筛选得到22个主要活性成分、药物-疾病相关靶点298个,提示祛痰合剂可能是通过药物应答、磷脂酶C激活G蛋白偶联受体信号通路及细胞增殖正向调节作用等生物过程,酶结合、蛋白激酶活性及药物结合等分子功能发挥祛痰镇咳的作用,其机制可能与神经活性配体-受体相互作用、环腺苷酸信号途径和钙信号通路等多个通路的调控作用密切相关。结论:祛痰合剂可以通过多成分、多靶点、多通路的方式发挥其祛痰镇咳的作用机制,本研究为进一步探索祛痰合剂祛痰镇咳的机制奠定了研究基础。

关键词： GEO基因芯片   慢性胃炎   胃黏膜上皮内瘤变   胃早期癌   参苓脾喜汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 基于GEO基因芯片、网络药理学及分子对接技术探讨参苓脾喜汤防治慢性胃炎(CG)、胃黏膜上皮内瘤变(GIN)、胃早期癌(EGC)的作用机制。方法 从GEO数据库下载含CG、GIN、EGC基因芯片GSE130823,使用R4.1.1筛选共同差异表达基因。利用TCMSP数据库筛选参苓脾喜汤活性成分及对应靶点,使用R4.1.1对共同表达基因与药物靶点取交集,通过Cytoscape3.9.1软件构建中药-活性成分-靶点网络,并通过STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络并进行拓扑分析,以筛选核心靶点,使用R4.1.1对交集基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。最后将排名靠前的药物活性成分与核心靶点蛋白进行分子对接验证。结果 共筛选出1 115个差异表达基因,参苓脾喜汤活性成分119种,靶点247个,主要活性成分包括槲皮素、豆甾醇、木犀草素等。预测得到参苓脾喜汤治疗CG、GIN、EGC潜在作用靶点22个,包括CHRM3、AR、ADRB2、DPP4等。GO功能和KEGG富集分析结果显示,参苓脾喜汤治疗CG、GIN、EGC主要涉及对cAMP、IL-17、TNF、离子跨膜转运蛋白活性的调节、钙信号通路等方面。分子对接结果显示,木犀草素与ALB、AR、DPP4有较强结合能力,槲皮素与ALB、DPP4有较强结合能力,豆甾醇与AR有较强结合能力。结论 参苓脾喜汤中多种活性成分可能通过cAMP、IL-17、TNF等信号通路,调控ALB、AR、DPP4、CYP3A4等靶点治疗CG、GIN、EGC。