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关键词： 网络药理学   分子对接   生物被膜   藤椒精油   解淀粉芽孢杆菌  

摘要： 为探讨藤椒精油抗解淀粉芽孢杆菌生物被膜的关键活性分子及其胞内作用机理,采用PharmMapper数据库进行靶点预测,结合基因组注释信息对筛选后的靶点进行清洗过滤,预测筛选藤椒精油关键活性组分及抗生物被膜的作用靶点,并应用Cytoscape软件构建藤椒精油活性分子-潜在靶点互作网络,通过String数据库对潜在靶点进行GO与KEGG通路富集分析。应用STITCH数据库获得潜在靶点互作关系,Cytoscape软件进行网络拓扑分析,筛选关键核心靶点。采用CB-DOCK2在线分子对接服务器进行藤椒精油活性分子与核心靶点的分子对接。最后通过离体培养结合结晶紫染色法、细菌运动能力实验验证藤椒精油关键活性分子的抗生物被膜活性。结果表明,通过网络药理学方法共筛选获得了21种藤椒精油活性组分,133个潜在作用靶点,8个核心靶点。GO富集分析共获得17个GO二级条目,包括生物学过程条目6个、分子功能条目8个和细胞组分条目3个。KEGG通路富集分析共获得8条信号通路,涉及次级代谢产物的生物合成、氨基酸的生物合成等通路。分子对接结果表明,藤椒精油关键活性组分中桉叶醇、金合欢醇乙酸酯、反式法尼醇可通过氢键和疏水相互作用等分子间作用力与核心靶点OdhA、CarB、PurF紧密结合并形成稳定构象。离体生物被膜培养验证实验结果表明,0.32~1.28μL/mL的金合欢醇乙酸酯、反式法尼醇对解淀粉芽孢杆菌均有显著的抗生物被膜活性。研究结果旨在为藤椒精油抗细菌生物被膜的胞内分子机理提供新的研究思路。

关键词： 网络药理学   十八反   缺血性中风   作用机制  

摘要： 目的运用网络药理学方法探讨附子-半夏药对治疗缺血性中风的作用机制。方法通过TCMSP数据库收集药对的有效成分及作用靶点信息;运用Uniprot蛋白质数据库寻找蛋白质靶点和相应的人类基因;利用GeneCards数据库和OMIM数据库预测疾病靶点,运用Venny2.1取二者交集靶点;利用STRING、Cytoscape3.7.2绘制PPI网络;最后通过R软件进行GO以及KEGG分析,并使用Cytoscape3.7.2软件构建“成分-疾病靶点-通路图”。结果附子-半夏药对共同拥有β-谷甾醇、黄芩苷、豆甾醇、卡文定碱、松柏苷等主要活性成分通过脂质、粥样硬化、细胞凋亡及P53信号通路作用在AKT1、CASP3、PTGS2、TP53、PPARG等靶点上治疗缺血性中风。结论附子-半夏药对通过多靶点、多途径、多通路发挥防治缺血性中风的作用。

关键词： 降香檀   化学成分   药理作用  

摘要： 降香檀是我国二级保护树种,具有极高的材用和药用价值。其树干和根的干燥心材是我国名贵南药降香,具有化瘀止血、理气止痛的功效。然而,降香檀资源紧缺,降香药材品质难以保证,严重制约了该产业的发展。本文总结了近年来降香檀资源的研究现状,对降香檀心材、叶、籽的化学成分和药理作用进行综述,以期为降香檀资源进一步研究和开发利用提供参考依据。

关键词： 葛根   化学成分   异黄酮   药理作用  

摘要： 葛根为常见中药,含有多种异黄酮类物质活性物质,具有多种药理作用。本文对葛根异黄酮化合物抗氧化、保护心脑血管系统、护肝解酒、降糖降脂、免疫调节、抗肿瘤、抗炎、防治骨质疏松等作用及其作用机制进行了较为全面的综述。

关键词： 二陈汤   肺癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的采用网络药理学及分子对接技术分析二陈汤治疗肺癌的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取二陈汤的成分及相关靶点,文献检索时间为2022年11月24日至2023年3月31日。从GeneCards、OMIM、PharmGKB等数据库分别获取肺癌的相关靶点并筛选出与二陈汤靶点基因的交集基因;构建蛋白互作PPI网络,R语言可视化关键蛋白的生物功能和通路富集;分子对接验证二陈汤中主要活性成分与靶点蛋白的结合能力。结果筛选得到二陈汤有效成分142种,有效成分靶点229个,与肺癌共同靶点227个。生物功能涉及外来生物刺激、对脂多糖的反应及细胞对化学应激的反应等。通路富集分析主要涉及晚期糖基化终末产物-受体信号通路、脂质和动脉粥样硬化、人巨细胞病毒感染通路、化学致癌-受体激活、白介素-17信号通路等。分子对接显示核心靶点可与药物有效成分稳定对接。结论二陈汤可能通过槲皮素、松柏苷、柚皮素等多种活性成分,多靶点、多通路发挥其抗肺癌作用。

关键词： Tenapanor   ESRD   高磷血症   NHE3抑制剂   药理作用   临床评价  

摘要： Tenapanor是一种新型降磷药物,主要作用于钠/氢交换蛋白3(NHE3)起抑制作用,此外还可以通过下调磷酸钠盐协同转运蛋白(NAPI)的表达,从而降低肠道对磷的吸收。Tenapanor主要用于治疗终末期肾脏病-血液透析(ESRDHD)患者高磷血症。腹泻为本品最常见的不良反应。本文通过对Tenapanor进行文献检索,就其药理作用、药动学特性、临床评价、安全性、药物相互作用和用法用量进行综述。

关键词： 网络药理学   肝岩舒方   原发性肝癌   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学探讨肝岩舒方治疗原发性肝癌的活性成分、作用靶点、信号通路等,并验证肝岩舒方对肝癌细胞增殖、侵袭及迁移的影响。方法通过3种数据库获得肝癌疾病靶点,以及肝岩舒方10味中药的活性成分,筛选出各中药有效化合物所对应的药物靶点,分析获得药物成分-疾病共同靶点,绘制蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,构建肝岩舒方中药-化合物成分网络图、药物活性成分-作用靶点网络并进行拓扑分析,获得核心靶点。基因本体(Gene Ontology,GO)分析对靶点基因的序列信息进行功能分类分析,京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析靶点相关代谢通路。通过体外实验,制备对照组、肝岩舒方组、芪灵蟾组、索拉非尼组、肝岩舒方和索拉非尼联合治疗组的SD大鼠含药血清,CCK-8检测细胞活性,细胞划痕检测细胞迁移水平,Transwell检测各组细胞转移水平,蛋白免疫印迹法(Western Blot,WB)检测各组基质金属蛋白酶2(matrix metalloproteinase 2,MMP-2)蛋白表达水平。结果从肝岩舒方中筛选出167个化合物,与肝癌共有靶点93项,核心靶点10项;在此基础上构建了肝岩舒方的成分-靶点、成分-肝癌疾病靶点及相关信号通路的共同表达网络,同时筛选出与肝岩舒方关键成分相关的主要信号通路,发现肝岩舒方可能通过叉头框转录因子O(forkhead transcription factor O,FOXO)信号通路、AGE-RAGE信号通路等对肝癌起治疗作用。CCK-8实验中,给药48小时后肝岩舒方能使肝癌细胞HepG2的增殖受到抑制,而后选取20%浓度处理细胞。划痕试验结果显示:与对照组相比,肝岩舒方组HepG2细胞在48 h时迁移水平显著降低(P<0.05)。Transwell实验显示:与对照组相比,肝岩舒方和西药联合治疗组的细胞转移水平降低(P<0.05);与肝岩舒方组及西药组相比,肝岩舒方和西药联合治疗组的细胞转移水平显著降低(P<0.001)。WB检测细胞中MMP-2的表达显示:与单一药物治疗相比,肝岩舒方和西药联合治疗下MMP-2表达下调。结论从多角度探索了肝岩舒方治疗原发性肝癌的作用机制,揭示了肝岩舒方的药理作用,为其后续的实验研究及临床疗效指标的筛选提供了方向。

关键词： 酸枣仁   UPLC-Q-Exactive-Focus-MS/MS   成分分析   网络药理学   阿尔茨海默病   拟雌内酯   山柰酚   乌药碱   酸李碱  

摘要： 目的通过超高效液相色谱-静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q-Exactive-Focus-MS/MS)分析酸枣仁中的化学成分,依据解析的化学成分及中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、本草组鉴数据库(HERB)获取的酸枣仁主要成分结合网络药理学和分子对接技术初步预测其抗阿尔茨海默病(AD)的药效物质基础,筛选出潜在功效成分,预测作用机制。方法采用UPLC-Q-Exactive Focus-MS/MS对酸枣仁进行化学成分分析,分别在正、负离子模式下扫描,结合对照品、文献中的碎片离子信息、保留时间进行匹配,确认化学成分。利用TCMSP、HERB数据库获取酸枣仁的主要成分及其对应作用靶点信息;通过Gene Cards、OMIM数据库获得AD相关疾病靶点;将酸枣仁主要成分对应靶点与AD靶点取交集,借助String 11.5平台和Cytoscape 3.7.2软件绘制交集基因蛋白质相互作用(PPI)网络;利用DAVID 6.8对核心靶点进行基因本体(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过微生信云平台对富集结果可视化;借助Auto Dock Tools软件对核心成分及关键靶点基因进行分子对接。结果酸枣仁定性分析中共鉴定出40个化合物,主要包括3个有机酸类、28个黄酮类、8个生物碱类、1个皂苷类;筛选出发挥改善AD作用的核心成分5个,包括拟雌内酯、油酸、山柰酚、乌药碱、酸李碱;酸枣仁改善AD的核心靶点有JUN、AKT1、STAT3、MAPK14、ESR1、IL16等;KEGG通路分析共得到157条通路,其中PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路排名靠前;GO富集分析得到生物过程(BP)条目336个、细胞组分(CC)条目45个、分子功能(MF)42个。分子对接结果显示,酸枣仁的4个核心成分与关键靶点间存在分子结合位点且结合能较强,均小于-20.93 kJ·mol^(-1)。结论通过UPLC-Q-Exactive-Focus-MS/MS解析的化学成分结合网络药理学、分子对接预测了酸枣仁是通过多成分、多靶点、多途径来发挥抗AD作用的。

关键词： 铁死亡   肝硬化   网络药理学   数据挖掘   用药规律  

摘要： 目的:运用网络药理学和数据挖掘技术,探索中药调控铁死亡干预肝硬化的用药规律,为肝硬化铁死亡的相关研究提供参考。方法:利用GeneCards、GeneCLiP3和FerrDb数据库获取铁死亡的强相关靶点,通过GeneCards和DisGeNET数据库获取肝硬化疾病靶点,两者映射得到肝硬化铁死亡的相关靶点;对潜在靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,选取Degree值≥2倍中位数的靶点(潜在靶点)通过中药系统药理学数据库与分析平台获取相关化合物和中药,利用R语言对潜在靶点进行相关机制分析;利用Cytoscape 3.7.2软件构建潜在靶点PPI网络图、靶点-化合物网络图、靶点-化合物-中药网络图;利用分子对接验证靶点与化合物以及中药核心成分的结合活性;借助中医传承辅助平台分析候选中药的性味归经及功效。结果:共得到肝硬化铁死亡相关靶点225个,Degree值≥36的肝硬化铁死亡的潜在靶点有47个,筛选得到146个化合物和284味中药,靶点与化合物及中药的核心成分结合较稳定,候选中药以寒性、苦味、入肝经、清热类、补虚类及活血化瘀类为主。结论:本研究从肝硬化和铁死亡的靶点出发,挖掘调控铁死亡干预肝硬化的中药及用药规律,也探讨了肝硬化铁死亡的相关作用机制,可为肝硬化铁死亡的相关研究提供参考。

关键词： 淫羊藿素   淫羊藿   抗肿瘤   免疫调节   细胞凋亡  

摘要： 淫羊藿素(icaritin)是中国传统中草药淫羊藿(Epimedium)的单体有效成分,具有免疫调节、心血管保护、骨保护、抗氧化等广泛的药理学活性,同时,淫羊藿素通过阻滞细胞周期、促进凋亡、抑制转移、免疫调节等多种途径对不同肿瘤均有抑制作用。综述有关淫羊藿素的化学成分及国内外在抗肿瘤和非抗肿瘤药理作用的最新研究进展,为淫羊藿素进一步开发和临床精准应用提供理论依据。