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关键词： 西红花   帕金森病   网络药理学   分子对接   神经炎症   作用机制  

摘要： [目的]基于网络药理学和分子对接,探究中药西红花(Saffron)对帕金森病(Parkinson’s disease,PD)的治疗作用及分子机制。[方法]通过中药系统药理学数据库和文献调研,确定纳入分析的西红花药效成分;借助化合物靶点数据库和疾病靶点数据库,分别预测西红花成分对应的靶点和PD靶点;使用R程序和引用相关R包,对化合物-疾病的交集靶点进行富集分析;构建蛋白互作网络,分析节点相关拓扑参数;模拟分子对接过程,验证代表性化合物和关键靶点的结合特性。通过实验初步评估西红花酸对关键靶点作用的药效学性质。[结果]西红花具有成药潜力的8种成分对应279个靶点,PD对应的疾病靶点有2 183个,获得化合物和疾病的交集靶点共98个。富集分析提示化合物-疾病交集靶点参与活性氧自由基的合成与代谢、神经炎症等生物过程和涉及丝裂原活化蛋白激酶信号通路等。蛋白互作网络分析确认的关键靶点为肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)和信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)。分子对接显示,西红花苷类和西红花酸类成分与TNF具有更强的结合活性。实验表明,西红花酸能降低脂多糖诱导的细胞炎性因子TNF、白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)以及诱导型一氧化氮合酶(inducible nitric oxide synthase,iNOS)的转录水平。[结论]西红花可作为PD治疗的候选中药,其神经保护作用可能涉及众多靶点和信号通路的交互协同,西红花酸抗中枢神经炎症的活性特别值得关注。

关键词： 程氏萆薢分清饮   网络药理学   动脉粥样硬化   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:利用网络药理学和分子对接技术,研究程氏萆薢分清饮预防和治疗动脉粥样硬化(Atherosclerosis,AS)疾病的潜在作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对该制剂的成分进行筛选,包括川萆薢、石菖蒲、车前子、黄柏、白术、茯苓、丹参和莲子心的有效成分和基因靶点,利用Cytoscape 3.9.1构建药物-成分-靶点网络图。利用GeneCards数据库进行目标筛选,并将其与局部目标进行交叉,将常用的基因目标引入STRING中,构建蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein Interaction,PPI)网络,最终利用Cytoscape 3.9.1进行可视化,以筛选出核心基因靶点。在David平台上,进行了基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并利用Cytoscape 3.9.1构建了成分-目标-路径网络图,最终通过Autodock软件进行了分子对接验证。结果:程氏萆薢分清饮中的有效成分可能为beta-谷甾醇、槲皮素、丹参酮IIA以及木犀草素等,这些成分可能对AS产生显著的影响。其潜在基因靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、Jun原癌基因(Jun Proto-Oncogee,JUN)、信号转导因子和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、一氧化氮合酶2(Nitric Oxide Synthase 2,NOS2)等。流体剪切应力与AS通路、晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Advanced Glycation End Product Receptor,RAGE)通路及白细胞介素(Interleukin,IL)-17通路等,为其影响AS的重要通路。分子对接显示薯蓣皂苷元和丹参酮IIA与β2肾上腺素受体(Adrenoceptor Beta 2,ADRB2)和前列腺素氧化环化酶2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)等关键靶点之间存在氢键相互作用且结合构象较好,约89%低于–7.5 kcal/mol,且多数对接优于阿托伐他汀。结论:本项研究初步探讨程氏萆薢分清饮多靶点、多途径防治AS的潜在作用机制,为其临床与药理的研究提供了一定的方向。

关键词： 白花蛇舌草   膀胱肿瘤   网络药理学   分子机制   信号通路  

摘要： 应用网络药理学技术探讨白花蛇舌草治疗膀胱肿瘤的作用机制;方法 通过TCMSP、PubChem、SwissTargetPrediction网站检索、比较、筛选出白花蛇舌草的作用靶点;利用DisGENT、Genecards和TTD数据库预测和筛选膀胱肿瘤的作用靶点,两者取交集在Venny 2.1.0中得到白花蛇舌草治疗膀胱肿瘤的靶点交集图;将 Venny 2.1.0 中得到的“药物-疾病”交集靶点导入 STRING 12.0 网站和 Cy-toscape 3.9.1软件中构建蛋白互作网络(protein-protein interaction network,PPI)分析其网络拓扑结构;通过DIVAD数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclo- pedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,预测其作用机制;结果 白花蛇舌草的活性成分中有3个成分可被肠道有效吸收,涉及299个靶点,分列去除重复最后保留247个靶点。膀胱肿瘤涉及1455个基因,分列去除重复最后保留1212个靶点,药物与疾病得交集基因有94个。关键靶点涉及STAT3、AKT1、PIK3CA、CCND1 等;潜在靶点多富集在PI3K-AKT 信号通路、FoxO信号通路、Thyroid hormone信号通路和Estrogen Prolactin信号通路;结论 白花蛇舌草作用于膀胱肿瘤时可能通过调节GAPDH 、AKT1、EGFR及STAT3等关键蛋白,干预PI3K-Akt信号通路、FoxO信号通路、雌激素信号通路参与细胞增殖、凋亡与自噬,抑制病毒复制、膀胱肿瘤细胞增殖从而治疗膀胱肿瘤,提示了治疗膀胱肿瘤的关键机制和途径。

关键词： 胆管癌   中医证候   疏肝健脾   清热祛湿   肝郁脾虚证   肝胆湿热证   湿热蕴蒸证   热毒炽盛证   脾阳虚衰证  

摘要： 胆管癌是由胆汁淤积、胆管结石、肝硬化、自身免疫性肝病、肝炎等前置病变恶化发展而来的重大疾病。通过对临床诊疗中常见的5种胆管癌中医证型进行总结,分析各证型胆管癌的临床常用方药。通过频次与用药规律分析,筛选出关键中药,并根据其功效归纳为疏肝健脾、清热祛湿与其他功效中药,并从现代药理学角度总结了相关研究进展。通过系统梳理胆管癌辨证论治的用药规律,为胆管癌临床诊疗和抗胆管癌中药创新药物研发提供参考。

关键词： 板蓝根   新型冠状病毒肺炎(COVID-19)   作用机制   网络药理学  

摘要： 通过网络药理学技术探索板蓝根(Isatis tinctoria Linnaeus)预防新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制,提供潜在的药物靶点.利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和7个疾病-基因数据库建立板蓝根靶点和COVID-19相关基因集.通过基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络阐述板蓝根预防COVID-19的潜在机制.获得53个板蓝根预防COVID-19的靶基因,然后构建包含90个活性化合物节点和275条化合物-靶点连线的相关化合物-靶点网络.GO和KEGG表明,板蓝根可通过调节免疫应答、细胞凋亡和病毒感染发挥抗COVID-19的作用.PPI网络和子网络分析识别出10个关键靶基因,其中MAPK1是最显著的靶基因,它参与肺损伤、肺纤维生成和病毒感染,因此对COVID-19发挥潜在的预防作用.网络药理学策略揭示板蓝根预防COVID-19的分子机制,MAPK1是一个潜在的作用靶点,可以减少肺组织损伤,消除病毒感染.

关键词： 刺五加   提取物   化学成分   药理作用  

摘要： 刺五加[Acanthopanax senticosus(*** Maxim.)Harms],是五加科(Araliaceae)五加属(Acanthopanax)小型多年生耐寒灌木,其广泛分布于中国、朝鲜、日本和俄罗斯。中药刺五加,为植物刺五加的干燥根和根茎/茎,被广泛认定为具有益气、健脾、补肾、安神的功效。刺五加整株植物都具有药用价值,包括根、茎、树皮、叶和果实。在过去的几十年,全世界范围内的研究人员对该植物进行了系统的研究,发现其蕴含着丰富的药用价值。本文总结了近几年刺五加在保护肝脏、保护心脏、保护中枢神经系统、免疫调节、抗肿瘤、抗氧化、抗糖尿病等方面的药理作用研究进展,以期为研究人员深入研究刺五加药用价值及其在临床上用于疾病的预防和治疗提供一定的参考。

关键词： 灵芝孢子粉   灵芝   质量标志物   质量标准   三萜类   多糖类  

摘要： 灵芝孢子粉是灵芝的生殖细胞,包含灵芝所有的化学成分,主要含有灵芝三萜类、多糖类、甾体类、脂肪酸类和蛋白质类等多种化合物。灵芝孢子粉具有抗肿瘤、免疫调节、抗氧化、保护心血管、保肝护肝等药理作用。《中国药典》2020年版对灵芝孢子粉的质量控制标准尚未明确规定,就灵芝孢子粉化学成分和药理作用研究进展进行综述,并基于质量标志物(quality marker,Q-Marker)理论,从植物亲缘性与特有性、有效性、可测性、临床应用、可入血成分等方面进行Q-Marker预测分析,初步推测多糖类、灵芝酸、甾醇类(麦角甾醇)、不饱和脂肪酸(油酸)等成分为其Q-Marker,为规范灵芝孢子粉质量研究和建立、完善灵芝孢子粉质量标准提供参考。

关键词： 网络药理学   分子对接   酒精性肝病   饮久舒  

摘要： 目的初步探讨饮久舒解酒护肝的作用机制。方法通过中药系统数据库(BATMAN-TCM)获得饮久舒12味中药的活性成分及作用靶点,使用Cytoscape_v3.7.2构建中药-活性成分-靶点网络,通过GEO数据库获得酒精性肝病(ALD)的疾病靶点;联合使用STRING数据库和Cytoscape_v3.7.2绘制蛋白质互作网络;通过DAVID数据库进行基因功能分析和KEGG通路富集分析,预测饮久舒发挥解酒护肝的潜在作用机制;利用Pymol和AutoDock Vina软件对关键活性成分与ALD的关键靶点进行分子对接验证。结果饮久舒共有168种活性成分及对应的作用靶点1428个。ALD中的差异基因共2314个,其中上调基因1147个,下调基因1167个。KEGG通路富集分析中发现共同作用靶点主要通过参与FoxO信号通路、胆汁分泌、氨基酸代谢等发挥作用。分子对接发现黄夹次甙丙和肉豆蔻醚等关键活性成分与ALD关键靶点有较强的亲和力。结论饮久舒具有多成分-多靶点-多通路的作用特点,该研究为进一步探索饮久舒解酒护肝的作用机制提供了研究基础。

关键词： 小儿柴桂退热口服液   冠状病毒感染   网络药理学  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接的方法探究小儿柴桂退热口服液(Xiaoer Chaigui Tuire Oral Liquid,XCTOL)治疗冠状病毒感染(Coronavirus Infection,CI)的潜在分子机制。方法通过TCMSP数据库检索XCTOL中含有的活性成分,利用Pubchem联合SwissTarget Prediction平台检索XCTOL活性成分的作用靶点;Genecard数据库检索冠状病毒相关疾病靶点;Cytoscape3.7.2软件和STRING数据库进行“中药-成分-靶点”网络和PPI网络的构建与拓扑分析,寻找关键成分和靶点;DAVID数据库对XCTOL与冠状病毒交集靶点进行GO和KEGG富集分析;Autodock1.5.6软件对活性成分和靶点蛋白进行分子对接验证。结果共筛选获得XCTOL活性成分74个和潜在作用靶点169个;富集GO生物过程20个和20条KEGG通路,包括HIF1信号通路、PI3K-Akt信号通路、VEGF信号通路、TNF信号通路、流感和肝炎病毒等信号通路;分子对接验证XCTOL中多种成分作用与相关蛋白的对接活性,其中豆甾醇和芍药苷的对接活性最强。结论XCTOL可能通过调控炎症反应和细胞间信号转导等过程来控制CI的进一步发展,具有多成分、多靶点、多通路的特点,本研究为系统阐明XCTOL主要成分治疗CI的分子机制提供了参考。