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关键词： 枇杷叶   三阴性乳腺癌   网络药理学   分子机制  

摘要： 目的:基于网络药理学和实验验证探讨中药枇杷叶抑制三阴性乳腺癌的分子机制。方法:通过TCMSP数据库获取中药枇杷叶的潜在药效成分及靶点。利用GeneCards、OMIM及DisGeNET数据库获取三阴性乳腺癌的相关靶点。利用String平台进行蛋白互作分析。采用Metascape数据库分析潜在靶点参与的生物过程及通路。通过CB-Dock进行分子对接验证。采用MTT比色法和平板克隆形成实验检测中药枇杷叶潜在药效成分对4T1细胞增殖活性的影响。采用蛋白免疫印迹法检测相关蛋白表达水平。结果:中药枇杷叶有18个潜在药效成分和147个潜在靶点作用于三阴性乳腺癌。齐墩果酸(oleanolic acid,OA)和(-)-表没食子儿茶素没食子酸酯(epigallocatechin gallate,EGCG)等成分与TP53和AKT1等靶点的亲和力强。OA和EGCG可以时间和剂量依赖的方式抑制4T1增殖,减少p-AKT、p-mTOR蛋白表达,并上调细胞周期调控因子p27的表达水平。结论:中药枇杷叶中的OA和EGCG可以通过调节PI3K-AKT信号通路,上调细胞周期调控因子p27,抑制三阴乳腺肿瘤细胞的侵袭和复制,从而抑制乳腺癌细胞增殖。

关键词： 柴胡-黄芩药对   病毒性肺炎   网络药理学   靶点  

摘要： 目的 通过数据库挖掘柴胡-黄芩有效成分及作用靶点,构建药对化学成分-作用靶点与病毒性肺炎靶点网络,探讨其治疗病毒性肺炎的机制。方法 从基因数据库GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank获取病毒性肺炎疾病靶点,通过中药系统药理学数据库(TCMSP)设置查询条件:口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18查找柴胡-黄芩药对活性成分及靶点,通过Cytoscape3.8.0软件构建药物主要化学成分-作用靶点和疾病靶点网络,并利用PPI网络构建核心进行分析,同时利用基因功能(GO)和信号通路(KEGG)分析共同作用靶点及相关信号通路。结果 从TCMSP中筛选出柴胡(17个)-黄芩(36个)药对共有53种有效活性成分,从疾病基因数据库筛选出与病毒性肺炎密切相关的靶点共计4238个,通过比对分析药对-疾病作用靶点得出柴胡-黄芩药对与病毒性肺炎存在143个相同靶点。PPI、GO、KEGG分析显示柴胡-黄芩药对通过调控PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路及IL-17等信号通路作用于FOS、TP53、TNF、JUN、IL6、MYC、RELA、HIF1A、CCND1、MAPK14、AKT1等关键靶点,通过抑制细胞增殖、应激、炎症、功能同步化、凋亡等途径从而发挥病毒性肺炎的作用。结论 本研究从网络药理学的角度揭示柴胡-黄芩药对治疗病毒性肺炎多靶点的机制,对于其临床应用具有翰要的理论意义。

关键词： 人参   红参   黑参   西洋参   人参叶   脾气虚   网络药理学  

摘要： 目的利用网络药理学探究人参、红参、黑参、西洋参和人参叶治疗脾气虚的药效物质基础与作用机制。方法利用TCMSP数据库查阅相关文献筛选人参、红参、黑参、西洋参和人参叶的有效成分和靶点。利用PubChem和Swiss target prediction平台收集TCMSP数据库中没有收录的人参、红参、黑参、西洋参和人参叶有效成分与靶点信息。利用GeneCards数据库对脾气虚靶点进行搜索并下载数据,整理和汇总。利用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-疾病-靶点网络图。在String平台上构建靶点蛋白互作网络,最后利用R软件对关键靶点基因进行KEGG通路富集分析,揭示五种药材治疗脾气虚的作用机制和通路。结果通过筛选分析,人参中有78个核心成分可通过537个核心靶点作用于195条通路上;红参中有26个核心成分可通过279个核心靶点作用于158条通路上;黑参中有16个核心成分可通过157个核心靶点作用于149条通路上;西洋参中有27个核心成分可通过236个核心靶点作用于168条通路上;人参叶中有26个成分可通过216个核心靶点作用于162条通路上。五种药材的活性成分可通过STAT3(信号转导及转录激活因子3)、MAPK1(丝裂原活化蛋白激酶1)、HSP90AA1(热休克蛋白90AA1)、VEGFA(血管内皮生长因子A)等多个关键靶点调控PI3K-Akt信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等发挥治疗作用。结论人参、红参、黑参、西洋参及人参叶主要通过多靶点调配神经系统、抑制细胞分裂周期、控制炎症反应等途径发挥治疗脾气虚的作用。

关键词： 社区获得性肺炎   扶正解毒方   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨扶正解毒方治疗社区获得性肺炎(CAP)可能的作用机制。方法应用TCMSP、UniPort数据库筛选扶正解毒方的药物活性成分及相对应的靶点蛋白;应用GeneCards、OMIM和Disgent数据库中检索出CAP相关靶基因。应用Metascape数据库进行GO富集分析和KEGG通路富集分析;最后通过CB-Dock对网络中度值较高的药物成分与核心作用靶点进行分子对接验证。结果筛选得到扶正解毒方治疗CAP重要活性成分215个,核心靶点113个,确定扶正解毒方治疗CAP的主要通路,分子对接中活性成分与靶点具有较为稳定的结合活性。结论扶正解毒方具有多因素协同调控的作用特点,这为进一步阐明扶正解毒方治疗CAP的作用机制提供了科学思路与依据。

关键词： 网络药理学   分子对接   桃红四物汤   脑卒中   分子机制  

摘要： 目的通过网络药理学、分子对接技术和动物实验探讨桃红四物汤对缺血性脑卒中的调控机制。方法运用数据库整理分析桃红四物汤与疾病的交集靶点,进行网络拓扑分析及蛋白质相互作用分析并获取核心成分和核心靶点;对交集靶点进行GO和KEGG富集分析;利用分子对接技术获得通路蛋白与核心成分结合能;采用线拴法建立小鼠脑缺血再灌注损伤(MCAO/R)模型,利用神经行为学评分、TTC染色技术考察桃红四物汤防治缺血性脑卒中的药效作用,利用Western blot技术考察桃红四物汤对MCAO/R小鼠脑中PI3K、AKT蛋白和炎症因子IL-1β、IL-18表达的影响。结果桃红四物汤抗缺血性脑卒中的核心成分可能为槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、山柰酚、豆甾醇、黄芩素、杨梅酮、β-胡萝卜素及常春藤苷,核心靶点可能为MAPK14、RELA、TNF、TR53、MAPK1、MYC、FOS、HSP9AA1、ESR1、AKT1、HF1A、CTNNB1。交集靶点主要富集在脂质和动脉粥样硬化、PI3K/AKT等信号通路,涉及氧化应激、对脂多糖的反应等生物进程。分子对接预测核心成分与通路蛋白具有较好的结合能力。动物实验表明桃红四物汤可降低MCAO/R小鼠神经功能评分,减小脑梗死体积,降低脑内IL-1β、IL-18的表达,提高PI3K、AKT的表达。结论桃红四物汤可能通过激活PI3K/AKT信号通路,调节神经炎症,防治缺血性脑卒中。

关键词： 网络药理学   分子对接   药对   麦冬-五味子   心肌纤维化   机制研究  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接方法探究“麦冬-五味子”药对治疗心肌纤维化的作用机制。方法运用TCMSP数据库及HERB数据库筛选“麦冬-五味子”药对药物成分和靶点,运用GeneCards数据库、Disgenet数据库、OMIM数据库筛选疾病靶点,获取共同靶点;通过Cytoscape软件构建“药物活性成分-疾病-靶点”网络模型;利用微生信平台进行基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG);利用STRING数据库构建蛋白互作网络;通过Auto Dock Tools1.5.6软件进行分子对接验证。结果“麦冬-五味子”药对中共筛选得到戈米辛M2、五味子酚乙、麦冬二氢高异黄酮B等85个活性成分,主要作用于HSP90AA1、AKT1、SRC等163个心肌纤维化靶点上,主要富集在脂质与动脉粥样硬化信号通路、糖尿病并发症中的age-rage信号通路、癌症发病途径信号通路等相关通路上。结论“麦冬-五味子”药对主要通过调控炎性反应、氧化应激、脂质沉积、细胞增殖凋亡等多种生物过程来抑制心肌纤维化。

关键词： 藏药   螃蟹甲   化学成分   药理作用   综述  

摘要： 通过查阅本草书籍和相关文献,从化学成分和药理作用2个方面对藏药螃蟹甲的相关研究进行总结和概述。藏药螃蟹甲用药需求逐渐增大,但繁殖相对缓慢,供不应求,已被列入藏药濒危物种之一。为避免藏药螃蟹甲资源枯竭,应重视其种植栽培和可持续发展。

关键词： 白肉灵芝   醇提物   矽肺   网络药理学   靶点   分子对接   白细胞介素-6   作用机制   小鼠  

摘要： 目的通过网络药理学、分子对接技术和动物实验探究白肉灵芝醇提物(GLE)对矽肺的改善作用及其潜在分子机制。方法(1)采用超高液相色谱-四极杆静电场轨道阱质谱法(UPLC-QE-MS)分析GLE成分;利用网络药理学和分子对接技术,探究GLE干预矽肺炎症进程中的活性成分及调控的潜在分子通路和靶点。(2)将无特定病原体级雄性C57BL6/J小鼠分为4组,每组10只。采用非暴露式气管滴注法,矽肺模型组和GLE干预组小鼠一次性予质量浓度为50 g/L的二氧化硅混悬液80μL染尘,空白对照组和GLE对照组小鼠均予等体积的无菌0.9%氯化钠溶液;造模后第2天起,GLE对照组和GLE干预组小鼠均予剂量为200 mg/(kg·d)的GLE灌胃,空白对照组和矽肺模型组小鼠均予等体积0.9%氯化钠溶液灌胃,每日1次,连续35 d。实验结束后,观察各组小鼠肺组织病理学改变情况,计算肺质量系数、炎症评分和胶原沉积面积占比,采用酶联免疫吸附实验检测肺组织中肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-1β和IL-6水平。结果(1)UPLC-QE-MS技术检测出GLE的76种活性成分;其中,36种成分满足类药性五原则筛选条件。基于网络药理学理论,该36种GLE活性成分中共筛选出改善矽肺炎性反应的潜在作用靶点67个。京都基因与基因组百科全书富集分析和基因本体论功能分析结果显示,IL信号和免疫细胞的细胞因子信号在GLE改善矽肺的过程中发挥关键作用。分子对接结果显示,67个交集靶点中,排名基于前10的依次是TNF、IL6、B淋巴细胞瘤2、细胞肿瘤抗原p53、半胱氨酸蛋白酶-3亚基p12、JUN、表皮生长因子受体、IL1B、67 kDa基质金属蛋白酶-9和前列腺素G/H合酶2。蛋白质-蛋白质相互作用分析结果显示,与关键靶点TNF-α、IL-1β、IL-6亲和力最强的成分是甘草次酸;其次为灵芝酸DM、泽泻醇C、灵芝酸β和红光皂苷元。(2)组织病理学检查结果显示,GLE可缓解矽肺小鼠模型的肺部炎症反应和胶原沉积。GLE干预组小鼠肺质量系数、炎症评分、胶原面积占比和IL-6水平均低于矽肺模型组(P值均<0.05);但该2组小鼠肺组织中TNF-α和IL-1β水平分别比较,差异均无统计学意义(P值均>0.05)。结论GLE可能通过抑制小鼠肺组织中IL-6水平而改善二氧化硅所致肺组织炎症和纤维化;其机制具有多成分、多靶点、多通路协同作用的特点。

关键词： 骨质疏松症   网络药理学   山药   杜仲   益肾健脾  

摘要： 目的:运用网络药理学探索益肾健脾中药“山药-杜仲”药对治疗骨质疏松症的作用机制。方法:通过中药数据库检索“山药-杜仲”的活性成分及相关作用靶点,运用Cytoscape 3.7.2制作“活性成分-靶点”网络图。利用GeneCards数据库搜集骨质疏松症相关靶点,将药物靶点与疾病靶点进行映射,取交集靶点上传STRING 11.0数据库构建蛋白互作网络,将该网络导入Cytoscape 3.7.2进一步加工分析。将关键靶点上传至Metascape平台进行GO富集分析与KEGG通路富集分析。结果:共获得山药和杜仲活性成分38个,对应靶点225个,骨质疏松症相关靶点1376个。药物-疾病作用核心靶点80个,包括白蛋白、白细胞介素6、腺苷酸激酶同工酶1、血管内皮生长因子、抑癌基因p53、肿瘤坏死因子、基质金属蛋白酶9等。KEGG富集分析显示其作用于骨质疏松症的潜在通路主要包括糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、T细胞受体信号通路、p53信号通路、TGF-β信号通路、HIF-1信号通路等。结论:本研究初步探讨了益肾健脾药对“山药-杜仲”对骨质疏松症的“多通路、多靶点”作用机制,为进一步探索益肾健脾法治疗骨质疏松症提供研究思路与理论基础。

关键词： 网络药理学   止痛消炎膏   慢性湿疹   靶点   通路  

摘要： 目的基于网络药理学探讨止痛消炎膏治疗慢性湿疹的分子作用机制。方法通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)、PubChem数据库筛选止痛消炎膏的潜在活性成分[口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18]。采取SwissTargetPrediction数据库预测其作用靶点,与DisGeNET数据库、GeneCards数据库、治疗靶点数据库(TTD)获得慢性湿疹疾病靶点相映射,得到止痛消炎膏治疗慢性湿疹的潜在靶点。利用Cytoscape3.7.2软件构建止痛消炎膏-活性成分-靶点网络图,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,并在R软件中使用Bioconductor生物信息软件包对止痛消炎膏的作用靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。结果止痛消炎膏中有186个潜在活性成分,将止痛消炎膏与湿疹作用靶点相匹配,两者取交集后获得药物-疾病共同靶点115个;番泻叶甙、白当归醚、白当归脑、大黄酸、大黄苷、迷迭香酸等可能是止痛消炎膏治疗慢性湿疹的主要活性成分,其作用于TNF、IL-6、AKT1、CXCL8、IL-2、STAT3等靶点,参与转录调控及药物反应等生物过程,通过卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒感染、TNF信号通路、Toll样受体信号通路、C型凝集素受体信号通路等发挥治疗慢性湿疹的作用。结论番泻叶甙、白当归醚、白当归脑、大黄酸、大黄苷、迷迭香酸等在止痛消炎膏治疗慢性湿疹中具有重要意义;调节炎症通路及干预炎症的发生发展可能是止痛消炎膏治疗慢性湿疹的作用机制。