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关键词： 栀子   肝纤维化   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接方法探究栀子抗肝纤维化的功效物质及作用机制。方法:使用UPLC-Q/TOF-MS对栀子的成分进行检测和分析;通过TCMSP数据库及文献调研筛选栀子抗肝纤维化的活性成分,并使用Swiss target prediction网络预测平台和Drugbank数据库获取其作用靶点;采用GeneCards和OMIM数据库获取肝纤维化相关靶点,与活性成分靶点取交集,获得栀子抗肝纤维化的潜在作用靶点;借助Cytoscape软件构建“活性成分-潜在靶点”网络,并通过度值筛选核心成分;使用STRING平台进行蛋白相互作用分析,通过度值筛选核心靶点;采用DAVID数据库对栀子抗肝纤维化的潜在作用靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;使用分子对接技术验证核心成分与靶点的结合作用。结果:在栀子中鉴定出72个化合物;筛选出抗肝纤维化的活性成分27个,潜在作用靶点331个;“活性成分-潜在靶点”网络筛选出核心成分8个;蛋白质互作网络分析获取核心靶点77个;GO和KEGG富集分析发现栀子通过代谢通路、PI3K-Akt信号通路、脂质与动脉粥样硬化等治疗肝纤维化;分子对接结果表明核心成分与核心靶点均能自由结合。结论:栀子可能通过参与PI3KAkt、MAPK等信号通路,作用于MAPK3、MAPK1等基因靶点,发挥抗纤维化的功效。

关键词： 山姜属   二苯基庚烷   化学成分   生物活性   药理作用   研究进展  

摘要： 山姜属(Alpinia)为姜科中药的主要药用植物来源,该属包含高良姜、益智、草豆蔻等多种传统中药。目前,研究者从山姜属的药用植物中发现数量众多且结构新颖的二苯基庚烷类化合物,该类型化合物是山姜属植物的代表性成分类型之一,其具有广泛的药理活性,包括抗氧化、抗肿瘤、抗炎、降血糖、抗病毒等。本文对山姜属中二苯基庚烷类化合物的结构和生物活性进行了总结,以化合物类型对结构进行分类,归纳讨论了无环直链二苯基庚烷、环氧二苯基庚烷、二苯基庚烷二聚体、二苯基庚烷-单萜聚合体和二苯基庚烷-黄酮聚合体的结构特征和他们的主要药理作用,以期为该属植物的开发利用提供参考。

关键词： 广西莪术   化学成分   药理作用   质量分析方法   临床应用  

摘要： 广西莪术(Curcuma kwangsiensis)是广西道地药材之一,有行气破血、消积止痛的功效,其药用历史悠久、临床应用广泛,可用于治疗肿瘤、血栓、消化不良和闭经等多种疾病。本文从化学成分、药理作用、质量分析方法和临床应用4个方面对广西莪术现有研究进行归纳和阐述,旨在为广西莪术的深入开发及推广应用提供参考。

关键词： 虎杖   动脉粥样硬化   铁死亡   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:以网络药理学和分子对接分析的方法,系统研究虎杖调控铁死亡抗动脉粥样硬化(AS)的机制,为开发治疗AS的新药提供理论依据。方法:采用TCMSP数据库对虎杖的活性成分和治疗靶点进行预测和筛选。通过GeneCards数据库和Drugbank数据库获取AS的疾病靶点。利用Venny在线工具获得虎杖活性成分和AS的共同作用靶点。在Cytoscape3.9.1软件绘制活性组分和靶点网络图,STRING数据库分析了蛋白-蛋白相互作用(PPI),利用Metascape数据库对交叉靶点进行了GO生物富集及KEGG富集分析。运用GeneCards数据库和FerrDb数据库获得调控铁死亡基因,综合分析虎杖活性成分、AS、铁死亡3者关系并进行分子对接。分子对接研究由SYBYL-X 2.0软件进行验证完成。结果:得到的虎杖的活性成分有10个,对应靶点252个,AS靶点1328个,铁死亡对应靶点887个,3者取交集基因得到44个,蛋白互作分析发现TP53、JUN和IL-6为调控铁死亡治疗AS主要靶点,KEGG富集结果发现,虎杖调控铁死亡治疗AS通过介导MAPK信号通路。分子对接结果表明,虎杖药物主要活性成分与TP53、JUN和IL-6靶点具有较好的结合能力。结论:虎杖可能通过MAPK信号通路影响TP53、JUN和IL-6等基因发挥调控铁死亡治疗AS。

关键词： 糖尿病肾病   网络药理学   作用机制   活性成分   靶蛋白   富集分析   信号通路  

摘要： 通过网络药理学方法分析苍术-茯苓药对在治疗糖尿病肾病(DN)中的作用及相关分子机制。方法 通过检索有机小分子生物活性数据库(Pubchem)等数据库获取苍术-茯苓药对已知活性成分及靶蛋白;利用人类基因数据库(GeneCards)获取DN相关疾病基因;运用Cytoscape3.9.1软件分别构建“苍术-茯苓药对活性成分-靶蛋白”相互作用网络和“苍术-茯苓药对靶蛋白-DN基因”蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析网络拓扑结构;采用David数据库进行苍术-茯苓药对治疗DN靶点京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析和基因本体(GO)富集分析。结果 筛选获得苍术-茯苓药对20个活性成分及其对应的309个靶蛋白,其中主要活性成分为多孔菌酸C、齿孔酸等,关键蛋白为肿瘤坏死因子、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶等。KEGG通路富集结果提示,苍术-茯苓药对可能通过作用于AGE-RAGE、PI3K-AKT、TNF等信号通路,抑制炎症反应、肾脏纤维化和胰岛素抵抗,调节肾小球滤过率,从而减缓DN发展。结论 苍术-茯苓药对治疗DN涉及多个靶点和信号通路,可能通过抑制炎症反应、肾脏纤维化和胰岛素抵抗等过程进行干预。

关键词： 帕金森病   半夏-陈皮-茯苓   网络药理学   作用机制预测  

摘要： 目的:基于网络药理学探究半夏-陈皮-茯苓治疗帕金森病的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取药物有效成分并预测靶点。获取2D结构图,并录入Phrammarpper数据库获得成分靶点。使用PharmGKb数据库、GeneCard数据库、DrugBank数据库、Therapeutic Target Database数据库预测疾病靶点。使用Venny 2.1在线制作平台获取药物疾病交集靶点。使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。使用R语言和Cytoscape软件中CytoNCA APP获取核心靶点。通过R语言中BiocManager包和OrgDb包等和R Studio软件进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析。使用Cytoscape软件建立“药物-成分-靶点-通路”网络关系图。结果:获得药物核心成分8个,核心靶点11个。GO富集共得到1 959条项目,包括生物进程1 731条、细胞组分80条、分子功能148条。京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集结果主要包括磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase, PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、环磷酸腺苷(Cyclic Adenosine Monophosphate,cAMP)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)、白细胞介素(Interleukin,IL)-17、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)等信号通路。结论:半夏-陈皮-茯苓具有多种成分、多个靶点、多条通路治疗帕金森病的特点,为治疗帕金森病提供了基础研究。

关键词： 四妙丸   网络药理学   腰椎间盘突出症   药物作用机制  

摘要： 目的:采用网络药理学的研究方法,对四妙丸用于治疗腰椎间盘突出症(LDH)的药理作用以及机制问题进行研究和探讨。方法:借助TCMSP平台筛选出四妙丸活性药物成分及靶标预测。从OMIM数据库、GeneCards数据库、Drugbank数据库中检索出疾病靶标。采用R软件确定了四妙丸-LDH的交集靶点并利用STRING网站进行蛋白互作。利用Cytoscape软件构建了药物成分-交集靶点网络。最后在R软件将交集靶标进行富集分析。结果:分析研究显示共挖掘到了四妙丸中活性药物成分75种及预测靶点2902个、399个LDH疾病相关靶点,取交集后得到四妙丸-LDH交集靶点45个,分析得到MAPK14、MAPK1、IL6、ESR1、FOS和JUN可能为核心靶点,汉黄芩素、槲皮素可能为四妙丸治疗LDH的关键活性化合物。GO富集分析得到GO条目2004个,KEGG分析得到AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等可能为作用通路。结论:四妙丸中有多个对LDH有抑制作用的药效成分,多成分多靶标共同作用是其作用机制。

关键词： 黄连膏   指纹图谱   特应性皮炎   网络药理学   经典名方   小檗碱  

摘要： 目的:建立黄连膏的指纹图谱,结合网络药理学和实验验证分析其治疗特应性皮炎(Atopic dermatitis,AD)的机制,预测其潜在的质量标志物(Q-Marker),为其质量控制和临床应用提供依据。方法:建立黄连膏的HPLC指纹图谱,对共有峰进行指认和归属,应用网络药理学筛选和分析黄连膏相关成分的作用靶点和通路,预测其抗AD潜在的Q-Marker;建立1-氯-2,4-二硝基苯(DNCB)诱导的AD小鼠模型,对预测结果进行验证。结果:指纹图谱共标定23个共有峰,并指认出5个色谱峰;将5个成分经网络药理学分析,筛选出EGFR、IL-10、PTGS2、VCAM1、STAT3、ICAM1等作用靶点,癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化、TNF信号通路、细胞凋亡等关键信号通路,以“Q-Marker五原则”为核心,结合指纹图谱及网络药理学分析结果,初步预测小檗碱、姜黄素、藁本内酯、芝麻素、芝麻酚为黄连膏潜在的Q-Marker。动物实验验证,黄连膏能有效改善AD模型小鼠皮损(p<0.001),减少抓挠次数(p<0.001),降低血清炎症因子IL-6,IFN-γ,TNF-α水平(p<0.001),减轻皮肤角化过度和表皮及真皮的增厚,减少肥大细胞数量。结论:本研究建立的HPLC指纹图谱方法稳定可行,结合网络药理学及实验验证发现黄连膏中5个成分与其抗皮炎功效密切相关,为黄连膏的质量控制提供参考,同时也为黄连膏药效关联物质基础的研究及作用机制的探索奠定基础。

关键词： 新型冠状病毒感染   抗奥合剂1号方   网络药理学   超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱   分子对接  

摘要： 目的:基于超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱(UHPLC-Q-TOF/MS)、网络药理学及分子对接技术,探讨抗奥合剂1号方防治新型冠状病毒感染(COVID-19)的作用机制。方法:采用UHPLC-Q-TOF/MS对抗奥合剂1号方入血成分进行定性分析;采用网络药理学方法筛选抗奥合剂1号方活性成分、关键靶点并探讨作用机制。采用AutoDock软件对关键靶点及活性成分进行分子对接验证。结果:共鉴定抗奥合剂1号方入血成分31个,靶蛋白相互作用(PPI)分析筛选关键靶点105个,KEGG富集分析发现抗奥合剂1号方可能通过TNF、IL-17、PI3K-Akt等信号通路发挥抗COVID-19的作用。分子对接结果显示,关键靶点ALB、TNF、IL-6与抗奥合剂1号方中活性成分甘草酸、人参皂苷Rb1、阿魏酸结合良好。结论:抗奥合剂1号方可通过多成分、多靶点、多通路协同发挥防治COVID-19的作用。

关键词： 地板藤   原发性痛经   网络药理学   作用机制   分子对接  

摘要： 目的:基于UPLC-QE-MS分析地板藤化学成分以及通过网络药理学探讨地板藤治疗原发性痛经的作用机制。方法:通过UPLC-QE-MS分析所得地板藤化学成分,利用Swiss ADME和Swiss Target Prediction筛选出药物化学成分相应靶点,再通过GeneCards、OMIM、Drugbank等数据库得到原发性痛经疾病靶点,利用Cytoscape绘出“药物-成分-靶点”及蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)图。其次可由Metascape与微生信得到GO与KEGG富集分析可视化图,最后使用分子对接对网络药理学内容进行初步验证。结果:经UPLC-QE-MS共分析出117个化合物,通过Swiss ADME筛选的出79个成分,这些成分作用于362个靶点;药物-疾病共有靶点30个,经PPI网络图得可能作用的靶点为白蛋白(ALB)、前列腺素-过氧化内合酶2(PTGS2)、过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARA);经GO富集分析得312条,主要涉及脂肪酸代谢过程、花生四烯酸代谢过程、异生代谢过程、血红素结合过程、类固醇羟化酶活性过程等;KEGG富集分析得花生四烯酸代谢、PPAR、AMPK、cAMP、PI3K-Akt等26条通路;分子对接结果显示关键靶点与活性成分结合结合效能较低,具较好的亲和力。结论:初步分析得出地板藤的化学成分,同时探讨了其治疗原发性痛经可能的药效物质及其作用机制,后续为其治疗原发性痛经提供理论依据。