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关键词： 护肝布祖热颗粒   免疫性肝损伤   分子对接   细胞凋亡   通路  

摘要： 护肝布祖热颗粒是维吾尔族传统的护肝方。作者在先前的一项研究中通过调节免疫平衡和抑制IRF1/JNK信号诱导的细胞凋亡,探讨了HBG抗免疫性肝损伤(ILI)的机制。但不是所有的机制都得到了探讨。本研究通过体内实验及网络药理学进一步研究了HBG降低小鼠刀豆球蛋白A(ConA)诱导的ILI的机制。首先,TCMSP、PharmMapper和GeneCards数据库确定了HBG治疗ILI的活性化合物和关键靶点。通过网络药理学和分子对接对确定的关键靶点和相关信号通路进行筛选。ConA诱导的小鼠ILI模型探讨了HBG对抗ILI的疗效和机制;蛋白质印迹分析检测关键蛋白的表达水平;网络药理学鉴定了16个化合物和53个靶标。成分-靶向通路(C-T-P)网络和分子对接表明,EGFR、HRAS、AKT1和PIK3R1是HBG对抗ILI的关键靶点。此外,分子对接显示,前八种活性化合物的对接得分高于阈值。与ConA组相比,HBG显著上调p-EGFR、Ras、p-AKT、p-PI3K、p-BAD和Bcl-2的表达,并下调Bax、裂解caspase 9和3的蛋白水平。HBG通过EGFR/Ras/PI3K/AKT信号通路抑制细胞凋亡,从而减轻ILI。

关键词： 青黛   2型糖尿病   网络药理学   作用机制   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接初步揭示了青黛抗2型糖尿病的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中根据吸收和代谢情况选出青黛的有效成分及成分所对应的靶点,将靶点转换成对应的基因,取青黛和2型糖尿病的交集基因做PPI蛋白互作网络图,通过David数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,最后采用分子对接验证。结果:筛选得到青黛的活性成分9个、交集基因204个,通过蛋白互作分析发现“STAT3、JUN、MAPK3”可能有治疗2型糖尿病的作用,KEGG富集发现,且可能通过positive regulation of transcription from RNA polymerase II promotor、response to drug、positive regulation of gene expression等信号通路进行调控。分子对接结果表明青黛中的Bisindigotin、Indican、Isovitexin等活性成分与“STAT3、JUN、MAPK3”有比较强的结合能力。结论:青黛可能是通过Bisindigotin、Indican、Isovitexin等成分调控positive regulation of transcription from RNA polymerase II promotor等相关信号通路上的STAT3、JUN、MAPK3等基因发挥治疗2型糖尿病的作用。

关键词： 鬼箭羽   糖尿病   网络药理学  

摘要： 目的 通过网络药理学预测鬼箭羽治疗糖尿病的作用机制。方法 鬼箭羽药物成分靶点来自中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)。用基因数据库查询相应基因,利用Cytoscape软件构建网络图。采用基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测鬼箭羽治疗糖尿病的作用机制及潜在靶点。结果 “药物-化合物-靶点-疾病”网络图包含了21种活性成分和154个交叉靶点,主要靶点包括视网膜母细胞瘤基因1(RB1)、细胞周期蛋白D1(CCND1)、丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT1)和丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)。通过GO功能富集分析,共获得了20个项目(P<0.05)。KEGG通路富集分析筛选了13条信号通路(P<0.05),其中的脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力与动脉粥样硬化、高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)信号通路,对糖尿病有作用。结论 鬼箭羽的活性成分可通过作用于RB1、CCND1、AKT1、MAPK1、MAPK3等多个靶点来调节胰岛素的分泌,从而对糖尿病发挥治疗作用。

关键词： 姜黄素   心力衰竭   心肌肥大   纤维化   细胞自噬   氧化应激反应   炎性损伤   Ca^(2+)-ATP酶   Dickkopf相关蛋白3  

摘要： 心力衰竭是高血压、缺血性心脏病、瓣膜性心脏病、冠心病等各种心血管事件常见的终末期临床表现,病理特征以进行性心功能不全和心肌重塑为主。姜黄素可通过抗心肌肥大和纤维化,增强细胞自噬,降低氧化应激反应,减轻心肌炎性损伤,调节Ca^(2+)-ATP酶活性,上调Dickkopf相关蛋白3的表达,多途径防治心力衰竭,进一步阻止心肌重塑,改善心功能。总结了姜黄素防治心力衰竭的研究情况,分析其作用机制,为姜黄素的临床运用提供支持。

关键词： 钩藤   生物碱   药理   临床应用  

摘要： 钩藤(Uncaria rhynchophylla)是广西区域特色药材品种之一,具有息风定惊、清热平肝的功效,药用历史悠久。钩藤生物碱是钩藤的主要药效成分,对缓解药物成瘾、阿尔茨海默症、高血压等疾病具有显著功效,其方药天麻钩藤饮、复方钩藤降压片等在临床上广泛应用。随着现代医学研究技术的进步,钩藤生物碱及其方药的治病机理正在不断被发现。本文收集近十年钩藤相关研究文献,以钩藤的药效物质为基础,总结钩藤生物碱及其方药的药理研究成果,分析钩藤的临床应用情况,以期为钩藤的新药研发或新应用提供理论借鉴。

关键词： 血府逐瘀汤   特发性肺纤维化   网络药理学   分子对接   STAT3   ERK   TLR3  

摘要： 目的 基于网络药理学和动物实验研究血府逐瘀汤治疗特发性肺纤维化(IPF)的作用机制。方法 于TCMSP数据库筛选血府逐瘀汤的潜在活性成分和作用靶点,并通过相关数据库分析IPF相关靶点,两者取交集后获得血府逐瘀汤治疗IPF的关键靶点;通过STRING平台和Cytoscape软件构建血府逐瘀汤潜在活性成分-靶点调控网络和蛋白互作网络,并对网络进行拓扑分析,获取血府逐瘀汤治疗IPF的核心靶点;对核心靶点进行功能富集分析,预测血府逐瘀汤治疗IPF的作用机制。通过动物实验对网络药理学研究结果进行验证,构建IPF大鼠模型,进行HE和Masson染色,采用ELISA法检测肺组织羟脯氨酸水平,并对富集分析筛选出的相关信号通路中关键蛋白的表达进行分析。结果 共获取血府逐瘀汤治疗IPF的158个关键靶点,拓扑分析后,得到核心靶点20个,主要富集于病毒感染相关通路。动物实验表明,血府逐瘀汤能改善IPF大鼠肺泡炎症反应和纤维化程度,并降低Kaposi’s肉瘤相关疱疹病毒感染通路中关键蛋白STAT3、ERK和TLR3的表达。结论 血府逐瘀汤可能通过多成分、多靶点、多途径影响病毒感染相关信号通路,发挥抗肺纤维化作用。

关键词： 罗汉果   糖尿病肾病   网络药理学   炎症因子   蛋白-蛋白互作网络  

摘要： 目的:利用网络药理学分析罗汉果对糖尿病肾病(DN)的改善作用,阐明其可能的相关机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)确定罗汉果中的有效成分及其作用靶点。通过DisGeNET数据库和GeneCards数据库筛选DN靶基因。将罗汉果与DN靶点进行对比,获取罗汉果对DN的关键靶点。通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图,通过Cytoscape软件进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。采用分子对接技术预测DN核心靶点与罗汉果主要活性成分的结合能力。结果:采用TCMSP数据库结合选入标准共筛选出罗汉果5种活性成分(ZINC03860434、Perlolyrine、beta-sitosterol、Kaempferol和Flazin)及丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1 (AKT1)、转录因子RELA、c-Jun氨基末端激酶(JUN)和肿瘤坏死因子(TNF)为代表的85个靶点,其中kaempferol所含靶点最多。筛选出的85个靶点中与DN相关的靶点有34个。GO功能富集分析主要涉及氧化应激、炎症及凋亡调控和细胞信号传导等生物学过程(BP)。KEGG信号通路富集分析涉及晚期糖基化终产物(AGE)-AGE受体(AGE-RAGE)信号通路、 TNF信号通路和C型凝集素受体信号通路等。罗汉果主要活性成分与DN靶点蛋白分子对接分析,5种活性成分分子对接结合能均在-8.00~-5.00 kJ·mol^(-1)之间。结论:Kaempferol是罗汉果中对DN治疗最有效的活性成分,其作用机制主要与抑制炎症有关。

关键词： 大血藤   溃疡性结肠炎   GEO芯片   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的明确大血藤抗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用,并探讨其作用机制。方法以葡聚糖硫酸钠诱导UC小鼠模型评价大血藤抗UC作用;依据中国知网和PubMed网站获取大血藤的成分,SwissTargetPrediction数据库筛选成分靶点,GEO基因芯片提取UC差异基因,构建大血藤“成分-靶点-疾病”网络,筛选核心靶点后,进行蛋白互作与聚类分析、生物过程及通路富集分析,并以分子对接和文献初步验证网络分析的可靠性。结果大血藤能显著改善UC小鼠的疾病活动指数评分、结肠缩短和结肠组织病理变化,具有良好的抗UC作用;网络分析发现大血藤抗UC核心成分包括(+)-Dihydroguaiaretic acid、Isorhapontigenin和Pinosylvin等,核心靶点EGFR、STAT1、LCK等63个,通过调节PI3K-Akt信号通路和癌症蛋白聚糖等多条免疫抗炎和抗肿瘤相关的信号通路,影响氨基酸修饰,激酶活性调节,细胞反应和氧化应激等生物过程抗UC。分子对接和文献表明所构建网络可靠性较高。结论大血藤有良好的抗UC作用,其机制可能与调节肠道免疫炎症及细胞增殖、分化与迁移等密切相关,具备多成分、多靶点、多途径的特点。

关键词： 小建中汤   网络药理学   药理作用分子作用机制(中药)   分子对接模拟   酶联免疫吸附测定  

摘要： 目的以网络药理学研究结果为基础,对小建中汤中桂枝、甘草、生姜、大枣、白芍、饴糖6种中药开展深入研究,以期为小建中汤治疗脾胃虚寒类消化性溃疡作用机制研究提供新的依据及方向。方法基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)获取小建中汤6种中草药的相关化学成分,并在Swiss Target Prediction中搜索活性化学成分潜在靶点;通过GeneCards数据库检索消化性溃疡、十二指肠溃疡、胃溃疡靶点和脾胃虚寒型消化性溃疡主要症状靶点;筛选出疾病主要症状、疾病和药物的共同靶点;运用Cytoscape Version 3.7.2软件绘制药物-化合物-靶点网络;利用STRING数据库绘制构建蛋白质相互作用(PPI)网络分析共同靶点之间的相互作用,找出可能的关键基因;利用R软件进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,分析治疗的作用机制;运用AutoDock及Pymol对关键靶点与相应活性成分进行分子对接验证,实验验证小建中汤对靶点蛋白、白细胞介素(IL)-6表达的影响。结果分析得到小建中汤具有128个活性化学成分作用于75个脾胃虚寒型消化性溃疡靶点,其中TP53、血管内皮生长因子(VEGF)、IL-6、胱天蛋白酶3(CASP3)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、信号转导因子和转录激活因子3(STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、白蛋白(ALB)、表皮生长因子受体(EGFR)与非受体酪氨酸激酶(SRC)为核心靶点;而小建中汤治疗脾胃虚寒型消化性溃疡的核心活性成分是儿茶素、羟黄酮、芍药内苷C、拟雌内酯、草果甲素等;靶点基因主要富集于脂筏、膜微结构域、膜区、细胞小凹等细胞区域,作用于跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、蛋白酪氨酸激酶活性、跨膜受体蛋白激酶活性、磷酸酶结合等分子功能,重要的是具有调节平滑肌细胞增殖和氧化应激反应。生物学通路则主要集中于磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-Akt信号通路、缺氧诱导因子(HIF)-1信号通路、C型凝集素受体信号通路、胃癌等通路。分子对接结果显示,筛选的主要核心成分与其对应靶蛋白具有较好的结合活性。结论小建中汤通过网络药理学预测的作用机制多成分、多靶点、多通路治疗脾胃虚寒型消化性溃疡;实验验证小建中汤可下调靶点蛋白IL-6的表达,抑制肠上皮损伤。

关键词： 抑郁症   牡丹皮-栀子   网络药理学   中药  

摘要： 目的通过网络药理学的方法研究牡丹皮-栀子治疗抑郁症的作用机制。方法该文通过计算机技术筛选牡丹皮、栀子治疗抑郁症的主要活性成分及其潜在作用靶点,探讨其抗抑郁作用的药理学机制。应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Uniport数据库整理及筛选牡丹皮、栀子的有效成分和作用靶点及对应的基因名。通过GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、靶点预测数据库(TTD)提取抑郁症(depressive disorder,DD)的相关靶点基因。进行Venn分析,将成分靶点与抑郁症疾病靶点取交集,获得共同靶点基因。构建化合物-靶点复合网络,筛选发挥抗抑郁作用的关键成分,同时用共同靶点基因构建蛋白互作网络(PPI)筛选出关键蛋白。将Metascape数据库和微生信云平台筛选得到的共同靶点基因进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)与基因本体(GO)通路富集分析,再通过KEGG数据库画出KEGG信号通路图。结果筛选得到牡丹皮、栀子与抑郁症有关的15个活性成分、138个对应靶点;PPI网络涉及138个节点,1648条边;GO富集主要涉及对氧气水平反应、细胞膜筏、DNA结合转录因子活性的调节。KEGG富集气泡图显示与癌症通路、脂质与动脉粥样硬化通路、PI3K-Akt信号通路等相关通路有关。结论通过网络药理学可以分析出牡丹皮、栀子在治疗抑郁症方面的有效化合物和关键通路等,为牡丹皮、栀子治疗抑郁症的临床研究提供了理论依据。