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关键词： 扩张型心肌病   真武汤   基因   网络药理学   机制  

摘要： 目的基于网络药理学技术对真武汤治疗扩张型心肌病(Dilated cardiomyopathy,DCM)药理机制及相关作用靶点进行分析。方法在现有中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)的基础上,筛选既往研究中真武汤的有效成分及相关靶向基因,后根据拓扑分析构建真武汤的H-C网络。采用Drugbank和Genecards药物及基因相关数据库构建DCM疾病相关靶点,并与构建的真武汤有效成分网络进行匹配进而明确真武汤治疗DCM的潜在治疗靶点。并应用Metascape及DAVID数据库对真武汤潜在治疗靶点进行GO生物过程及KEGG信号通路分析,构建PPI网络,对PPI网络进行拓扑分析以明确DCM及真武汤治疗的核心靶点。结果真武汤中有效化学成分包括白术15种,茯苓6种,白芍11种,附子7种,生姜33种,有效成分作用靶点106个。在药物-有效成分-靶点网络内重要性前10的有效成分中,包含山奈酚、β-谷甾醇、豆甾醇,有106个可以作为真武汤治疗DCM的潜在治疗靶点。在得出的全部20调信号通路中,其中PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路等10个通路排名靠前。通过GO富集功能共筛选涉及炎性反应、细胞凋亡及细胞增殖等方面排名靠前的富集网络30条,BP、CC及MF每个层面各10条。PPI网络筛选的核心靶点为RBM20、IL1B、TP53、IL6、MMP9、ESR1、TNF、AKT1、FHOD1、SPEG基因。结论山奈酚、β-谷甾醇及豆甾醇等是真武汤治疗DCM的潜在有效成分,通过调控AMPK-mTOR通路发挥作用,RBM20、IL1B、TP53等基因为真武汤治疗的核心作用靶点。

关键词： 心力衰竭   急性   真武汤   葶苈大枣泻肺汤   网络药理学   机制  

摘要： 目的:运用网络药理学研究方法探讨真武汤合葶苈大枣泻肺汤治疗急性心力衰竭的作用机制。方法:在中药系统药理学分析平台上运用中药分子机制的生物信息学分析工具,筛选真武汤合葶苈大枣泻肺汤的成分和靶点;并通过相关数据库检索急性心力衰竭相关靶点;通过韦恩图得到真武汤合葶苈大枣泻肺汤和急性心力衰竭的共同靶点,然后利用STRING网站进行化合物-疾病共同靶点蛋白互作分析;利用David数据库进行基因本体分析和通路富集分析。最后,采用Cytoscape 3.72软件构建药物-成分-作用靶点-通路-疾病的网络模型。结果:通过筛选得到真武汤合葶苈大枣泻肺汤的潜在主要活性成分196个,涉及127个疾病作用靶点,主要活性成分为檞皮素、β-谷固醇、山柰酚、芍药苷等,信号通路为AGE-RAGE、IL-17等,共同发挥治疗急性心力衰竭的作用。结论:真武汤合葶苈大枣泻肺汤治疗急性心力衰竭是多成分、多靶点、多途径相互作用的结果,为真武汤合葶苈大枣泻肺汤的基础或临床研究提供一定的理论依据。

关键词： 六神丸   泼尼松   甲状腺炎,亚急性   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的探究六神丸联合泼尼松治疗亚急性甲状腺炎(SAT)的潜在作用。方法应用TCMSP、HERB数据库和Swiss Target Prediction数据库等筛选六神丸、泼尼松的活性成分与靶点,并从GeneCards、OMIM、TTD和DisGeNET数据库获取SAT相关的治疗靶点。应用R语言Cluster Profiler包进行基因本体(GO)、京都基因和基因组(KEGG)富集分析,Cytoscape软件构建药物-活性成分-治疗靶点网络图,并针对关键靶点绘制蛋白-蛋白相互作用网络。通过拓扑结构分析获得关键基因,对关键基因、活性成分构建网络,采用分子对接分析关键靶点。结果筛选获得六神丸活性成分12个,对应抗SAT靶点441个;泼尼松抗SAT靶点15个,六神丸联合泼尼松与SAT疾病交集靶点135个。GO富集筛选在生物过程方面获得1811个条目,分子功能方面获得81个条目,细胞组成方面获得63个条目;KEGG富集分析出146条通路,涉及PI3K/Akt、MAPK、Rap1等信号通路。将六神丸活性成分远华蟾毒精、菜油甾醇、乙酸龙脑酯、脱氧胆酸等与筛选出的基因靶点SRC、HSP90AA1、STAT3、TP53、MAPK3进行分子对接,发现关键中药活性成分与关键靶点之间的结合性良好。结论六神丸联合泼尼松治疗SAT可能与通过多成分、多靶点调节PI3K/Akt、MAPK、Rap1等信号通路有关。

关键词： 海藻   甲状腺乳头状癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的利用网络药理学与分子对接技术研究富碘中药海藻治疗甲状腺乳头状癌的作用机制。方法通过TCMSP平台及查阅文献筛选海藻的活性成分及药物靶点,用Genecards、OMIM和DrugBank数据库收集甲状腺乳头状癌的疾病靶点,取药物靶点和疾病靶点的交集作为潜在靶点,并在STRING数据库中获得靶点蛋白质互作网络,导入Cytoscape软件获得关键靶点和有效成分,在Metascape数据库中进行关键靶点的GO功能和KEGG通路富集分析,最后用Autodock vina软件进行海藻有效成分和关键靶点的分子对接验证。结果共筛选得到富碘中药海藻治甲状腺乳头状癌8种有效成分和14个关键靶点,通过分子对接验证了海藻主要有效成分槲皮素和TNF、TP53、IL-6和VEGFA等关键靶点间的分子结合力很强。富集分析结果表明海藻有效成分和关键靶点通过参与调节PPAR信号通路、NF-κB信号通路、IL-17信号通路、前列腺癌、HIF-1信号通路等而发挥治疗甲状腺乳头状癌的作用。结论富碘中药海藻治疗甲状腺乳头状癌的作用机制可能是海藻中所含有效成分通过调节多个甲状腺乳头状癌相关靶点,进而介导多条信号通路,以达到治疗疾病的目的,也为今后甲状腺乳头状癌的治疗提供新的研究思路。

关键词： 糖尿病肾病   九味降糖口服液   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨九味降糖口服液治疗糖尿病肾病的作用机制。方法 在中药系统药理学数据库与分析平台、中医药整合药理学研究平台、本草组鉴数据库筛选九味降糖口服液各味中药的活性成分后,借助SwissTargetPrediction数据库和UniProt数据库获取其对应的作用靶点。在GeneCards~?及DisGeNET数据库检索糖尿病肾病相关靶点后,对两类靶点取交集。基于交集靶点,通过STRING数据库和Cytoscape 3.8.3软件构建蛋白-蛋白相互作用网络和药物-成分-靶点-疾病可视化调控网络,以分别筛选核心靶点和核心活性成分。通过Metascape数据库进行功能富集分析和通路富集分析。采用AutoDockTools 1.5.7软件对核心活性成分与核心靶点蛋白进行分子对接验证。结果 共获得九味降糖口服液的活性成分84个,活性成分作用靶点1 078个,糖尿病肾病相关靶点613个,交集靶点共169个。核心活性成分为槲皮素、大豆苷元、葛根素、山柰酚、4′-甲氧基葛根素、异鼠李素、芒柄花素、β-谷甾醇、鞣花酸、京尼平苷、毛蕊异黄酮,核心靶点为GAPDH、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT)1、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤蛋白53(TP53)、IL-1β。富集分析结果显示,交集靶点主要参与对激素、肽、无机物、氮化合物的反应等生物过程,富集于膜筏、膜微区、质膜筏等细胞组分,主要涉及蛋白激酶活性、以醇为受体的磷酸转移酶活性、激酶活性等分子功能,并涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/AKT信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(AGE)-晚期糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、低氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等信号通路。分子对接结果显示,核心活性成分与核心靶点对接结果良好。结论 九味降糖口服液的多个活性成分可能通过作用于GAPDH、TNF、IL-6、AKT1、VEGFA、TP53、IL-1β等靶点,调控AGE-RAGE信号通路、PI3K/AKT信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等,从而影响炎症反应和氧化应激,进而影响糖尿病肾病的发生和发展。

关键词： 食管癌   肿瘤微环境   八珍汤   生物信息学   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的:基于网络药理学和生物信息学探讨八珍汤重塑食管癌肿瘤微环境的作用机制。方法:收集中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中八珍汤组方药物的有效成分及其靶点,从TCGA数据库下载食管癌患者的转录组数据和临床信息,根据ESTIMATE算法计算食管癌样本的基质评分、免疫评分、综合评分,筛选食管癌肿瘤微环境预后相关基因,将这些基因作为重塑食管癌肿瘤微环境的相关靶点。最后将中药靶点和疾病靶点取并集,获得八珍汤重塑食管癌肿瘤微环境的相关靶点,并通过Cytoscape 3.9.1构建“中药-成分-靶点”网络。基于STRING 11.5数据库及Cytoscape 3.9.1软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并通过Cytoscape 3.9.1的插件CytoHubba筛选核心基因,运用DAVID数据库对中药与疾病共有靶点进行基因本体(GO)富集分析以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,并对药物有效成分和核心基因进行分子对接验证。结果:获得八珍汤重塑食管癌肿瘤微环境的31个相关基因,根据MCC算法筛选得到前5个较为重要的基因:ICAM1、CCL2、CXCL10、STAT1、VCAM1。GO功能、KEGG通路富集分析结果显示,中药-疾病共有靶点基因主要富集于趋化因子信号通路、TNF信号通路、NF-κB信号通路等。分子对接结果显示,八珍汤药物主要有效成分和核心靶点蛋白有良好的结合力。结论:八珍汤可能通过靶向ICAM1、CCL2、CXCL10、STAT1、VCAM1等关键基因调控趋化因子、TNF、NF-κB等信号通路重塑食管癌肿瘤微环境,从而影响食管癌细胞生长、侵袭转移、血管生成、化学耐药等。

关键词： 苦参   乳腺癌   网络药理学   分子对接   雄激素受体  

摘要： 目的采用网络药理学和分子对接的方法分析苦参抗乳腺癌的主要活性成分及潜在分子机制。方法采用TCMSP、ETCM数据库和查阅国内外文献收集筛选苦参化学成分,通过Swiss Target Prediction数据库对有效活性成分的靶点进行预测,通过GeneCards、TTD、Drugbank、OMIM收集乳腺癌相关靶点,根据Venny 2.1.0软件筛选出苦参抗乳腺癌疾病靶点;采用Cytoscape软件构建苦参-核心活性成分-靶点网络图,用STRING数据库分析共有靶点,构建PPI网络图,通过DAVID数据库和Hiplot平台对关键靶点蛋白进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,并采用Schrodinger软件对活性成分与靶点进行分子对接,同时采用分子生物学方法对关键靶点进行验证。结果从苦参中共筛选出结构明确的活性成分36个,筛选出70个苦参抗乳腺癌的疾病靶点,其中EGFR、AKT1、ESR1、SRC、CYP19A1、AR、ABCB1等12个核心靶点参与乳腺癌中内分泌抵抗、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药、雌激素等信号通路,且核心成分与关键靶点AR之间的结合能最高。体外细胞实验显示,苦参提取物可抑制乳腺癌细胞的增殖,诱导细胞凋亡,上调AR蛋白的表达。结论苦参通过多成分作用于多靶点和多个信号通路,调节复杂的生物过程发挥抗乳腺癌的作用,苦参对AR蛋白的上调可能成为治疗乳腺癌新的治疗策略。

关键词： 白花蛇舌草   化学成分   药理作用   临床研究  

摘要： 目的:为白花蛇舌草现代研究提供理论依据,为其新药开发和质量评价奠定基础。方法:本文通过数据库的检索,对近十年的白花蛇舌草化学成分、药理作用以及临床应用的相关文献资料进行整理与总结。结果:发现白花蛇舌草中主要含有环烯醚萜类、黄酮类、蒽醌类、多糖类、有机酸类以及微量元素等多种化学成分物质;具有抗肿瘤、抗炎、抗氧化活性以及免疫调节等药理作用。白花蛇舌草在炮制方面的研究比较少,临床上常用其治疗各种癌症,包括肠癌、胃癌、肝癌、直肠癌等,与半枝莲和其他抗癌药合用效果更佳。结论:目前白花蛇舌草的化学成分研究较为全面,药理研究多是抗癌、抗炎,临床上常与清热解毒类药物合用,目前暂未见毒副作用的报道。

关键词： 网络药理学   消岩汤   胃癌   作用机制  

摘要： [目的]运用网络药理学探讨消岩汤治疗胃癌的作用机制。[方法]通过TCMSP、TCMID和BATMAN-TCM数据库筛选消岩汤的活性成分及作用靶点,后利用Uniprot获取蛋白靶点所对应的基因名称;通过DrugBank、GeneCards、OMIM数据库挖掘胃癌疾病靶点,并筛选出与消岩汤靶点基因的交集基因;运用Cytoscape3.7.2软件绘制药物-化合物-交集靶点网络图;运用String数据分析平台构建PPI网络,并运用MCODE插件对PPI网络进行Cluster模块分析;运用Metascape数据库进行KEGG富集分析及GO富集分析;运用Kaplan-Meier Plotter数据库探索关键基因靶点对胃癌患者OS的影响,绘制生存曲线。[结果]筛选得到消岩汤活性成分41种、靶点基因266个,胃癌靶基因1163个,最终获得交集基因116个,剔除不含交集基因的活性成分后得到化合物35种。TP53、JUN、AKT1、MAPK3、RELA、MAPK1、ESR1、MAPK14、IL-6等为消岩汤治疗胃癌的关键靶点。GO富集分析结果显示与凋亡的信号通路、对无机物质的反应、对氧化应激的反应、对化学应激的反应等相关,KEGG通路富集分析结果显示主要涉及癌症中的蛋白多糖、PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、铂类耐药等。生存分析结果显示TP53、AKT1、MAPK3、RELA、ESR1高表达的患者总生存期显著低于低表达组,JUN、MAPK1、MAPK14高表达患者的总生存期则显著高于低表达组。[结论]基于网络药理学的研究方法有助于寻找消岩汤治疗胃癌的关键靶点及信号通路,为深入探索消岩汤治疗胃癌的作用机制提供了有益信息和数据支撑。

关键词： 川芎   化学成分   药理作用   提取工艺  

摘要： 中药川芎中主要含有苯酞类、酚酸类、生物碱类及多糖类等化学成分。药理学研究表明,川芎具有镇痛、对血管内皮细胞增殖的促进作用和再灌注损伤的保护作用、抗炎、对心脑血管系统的保护作用等多种生物活性。川芎的提取方法主要包括超声波提取法、微波辅助萃取法和超临界流体萃取法等。本文综述川芎的化学成分、药理作用及提取工艺的研究进展,为川芎的药效物质基础和作用机制等研究提供参考。