课程文献中心 更多>>

关键词： Bioscience   Physical Sciences   MathML   Special Characters  

ISBN: (数字)9781000999228 ISBN: (纸本)9781003366669

摘要： This unique volume traces the behavior of the drug substance, starting from the initial pre-contact stage, and ending with the formation of the complex. Molecular recognition lies in the foundation of every life form and includes many mysteries. Currently, studies on this topic in pharmacology are limited to determining the properties of complexes of medicinal substances (drugs) with specific (complementary) biomolecules: receptors, enzymes, ion channels etc. The results present the mechanisms preventing drugs from such non-specific binding. This direction is very fruitful, although the phenomenon of molecular recognition is far wider. Features Presents the basics of thermodynamics and kinetics of complex formation between ligands and receptors Selected novel therapeutic concepts are tested and validated Provides a review of the pharmacophore approach and drug design methods By its nature, pharmacology is a multi-disciplinary science, hence, disciplinary areas include chemistry, biology and neuroscience Discusses hot topics including 3D structure determination techniques and in silico methods and neural networks The main theme of the book is the consideration of mechanisms created by nature to protect physiologically active substances from being stuck on nonspecific acceptors in the body. The book describes the materials that aid in the development of new medicinal substances. It is intended for researchers, as well as upper-level undergraduate and graduate students interested in the problems of molecular pharmacology and drug design.

关键词： 积雪草酸   宫颈癌   网络药理学   核心靶点  

摘要： 通过网络药理学方法筛选获得积雪草酸与IA1期宫颈癌的交集靶点,分析GO功能和信号通路,经拓扑学筛选核心靶点,进行分子对接验证。结果表明,积雪草酸与IA1期宫颈癌有60个交集靶点,涉及101项GO功能和30条KEGG信号通路,确定了4个核心靶点(IL1B、CXCL8、CCL2和TLR4),分子对接验证结果显示积雪草酸与核心靶点结合稳定。

关键词： 桂枝茯苓丸   异位妊娠   网络药理学   分子对接   作用机制   张仲景  

摘要： 目的:应用网络药理学和分子对接探究桂枝茯苓丸治疗异位妊娠的潜在作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选桂枝茯苓丸组方中药有效成分及相应作用靶点。在DrugBank、PharmGkb、GeneCards、TTD和OMIM五大数据库检索异位妊娠相关靶点,并与药物作用靶点进行映射,取交集得到桂枝茯苓丸治疗异位妊娠的潜在靶点。应用Cytoscape_v3.9.1软件构建“桂枝茯苓丸-异位妊娠”调控网络,并使用CytoNCA插件进行拓扑分析筛选关键化合物。将潜在靶点输入STRING在线平台获得蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)关系,通过Cytoscape_v3.9.1构建PPI网络并进行拓扑分析筛选核心靶点。使用David数据库对潜在靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。采用AutoDock vina软件对关键化合物与核心靶点进行分子对接。结果:运用TCMSP数据库筛选得到桂枝茯苓丸有效成分85个,相关靶点525个。于DrugBank、PharmGkb、GeneCards、TTD、OMIM五大数据库检索得到异位妊娠靶点3055个。桂枝茯苓丸有效成分作用靶点与异位妊娠总靶点进行映射得到桂枝茯苓丸治疗异位妊娠的潜在靶点145个。“桂枝茯苓丸-异位妊娠”调控网络分析筛选得到槲皮素、山柰酚、黄芩素等6个关键化合物。PPI网络分析得到10个核心靶点。GO富集分析得到生物学过程725种、分子功能154类和78个细胞组分。KEGG信号通路富集分析得到167条富集通路。分子对接结果表明,关键化合物与核心靶点蛋白间存在良好的亲和力。结论:桂枝茯苓丸中的多种有效成分能够作用于多个潜在靶点并通过多条途径发挥治疗异位妊娠的作用。

关键词： 参芪解郁方   产后抑郁症   网络药理学   细胞因子   免疫调节   作用机制   靶点  

摘要： 目的:基于网络药理学及动物实验分析参芪解郁方治疗产后抑郁症(PPD)的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Uniprot数据库对参芪解郁方药物进行成分和靶点的处理收集,再借助GeneCards数据库对疾病靶点进行收集,与药物靶点取“药物-疾病”交集,获得核心靶点,使用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。运用Metascape平台进行基因本体(GO)与京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。最后通过造模和药物对大鼠进行干预后,予以旷场实验、强迫游泳实验和蔗糖水消耗实验进行行为学评估,再利用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测各组大鼠血清白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平。结果:筛选到57个参芪解郁方相关活性成分,对应产后抑郁症的潜在作用靶点103个,关键成分有槲皮素、β-谷甾醇、植物甾醇等,核心靶点涉及IL-6、TNF、IL-1β等,主要通过磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、雌激素、T细胞抗原受体等通路发挥药效。动物实验显示参芪解郁方可以提高大鼠旷场实验水平得分、垂直得分及蔗糖水消耗量,减少强迫游泳不动时间,降低大鼠血清中IL-1β、IL-6、TNF-α水平。结论:参芪解郁方治疗产后抑郁症具有多通路-多靶点的特性,其机制与参芪解郁方的免疫调节作用有关。

关键词： 东北桤木   弓形虫   网络药理学  

摘要： [目的]基于网络药理学方法探讨东北桤木的抗弓形虫作用机制.[方法]检索PubChem数据库获得东北桤木中的化合物分子结构(以smiles格式存储),在Digenet、GeneCards和Drugbank数据中进行筛选得到抗弓形虫的靶点;通过建立药物靶基因与疾病靶点venny图寻找共同基因靶点;利用Cytoscape 3.7.2软件构建药物成分-靶标-疾病网络图,采用网络分析仪分析东北桤木的主要活性成分.[结果]东北桤木中的黄酮类成分与弓形虫多个靶点相关;AKT1、EGFR、JUN、STAT3及TLR4等是蛋白质相互作用网络中的关键靶标;与弓形虫相关的通路有NF-κB、Toll样受体及JAK-STAT信号传导等.[结论]东北桤木的多个活性成分可通过多靶点、多通路起到抗弓形虫作用.

关键词： 网络药理学   原发免疫性血小板减少症   犀角地黄汤合方   作用机制  

摘要： 目的 运用网络药理学方法研究犀角地黄汤合方对原发免疫性血小板减少症(ITP)的作用机制。方法 通过TCMSP、TCM-ID、PharmMapper数据库获取犀角地黄汤合方的药物成分、成分靶点,通过OMIM、DrugBnak、DisGeNET、GeneCards、TTD数据库获取ITP的疾病靶点,通过jvenn平台获取中药与疾病的交集靶点,利用STRING数据库对上述交集靶点构建蛋白质相互作用关系(PPI)网络,以获取关键靶点。应用Cytoscape软件构建中药-活性成分-靶点并进行可视化分析,通过Metascape数据库进行基因本体(GO)功能和通路分析。结果 筛选出活性成分75个,交集靶点140个,主要活性成分包括槲皮素、山柰酚、丁香脂素二葡萄糖苷、β-谷甾醇、豆甾醇等,PPI网络中分析排名靠前的靶点包括非受体型酪氨酸蛋白激酶(SRC)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)等;GO功能及KEGG富集分析结果:关键蛋白富集在膜微区、膜筏、囊泡腔等位置,参细胞运动及迁移等过程,关键靶点主要通过PI3K-AKT、IL-17信号通路等信号通路对ITP发挥作用。结论 犀角地黄汤合方可能通过槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇、丁香脂素二葡萄糖苷等化合物,经由SRC、TP53、TNF、MAPK1、MAPK14等靶点,通过PI3K-AKT、IL-17等信号通路发挥治疗ITP的作用。