课程文献中心 更多>>

关键词： 麻射安金丸   慢性阻塞性肺疾病   网络药理学   基因   核心靶点  

摘要： 目的基于网络药理学分析麻射安金丸治疗慢性阻塞性肺疾病(Chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的潜在机制。方法应用TCMSP中药系统药理学数据库及相关文献资料等检索麻射安金丸中的生物活性成分,筛选出作用靶点,构建麻射安金丸的药物-有效成分-作用靶点网络。根据Drugbank和Genecards等数据库建立其与COPD的相关疾病靶点,并与麻射安金丸的有效成分靶点相匹配获得潜在治疗靶点。基于Metascape数据库和DAVID数据库对潜在治疗靶点进行GO生物过程、KEGG信号通路分析,并分析蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI),用Cytoscape软件对PPI网络进行拓扑分析。结果麻射安金丸中有效化学成分有1525种,包括半夏22种、赤芍18种、川芎22种、甘草95种、僵蚕3种、苦杏仁26种、麻黄43种、牡蛎1种、木香29种、砂仁23种、射干12种和浙贝母5种,有效成分作用靶点基因298个。在药物-有效成分-靶点网络内重要性前10的有效成分中,来源自麻黄6种,赤芍、苦杏仁、僵蚕3种,射干、甘草、半夏、川芎、砂仁2种,浙贝母1种。KEGG富集分析显示,在得出的全部20调信号通路中,得到10条靠前的信号通路。GO功能富集分析显示,前10个生物过程包括酶结合、DNA依赖的转录正调控等;前10个分子功能包括核质、细胞质等;前10个细胞定位包括蛋白质变性调节、蛋白质代谢调节等。PPI网络经提取后获得了包含21个节点的核心网络,其中JUN、MAPK1、MAPK3、TNF、RELA、MYC、STAT3、TP53、AKT1、MAPK8、EGFR、MAPK14和PRKCA基因是核心靶点。动物实验显示:模型组和对照组大鼠血清IL-1β、IL-6和TNF-α均高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05);模型组大鼠血清IL-1β、IL-6和TNF-α均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。模型组和对照组大鼠MAPK1、MAPK3、MYC的mRNA表达水平均高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05);模型组大鼠MAPK1、MAPK3、MYC的mRNA表达水平均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论麻射安金丸通过多成分、多靶点和多通路治疗COPD,其中麻射安金丸的潜在有效成分主要来源于麻黄、射干、柴胡、白芍、白术和甘草,麻射安金丸治疗作用的核心靶点主要有JUN、MAPK1、MAPK3等基因。

关键词： 老年便秘   网络药理学   分子机制  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨宫毅教授临床治疗老年便秘核心用药的作用机制。方法:在TCMSP、Drugbank、TTD、Disgenet和GeneCards数据库中检索核心药物白术、党参、黄芪、当归、紫菀以及疾病的靶点;运用Venny 2.1获取交集靶点,继而于String中进行PPI分析;通过Cytoscape 3.7.1以及Metascape数据库完成可视化以及GO、KEGG富集分析。结果:得到41个活性成分、217个药物靶点、1079个疾病靶点以及94个交集靶点。其中41个活性成分中含有木犀草素、山奈酚和槲皮素等;217个核心靶点含有AKT1、IL6、TNF等;信号通路以癌症通路、MAPK通路、PI3K-AKT通路和AGE-RAGE通路为主。结论:宫毅教授治疗老年便秘以白术、党参、黄芪、当归和紫菀为核心药物,其可能通过多靶点、多通路协同交互发挥作用,需进一步实验验证。

关键词： 补中益气丸   网络药理学   UPLC-QE-MS   溃疡性结肠炎   KEGG  

摘要： 目的:在网络药理学和实验验证的基础上,探讨补中益气丸在治疗溃疡性结肠炎中的作用机制。方法:采用UPLC-QE-MS对补中益气丸进行定性分析。从GeneCards中检索到化学成分和疾病的靶点,然后构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction networks,PPI),从GO term分析和KEGG通路分析中筛选核心靶点,建立溃疡性结肠炎小鼠模型,验证其关键靶点。结果:共筛选出123个交集靶点和24个核心靶点,共鉴定出补中益气丸的41种化学成分。KEGG分析和PPI网络分析表明,补中益气丸可能通过Akt、PI3K等途径在溃疡性结肠炎的治疗中发挥作用。动物实验结果显示,补中益气丸可显著改善溃疡性结肠炎的症状,降低血清中IL-6和TNF-α水平(P<0.01),抑制Akt-PI3K信号通路,降低PI3K蛋白表达(P<0.05)。结论:补中益气丸可能通过抑制AktPI3K信号通路,抑制PI3K表达,降低IL-6和TNF-α水平,在溃疡性结肠炎中发挥作用。

关键词： 贝赫切特综合征   甘草泻心汤   药理作用分子作用机制(中药)   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接技术研究甘草泻心汤治疗白塞病(BD)的分子机制,为今后的研究提供参考。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取甘草泻心汤中七味药材的有效成分与作用靶点,并利用UniProt数据库将作用靶点基因加以注释和整合。通过GeneCard、PharmGkb、TTD、OMIM、DrugBank数据库获得BD疾病靶点,并与药物作用靶点取交集。使用Cytoscape 3.8.0软件构建药物-成分-疾病靶点网络图;使用STRING数据库构建蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络,并用Cytoscape 3.8.0软件进行分析;使用R×644.0.5软件和脚本对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用AutoDock Tools对核心靶点及核心成分进行分子对接验证。结果共筛选出甘草泻心汤236个成分、3480个靶点,986个BD疾病靶点,63个药物与疾病交集靶点,筛选出槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、豆甾醇、黄芩甙元、富马碱、汉黄芩素7个核心成分,前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、白细胞介素18(IL-18)、CC趋化因子配体2(CCL2)、基质金属蛋白酶9(MMP-9)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、CXC趋化因子配体8(CXCL8)7个核心靶点。共得到1804个GO条目,106条KEGG通路,包含晚期糖基化终末产物/晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、IL-17信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路等。分子对接结果显示,药物核心成分与疾病核心靶点之间有较强的结合能力。结论甘草泻心汤可通过多成分、多靶点、多通路治疗BD。

关键词： BOPPPS教学模式   药理学   教学效果   教学满意度  

摘要： 目的探讨BOPPPS教学模式在药理学教学中的应用效果。方法选取2023年1月—2024年1月永州市中心医院药学部的24名实习药师为研究对象,依据不同教学模式分为常规组与BOPPPS组,每组12名,两组分别采用常规教学模式、BOPPPS教学模式,对比两组实习药师的考核成绩、教学效果、教学满意度。结果BOPPPS组的理论考核成绩、实验操作成绩(90.13±4.86)分、(91.48±3.95)分高于常规组(82.47±5.61)分、(85.19±4.28)分,差异有统计学意义(t=3.575、3.741,P均<0.05)。BOPPPS组增加学习兴趣、提升学习效率、培养医学思维、加强知识运用、增加知识储备评分高于常规组,差异有统计学意义(P均<0.05)。BOPPPS组的教学满意度(100.00%)高于常规组(58.33%),差异有统计学意义(P<0.05)。结论将BOPPPS教学模式应用于药理学教学中,不仅能够使实习药师更加深入地理解药理学知识,提高学习效果,增强其学习兴趣和动力,还能够提高药理学教学质量和水平。

关键词： 药理学   实验教学   微课   TBL教学模式  

摘要： 在“互联网+”背景下,微课已成为各大高校广泛运用的一种教学模式。TBL(Team-based learning)即以团队为基础的学习模式,在提高学生团队协作能力、自主学习能力方面发挥着重要作用。将微课结合TBL教学模式应用在安徽X学院药理学实验教学中并分析其实践成效。具体将学院2018级药学专业学生作为对照组,采用传统的教学模式进行实验教学,将2019级药学专业学生作为实验组,采用微课结合TBL教学模式进行实验教学。实践表明,将微课与TBL教学模式相结合融入药理学课程实验教学中有利于形成智慧学习生态,能为学生自主学习提供有效途径,提升了学生的自主学习能力、动手操作能力、团队协作能力、发现及分析解决问题的能力,课堂方式也实现了从传统到现代的转变。

关键词： 槐角丸   结肠癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 本文通过网络药理学和分子对接技术探讨槐角丸治疗结肠癌(colon cancer,CC)的有效活性成分及作用机制。利用TCMSP数据库检索槐角丸的活性化合物及靶点;OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库收集CC的相关靶点、运用STRING数据库和CytoScape软件构建“主要活性成分-靶点”网络以及药物与疾病共同靶点的PPI网络图。利用CytoScape筛选出关键靶点并使用Metascape数据库对其进行GO富集和KEGG通路注释分析,预测其作用机制。利用分子对接技术验证槐角丸与关键靶点之间的关系。最终共选出槐角丸中6种药材对应的230个靶点,其中CC有130个共表达靶点,核心靶点13个。核心靶点共涉及406条GO分析条目及127条KEGG信号通路。预测槐角丸治疗CC的关键活性成分可能为β-谷甾醇、山柰酚和汉黄芩素,过程主要涉及TP53、HSP90AA1、AKT1、MAPK3、MAPK1、RELA等靶点,并通过介导癌症相关通路、PI3K-AKT信号通路、癌症中的蛋白多糖、TNF信号通路、IL-17信号通路等来发挥治疗CC的作用。分子对接显示,β-谷甾醇、山柰酚、汉黄芩素、柚皮素、川陈皮素与TP53、HSP90AA1、AKT1、MAPK3之间具有良好的结合力。生存分析结果显示,HSP90AA1、CAV1、ESR1、MAPK8高表达的患者总生存期显著低于低表达组,TP53、MAPK1、EGFR、RXRA高表达患者的总生存期则显著高于低表达组。本文通过网络药理学研究了槐角丸治疗CC的主要活性成分及其对应的靶点和作用通路,为槐角丸治疗CC提供了新思路。

关键词： 知葛通脉颗粒   网络药理学   分子对接   糖尿病下肢动脉粥样硬化性病变  

摘要： 目的借助网络药理学研究方法,初步探索知葛通脉颗粒治疗2型糖尿病下肢动脉粥样硬化性病变的靶点和机制,为进一步研究提供相关理论支持和线索。方法通过TCMSP数据库检索、文献补充,筛选知葛通脉颗粒有效成分及效用靶点,通过GeneCards、OMIM等数据库挖掘2型糖尿病LEAD靶点,取药物与疾病的交集靶点;利用STRING11.5制作PPI网络图,并通过PPI网络拓扑关系分析知葛通脉颗粒治疗2型糖尿病LEAD的关键靶点;构建“药物-成分-靶点”关系图,筛选中药颗粒核心成分。在Metascape平台进行GO、KEGG富集分析,探索药物治疗疾病的潜在机制,构建“成分-靶点-通路”图。最后,通过AutoDockTools 1.5.6进行分子对接,验证药物活性成分与疾病靶点之间的反应活性。结果研究获得知葛通脉颗粒有效成分71种,潜在靶点261个,与DLEAD交集靶点107个,筛选出核心成分槲皮素、木犀草素、山柰酚、芒柄花黄素、异鼠李素、去水淫羊藿黄素、薯蓣皂苷元、β-谷甾醇、金圣草素、豆甾醇,关键靶点AKT1、IL-6、TNF、TP53、VEGFA、IL-1B。相关作用通路有183条,作用通路主要涉及MAPK、糖尿病并发症中的AGE-RAGE、HIF-1信号通路等。对接结果显示中药成分与疾病靶点之间可较好地结合。结论知葛通脉颗粒可通过槲皮素、木犀草素、山柰酚、芒柄花黄素、异鼠李素、去水淫羊藿黄素、薯蓣皂苷元、β-谷甾醇、金圣草素、豆甾醇等关键有效成分作用于AKT1、IL-6、TNF、TP53、VEGFA、IL-1B等关键靶点,调节MAPK、糖尿病并发症中的AGE-RAGE、HIF-1等信号通路,多靶点、多通路协同发挥对DLEAD的治疗作用。

关键词： 淫羊藿   保健品   数据挖掘   网络药理学   缓解体力疲劳   增强免疫力   改善骨密度   淫羊藿苷   朝藿定A  

摘要： 目的通过数据挖掘、网络药理学及分子对接技术分析含淫羊藿的保健食品的组方规律并对其潜在的机制进行研究。方法通过检索国家市场监督管理总局及药智网含淫羊藿的保健食品,采用频数统计和关联规则等方法分析基本信息及组方规律。通过检索TCMSP等数据库、整理相关文献获得淫羊藿相关化学成分及潜在靶点;根据保健功能频次分析结果,从GeneCards等数据库中筛选相关的潜在靶点信息;借助R语言相关软件包、String数据库、Cytoscape软件等筛选出关键成分和关键靶点。随后进行蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,根据度(degree)值筛选出核心靶点,并进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。最后,利用分子对接技术验证核心靶点和关键成分的作用亲和力。结果筛选纳入501种含淫羊藿保健食品。剂型以胶囊剂为主;保健功能频次排名前3的分别为缓解体力疲劳(343次)、有助于增强免疫力(140次)、有助于改善骨密度(87次);涉及116种中药,以补虚药为主,四气以温为主,五味以甘为主,归经以肾经为主。获得淫羊藿有效成分139个、靶基因1677个,获得体力疲劳相关潜在靶点849个、免疫力相关潜在靶点2076个、骨质疏松相关潜在靶点1440个;将淫羊藿和主要保健功能的靶基因取交集,得到淫羊藿缓解体力疲劳关键靶点227个、有助于增强免疫力关键靶点358个、有助于改善骨密度关键靶点332个;淫羊藿通过激酶活性的正向调节等过程及磷脂酰肌醇-3-羟激酶(phosphatidylinositol-3-hydroxykinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)等信号通路起到缓解体力疲劳的作用,通过细胞因子产生的正向调节等过程及Th17细胞分化等信号通路起到增强免疫力的作用,通过对肽的反应等过程及PI3K/Akt等信号通路起到改善骨密度的作用。分子对接结果提示淫羊藿的关键成分与核心靶点能自发稳定地结合。结论通过数据挖掘、网络药理学和分子对接研究,分析了含淫羊藿的保健食品相关信息,初步揭示淫羊藿主要保健功能的潜在靶点与机制通路,为淫羊藿后续产品的研发提供了理论依据。

关键词： 扶肾颗粒   腹膜透析   腹膜炎   网络药理学   TLR4/NF⁃κB通路  

摘要： 基于网络药理学与动物实验探究扶肾颗粒(Fushen Granules,FSG)抑制腹膜透析(peritoneal dialysis,PD)大鼠炎症状态,防治腹膜透析相关性腹膜炎(peritoneal dialysis⁃related peritonitis,PDRP)的机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台筛选扶肾颗粒主要活性成分并进行靶点预测,通过DisGeNET等数据库筛选PDRP相关靶点,利用在线软件作图工具平台获得药物与疾病靶点的交集靶点,并构建可视化扶肾颗粒⁃PDRP核心靶点蛋白⁃蛋白互作(PPI)网络,将得到的276个扶肾颗粒⁃PDRP的“药物⁃疾病”共同靶点导入DAVID数据库进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能与京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,筛选出扶肾颗粒治疗PDRP的主要信号通路为TLR4/NF⁃κB;创建5/6肾切除尿毒症大鼠模型,术后2周起,每日定时给予实验大鼠腹腔注射20 mL 1.25%葡萄糖透析液建立PD大鼠模型,假手术组、模型组每日灌胃2 mL生理盐水,扶肾颗粒低(0.54 g·kg^(-1))、中(1.08 g·kg^(-1))、高(2.16 g·kg^(-1))剂量组每日灌胃2 mL,培菲康组每日灌胃2 mL(113.4 mg·kg^(-1))培菲康溶液,干预8周。试剂盒检测大鼠肾功能指标[血肌酐(Scr)、尿素氮(BUN)]含量,ELISA检测血清炎症因子[超敏C反应蛋白(hs⁃CRP)、肿瘤坏死因子⁃α(TNF⁃α)、白细胞介素(IL)⁃6]、脂多糖(LPS)、脂多糖结合蛋白(LBP)含量,苏木精⁃伊红(HE)染色观察结肠组织病理形态,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测结肠组织TLR4/NF⁃κB信号通路关键因子LBP、Toll样受体4(TLR4)、NF⁃κB p65蛋白(NF⁃κB p65)、核因子抑制蛋白(IκBα)、TNF⁃α、IL⁃1β蛋白表达。结果显示,与假手术组比较,模型组结肠组织各层结构异常,肠绒毛稀疏、变短,黏膜层可见水肿,间隙变宽,局部发现炎症细胞明显浸润,体质量显著下降(P<0.01),肾功能指标(Scr、BUN)含量均显著升高(P<0.01),血清炎症因子(hs⁃CRP、TNF⁃α、IL⁃6)、LPS、LBP含量均显著升高(P<0.01),LBP、TLR4、NF⁃κB p65、TNF⁃α、IL⁃1β蛋白表达显著升高(P<0.01),IκBα蛋白表达显著降低(P<0.01);与模型组比较,扶肾颗粒低、中、高剂量组与培菲康组大鼠结肠组织肠绒毛受损有不同程度减轻,黏膜下层水肿减轻,间隙变窄,固有层炎症细胞浸润减少,扶肾颗粒中、高剂量组及培菲康组肾功能指标(Scr、BUN)含量均显著降低(P<0.05或P<0.01),血清炎症因子(hs⁃CRP、TNF⁃α、IL⁃6)含量均显著降低(P<0.05或P<0.01),扶肾颗粒组与培菲康组血清LPS、LBP含量显著降低(P<0.01),扶肾颗粒组LBP、TLR4、NF⁃κB p65、TNF⁃α、IL⁃1β蛋白表达显著降低(P<0.05或P<0.01),IκBα蛋白表达显著升高(P<0.01),培菲康组LBP蛋白表达显著降低(P<0.01)。结果提示,扶肾颗粒可保护PD大鼠残余肾功能,减轻炎症反应,保护结肠组织。基于网络药理学筛选出TLR4/NF⁃κB通路可能是扶肾颗粒治疗PDRP的主要信号通路。结果表明,扶肾颗粒通过调节PD大鼠结肠TLR4/NF⁃κB通路关键因子蛋白表达,改善肠道炎症反应、保护肠屏障防治PDRP。