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关键词： 清眩润目饮   干眼症   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:应用网络药理学和分子对接方法深入研究清眩润目饮治疗干眼症(Dry Eye Disease, DED)的作用机制。方法:首先,利用TCMSP、UniProt数据库收集清眩润目饮的活性成分及相关靶点,通过Cytoscape 3.9.1软件进行可视化,检索GeneCards与OMIM数据库获取DED的相关靶点。然后,借助venny 2.1平台绘制韦恩图,利用STRING平台构建蛋白相互作用(PPI)网络,并用Cytoscape进行可视化分析。将靶点信息导入Metascape数据库,进行后续的GO功能和KEGG通路富集分析,通过微生信平台进行可视化。最后使用AutoDock进行分子对接。结果:共获得清眩润目饮活性成分204个,对应靶点574个,DED相关靶点2621个,得到294个交集靶点;网络分析的结果显示TNF、IL-6、TP53、JUN、STAT3和AKT1为清眩润目饮治疗DED的核心靶点,槲皮素、山柰酚、木犀草素、维生素和腺苷为关键活性成分。共富集得到827条GO条目,154条KEGG通路。分子对接结果表明2种核心活性成分与TP53和AKT1均有较好结合活性。结论:清眩润目饮可能通过槲皮素、山柰酚、木犀草素、维生素和腺苷等核心活性成分作用于TP53、AKT1等核心靶点治疗DED,为清眩润目饮治疗DED提供理论依据。

关键词： 痹证   痛风   银柴胡   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 运用网络药理学及分子对接技术探究银柴胡抗痛风作用机制。方法 利用TCMSP、Swiss Target Prediction检索银柴胡作用靶点;利用DisGenet、Genecards数据库检索痛风疾病靶点并获取疾病与成分的交集基因。String数据库和Cytoscape构建关键蛋白互作网络图(PPI),随后应用DAVID数据库对关键靶点进行生物学信息分析,应用Autodock及pymol软件对核心靶点对应活性成分进行分子对接验证。结果 共筛选8个核心基因,分别为SRC、TNF、PPARA、ALB、NOS_(2、)PPARG等。这些靶点主要涉及癌症的通路、化学致癌-受体活化、脂质和动脉粥样硬化、PPAR等信号通路。结论 银柴胡可能通过银柴胡胺D、豆甾醇、菠菜甾醇等与PPAR等通路的多个靶点调节免疫反应和炎症反应发挥抗痛风作用。

关键词： 滋肾清热利湿化瘀方   多囊卵巢综合征   网络药理学   机制   AKT   p38MAPK   STAT3  

摘要： 目的采用网络药理学探讨滋肾清热利湿化瘀方(Zishen Qingre Lishi Huayu Prescription,ZQLHP)治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的作用机制,并进行实验验证。方法基于网络药理学预测滋肾方的核心成分、靶基因和主要通路,对其中PCOS相关成分、靶基因、通路进行筛选;采用来曲唑(letrozole,LET)诱导PCOS小鼠模型,观察滋肾方对PCOS小鼠的作用,并对网络药理学结果进行机制验证。结果网络药理学结果表明,滋肾方456个成分中含有361个相关靶点,PCOS相关靶点1397个,交集靶点125个;获得槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇等主要活性成分与丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、蛋白激酶1(AKT serine/threonine kinase 1,AKT1)和信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)等核心靶点;GO分析得到BP 663条目,CC 64条目,MF 119条目,其中富集基因数量较多的条目为negative regulation of apoptotic process,plasma membrane,protein binding;KEGG分析显示潜在作用靶点主要富集在癌症信号通路、PI3K-AKT和TNF等信号通路;PPI网络分析结果显示,MAPK3、AKT1和STAT3可能是滋肾方治疗PCOS的关键靶点。动物实验结果表明,与模型组比较,滋肾方组的小鼠的体重降低(P<0.05),且能有效改善PCOS模型小鼠的组织病理学表现,囊性卵泡数量降低(P<0.05),黄体数量增加(P<0.01)。降低卵巢组织中IL-10水平(P<0.01),升高IL-6、TNF-α水平(P<0.05,P<0.01)。Western blot和免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)结果显示,PCOS小鼠卵巢组织p-AKT蛋白表达量下降(P<0.05,P<0.01),p-p38MAPK和p-STAT3蛋白表达较正常组升高(P<0.05,P<0.01),而经滋肾方治疗后p-AKT蛋白表达上升(P<0.05),p-p38MAPK和p-STAT3蛋白表达明显下降(P<0.05,P<0.01)。结论滋肾方可能通过调控AKT/p38MAPK/STAT3信号改善来曲唑诱导的PCOS小鼠的炎性损伤。

关键词： 特拉唑嗪   药理学   研究进展   药代动力学  

摘要： 特拉唑嗪是一种新型抗高血压药物,作为哌唑嗪的类似物,具有选择性阻滞突触后α1-肾上腺受体的作用,可松弛血管平滑肌,控制血压;与哌唑嗪相比,特拉唑嗪具有降压作用较为缓和,作用时间长且线性量效关系良好的优点。欧美等地区的广泛临床研究表明,特拉唑嗪是一种长效的抗高血压新药,优于哌唑嗪。同时,特拉唑嗪可松弛前列腺和膀胱颈部的肌肉,使小便更顺畅,用于治疗良性前列腺疾病;在神经退行性疾病中(例如帕金森病、肌萎缩侧索硬化、阿尔茨海默病、多系统萎缩症等),特拉唑嗪能结合并激活磷酸甘油酸激酶1(PGK1),通过增强PGK1活性和促进糖酵解来保护神经元;特拉唑嗪与部分胃肠道疾病、创伤后应激障碍症、多汗症以及脑卒中的治疗也有一定的关系。本文介绍了特拉唑嗪的基本概况、药代动力学特征、临床应用及药理作用,为今后特拉唑嗪的研究提供参考。

关键词： 补阳还五汤   糖尿病血管并发症   网络药理学   实验验证   血管内皮   蛋白激酶   炎症因子  

摘要： 目的:基于网络药理学结合实验验证,探讨补阳还五汤含药血清对高糖损伤血管内皮细胞的影响。方法:基于复方网络药理学从TCMSP数据库、化源网、Swisstarget prediction数据库获取补阳还五汤有效化学成分及靶点,通过GeneCards、OMIM、Drugbank数据库收集糖尿病血管并发症相关靶点,运用String数据库构建关键靶点PPI网络图。基于Metascape数据库进行GO和KEGG富集分析。使用Autodock和Pymol软件进行分子对接验证。建立高糖诱导的HUVECS细胞损伤模型,给予5%、10%补阳还五汤含药血清;采用CCK-8法检测HUVECs细胞增殖情况,TBA法测定MDA含量;黄嘌呤氧化酶法测定SOD活性;Annexin V-FITC/PI双标记法联合Hoechst 33258、JC-1检测细胞凋亡情况;ELISA法检测IL-6、TNF-ɑ炎性因子含量;Western Blot法检测VEGF、p-AKT和AKT蛋白的表达。结果:补阳还五汤治疗糖尿病血管并发症有效成分为69个,潜在靶点306个,涉及的主要有效成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇,关键靶点有血管内皮生长因子(VEGFA),细胞炎性因子TNF、IL6等;生物学过程涉及对激素的反应、细胞对氮化合物的反应及对细胞因子的反应等,细胞组成涉及膜筏、膜侧和受体复合物等;分子功能涉及激酶活性与结合、脂质结合和转录因子结合等过程,其发挥作用机制的通路可能与脂质和动脉粥样硬化,细胞凋亡与衰老,生长激素的合成分泌,胰岛素抵抗,糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路及PI3K-AKT信号通路等相关。基于网络药理学结果佐以实验验证,结果表明与模型对照组比较,18.5 g/kg补阳还五汤10%含药血清组细胞存活率显著增加(P<0.01),18.5 g/kg补阳还五汤含药血清5%、10%组可降低受损内皮细胞MDA含量(P<0.05或P<0.01),显著提高SOD活力(P<0.01),显著抑制细胞凋亡,降低受损内皮细胞IL-6、TNF-ɑ含量(P<0.05或P<0.01),降低VEGF、p-AKT/AKT蛋白表达(P<0.01),改善高糖状态的血管内环境。结论:补阳还五汤能够改善高糖状态的血管内环境,治疗糖尿病血管并发症,机制可能与其保护高糖损伤内皮细胞,促进细胞增殖,抑制细胞凋亡及炎症因子生成,以及下调VEGF和p-AKT/AKT蛋白,调节调控PI3K/AKT信号通路有关。

关键词： 鹿蹄橐吾   镇咳   网络药理学   活性成分   分子机制  

摘要： 目的:采用网络药理学方法获取鹿蹄橐吾治疗咳嗽的潜在活性成分及蛋白靶点,并探讨可能的作用机制。方法:从PubMed等数据平台获得鹿蹄橐吾化学成分并使用SwissADME和SwissTargetprediction对其进行筛选,获取潜在成分;利用GeneCards获取咳嗽相关靶点;通过STRING和Cytoscape构建和分析PPI网络,获取核心靶点;使用Metascape平台进行GO生物功能过程和KEGG代谢通路富集分析。结果:在多平台分析下得到23个核心靶点,其对应成分中多为艾里莫芬烷型倍半萜,GO分析获取了如蛋白磷酸化正调控、炎症反应调节等生物过程,细胞膜及突触等细胞组成,以及蛋白激酶结合、蛋白质结构域特异性结合等分子功能条目。KEGG富集显示与炎症等相关的信号通路。结论:鹿蹄橐吾存在改善咳嗽病征的有效成分,且以多组分、多靶点、多通路的形式发挥作用,其机制可能涉及炎症和免疫等相关通路。

关键词： “萆薢-菟丝子”   慢性前列腺炎   中医药   网络药理学   分子对接  

摘要： 应用网络药理学与分子对接揭示“萆薢-菟丝子”药对治疗慢性前列腺炎的分子机制,为其临床应用提供新的理论依据及研究思路.从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得“萆薢-菟丝子”药对主要活性成分,利用PubChem数据库以及SwissTargetPrediction平台数据库获取主要活性成分的药物靶点,由GeneCards数据库、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DisGeNET数据库中获得慢性前列腺炎疾病相关靶点,与先前获得的药物靶点进行交集,获得共有靶点.利用DAVID 2021在线数据库对共有靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;应用STRING11.5在线数据库构建共有靶点蛋白互作网络(PPI)分析;最后通过Discovery Studio2019对靶点蛋白与关键化合物进行分子对接评价.共筛选出13个“萆薢-菟丝子”主要活性成分,包括Diosgenin薯蓣皂素、Sesamin芝麻素、NSC63551柱头甾醇、Isorhamnetin异鼠李素、beta-sitosterolβ-谷甾醇等;药物靶点312个,与疾病靶点取交集得到162个共有靶点,其中核心靶点有SRC、EGFR、PIK3R1、MAPK3、AKT1等.KEGG主要富集共142个条目,主要为癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、化学致癌-受体激活、Th17细胞分化等.Discovery Studio2019分子对接结果显示SRC与Quercetin槲皮素、EGFR及PIK3R1与beta-sitosterolβ-谷甾醇、MAPK3与NSC63551柱头甾醇结合度最高.由此可知,“萆薢-菟丝子”药对能够多成分、多靶点、多通路协同调控治疗慢性前列腺炎,且可能具有抑制前列腺炎向前列腺癌进展的潜在作用,为临床进一步研究提供了新的思路.

关键词： 网络药理学   斑马鱼   中药   药效物质   机制   质量标志物  

摘要： 网络药理学高度契合中药多成分、多靶点的整体观和系统论思想,在中药现代化过程中迅速发展。实验验证是网络药理学的关键研究内容之一。斑马鱼模型具有完整的药物代谢系统、复杂的体内环境和靶点、通路调控机制,且利用该模型开展实验具有用药量少、高通量、周期短等优势。近年来,网络药理学预测结合斑马鱼模型实验验证的研究模式,在阐明中药药效物质及作用机制方面得到广泛应用。本文对网络药理学和斑马鱼模型综合应用的进展及发展趋势进行综述,以期为该方法在阐明中药功效现代科学内涵中的应用提供参考。

关键词： 淫羊藿   后备母猪   发情   转录组   代谢组   网络药理学  

摘要： 旨在揭示淫羊藿对后备母猪发情的作用及其机理。本试验选择210~220日龄,体重(99.547±1.987)kg,发育成熟且符合配种条件的后备待配二元母猪32头,随机分为对照组和试验组,每组16头母猪,每个重复1头母猪。对照组饲喂基础日粮,试验组在饲喂基础日粮的基础上补充淫羊藿粗提物50 mg·d^(-1)。试验饲喂28 d。结果表明,试验组母猪发情提前,血清FSH、LH和E_2显著增加(P<0.05)。卵巢转录组结果表明,检测出477个上调差异mRNAs,754个下调差异mRNAs。GO富集分析发现,差异的mRNA主要富集在运输囊泡、脂肪细胞分化、节律行为、发情周期等过程;KEGG富集分析发现,差异的mRNA主要富集在紧密连接、碳水化合物代谢、刺猬信号通路、GnRH分泌和PI3K-AKT信号通路等信号通路。卵巢代谢组结果表明共有1616个代谢物上调,1254个代谢物下调。KEGG富集分析表明,差异代谢物主要富集在α-亚麻酸代谢、ATP转运蛋白、亚油酸代谢、β-丙氨酸代谢、氨基苯甲酸盐降解、生物素代谢等通路。网络药理学分析结果表明淫羊藿作用卵巢的潜在作用靶点共161个。PPI互作网络得到degree前10的蛋白作为核心靶点,根据得分依次为TP53、SRC、AKT1、CCND1、TNF、ESR1、EP300、ERBB2、JAK2、PARP1。GO分析结果表明,淫羊藿作用卵巢的靶点主要参与了蛋白磷酸化、MAPK级联反应的正调控、生物节律、基因表达的正调控、细胞凋亡过程的负调控、细胞内钙离子浓度的正调控、RNA聚合酶II启动子转录的正调控等生物学过程。KEGG分析结果显示,靶点蛋白信号通路富集在PI3K-Akt信号通路、细胞周期、细胞衰老、HIF-1信号通路、孕激素介导的卵母细胞成熟等途径。以上结果从活体、代谢、转录和分子层面揭示了淫羊藿对后备母猪发情的影响和作用途径,本研究发现饲喂淫羊藿能够改变后备母猪卵巢转录与代谢模式,显著提高FSH、LH和E_2水平,进而促进母猪发情,淫羊藿的主要成分能够与TP53、SRC、AKT1、CCND1、TNF、ESR1、EP300、ERBB2、JAK2、PARP1结合发挥调控作用。本研究为淫羊藿应用提高后备母猪发情利用率提供理论依据。

关键词： 糖尿病足溃疡   外用中药复方专利   数据挖掘   网络药理学   分子对接   动力学模拟   实验验证   清热解毒   活血化瘀  

摘要： 目的基于国家知识产权局专利数据库,分析外用中药复方专利治疗糖尿病足溃疡(diabetic foot ulcer,DFU)的用药规律及作用机制,并通过实验验证相关结果。方法根据纳入和排除标准检索数据库中治疗DFU的外用中药复方专利,去重后构建DFU外用中药复方专利集,对其进行频数、性味归经、关联规则及聚类分析,筛选治疗DFU的外用核心中药数据集;进一步建立疾病-核心中药-活性成分-共有靶点网络模型,通过共有靶点建立蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interaction networks,PPI),利用Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析;借助分子对接及动力学模拟评估潜在关键靶标与活性成分之间的结合能力与稳定性;并基于CCK-8法评估关键活性成分对细胞增殖的影响,利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)验证活性成分对PI3K及Akt信号通路的调控作用。结果共收集专利98项,包含中药281味。其中,寒性中药应用次数最多,归肝经中药应用最多,清热类中药应用最多。通过数据挖掘获得频数前3位的核心中药为当归、黄柏和红花,进一步筛选得出核心中药包含活性成分85种,其对应疾病靶点889个;与DFU靶点取交集后得到166个共有靶点,通过PPI网络拓扑分析,确定了包括肿瘤坏死因子α(TNF-α)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)等8个核心靶点。GO和KEGG通路富集分析证实,核心中药的活性成分主要作用于炎症反应及细胞凋亡等相关靶点,通过调控磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)等信号通路治疗DFU。分子对接和动力学模拟表明关键靶点与其对应的核心成分之间具有良好的结合能力及稳定性。实验研究表明,关键活性成分豆甾醇具有较高的生物安全性,其可明显上调PI3K及Akt的转录水平。结论通过多维数据挖掘分析证实治疗DFU的外用复方大多具有清热解毒、活血化瘀特性,其关键活性成分豆甾醇、二氢尼洛替星主要作用于PPARγ及TNF-α等DFU靶点;豆甾醇可明显上调PI3K及Akt信号通路发挥治疗DFU的效果。