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关键词： 高血压   菊花   夏枯草   网络药理学  

摘要： 目的:利用网络药理学及分子对接探究菊花-夏枯草治疗高血压(hypertension)的作用机制。方法:利用TCMSP检测菊花及夏枯草的活性成分,利用GeneCards、OMIM等数据库获取与高血压病的有关靶点,运用Cytoscape软件建立“药物-活性成分-靶点”的调控网络,利用DAVID6.8进行GO和KEGG富集分析,最后使用Auto Dock Vna1.1.2软件对活性成分与关键靶点之间的分子对接。结论:共筛选出菊花及夏枯草共24个活性成分,高血压潜在治疗靶点157个,得到IL6、IL1B、AKT1、CASP3、TNF、TP53、EGFR、JUN、MMP9、MYC10个重要作用靶点;GO功能富集分析筛选出372条结果,KEGG通道富集包含肿瘤中的通道、流体切应力和动脉粥样硬化等信息通路。分子对接结果显示,主要活性成分与5个核心靶点(IL6、IL1B、AKT1、TNF、TP53)均有较好的亲和力。结论:菊花-夏枯草药对通过多成分、多靶点、多通道防治高血压,为中西医结合防治高血压提供更多的选择。

关键词： 莱菔子   生熟异治   化学成分   药理作用   活性成分   质量标志物  

摘要： 莱菔子为重要的药食兼用的传统中药,是“生熟异治,生升熟降”的典型药物。该文以莱菔子生熟异治为主题,就近年来生、熟莱菔子的化学成分和药理作用等各方面的差异研究进行综述,较全面、系统地总结了莱菔子生熟异治的研究,并基于中药质量标志物(Q-marker)的原则,通过对生、熟莱菔子的化学成分生源途径、化学成分检测技术以及双向调节药效与化学成分关联的比较分析,发现莱菔素和萝卜硫苷可分别作为生、熟莱菔子质量标志物的候选化合物。以期为莱菔子的深入炮制研究、新药开发及其临床应用安全性和有效性的提高提供参考。

关键词： 血府逐瘀汤   冠心病   缺血性脑卒中   异病同治   网络药理学  

摘要： 目的 通过网络药理学方法结合分子对接技术探讨血府逐瘀汤“异病同治”治疗冠心病和缺血性脑卒中的作用机制。方法 在TCMSP数据库检索并结合文献筛选血府逐瘀汤11味中药的活性成分和作用靶点,通过Uniprot数据库匹配靶点官方名称。从OMIM、DrugBank、DisGNET、TTD、GeneCards数据库获取冠心病和缺血性脑卒中相关疾病靶点,取交集靶点,构建“单味药—共有靶点—疾病”网络。建立蛋白间相互作用网络,利用Centiscape插件筛选关键靶点,利用MetaScape数据库进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。通过AutoDockTools-1.5.6进行分子对接预测。结果 筛选后得到血府逐瘀汤活性成分192个,作用靶点394个;与冠心病和缺血性脑卒中相关且排序靠前的通路有脂质和动脉粥样硬化、缺氧诱导因子-1、松弛素、核因子-κB信号通路等,主要与脂质代谢、炎症反应、氧化应激、血管生成和细胞凋亡等生物学过程相关。本方中主要活性成分木犀草素、山柰酚、柚皮素与靶点蛋白蛋白激酶1、白蛋白、胰岛素结合较好。结论 基于网络药理学的方法发现血府逐瘀汤通过多靶点、多途径治疗冠心病和缺血性脑卒中,且多个成分表现出良好的活性;可能通过抗氧化、抗炎、抑制细胞凋亡、调节激素水平、促进血管生成等作用,改善局部缺血缺氧状态,发挥“异病同治”作用。

关键词： 网络药理学   分子对接   白药子   活性成分   口腔鳞癌  

摘要： 为利用网络药理学及分子对接技术探究白药子有效成分对应靶基因治疗口腔鳞癌的作用机制.采用TCMSP、PubChem、GeneCards、David、STRING 11.5、SwissTargetPrediction、中国知网等数据库进行文献挖掘获取中药活性成分及疾病相关靶标,并对其进行条件筛选.运用Cytoscape3.7.2绘制白药子的“药物-活性成分-靶点-疾病”网络图,运用Venny 2.1.0网站绘制白药子有效成分-口腔鳞癌交集靶点的韦恩图,利用STRING 11.5网站,将置信度设为0.400,其他设置保持默认,提取交集基因制作蛋白互作(PPI)关系网络图,依据相互关系筛选核心靶标.制作“中药-成分-靶点-疾病”核心靶标互作网络模型.基于David数据库进行功能分析及通路富集分析,再用微生信网站(http://***/)进行可视化分析.结果得到白药子活性成分25个,筛选出有效活性成分6个,筛选出有效基因靶点155个、口腔鳞癌相关基因靶点3450个,获取相关交集靶点90个,得到20条主要KEGG通路.本研究通过网络药理学研究分析,构造白药子治疗口腔鳞癌“化合物、靶点及其途径”的互作网络,为研究白药子治疗口腔鳞癌临床应用提供理论基础.

关键词： 五味消毒饮   质量标志物   指纹图谱   网络药理学   经典名方   肿瘤   癌症  

摘要： 目的 基于HPLC指纹图谱和网络药理学对五味消毒饮中的质量标志物(Q-marker)进行预测。方法 建立15批五味消毒饮的指纹图谱,并对其进行峰指认和峰归属,利用中药色谱指纹图谱相似度评价系统软件(2012年版)进行分析;通过网络药理学对核心靶点及通路进行筛选,构建“成分-靶点-通路”网络图;以Q-marker“五原则”为核心预测五味消毒饮的质量标志物。结果 15批五味消毒饮指纹图谱相似度大于0.95,标定13个共有峰,对其中11个特征峰进行指认,分别为新绿原酸、绿原酸、秦皮乙素、隐绿原酸、马钱子苷、断氧化马钱子苷、菊苣酸、异绿原酸B、异绿原酸A、异绿原酸C、蒙花苷;通过网络药理学分析,推测绿原酸、秦皮乙素、断氧化马钱子苷、菊苣酸、蒙花苷5个成分可能为五味消毒饮的潜在Q-marker,其可能通过调节肿瘤抑制因子p53/癌蛋白Mdm2、酪氨酸蛋白激酶SRC等多个基因以及胰腺癌、前列腺癌等多条癌症疾病通路来发挥抗肿瘤、抗癌功效;同时还对五味消毒饮可用于治疗新型冠状病毒肺炎进行预测分析。结论 建立的五味消毒饮HPLC指纹图谱分析方法灵敏、快速且稳定;结合网络药理学筛选出具有溯源性和可预测性,且与五味消毒饮临床应用相关的5个化合物作为其潜在Q-marker,为今后五味消毒饮的进一步研究提供参考。

关键词： 桑寄生   牙周炎   网络药理学   分子对接   牙龈卟啉单胞菌   动物模型   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学方法探究桑寄生治疗牙周炎的作用机制并通过分子对接和体内实验验证,探究桑寄生乙醇提取物对牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,P.g)生长作用的影响以及对实验性大鼠牙周炎的治疗效果。方法在中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)中检索桑寄生有效作用成分,通过Swiss Target Prediction数据库预测作用靶点,经GeneCards、DisGeNET和OMIM数据库检索得到牙周炎相关靶点,通过Venny分析获得共同靶点。采用STRING数据库构建PPI网络并筛选关键基因,经DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,采用Cytoscape 3.10.0软件构建桑寄生“药物-成分-靶点-通路”网络,经分子对接验证药物成分与靶点的结合情况。采用倍比稀释法测定桑寄生乙醇提取物对牙龈卟啉单胞菌的最低抑菌浓度(Minimum inhibitory concentration,MIC)和最低杀菌浓度(Minimum bactericidal concentration,MBC)。将42只雄性SD大鼠随机分为空白组、溶剂组、模型组、盐酸米诺环素组、桑寄生高、中、低剂量组。丝线结扎左上第一磨牙并接种P.g构建实验性大鼠牙周炎模型,每天对各组大鼠进行相应药物干预并记录体重、探诊深度(Probing depth,PD)、龈沟出血指数(Sulcus bleeding index,SBI)。14 d后拍摄X线片确定建模成功,处死各组大鼠获取血清、颌骨及牙龈组织标本。RT-PCR检测白细胞介素6(Interleukin 6,IL-6)、肿瘤坏死因子α(Tumor necrosis factorα,TNF-α)、基质金属蛋白酶9(Matrix metalloproteinase 9,MMP-9)、Runt相关转录因子2(Runt-related transcription factor 2,RUNX2)、骨钙素(Osteocalcin,OCN)、骨保护素(Osteoprotegerin,OPG)、核因子κB受体激活配体(Receptor activator of nuclear factor-κB ligand,RANKL)mRNA表达水平。ELISA检测血清中IL-6、TNF-α、MMP-9表达水平。HE染色观察炎症浸润情况。免疫组化染色观察RUNX2、OCN蛋白表达情况。结果筛选得到4个桑寄生有效成分,545个药物靶点,4151个牙周炎治疗靶点,Venny分析得到186个桑寄生治疗牙周炎的潜在靶点。PPI网络分析得到IL-6、TNF-α、MMP9等10个核心靶点。富集分析得到的主要通路为PI3K-Akt信号通路等。分子对接结果表明桑寄生有效成分与关键靶点具有较好的结合能力。桑寄生乙醇提取物对P.g的MIC为0.5 g/L,MBC为2 g/L。桑寄生乙醇提取物对实验性大鼠牙周炎的PD、SBI有良好的改善作用,可降低血清中IL-6、TNF-α、MMP-9表达,缓解牙周组织炎症情况。可促进牙周组织中RUNX2、OCN、OPG的表达,抑制RANKL的表达,调节骨稳态,缓解牙周骨组织流失。结论桑寄生乙醇提取物对P.g具有抑制和杀灭作用,可减轻炎症反应、调节骨稳态,通过多组分、多靶点、多通路的协同作用治疗牙周炎。

关键词： 王枣子叶   UPLC-Q-TOF-MS/MS   抗炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:本文旨在利用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术,快速准确地鉴定王枣子叶的化学成分,结合网络药理学和分子对接方法,探究王枣子叶抗炎的潜在分子作用机制。方法:首先通过UPLC-Q-TOF-MS/MS分析王枣子叶的主要化学成分,并利用Swiss Target Prediction数据库预测其主要成分靶点,通过GeneCards数据库收集抗炎的相关治疗靶点,运用Venny 2.1构建韦恩图取主要成分靶点、GeneCards抗炎靶点交集,其次通过String数据库构建蛋白相互作用网络,将结果导入Cytoscape 3.6.0软件构建蛋白互作网络及成分-靶点-通路网络。通过Metascape数据库对靶点基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,最后利用Autodock等软件将网络中预测到的关键活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果:从王枣子叶中共鉴定出化合物63个,显示60个抗炎作用的活性成分和203个潜在靶点。主要通过炎症反应的调节、炎症反应、细胞迁移的积极调节、磷酸化的正向调节、对激素的反应等生物过程,以及Pathways in cancer、AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications、Lipid and atherosclerosis、EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance、Proteoglycans in cancer、Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection、PI3K-Akt signaling pathway、Prostate cancer、Chemical carcinogenesis-receptor activation、Fluid shear stress and atherosclerosis等关键信号通路,发挥抗炎的作用。结论:王枣子叶的多种有效成分能够通过多靶点、多通路发挥抗炎作用。

关键词： 中国药理学会   药效动力学   药物治疗学   新药研究   药物基因组学   定量药理学   征订启事   幅面尺寸  

摘要： 本刊为中国科学技术协会主管,中国药理学会主办的全国性、学术性刊物。月刊,幅面尺寸:280mm×205 mm,120页,CN34-1206/R,ISSN1009-2501。以从事新药研究、临床药理学与治疗学工作的高中级医疗、科研、教学人员为主要读者对象。设有专论、综述与讲座、基础研究、定量药理学(包括药代动力学、药效动力学及药物临床评价等)、临床药理学(包括药物基因组学及药物蛋白组学等)、药物治疗学、读者·作者·编者等栏目。

关键词： 槲皮素   网络药理学   阿尔兹海默病   β淀粉样蛋白25-35(Aβ_(25-35))   小鼠海马神经元细胞  

摘要： 目的通过网络药理学和实验验证和探究槲皮素(quercetin)治疗阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)的作用机制。方法通过TCMSP、Swiss Target Prediction和Uniprot数据库筛选槲皮素对应的作用靶点。通过TCMIP V2.0、TCMSP、TTD、DrugBank、CTD和DisGeNET数据库得到与AD发病机制相关的靶点,并与槲皮素作用靶点进行映射,将得到的交集靶点作为槲皮素治疗AD的靶点。通过String数据库、CytoNCA和MCODE插件对槲皮素治疗AD的靶点进行各蛋白之间的相互作用研究,作用强的靶点为槲皮素治疗AD的关键靶点。将槲皮素治疗AD的靶点通过Cytoscape 3.8.2软件的ClueGO插件和DAVID数据库进行GO和KEGG信号通路富集分析。用蛋白印迹法(Western blotting)和实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)对预测的通路进行初步验证。结果筛选出与槲皮素作用的靶点有230个,与442个AD疾病靶点重合的靶点有43个,该靶点涉及多个生物学过程和54条信号通路。通过聚类分析和网络拓扑参数,得到槲皮素治疗AD的6个关键靶点,包括糖原合成酶激酶-3β(glycogen synthase kinase-3β,GSK3β)、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、淀粉样βA4蛋白(amyloidβA4 protein,APP)、磷脂酰肌醇3-激酶调节亚单位α(phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunitα,PIK3R1)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、胰岛素样生长因子Ⅱ(insulinlike growth factorⅡ,IGF2)和转化生长因子β1(transforming growth factor beta-1,TGFβ1);细胞实验结果表明,槲皮素可提高AD细胞模型中的蛋白激酶B(protein kinase B,AKT),GSK-3βmRNA水平,与调控AKT/GSK-3β通路的磷酸化有关。结论槲皮素可增强损伤神经细胞的稳定性、改善细胞膜的通透性,从而稳定细胞内环境。该作用可能与槲皮素提高AD细胞模型中的AKT、GSK-3β等mRNA水平,调控AKT/GSK-3β通路的磷酸化有关。

关键词： 溃疡性结肠炎   白及   网络药理学   分子对接  

摘要： 溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是位于直肠至结肠黏膜及黏膜下层的慢性非特异性炎症性疾病,临床主要表现为腹痛、腹泻和黏液脓血便反复发作^([1])。常见病因包括肠道通透性改变、肠道菌群失调、黏膜免疫应答、心理因素以及肠神经结构和功能异常^([2])。目前,临床尚无根治性治疗手段,治疗难度大,并且需要长期维持治疗,有进展为结肠癌的潜在风险,严重影响患者的生活质量^([3])。根据UC的临床表现,中医将其归属于“泄泻”“痢疾”范畴^([4])。脾虚、湿热内蕴是UC活动期的的核心病机,治疗以清热解毒、健脾化湿、敛疮生肌为大法^([5])。