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关键词： 胃癌   术后胃肠功能障碍   组方用药   数据挖掘   网络药理学  

摘要： 目的基于数据挖掘和网络药理学分析中医药干预胃癌术后胃肠功能障碍(postoperative gastrointestinal dysfunction,POGD)的用药规律。方法通过中国知网、万方数据库、维普及中国生物医学文献数据库收集筛选相关文献,进行规范化处理。采用Excel 2019对用药、性味归经进行频次统计,采用IBM Modeler 18.0软件对药物进行关联规则分析,采用IBM SPSS Statistics 26.0软件对高频药物进行聚类分析。构建药物-有效成分-靶点网络及药物与疾病关键靶点蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果共纳入处方61首,涉及中药118味。使用频次前四味为白术、甘草、陈皮、茯苓;四气分布以温为主,兼以平、寒,五味分布以甘为主,兼以苦、辛;归经频次分布以脾为主,肺、胃次之。关联规则分析结果显示,强关联药组合有13对,如“白术-茯苓”“白术-陈皮”等。高频药物可聚为3类。共筛选出白术-茯苓潜在活性成分26个,靶点362个,药物与疾病交集关键靶点137个,将肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator activated receptorγ,PPARG)、前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin endoperoxide synthase 2,PTGS2)等作为关键靶点,磷酸肌醇3激酶-蛋白激酶B(phosphoinositide 3-kinaseprotein kinase B,PI3K-AKT)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinase,MAPK)等信号通路是核心药物组合治疗POGD的潜在信号通路。结论中医药治疗胃癌POGD以温补为主,从脾肺论,重视气机调畅,标本兼顾,其中白术-茯苓可能是治疗胃癌POGD的核心药物组合。

关键词： 二至丸   非小细胞肺癌   网络药理学   靶点预测  

摘要： 目的:基于网络药理学及分子对接探讨二至丸对非小细胞肺癌的作用机制,为新型抗癌中医药物的研发提供科学依据。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)收集墨旱莲、女贞子的主要化学成分,根据药物分布、吸收、代谢、排泄(ADME)筛选药物活性成分,并获取对应靶点;通过Drugbank、Genecards、OMIM数据库获得非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的重要靶点并去除重复值,利用String数据库进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络;使用Cytoscape3.7.1构建“二至丸成分-非小细胞肺癌靶点”网络,最后通过进行分子对接验证。并利用Cytoscape3.7.1软件筛选出排名靠前的核心靶点;使用R语言对PPI中的靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组(KEGG)信号通路富集分析。结果:二至丸检索获得21个活性成分,去重之后获得205个药物靶点,NSCLC检索取得1935个疾病靶点,两者取交集,共获得132个共同交集靶点。PPI分析得到TP53、AKT1、MAPK1、RELA为核心的基因靶点,经过分子对接,发现二至丸中的槲皮素、木犀草素、山奈酚、β-谷甾醇、金合欢素与TP53、AKT1、MAPK1、RELA靶点结合良好,匹配度高。结论:二至丸可能是通过AGE-RAGE通路、IL-17信号通路、TNF信号通路参与调节非小细胞肺癌。

关键词： 皮肤损伤   创面消毒凝胶   愈合作用   大鼠   炎症因子   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的观察创面消毒凝胶对大鼠皮肤创伤后愈合的促进作用,并利用网络药理学探讨其潜在作用机制。方法将48只大鼠采用随机数字表法分为空白组、模型组和给药组,每组16只。除空白组外,其余2组建立皮肤创伤模型,造模后给药组在伤口涂抹创面消毒凝胶(1.0 mg/mm^(2)),空白组和模型组涂抹等体积的赋形剂,共涂抹28 d。于给药后第4,7,14,28天计算各组大鼠创面残留率;取造模处皮肤组织,行HE染色,观察各组大鼠皮肤病理变化。通过Cytoscape 3.7.2构建药物-成分-靶点-疾病网络,寻找核心成分及作用靶点,并利用AutoDock进行分子对接验证。结果给药后第4天给药组大鼠伤口开始结痂,给药后第7天模型组大鼠伤口开始结痂;与空白组比较,给药后第4,7,14,28天模型组大鼠创面残留率均明显升高,差异有统计学意义(P<0.01);与模型组比较,给药后第7,14,28天给药组大鼠创面残留率均明显降低,差异有统计学意义(P<0.05或P<0.01)。空白组大鼠皮肤组织真皮层和表皮层完整,少有炎症细胞。模型组大鼠表皮层增厚,真皮层内有大量炎症细胞,给药后第7,14,28天给药组毛细血管数量增多,开始形成完整的表皮基底层;给药后第4,7,14,28天给药组炎症细胞均明显减少(P<0.05或P<0.01)。网络药理学研究结果显示,创面消毒凝胶促进皮肤愈合的关键成分为槲皮素、芹菜素、熊果酸,关键作用靶点为环加氧酶2(PTGS2)、类固醇受体激活蛋白2(NCOA2)、环加氧酶1(PTGS1)。分子对接结果提示,熊果酸与PTGS1、PTGS2、NCOA2的结合能均较低,结合稳定。结论创伤消毒凝胶对破损皮肤愈合具有明显促进作用,其潜在机制与熊果酸等成分调控PTGS1、PTGS2、NCOA2等炎症因子有关。

关键词： 术后疼痛   神经性病理性疼痛   术后疼痛综合征   柴胡   芍药   网络药理学  

摘要： 本研究利用网络药理学结合分子对接,探究柴胡-芍药治疗术后疼痛(Postoperative pain,PP)的活性成分、关键作用靶点及潜在的分子机制。从数据库中检索并收集柴胡及芍药的有效活性成分和对应靶点以及术后疼痛靶点。采用术后疼痛综合征(Postoperative pain syndrome,PPS)及神经性病理性疼痛(Neuropathic pain,NP)相关的靶点,通过网络药理学分析出柴胡-芍药治疗术后疼痛的活性成分、成分一疾病的交集靶点以及可能的信号通路。通过分子对接预测活性成分与靶点蛋白的结合能力,经过一系列的分析,在满足筛选条件的18个成分中共筛选鉴定出5个生物活性成分豆甾醇、山柰酚、beta-sitosterol、Areapilin、isorhamnetin及36个柴胡芍药治疗术后疼痛的作用靶点,其中MAPK8、HMOX1、RELA、NOS2、JUN、PTGS2、PPARG、TNF、IL-6是柴胡-芍药治疗术后疼痛的关键靶点。基因本体论(GO)与京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析结果显示,TNF signaling pathway、IL-17 signaling pathway和C-type lectin receptor signaling pathway通路可能在柴胡-芍药治疗术后疼痛中发挥重要作用。分子对接的结果显示,两个生物活性成分均可较好结合,其中谷甾醇与TNF的结合能负值最大,可能是柴胡-芍药治疗术后疼痛有效活性成分。本研究通过成分-靶点-疾病的角度初步预测和验证了“柴胡-芍药”对治疗PP的药理和分子机制,为后续研究提供参考。

关键词： 小细胞肺癌   Mobocertinib   药理学   EGFR20号外显子插入突变   跨膜受体酪氨酸激酶抑制剂  

摘要： 肺癌是全球常见的恶性肿瘤之一,包括非小细胞肺癌和小细胞肺癌两种病理类型,其中,对于部分晚期非小细胞肺癌患者存在有意义的突变靶点,可首选靶向药物治疗。EGFR20号外显子插入(exon 20 insertion,ex20ins)突变是非小细胞肺癌罕见突变,通常对现有的靶向药物耐药,目前缺乏有效的靶向治疗药物。Mobocertinib是一种靶向EGFR ex20ins的新型小分子口服药物,2021年9月15日经美国FDA批准上市用于具有EGFR ex20ins突变的局部晚期或转移性NSCLC成年患者的治疗。本文对该药物的作用机制、药物效应动力学、药物代谢动力学、临床疗效及安全性等方面进行综述总结,为临床使用该药提供一定的参考。

关键词： 网络药理学   分子对接技术   川牛膝-当归   治疗   膝骨性关节炎   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术分析川牛膝-当归治疗膝骨性关节炎的作用机制,为后期进一步开展基础研究提供科学依据。方法通过TCMSP数据库筛选川牛膝-当归的有效活性成分,并对其靶点进行预测。通过OMIM、Genecards等数据库筛选膝骨性关节炎的相关靶点。利用Uniprot对获取靶点进行标准化,Venny在线平台作图取药物成分和疾病靶点的共同靶点。将共同靶点导入STRING平台构建PPI网络,运用Cytoscape进行可视化。通过内置的Network Analyzer分析节点的拓扑参数,运行CytoHubba插件计算筛选核心靶点。随后,利用metascape平台对交集靶点进行GO、KEGG富集可视化,并构建药物成分-靶点-通路的多维网络图。最后利用分子对接模拟活性成分作用于靶蛋白的结合情况。结果根据筛选条件(OB≥30%,DL≥0.18)和查阅文献,共获得6个活性成分和133个相关靶点。药物-疾病的共同靶点蛋白有58个,PPI中筛选获得核心靶点有TNF、TP53、CASP3、MYC、CCL2、CXCL8、NFKBIA、PTGS2等。成分-靶点-通路网络图显示,槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇等是核心活性成分。PTGS2、CASP3、CASP8、MAPK14、CHUK、BCL2、BAX、TNF等的Degree值较高。GO功能分析发现,共同靶点生物学进程包括细胞群增殖的负向调节、对激素的应答、细胞粘附的调节、免疫应答、细胞分化的负向调节等方面。细胞组分主要包含薄膜筏、膜微域、转录调节器复合体、细胞外基质等方面。分子功能主要是DNA结合转录因子结合、转录因子结合、蛋白的特异性结合、RNA聚合酶II特异性DNA结合转录因子结合等方面。KEGG通路的富集分析显示,共同靶点主要通过癌症信号通路、AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化、流体剪切应力与动脉粥样硬化、IL-17信号通路等途径发挥治疗作用。分子对接验证表明,川牛膝-当归主要活性成分与核心靶点均具有良好的结合能力。结论川牛膝-当归的活性成分主要通过下调相关炎症因子(包括细胞因子、黏附分子、趋化因子和基质金属蛋白酶)的表达、调控软骨细胞凋亡、增殖,抑制软骨细胞外基质的降解等机制而发挥治疗作用。

关键词： 板参散   脂肪肝综合征   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 为探究板参散防治蛋鸡脂肪肝综合征的作用机制,试验使用高能低蛋白日粮饲喂蛋鸡造模,检测板参散对模型蛋鸡肝脏组织形态和肝脏抗氧化性的影响,然后采用网络药理学方法获得板参散防治脂肪肝综合征的靶点蛋白信息,并对其进行蛋白互作关系分析、GO功能注释、KEGG信号通路富集分析和分子对接分析。结果表明:与模型组相比,饲喂板参散的药物组蛋鸡肝细胞内脂肪小滴蓄积减少,肝细胞形态结构正常,肝细胞间隙清晰,肝脏丙二醛含量显著降低(P<0.05),总抗氧化能力显著提高(P<0.05);筛选得到板参散中β-谷甾醇、木犀草素、丹参酮ⅡA及隐丹参酮等89个活性成分,其主要作用于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶Akt(AKT1)、肿瘤抗原P53(TP53)和信号转导子与转录激活子3(STAT3)等94个潜在蛋白靶点,β-谷甾醇、木犀草素、丹参酮ⅡA与关键靶点AKT1、TP53均具有良好的分子对接活性;核心靶点主要富集于细胞凋亡过程的负调控、细胞凋亡过程的正调控和RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等生物学过程,大分子复合物、核质、受体复合物等细胞组分,酶结合和相同蛋白结合等分子功能,以及脂质和动脉粥样硬化、PI3K/Akt信号通路、缺氧诱导因子信号通路等信号通路。说明板参散可通过多成分、多靶点、多通路机制防治脂肪肝。

关键词： 当归-川芎   药对   抗炎   镇痛   抗氧化   绿原酸   阿魏酸   洋川芎内酯Ⅰ   洋川芎内酯A   藁本内酯  

摘要： 当归-川芎是临床方剂常见药对,二药配伍具有养血补血、活血化瘀功效。现代研究发现,当归-川芎药对富含生物碱、有机酸、挥发油等活性成分,具有抗炎镇痛、抗氧化、补血活血、神经保护等作用,临床应用广泛,可用于治疗各类妇科疾病、心脑血管疾病、血液系统疾病等。结合国内外文献,从化学成分、药理作用、临床应用角度出发,综述近年来当归-川芎的研究现状,以期为该药对的科学应用及新药研发提供理论依据。

关键词： 西黄丸   宫颈癌   网络药理学   分子对接   表雄酮   槲皮素   雄甾酮   肿瘤蛋白P53   白细胞介素-17  

摘要： 目的利用网络药理学和分子对接的方法研究西黄丸治疗宫颈癌的分子机制。方法采用计算机检索TCMSP、BATMAN-TCM数据库,并筛选西黄丸的有效活性成分及作用靶点。检索OMIM、GeneCards数据库,获得宫颈癌的疾病靶点,合并去重后,与西黄丸获得的有效成分靶点取交集。运用String数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络图。利用Cytoscape3.9.1软件进行可视化,并采用DAVID数据库对交集基因进行(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后运用AutoDock Vina、Pymol软件进行分子对接验证。结果筛选得到西黄丸70个主要活性成分,包括表雄酮、槲皮素、雄甾酮等。与宫颈癌相关的靶点有116个,核心靶点有肿瘤蛋白P53(TP53)、表皮生长因子受体(EGFR)、蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素(IL)-6、原癌基因(MYC)、转录因子AP-1(JUN)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、IL-1B、肿瘤坏死因子(TNF)、雌激素受体1(ESR1)、B淋巴细胞2(Bcl-2)、低氧诱导因子-1A(HIF-1A)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、V-Rel网状内皮增生病毒癌基因同源物A(RELA)等。GO和KEGG分析结果显示,西黄丸治疗宫颈癌的重要通路有IL-17、TNF、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt、p53、HIF-1等信号通路。分子对接结果显示:西黄丸的主要成分与核心靶点有良好的对接效果。结论西黄丸主要通过调节IL-17、TNF、PI3K/Akt、p53,HIF-1等信号通路治疗宫颈癌。

关键词： 黄杜鹃根   化学成分   分离鉴定   网络药理学   镇痛  

摘要： 研究黄杜鹃根的化学成分及镇痛的作用机制,为揭示黄杜鹃根镇痛药效物质基础提供理论依据。本文运用大孔树脂、硅胶柱色谱和制备色谱对黄杜鹃根进行化学成分分离,利用^(1)H NMR、^(13)C NMR、MS等波谱数据鉴定化合物的结构;综合成分结果联合网络药理学分析黄杜鹃根镇痛作用的主要靶点和关键通路。结果表明,共分离鉴定得到9个化合物:3个二氢查尔酮类化合物,分别是4’-O-甲基根皮苷(1)、根皮素4’-O-葡萄糖苷(2)、根皮素(3);3个三萜类化合物,分别是齐墩果酸(4)、白桦酸(5)、熊果酸(6);3个脂肪酸类化合物,分别是棕榈酸(7)、硬脂酸(8)、山嵛酸(9);网络药理学结果表明,分离得到的9个化合物主要作用在MAPK1、MAPK3、MAPK8、IL-6、CASP3等靶点,通过调控花生四烯酸代谢、炎症介质对色氨酸通道等信号通路发挥抗炎镇痛作用。该研究初步阐明黄杜鹃根的化学成分及潜在的作用机制,为筛选黄杜鹃根镇痛的药效成分及深入阐明作用机制提供了理论依据。