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关键词： 胃荣汤   慢性萎缩性胃炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:本文拟通过网络药理学及分子对接技术,揭示胃荣汤治疗慢性萎缩性胃炎(Chronic Atrophic Gastritis,CAG)的机制和靶点。方法:采用TCMSP、BAT-MAN和HERB数据库搜索胃荣汤的主要成分及作用靶点;采用DisGeNET和Genecards数据库搜索CAG靶点,取药物靶点及疾病靶点的交集;运用Cytoscape3.7.1软件绘出“中药-核心成分-靶点-疾病”网络图;交集靶点导入String数据库进行PPI;通过David数据库对交集靶点进行GO和KEGG分析;通过分子对接技术对核心成分、靶点进行佐证。结果:实验表明胃荣汤和慢性萎缩性胃炎疾病的交集靶点总共86个。GO和KEGG表明,胃荣汤主要通过调控PI3K-AKT、MAPK等信号通路治疗慢性萎缩性胃炎;分子对接表明Quercetin、Luteolin、Kaempferol、Baicalein、Nicotinic acid与TP53、AKT1、TNF、IL-6、BCL-2结合稳定。结论:胃荣汤可通过多靶点、多成分、多途径的方式参与治疗CAG。

关键词： 运脾化湿清肺汤   特应性皮炎   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接探讨运脾化湿清肺汤治疗特应性皮炎(atopic dermatitis,AD)的作用机制。方法:运用中药网络药理学分析系统(TCM network pharmacology analysis system,TCMNPAS)v1.0获取运脾化湿清肺汤(陈皮、枳壳、桑叶、菊花、金银花、黄芩、土茯苓、白鲜皮、白术、甘草)的活性成分和作用靶点。运用GeneCards数据库、DrugBank数据库检索相关文献获取AD疾病靶点,并借助jvenn平台得到运脾化湿清肺汤与AD的交集靶点。将交集靶点上传至STRING数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。通过Cytoscape 3.8.0软件进行拓扑分析,从而筛选核心靶点。采用Metascape数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。利用Cytoscape 3.8.0软件构建“药物-活性成分-作用靶点”网络、“药物-靶点-通路”网络。最后,通过TCMNPAS数据库进行分子对接验证。结果:运脾化湿清肺汤活性成分243个、作用靶点344个。AD疾病靶点145个,两者的交集靶点15个。针对PPI网络进行拓扑分析,筛选得到4个核心靶点,即白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、CXC基序趋化因子配体8(C-X-C motif chemokine ligand 8,CXCL8)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)。GO功能分析主要涉及对病毒、细菌、脂多糖的应答及细胞因子受体结合、转录因子结合等。KEGG通路55条,主要涉及TNF信号通路、叉头框蛋白O(forkhead box protein O,FoxO)信号通路、低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路等。分子对接表明核心成分与活性靶点具有较好的亲和性和结合能力。结论:运脾化湿清肺汤可能通过三甲氧基黄酮、陈皮素、孕烷醇酮等活性成分作用于IL-6、TNF、CXCL8、MAPK1等靶点,调控TNF、FoxO、HIF-1等信号通路从而达到治疗AD的目的。

关键词： 喘证   慢性心力衰竭   金匮肾气丸   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学探讨金匮肾气丸治疗慢性心力衰竭的作用机制。方法借助数据库获取金匮肾气丸与慢性心力衰竭(CHF)的交集基因,利用Cytoscape 3.8.0软件构建中药化合物-靶点网络及蛋白与蛋白互作(PPI)网络,筛选关键靶点进行基因本体论(GO)和京都基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果获得金匮肾气丸与CHF的交集靶点190个,得到槲皮素、山柰酚等关键化合物。PPI分析筛选得到核心基因21个,并构建调控网络。GO分析得出生物过程2316条,主要与氧化应激等密切相关。KEGG分析获得相关信号通路178条,主要涉及高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)、白细胞介素-17(IL-17)、转化生长因子(TNF)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路等。结论金匮肾气丸主要通过多成分、多靶点、多途径作用机制治疗CHF,值得进一步研究探讨。

关键词： 网络药理学   苗药弩药   膝骨性关节炎  

摘要： 目的:运用网络药理学及实验研究苗药弩药治疗膝骨性关节炎的潜在的作用机制。方法:通过TCMSP、CNKI、BATMAN-TCM等数据库筛选弩药方潜在活性成分及作用靶点。检索OMIM、Drug bank、TDD及Genecards数据库获取膝骨性关节炎潜在作用靶点,进一步获取弩药方治疗膝骨性关节炎的潜在靶点。采用String数据库结合Cytoscape3.9.2绘制PPI网络。利用Metascape数据库对药物-疾病交集靶点进行GO及KEGG富集分析。采用RT-qPCR检测关节软骨中caspase-9 mRNA的表达。结果:共筛选得到38个活性成分,疾病与潜在活性成分共有143个交集靶点,其中包括ALB、AKT1、VEGFA、JUN、STAT3、MMP9等核心靶点;涉及的主要通路包括肿瘤通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等,弩药可显著降低关节软骨中caspase-9 mRNA的表达。结论:进一步阐明苗医弩药治疗膝骨性关节炎的潜在作用靶点及通路,有利于了解其作用机制,为后续相关研究奠定了基础。

关键词： 鼻炎,变应性   鼻敏康颗粒   网络药理学   分子对接   实验验证  

摘要： 目的借助网络药理学方法并结合动物实验预测鼻敏康颗粒治疗变应性鼻炎的分子机制。方法借助TCMSP、OMIM、GeneCards、TTD、DrugBank、PharmGKB数据库筛选鼻敏康颗粒的活性成分靶点及变应性鼻炎靶点;运用R语言软件对药物和疾病靶点映射取交集;采用Cytoscape 3.8.0软件、STRING数据库构建交集靶点PPI网络,并进行网络拓扑学分析;利用DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,并对主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证。将32只大鼠按随机数字表法分为空白组8只和造模组24只。造模组大鼠经卵清蛋白诱导建立变应性鼻炎模型。将造模成功的24只SD大鼠按随机数字表法分为模型组、西药组、鼻敏康颗粒组,每组8只。西药组灌胃氯雷他定药液1 mg/kg,鼻敏康颗粒组灌胃鼻敏康颗粒药液4.1 g/kg,空白组与模型组大鼠灌胃等体积的生理盐水,1次/d,连续2周。观察并记录30 min各组大鼠鼻炎症状,采用HE染色观察大鼠鼻黏膜病理改变,ELISA法检测大鼠血清中IL-17、IL-6水平,Western blot法测定大鼠鼻黏膜组织中TNF、STAT3蛋白表达。结果预测到鼻敏康颗粒治疗变应性鼻炎靶点41个,PPI网络拓扑学分析得到TNF、STAT3等核心靶点,GO生物过程涉及药物反应、炎症反应、细胞因子反应等,KEGG通路主要富集于Th17细胞分化、脂质和动脉粥样硬化、IL-17、Toll样受体等通路。分子对接结果显示,主要活性成分与关键靶点结合活性良好。动物实验表明,鼻敏康颗粒可改善变应性鼻炎大鼠鼻炎症状,下调血清IL-17、IL-6表达,抑制TNF-α、STAT3蛋白表达。结论鼻敏康颗粒可通过多个活性成分、多靶点、多通路治疗变应性鼻炎,其机制可能与调控Th17细胞分化通路相关蛋白有关。

关键词： 白术挥发油   化学成分   炮制   药理作用  

摘要： 白术挥发油为临床常用中药白术的主要有效部位,在白术根茎中的含量约为1.4%~2.5%,其化学成分复杂,共有约78种萜类、5种脂肪族、3种芳香族、1种甾体类和1种生物碱类,主要由苍术酮、β-桉叶醇、γ-榄香烯、白术内酯Ⅰ~Ⅲ等组成,并具有调节胃肠运动、改善肠道微生物群、抗消化道炎症、抗肿瘤、抗氧化、抗病毒等药理活性。本文系统检索了国内外白术挥发油的相关文献,针对白术挥发油的化学成分及药理作用等方面进行整理,并对其燥性、稳定性等问题做出讨论,以期为白术挥发油的深度开发与利用提供参考。

关键词： 中药   抗辐射   药理作用   作用机制   研究进展  

摘要： 中药具有高效、低毒、多靶点、特异性强等特点,其在辐射防护方面有着独特的优点。基于辐射对机体中免疫系统、造血系统和生殖系统的相关细胞及其通路损伤,以及DNA损伤和抗氧化应激,本文论述了近十年来中药及其复方抗辐射药理作用及机制的研究进展,并提出现有研究存在的问题,以期为后续新型辐射防护剂的中药产品开发提供参考。

关键词： 白藜芦醇   口腔鳞状细胞癌   网络药理学   分子对接   Src酪氨酸激酶   表皮生长因子受体   雌激素受体基因1   磷脂酰肌醇三激酶/蛋白激酶B信号通路  

摘要： 目的通过网络药理学及分子对接等生物学信息方法,探讨白藜芦醇治疗口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)的分子机制,为白藜芦醇治疗OSCC的临床应用提供参考。方法利用Swiss Target Prediction(http://***)、SEA数据库(http://***)、Pharm mapper数据库(http://***)检索获得白藜芦醇的相关靶点,以DISGENET(***)、OMIM(https://***)、GeneCards(https://***)数据库筛选OSCC疾病靶点,取药物与疾病靶点的交集,再采用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-疾病-靶点-通路”网络,String数据库构建靶蛋白相互作用网络,采用DAVID数据库对关键蛋白进行富集分析,最后通过AutoDock及PyMOL对关键蛋白进行分子对接验证,结合富集分析和分子对接结果预测白藜芦醇治疗OSCC可能的分子作用机制;细胞水平采用Western blot检测不同浓度(50、100μmol/L)白藜芦醇对OSCC细胞株HSC-3细胞Src酪氨酸激酶(Src tyro-sine kinase,SRC)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、雌激素受体基因1(estrogen receptor gene 1,ESR1)及磷脂酰肌醇三激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3 kinase/protein kinase B,PI3K/AKT)信号通路蛋白表达的影响。结果数据库得到白藜芦醇药物靶点243个,OSCC疾病靶点6094个,将药物与疾病的靶点进行交集获得116个潜在靶点,潜在靶点主要集中参与体内蛋白质自磷酸化、肽基酪氨酸磷酸化、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等生物过程,干预PI3K/AKT信号通路发挥抗OSCC的作用。分子对接结果表明白藜芦醇与EGFR、ESR1、SRC等OSCC关键靶点具有较好的结合活性。细胞实验结果表明,白藜芦醇药物干预以剂量依赖的方式抑制了HSC-3细胞中SRC、EGFR、ESR1及p-PI3K和p-AKT的蛋白表达。结论白藜芦醇对OSCC细胞SRC、EGFR、ESR1、p-PI3K、p-AKT靶点具有抑制作用。

关键词： 马甲子   白桦脂酸   结肠炎相关结直肠癌   网络药理学   分子对接   癌胚抗原   信号转导和转录激活子3  

摘要： 目的:研究马甲子(Paliurus ramosissimus,PR)对结肠炎相关结直肠癌(colitis-associated colorectal cancer,CAC)前期病变的干预作用,探索作用机制。方法:采用基因功能注解(GO)、基因数据库(KEGG)富集分析和分子对接等方法,分析马甲子提取物中主要药效成分白桦脂酸干预CAC前期病变的潜在靶点和通路;采用腹腔注射氧化偶氮甲烷(Azoxymethane,AOM)及经饮水摄入葡聚糖硫酸钠(Dextran sulfate sodium,DSS)对小鼠进行循环处理方式,建立实验性CAC前期病变小鼠模型,连续42 d灌胃给予马甲子提取物205、820 mg/kg,观察其对小鼠模型疾病活动指数(DAI)、结直肠组织病理等的影响,ELISA法检测血清中癌胚抗原(CEA)、白介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)含量,q RT-PCR法检测结直肠组织中信号转导和转录激活子3(Stat3)m RNA表达。结果:网络药理学研究筛选出157个白桦脂酸干预CAC的潜在作用靶点,对激素的反应、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路、细胞迁移的正向调节、等874个生物过程,激酶结合、蛋白激酶活性等75个分子功能,膜筏、谷氨酸能突触等37个细胞组分,涉及的主要通路有癌症通路、癌症中的蛋白聚糖、脂质和动脉粥样硬化、前列腺癌、JAK-STAT信号通路;白桦脂酸与IL-1β、STAT3等靶点亲和力均<-5 kcal/mol。与正常对照组比较,模型对照组小鼠死亡率明显增高(P<0.05),脾脏指数及组织病理评分显著升高(P<0.01),异型增生等提示癌前病变,血清中CEA、IL-1β、TNF-α含量显著升高(P<0.01),Stat3 m RNA的表达显著上调(P<0.01);与模型对照组比较,马甲子提取物820 mg/kg组组织病理评分明显降低(P<0.05),血清中CEA、IL-1β、TNF-α含量显著降低(P<0.01),Stat3 m RNA的表达显著下调(P<0.01)。结论:马甲子提取物经口给药可抑制AOM/DSS所致实验性CAC癌前病变,其作用机制与炎症抑制及下调STAT3等有关。

关键词： 柴胡注射液   发热   网络药理   分子对接   PTGS2   TP53  

摘要： 目的采用网络药理学方法及分子对接研究柴胡注射液(CI)退热作用的潜在机制。方法使用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索、文献补充获取柴胡的活性成分、潜在靶点。借助GeneCards、DurgBank以及人类在线孟德尔遗传数据库(OMMI)数据库检索发热相关靶点。运用STRING数据库将交集靶点行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析;在Cytoscape中建立“柴胡注射液-活性成分-靶点基因-发热”的网络;利用David数据库行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析;最后使用AutoDock Vina模拟分子对接。结果柴胡共有活性成分17个,作用靶点210个,发热靶点1208个,交集靶点102个。GO条目747个,涉及对外来刺激的反应、炎症反应、细胞对肿瘤坏死因子的反应、对脂多糖反应等生物学过程。KEGG通路156条,涉及AGE-RAGE、TNF、IL-17等信号通路。分子对接中成分与靶点可较好结合。结论CI通过多成分、作用于多靶点和途径对发热产生治疗作用。