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关键词： 糖脉康颗粒   糖尿病周围神经病变   网络药理学   分子对接   巴马汀   广玉兰内酯   11,14,17-三烯酸甲酯  

摘要： 目的通过网络药理学和分子对接的方法,探究糖脉康颗粒治疗糖尿病周围神经病变(DPN)的机制。方法利用检索中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)对筛选糖脉康颗粒的组方药物的化学活性物质,药物靶标采用Swiss Target Prediction平台进行预测,并搜索Genecards数据库、OMIM数据库、TTD数据库和DisGeNET数据库预测DPN相关靶点。对药物与疾病的靶标基因取交集后采用Cytoscape软件构建活性成分–靶点网络图,并导入String数据库构建PPI网络,进行拓扑分析寻找核心基因。采用R软件进行基因本体(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果糖脉康颗粒治疗糖尿病周围神经病变的关键化学成分为巴马汀、广玉兰内酯和11,14,17-三烯酸甲酯等;药物-疾病的共同靶点共331个,关键蛋白包括细胞肿瘤抗原p53、连环蛋白β-1(CTNNB1)、热休克蛋白90-α(HSP90AA1)等。GO富集分析显示,生物过程主要包括细胞对化学应激的反应、对营养素水平的反应和肽基酪氨酸磷酸化等,细胞组成主要包括膜筏膜微域和膜区等,分子功能主要包括蛋白酪氨酸激酶活性、细胞表面受体蛋白酪氨酸激酶活性和细胞表面受体蛋白激酶活性等。KEGG富集分析所涉及的通路有糖尿病并发症中的高糖基化终产物-高糖基化终产物受体信号通路、脂质和动脉粥样硬化、前列腺癌、表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂耐药性和癌症的中枢碳代谢等。分子对接结果显示,糖脉康颗粒中的7个关键活性成分与5个核心靶点蛋白的结合能均≤-5.0kcal/mol,说明成分和靶点蛋白结合性可能较好。结论利用网络药理学和分子对接揭示了糖脉康颗粒通过多种途径,多种信号通路作用于多种靶点发挥药效,为进一步阐释糖脉康颗粒治疗糖尿病周围神经病变的作用机制提供了依据。

关键词： 右归丸   强直性脊柱炎   网络药理学   IL-17信号通路   TNF信号通路  

摘要： 目的基于网络药理学的研究方法探讨右归丸干预强直性脊柱炎的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选出右归丸中药组成的有效化学成分及作用靶点信息,利用GeneCards及OMIM数据库获得强直性脊柱炎的靶点基因,通过VENNY 2.1.0获得右归丸组成中药与强直性脊柱炎的交集基因,借助String在线平台与Cytoscape 3.7.2软件获得PPI网络,在DAVID数据库完成GO及KEGG通路富集分析。结果共获得药物有效成分79个,有效基因靶点500个,疾病靶点基因767个,交集基因98个,PPI网络分析得到关键靶点基因是IL1B、IL6和TNF等。GO功能富集分析得到GOBP条目535条、GOMF条目88条和GOCC条目53条。KEGG富集分析得到121条通路,主要信号通路为IL-17、HIF-1和TNF等。结论该研究基于网络药理学理论,系统地分析了右归丸的中药组成可以通过多成分、多靶点、多通路等干预强直性脊柱炎的作用机制,进而起到调节免疫反应、调控炎症因子、保护软骨、延缓骨破坏等治疗作用。

关键词： 民族药   古山龙   糖尿病   网络药理学  

摘要： 目的通过网络药理学及分子对接等方法探讨古山龙防治糖尿病的作用机制。方法筛选古山龙目标化合物,采用Swiss Target Prediction对所选化合物进行靶点预测筛选,构建“成分-靶点”互作网络,结合Disgenet数据库获取糖尿病的相关基因,建立“成分-靶点-疾病”网络,对古山龙的专属成分与关键蛋白进行分子对接。结果经筛选得到古山龙15个目标化合物,预测出146个蛋白靶点,确定了84个与糖尿病相关靶点,涉及PI3K-Akt、AMPK、SignalingbyInterleukins等169条相关通路。分子对接结果显示古山龙专属成分与网络拓扑的关键靶点有很好的结合能力。结论古山龙可能是通过抗氧化,调控细胞凋亡通路,减少胰岛B细胞损伤,促进糖酵解等途径,改善糖尿病及其并发症。

关键词： 银翘散   抽动障碍   网络药理学   分子对接   炎症   神经递质  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接探讨银翘散治疗儿童抽动障碍(tic disorder,TD)的潜在药理机制。方法:借助中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)检索筛选银翘散的活性成分,利用TCMSP,SwissTargetPrediction数据库和TargetNet服务器对银翘散活性成分的靶点进行预测,通过比较毒物基因组学数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)和人类基因数据库(The Human Gene Database,GeneCards)获取抽动障碍(Tic Disorder,TD)的相关靶点。通过Venny图网站(http://***/webtools/Venn/)取银翘散活性成分靶点与TD相关靶点交集,获取银翘散治疗TD的潜在靶点。利用Cytoscape 3.8.0对有效成分及治疗靶点进行可视化,构建“中药-有效成分-治疗靶点”网络。借助STRING 11.0数据库构建蛋白互作网络,同时借助Cytoscape 3.8.0软件中CytoHubba计算网络中节点的拓扑参数,筛选出网络中的关键靶点。利用R语言的“ClusterProfiler”包对潜在治疗靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。最后,借助AutoDock Vina(Vina)平台进行分子对接,预测银翘散主要有效成分与关键靶点的结合度。结果:通过筛选得到银翘散的有效成分173个,预测靶点407个;TD相关靶点307个,银翘散治疗TD的治疗靶点共41个,其中ALB、IL-6、AKT1、APP、NR3C1等靶点在银翘散治疗TD的生物网络中具有关键作用,主要涉及神经递质传递信号、炎症、免疫等信号转导通路。分子对接结果显示银翘散活性成分与ALB、IL6、AKT1等关键靶点具有较高结合能力。结论:银翘散治疗TD的途径可能是多种活性成分和靶点的相互作用,通过调控免疫、炎症、神经递质等多条通路干预神经信号的传递。

关键词： 网络药理学   淫羊藿总黄酮   阿尔兹海默病   机制   淫羊藿  

摘要： 目的:采用网络药理学的分析方法研究淫羊藿总黄酮治疗阿尔兹海默病的机制。借助网络药理学数据库与分析平台(TCMSP)得到淫羊藿中的有效活性成分,并从中筛选出黄酮类成分。通过Pubchem和Swiss Target Prediction数据库,找到各黄酮类成分的相关靶点;采用Gene Cards数据库获取阿尔兹海默病的相关基因;淫羊藿“黄酮类活性成分-靶点-阿尔兹海默病”相互作用网络利用Cytoscape 3.9.1软件建立;采用Venny2.1.0平台获得总黄酮类成分与阿尔兹海默病的交集靶点,再将交集靶点输入STRING 11.0数据库获取蛋白质之间相互作用的网络图;采用Metascape数据库对GO功能以及KEGG通路进行分析。结果:得到淫羊藿治疗阿尔兹海默病黄酮类的核心成分12个,核心靶点为AKT1、TNF、VEGFA、SRC等10个,包括癌症途径、松弛素信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性等信号通路。结论:构建的“成分-靶点-通路”网络结构图能够揭示淫羊藿黄酮类成分的多成分、多靶点、多通路协同抗阿尔兹海默病的作用,为进一步阐明淫羊藿抗阿尔兹海默病的作用机制提供理论依据。

关键词： 高良姜   质量标志物   网络药理学   指纹图谱   化学成分  

摘要： 目的:将指纹图谱与网络药理学相结合预测分析高良姜的质量标志物(Q-Marker)。方法:采用高效液相色谱法(HPLC)对高良姜进行成分分析,对20批高良姜提取物成分进行相似度评价、聚类分析和主成分分析,筛选高良姜提取物中Q-Marker候选成分;对筛选的Q-Marker候选成分进行靶点收集和网络药理学分析,构建“成分-靶点-通路”网络,并预测高良姜提取物的Q-Marker。结果:20批高良姜指纹图谱相似度集中在0.952~1.000范围,提示不同产地和批次的高良姜提取物整体组成上具有一致性;聚类分析和主成分分析显示海南的高良姜样品聚类趋势比较一致,云南、广东和广西的高良姜未按产地归类,不同产地的高良姜在成分上存在着差异,说明产地只是高良姜质量的影响因素之一。根据HPLC共有成分以及聚类分析和主要成分分析,得到2个Q-Marker候选成分,分别为高良姜素和槲皮素。经网络药理学分析筛选6个关键活性成分,6个关键要点和21条通路。结论:本研究初步预测槲皮素、山奈酚和高良姜素为高良姜的Q-Marker,为高良姜的质量控制予与参考,同时也为高良姜功效关联物质的研究及作用机制的阐释奠定了基础。

关键词： 腱鞘炎   网络药理学   抗炎   免疫调节   作用机制  

摘要： 目的:运用网络药理学方法探讨温阳散寒活血方治疗狭窄性腱鞘炎的作用机制。方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCSMP)检索筛选温阳散寒活血方的药物活性成分及潜在靶点。结合GeneCards和OMIM数据库搜索腱鞘炎的相关基因靶点。基于Uniprot数据平台对靶点的基因名称进行整理与规范,在STRING 11.5数据平台上生成温阳散寒活血方治疗腱鞘炎的靶点蛋白互作网络,利用Cytoscape 3.9.1软件对温阳散寒活血方治疗腱鞘炎的成分、作用靶点进行分析与网络的构建,利用DAVID 6.8平台对靶点进行基因本体(GO)功能富集与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:最终筛选到温阳散寒活血方有效化学成分共计41个,作用靶点含有96个。温阳散寒活血方治疗腱鞘炎的核心活性成分有β-谷甾醇(β-sitosterol)、槲皮素(quercetin)、山柰酚(kaempferol)和杨梅酮(Myricanone)等,作用的关键靶点有IL6、VEGFA等。GO功能富集分析得到48个分子功能,KEGG富集分析得到47条信号通路,其中关系最密切的为TNF信号通路。结论:温阳散寒活血方通过多靶点、多途径抑制炎症反应,从而达到治疗腱鞘炎的目的。

关键词： 九节茶   屏障修复   作用机制   网络药理学  

摘要： 目的运用网络药理学研究九节茶多成分、多靶点、多通路修复肌肤屏障(skin barrier repair)的作用机制。方法通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)获得九节茶化学成分,以生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为阈值,筛选得到九节茶的有效成分,并利用Swiss Target Prediction网站检索到九节茶各有效成分对应的靶点;在GeneCards数据库输入关键词“skin barrier repair”,检索与屏障修复相关的疾病靶点;通过Cytoscape3.7.2软件构建“药物-疾病-靶点”的可视化网络;将九节茶有效成分与屏障修复的交集靶点通过STRING网站构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并筛选核心靶点;通过Metascape数据库进行基因本体(GO)生物过程富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;通过CB-Dock网站对九节茶主要活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果检索得到符合标准的九节茶有效成分11个,中药靶点对应的人类基因250个,屏障修复的疾病基因为4308个,中药靶点对应基因与疾病基因的交集基因190个。对190个交集基因进行基因GO功能分析,包含生物过程、分子功能、细胞组成3个方面,结果发现肌肤屏障修复生物学过程与对激素的反应、白细胞增殖调节、外部刺激反应的正调节、防御反应规则、磷酸化的正调节等方面相关;分子功能与蛋白域特异结合、磷酸酶结合、转录辅激活因子结合、非跨膜蛋白酪氨酸激酶活性、细胞因子受体结合等方面相关;细胞组成与转录调节复合物、薄膜筏、受体复合物、质膜细胞质侧的外源成分、焦点粘连等方面相关。结论KEGG通路富集分析发现肌肤屏障修复机制可能与癌症的途径、Th17细胞分化、乙型肝炎、破骨细胞分化、化学致癌-受体激活等通路相关。

关键词： 药理学实验   科研能力   综合实践能力  

摘要： 随着时代的发展,社会对专业型、创新型、复合型人才的要求越来越高。高校是培养人才的基地,故而社会对高校的教育也提出了更高的要求。实验教学是我国高校教育体系中不可或缺的重要组成部分,它对提高学生的动手能力、科研创新能力、理论结合实践的综合应用能力有着直接的作用。该文针对药理学实验教学中现存的一些问题,通过优化实验内容、开放实验室、完善考核体系等措施,增强学生科研创新素质和综合实践能力,以提高教学质量和人才培养质量。

关键词： 玉竹   生物活性成分   多糖   皂苷   免疫调节  

摘要： 玉竹不仅富含糖、蛋白质、氨基酸、维生素和矿物质等营养成分,还含较高的多糖、甾体皂苷、黄酮等生物活性成分,具有抗氧化、调节糖脂代谢、增强免疫、抗肿瘤、抗微生物、抗疲劳、抗衰老、护肝、调节胃肠道菌群、减肥等药理作用,已广泛用于普通食品和健康食品的开发利用。本文对其营养功能成分、生物活性及其在食品加工领域中的应用进展进行系统总结,以为其深入开发提供参考和支持。