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关键词： 莲子   慢性肠炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的采用网络药理学与分子对接的方法,分析莲子治疗慢性肠炎的作用机制。方法从BATMAN-TCM、TCMSP数据库中筛选莲子的有效成分及作用靶点,从GeneCards、Drugbank数据库中获取慢性肠炎的潜在靶点,取二者的交集作为研究对象,在Cytoscape中构建莲子与慢性肠炎的互作网络。使用STRING数据库构建PPI网络和MCODE模块,并使用DAVID数据库和Metascape数据库进行GO富集分析和KEGG富集分析。通过AutoDuck vina及PyMOL软件对靶基因和对应的活性化合物进行分子对接和可视化分析。结果莲子中关键有效成分与慢性肠炎的交集靶点一共58个,通过GO富集分析显示,这些基因主要富集在肠道电压门控钠离子通道与神经突触后膜,并参与了突触后膜电位的调节和钠离子跨膜转运的生物过程。KEGG富集分析显示,交集靶点富集的最主要的通路是肠神经活性配体-受体通路。分子对接结果显示,靶基因和对应的活性化合物具有较好的结合活性。结论莲子通过升高肠道乙酰胆碱酯酶活性、调节肠道5-羟色胺水平、抑制胆碱能受体在肠道中的表达,主要通过肠道电压门控钠离子信号通路和肠神经活性配体-受体通路发挥对慢性肠炎的治疗作用。

关键词： 药理学   学科融合   知识图谱   教学改革  

摘要： 药理学课程是护理学专业的必修课程,是基础医学与临床医学,医学与药学之间的桥梁课。药理学课程知识涉及生理学、生物化学、微生物学等多门基础医学课程的知识,在教学中发现,学生对先修的基础医学课程知识有遗忘,不能与药理学知识建立联系。因此,本文旨在以药理学课程为纽带,挖掘与各基础医学课程知识的前后关联关系,形成学科知识点融合网络,借助于学习通知识图谱信息技术,实施教学方法改革,帮助学生搭建起学科之间的桥梁,建立由点至线到面的知识网络。

关键词： 丹参   乳腺癌   网络药理学   分子对接   木犀草素   隐丹参酮   二氢丹参酮Ⅰ   丹参酮ⅡA  

摘要： 目的应用网络药理学和分子对接的方法探索丹参治疗乳腺癌的作用靶点及分子机制。方法由TCMSP数据库检索丹参的活性成分,由GeneCards、OMIM、TTD数据库筛选乳腺癌的作用靶点,使用Cytoscape软件构建“成分–疾病–靶点”网络图。由STRING平台构建蛋白相互作用(PPI)网络。通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,再由AutoDock Vina软件完成活性成分与核心靶点的分子对接验证,计算结合能,最终通过PyMol软件将对接结果可视化。结果筛选出丹参成分的对应靶点114个,疾病靶点2488个,得到共同靶点67个。富集分析表明共同靶点主要参与RNA转录、基因表达、细胞增殖与凋亡等生物过程,包括大分子复合物、细胞核、细胞质等细胞组分,具有酶结合、蛋白质结合、蛋白磷酸酶结合等分子功能,参与癌症通路、前列腺癌、脂质和动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路等。分子对接结果表明,木犀草素、隐丹参酮、二氢丹参酮Ⅰ、丹参酮ⅡA与关键靶点Akt1、肿瘤抑制基因(TP53)、表皮生长因子受体(EGFR)、肿瘤坏死因子(TNF)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)的分子对接结合能均小于−5 kJ/mol。结论木犀草素、隐丹参酮、二氢丹参酮Ⅰ、丹参酮ⅡA是中药丹参的主要成分,通过AKT1、TP53、EGFR、TNF、CASP3、VEGFA等关键靶点,调节癌症通路、PI3K/Akt信号通路等发挥抗乳腺癌的作用。

关键词： 冬青属   药用价值   化学成分   药理活性  

摘要： 冬青属植物具有重要的药用价值,其普遍含有三萜、黄酮等多种化学成分,在临床上有降血脂、心脑血管保护、抗菌消炎等作用。随着科学技术的发展及对于冬青属药用植物价值的发掘,有力地推动了该属植物的深入研究。本文综述了近年来国内外对常用冬青属药用植物化学成分及药理活性的有关研究,提出有必要深入研究冬青属药用植物的药理,筛选出更多的活性物质并深入发掘其在临床治疗上的用途。

关键词： 脊柱炎,强直性   三妙丸   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的通过网络药理学探究三妙丸对强直性脊柱炎的作用机制,并使用分子对接技术进一步分析相关有效成份及核心靶点。方法中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索三妙丸有效成份及作用靶点,使用人类基因数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、遗传药理学与药物基因组学数据库(PharmGKB)、疗效靶点数据库(TTD)、药物数据库(DrugBank)数据库检索疾病相关靶点,使用Perl语言进行归类数据分析,R语言绘制Venn图,分析出三妙丸作用于强直性脊柱炎的靶点。蛋白质相互作用数据库(STRING)网络平台检索靶蛋白之间相互关系,并导出PPI网络图,使用Cytoscape软件将药物有效成份及疾病相关靶点网络关系可视化。使用Bioconductor数据,R语言进行数据分析并绘制相关柱状图、气泡图、通路图。使用PubChem数据库、PDB数据库受体、配体信息,通过AutoDockTools进行分子对接、打分。结果检索出三妙丸中共44个有效成份,其中25个有效成份与强直性脊柱炎相关联;三妙丸中有效成份作用靶点203个,强直性脊柱炎相关靶点2200个,相关联靶点71个。基因本体富集分析(GO)及京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)分析,三妙丸通过白细胞介素-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、辅助性T细胞17细胞分化信号通路、破骨细胞分化信号通路、核因子-kappaβ信号通路治疗强直性脊柱炎。三妙丸有多种有效成份作用于强直性脊柱炎核心靶点环氧合酶2(COX2)、基质金属蛋白酶(MMP9),预测有效成份吴茱萸次碱、槲皮素、黄芩黄素可对COX2、MMP9靶点发挥作用。结论三妙丸治疗强直性脊柱炎是多靶点、多途径和多重机制。吴茱萸次碱可能是作用于COX2、MMP9靶点治疗强直性脊柱炎的新机制。

关键词： 卵巢癌   铂类药物耐药   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的探索中药在逆转卵巢癌铂耐药中的作用机制和潜在中药。方法通过GeneCards数据库筛选卵巢癌铂耐药潜在靶点,通过TCMSP数据库映射出可干预靶点的化合物及中药。利用Cytoscape软件构建潜在靶点—候选化合物—中药网络,进行拓扑分析和富集分析,分析潜在靶点、候选化合物和中药之间的关系,通过分子对接验证候选化合物与潜在靶点的相互作用,并分析中药的性味归经功效。结果获得逆转卵巢癌铂耐药潜在靶点111个,候选化合物235个,中药75种,发现皂素、玫瑰树碱、丹参酮、隐丹参酮、β-谷甾醇、苦参碱等化合物与PGR、AR、MAPK14、TNF、CASP3等靶点具有较强相关性,可进一步研究其抗卵巢癌铂耐药的作用。挖掘出多数中药以苦寒为主,归经于肝经和肺经。结论研究探索了中药逆转卵巢癌铂耐药中的作用机制和潜在中药,为中药临床应用和开发利用提供参考。

关键词： 口腔黏膜下纤维化   网络药理学   红花   牛膝  

摘要： 目的联合使用网络药理学和分子对接技术探究红花-牛膝的有效成分作用于口腔黏膜下纤维化(OSF)的治疗靶点。方法通过网络药理学方法获得“红花”“牛膝”的有效成分及作用靶点,以及OSF的疾病靶点。利用STRING平台构建蛋白互作PPI网络图;对关键活性成分与核心靶点进行分子对接分析,并对交集靶点进行了GO和KEGG富集分析。结果发现红花-牛膝作用于OSF的主要活性成分为木犀草素、黄芩苷、黄连素和黄连碱等;主要核心靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、低氧诱导因子1α(HIF-1α)等;主要涉及癌症中的蛋白多糖、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、白介素-17(IL-17)、C型凝集素受体等信号通路。分子对接结果亦表明活性分子与靶点基因均具备良好的结合力。结论本研究结果提示红花-牛膝可能通过多活性成分、多靶点以及多种信号通路来治疗OSF。

关键词： 白芍   化学成分   药理作用  

摘要： 白芍为毛茛科植物芍药的干燥根,主要产于浙江(杭白芍)、安徽(亳白芍)、四川(川白芍),具有平肝止痛、养血调经、敛阴止汗等功效。与白芍来源相近的赤芍为毛茛科植物芍药或川赤芍的干燥根,二者化学成分相似,但由于加工方法、炮制工艺等不同,导致二者功效及临床应用各有偏重,区别明显。现代研究表明,白芍中化学成分丰富,主要包含单萜及其苷类、三萜及其苷类、挥发油类、黄酮类、多酚类等,具有镇痛、抗炎、抗抑郁、保肝、抗肿瘤及抗高血糖等广泛的药理作用。本文从白芍的化学成分出发,对近年有关白芍有效成分及其药理学作用的研究进展进行综述,以期为白芍的综合开发利用提供参考。

关键词： 胃癌   青蒿素   网络药理学   分子对接   实验验证  

摘要： 目的:利用网络药理学和实验验证探究青蒿素抗胃癌的潜在作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库和疾病靶点数据库筛选青蒿素的作用靶点。使用Cytoscape软件构建“药物-疾病-靶点”网络图,利用String数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络图。DAVIDA数据库对交集基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,最终构建活性成分-靶点-关键通路网络。利用AutoDock Vina进行分子对接并计算结合亲和力。使用GEPIA和HPA等数据库分析核心靶点的mRNA和蛋白表达水平。结果:通过网络分析最终得到ABCB1、HSP90AA1、VEGFA三个核心靶点。功能富集分析显示,这些靶点基因通过PI3K-Akt信号通路对胃癌发挥良好的治疗效果。体外实验验证了青蒿素对胃癌细胞增殖和迁移的抑制作用,并且发现青蒿素能够下调核心靶基因ABCB1、HSP90AA1、VEGFA的表达,可能和PI3K-Akt信号通路有关。结论:本研究阐明了青蒿素在抗胃癌中的潜在靶点和分子机制,为传统中药治疗胃癌提供了新的思路和线索。

关键词： 高危型人乳头瘤病毒   槲皮素   作用机制   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨槲皮素在治疗宫颈高危型人乳头瘤病毒(high—risk human papilloma virus,HR-HPV)中的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP,https://tcmsp—***/)获得槲皮素相关靶点,利用GeneCards数据库获得HR—HPV疾病靶点,通过Venny2.1.0获得槲皮素治疗HR-HPV的潜在治疗靶点,利用String数据库构建蛋白质相互作用(protein—protein interaction,PPI)网络,利用Cytoscape进行蛋白质相互作用网络的可视化和构建,利用R语言进行基因本体(geneontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。使用AutoDock Vina软件进行分子对接。结果:从TCMSP数据库中鉴定出232个槲皮素相关靶点,从GeneCards中获得3421个疾病靶点。使用Veeny2.1.0软件获得139个潜在靶点。PPI分析显示,蛋白激酶B1(protein kinase B1,Akt1)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase1,MAPK1)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、信号转导与转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)和表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)可能是槲皮素治疗宫颈HR-HPV的中心靶点。GO和KEGG分析表明,槲皮素参与了多种功能途径、生物过程、分子类别和信号通路,包括Th17信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、EGFR信号通路、PI3K(磷脂酰肌醇-3激酶,phosphoinositide 3-kinase;PI3K)-Akt信号通路等。分子对接显示槲皮素与中心靶点结合良好。结论:槲皮素具有多方面的特性,靶向多种组分、途径和靶点,在治疗HR-HPV中主要通过调节炎症反应、氧化反应和凋亡过程进行干预。