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关键词： 大黄蛰虫丸   结直肠癌   网络药理学  

摘要： 目的:探讨大黄蛰虫丸治疗结直肠癌的药效物质基础以及作用机理。方法:利用TCMSP、TCMID系统并通过文献研究,以获得大黄蛰虫丸的主要化学成份及其功效靶位。再根据GeneCards中的结直肠癌药物靶位、DrugBank中的结直肠癌阳性药功能靶位相结合,证明大黄蛰虫丸功效靶位与结直肠癌之间的相互作用。借助Cytoscape3.7.1软件构建“组分-靶点”网络模型。最后,借助DAVID将主要靶点映射KEGG通路上,进一步阐释主要靶点与大黄蛰虫丸治疗结直肠癌的潜在联系。结果:“组分-靶点”网络包含226个化学组分和相应靶点34个(其中关键药效组分7个,主要靶点26个),主要靶点涉及NOS2、PPARG、PIK3CG、F2、GSK3B、CDK2、PGR、CHEK1等。映射KEGG通路111条(P<0.05),涉及的通路有PI3K-Akt通路、TNF通路、VEGF通路等。结论:结合文献和预测结果分析,榭皮素、L-尿苷为大黄蛰虫丸发挥抗结直肠癌作用的关键药效分子,其机制可能与PI3K-Akt信号通路有关。

关键词： 补阳还五汤   腰椎术后疼痛综合征   术后加速康复   分子对接模拟   网络药理学  

摘要： 目的:采用网络药理学分析方法探讨补阳还五汤对腰椎术后疼痛综合征的作用机制。方法:通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和阅读文献筛选补阳还五汤中可被人体吸收的活性成分及靶点,利用Cytoscape 3.9.0软件构建补阳还五汤活性成分-靶点网络图。利用在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、Disgenet数据库检索“疼痛,术后(Pain,Postoperative)、炎性疼痛(Inflammatory Pain)、下腰痛(Low Back Pain)、骨痛(Bone Pain)”,将获取的疾病基因靶点与补阳还五汤的靶点取交集,预测补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的靶点基因。使用Cytoscape 3.9.0软件构建补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的“活性成分-靶点”网络及蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用“微生信”网站进行靶点基因本体论(GO)分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。筛选补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的“活性成分-靶点”的主要活性成分和关键靶点进行分子对接。结果:从TCMSP和文献中筛选并去除重复后符合标准的活性成分70个、靶点292个,通过OMIM数据库、Disgenet数据库共检索到有关腰椎术后疼痛综合征的靶点共609个。将补阳还五汤靶点和腰椎术后疼痛综合征靶点利用Venny网站取交集后得到补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的靶点70个。补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的“活性成分-靶点”网络和靶点蛋白质-蛋白质相互作用显示,槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素、黄芩素、山柰酚为补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的主要活性成分,前列腺素内过氧化物酶合成酶2(Prostaglandin-endoperoxidase Synthase 2,PTGS2)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine-protein Kinase 1,AKT1)、转化生长因子-β1(Transforming Growth Factor Beta-1,TGFB1)、基质金属蛋白酶9(Matrix Metalloproteinase 9,MMP9)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)为预测的补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的关键靶点。KEGG分析结果显示补阳还五汤治疗腰椎术后疼痛综合征的分子生物学机制主要涉及晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End-product,AGE)与其受体(Receptor for Advanced Glycation End Products,RAGE)及辅助性T细胞17(Helper T Cell 17,Th17)细胞分化通路。分子对接结果显示槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素、黄芩素、山柰酚与关键靶点PTGS2、AKT1、TGFB1、MMP9、TNF均有较强的结合力。结论:补阳还五汤可能是通过调控AGE-RAGE及Th17细胞分化通路影响氧化应激反应、炎性因子表达、营养水平及细胞凋亡,发挥对腰椎术后疼痛综合征的治疗作用,其中槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素、黄芩素、山柰酚是主要活性成分,PTGS2、AKT1、TGFB1、MMP9、TNF可能为关键靶点。

关键词： 筋骨痛消液   质量标志物   高效液相色谱法   指纹图谱   网络药理学   骨关节炎  

摘要： 目的基于指纹图谱和网络药理学预测筋骨痛消液中的质量标志物(Q-Marker)。方法采用高效液相色谱(HPLC)法建立17批筋骨痛消液的指纹图谱,使用中药色谱指纹图谱相似度评价系统(2012A版)进行相似度评价和共有成分指认;采用网络药理学筛选共有成分的相关靶点和关键通路,并建立成分-靶点-通路网络,预测发挥活血化瘀通络、祛寒散结止痛作用潜在的Q-Marker。结果共标定29个共有峰,并指认出6个色谱峰,分别为龙血素B、11-羰基-β-乙酰乳香酸、川续断皂苷Ⅵ、羟基红花黄色素A、大黄酸、苦杏仁苷。筛选出50个核心靶点、90条富集通路,根据化合物、靶点及信号通路间的连接度,初步预测11-羰基-β-乙酰乳香酸、川续断皂苷Ⅵ、羟基红花黄色素A、大黄酸、苦杏仁苷5种Q-Marker。根据蛋白-蛋白相互作用网络计算得白蛋白(ALB)、JUN、酪氨酸激酶(SRC蛋白)、环加氧酶2(PTGS2)和丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)5个关键靶点;基因本体论(GO)功能富集分析涉及生物过程197条,细胞组分35条,分子功能64条;京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析得到相关度高的信号通路有脂质和动脉粥样硬化、松弛素、白细胞介素17(IL-17)、破骨细胞分化、凋亡、C型凝集素受体、Th17细胞分化等。结论所建立方法操作简便、重复性好,初步预测了筋骨痛消液中5种Q-Marker,可为其质量控制和作用机制研究提供参考。

关键词： 天麻   高血压   发病机制   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:本研究采用网络药理学及分子对接方法探讨天麻治疗高血压作用的分子机制。方法:天麻的主要活性成分来自TCMID和Pubchem数据库。利用OMIM,Disgenet,Genecards数据库建立了高血压靶点数据库。利用Cytoscape软件(3.7.2版)和R3.6.1软件建立“药物-成分-靶点-疾病”网络图。利用STRING数据库构建了蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并分析了蛋白相互作用关系。对核心靶点进行GO生物功能分析和KEGG富集分析。采用分子对接验证实验进行了验证。结果:天麻中的32种活性成分可以调控高血压的118个靶点。前5位关键活性成分为4-(4'-hydroxybenzyloxy)benzyl methyl ether,4-ethoxymethylphenyl-4'-hydroxybenzylether,dauricine,20-Hexadecanoylingenol,suchilactone,关键靶点为AKT1、ALB、NOS3、VEGFA、SRC。网络分析结果表明,这些靶点主要参与调节循环系统中的血管过程、调节管径、调节血管大小、调节血管直径、调节管径、调节血压等生物过程。参与高血压治疗的通路包括ERBB信号通路、Jak-STAT信号通路、PI3K/AKT信号通路、mTOR信号通路。分子对接验证实验结果表明,前5位化合物与AKT1、ALB、NOS3、VEGFA、SRC具有较好的结合活性。结论:天麻治疗高血压具有多成分作用于多靶点的特点,其作用机制涉及调节血浆胶体渗透压、细胞增殖和血管生成、炎症反应。本研究为进一步开展天麻治疗高血压的作用机制研究提供了新思路。

关键词： 黄芪   抗肝癌机制   PI3K-AKT信号通路   网络药理学   细胞实验   靶点   拓扑分析   分子对接  

摘要： 目的:从细胞实验和网络药理学探讨黄芪对肝癌的作用机制。方法:通过国家知识基础设施数据库(CNKI)、PubMed、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索黄芪和肝癌的相关基因靶点及活性成分。通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)和黄芪-肝癌作用网络。以DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并以CB-DOCK平台进行分子对接。细胞实验采用MTT法和蛋白质印迹法检测细胞增殖和蛋白表达。结果:筛选出黄芪19个有效成分,250个靶点。GO和KEGG富集分析得549个条目,145条信号通路,主要涉及调节DNA的转录,对细胞增殖和凋亡的调控等。作用通路主要涉及肿瘤相关的通路,如癌症通路、脂质和动脉粥样硬化、卡波西肉瘤、PI3K-AKT信号通路等。分子对接结果显示黄芪抗肝癌核心成分芒柄花黄素,毛蕊异黄酮,黄芪甲苷与PI3K-AKT信号通路蛋白有较好的结合力。网络药理学分析结果基础上,进一步细胞实验证实黄芪水提液能有效抑制HepG2细胞增殖,下调AKT1、PI3K p110,p-AKT1的蛋白表达水平。结论:黄芪能抑制PI3K-AKT信号通路,发挥对肝癌细胞的抑制作用,为其应用于肝癌临床治疗提供理论支持。

关键词： 桃红四物汤   子宫异常出血   蛋白激酶B   TNF-α   IL-6  

摘要： 目的探讨桃红四物汤治疗子宫异常出血(AUB)的潜在生物学机制。方法通过中药系统药理数据库(TCMSP)筛选TSD的活性化合物及其靶点,运用GeneCards、OMMI等数据库数据库筛选AUB靶点,确定交集基因;构建靶点网络和蛋白质相互作用(PPI)网络,采用米非司酮、米索前列醇联合复制AUB模型,对关键蛋白进行体内验证。结果筛选得到TSD活性成分69个,对应靶点224个,AUB相关靶点3271个,交集靶点164个。实验结果显示,TSD可显著减少大鼠子宫的出血量和出血时间,降低模型大鼠血清中IL-6和TNF-α,下调Akt1、TNF-α蛋白的表达。结论TSD对AUB的治疗作用可能与降低IL-6和TNF-α炎症因子的水平、下调Akt1和TNF-α蛋白表达有关,为进一步开展TSD治疗AUB的机制研究提供了新思路与方法。

关键词： 年龄相关性黄斑变性   决明子   网络药理学   生物信息学   分子对接  

摘要： 目的:对决明子治疗年龄相关性黄斑变性作用机制进行网络药理学分析与分子对接预测。方法:运用中医药系统药理学数据库及分析平台(TCMPS)数据库检索所需决明子有效药物成分,SwissTargetPrediction数据库获取其相关基因靶点。在DisGeNET数据库与GeneCards数据库中以关键字“Age-related macular degeneration”检索获得疾病相关基因。所有基因靶点在绘制Venn图筛选后,导入Cytoscape 3.8.0软件中构建决明子-化学活性成分-靶点可视化网络图谱。在STRING平台绘制蛋白质相互作用可视化网络,从DAVID在线数据库中获得GO生物功能富集分析与KEGG通路富集分析结果。计算机模拟关键蛋白靶点和药物成分的分子对接。结果:共检索到大黄酸、决明素等决明子有效活性成分9个,对应基因靶点208个,年龄相关性黄斑变性基因靶点1977个,两者交集基因靶点75个;GO生物功能与KEGG通路富集分析分别得到518个条目与146条通路。结论:决明子可通过影响PI3K-Akt信号通路、脂质与动脉粥样硬化等通路作用于TP53、TNF、MYC等靶点治疗年龄相关性黄斑变性;其治疗作用可能是多靶点、多通路且由其中多种成分介导的。

关键词： 人参皂苷Rg_(3)   提取制备   化学结构   抗肿瘤   综述  

摘要： 作为稀有皂苷的人参皂苷Rg_(3)(ginsenoside Rg_(3),G-Rg_(3))是人参的重要活性成分之一,随着人参在临床上的使用越来越广泛,学者对G-Rg_(3)的提取制备、化学组成及药理作用的研究也愈来愈深入。不同的提取制备方法对G-Rg_(3)的含量和纯度均会产生不同程度的影响,进而对其药理作用的发挥也会有所影响。G-Rg_(3)具有抗肿瘤、保护心血管系统、保护神经系统等药理作用。文章在全面查阅并梳理文献资料的基础上,对G-Rg_(3)的提取制备、化学结构及药理作用进行综述,并对G-Rg_(3)的研究前景进行展望,以期对G-Rg_(3)的进一步开发利用和研究提供有效的理论支持。

关键词： 橡子   酚类   萜类   氨基酸   抗癌   降糖   抗炎   抑菌  

摘要： 橡子为药食两用资源,有止肠风、冷热泻痢的功效,具有悠久的药用历史。橡子含有多种化学成分,至今已被鉴定的化学成分主要包括酚类、萜类、氨基酸以及矿质元素等,现代研究表明,其具有抗癌、降糖抗炎、抑菌和排铅等药理作用。对橡子的化学成分及药理作用的研究进展进行梳理并展开综述,以期更好地了解橡子的化学特征及药理作用,为扩大橡子的临床应用提供理论依据。

关键词： 阴道炎   完带汤   网络药理学   作用机制  

摘要： 基于网络药理学探讨完带汤治疗各种阴道炎的作用机制。方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP数据库)筛选出关于完带汤中所有药物的有效成分及作用靶点,利用UniProt Archive数据库进行基因名称规范。在人类基因综合分析数据库(GeneCards数据库)、药学资源数据库(Drugbank数据库)中提取有关阴道炎疾病的相关靶点并进行去重合并。将完带汤中所有药物的靶点与阴道炎疾病的靶点合并取交集后以Venn 图展示。利用Cytoscape软件进行构建“药物-活性成分-疾病靶点”的网络图,并利用其中的插件CytoNCA进行构建有关药物和疾病的核心靶点图。运用基因蛋白相互作用数据库(String数据库)构建蛋白互作 PPI 网络图。采用生物信息数据库系统( DAVIDA 数据库)对完带汤与阴道炎共有的靶点进行GO功能和KEGG富集功能分析,得到基因靶点参与的生物学过程和中药抗阴道炎的信号通路相关结果。结果 完带汤包含198个药物活性成分,所涉及的作用靶点共252个, 阴道炎疾病相关靶点859个,绘制Venn 图得到完带汤与阴道炎疾病交集基因94个,基因蛋白相互作用分析得到5个核心靶点基因。GO富集分析完带汤治疗阴道炎疾病的相关核心靶点基因主要分布细菌来源分子、氧化应激反应等方面。KEGG通路富集发现治疗完带汤的作用机制可能与肿瘤通路、AGE-RAGE信号通路、化学致癌–受体激活通路等相关。结论 完带汤具有多个成分、多个靶点、多条通路影响阴道炎的发生与发展。