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关键词： 辛夷   网络药理学   变应性鼻炎   肥大细胞   作用机制  

摘要： 目的:探讨辛夷通过抑制肥大细胞脱颗粒治疗变应性鼻炎(AR)的作用机制。方法:将P815细胞分为对照组(nc)、模型组(mc)、阳性药组(pc)及辛夷水提物低(0.01 mg/ml)、中(0.1 mg/ml)、高(1 mg/ml)剂量组,检测其对P815肥大细胞脱颗粒的抑制作用。利用TCMSP、UniProt、SwissTargetPrediction数据库及文献查阅等检索辛夷的活性成分和相关靶点;利用GeneCards、OMIM、MelaCards、TTD数据库获取AR的疾病靶点。构建共同靶点蛋白相互作用网络(PPI),对关键作用靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:辛夷对P815细胞脱颗粒具有明显的抑制作用(P<0.05)。成分靶点370个,肥大细胞脱颗粒靶点1940个,AR靶点2740个,共同靶点90个,其中TNF、SRC、AKT、STAT3、EGFR为关键靶基因。GO富集分析发现炎症应答、磷酸化、蛋白质磷酸化、质膜等参与AR的发生与治疗。KEGG通路富集分析显示,与EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、胰腺癌、非小细胞肺癌、fcεRI信号通路密切相关。结论:辛夷能抑制肥大细胞脱颗粒发并通过多靶点途径发挥治疗AR的作用。

关键词： 网络药理学   分子对接   扶脾柔肝颗粒   肝纤维化   血管新生  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接探讨扶脾柔肝颗粒(FRG)抗肝纤维化血管新生的物质基础及其分子机制。方法:从TCMSP、GeneCards和OMIM数据库中筛选FRG和肝纤维化血管新生的靶点,并运用Draw Venn Diagram数据库获得FRG与肝纤维化血管新生的共同靶点。使用Cytoscape软件构建“中药-成分-共同靶点”网络及PPI网络,并筛选出其关键成分和核心靶点。使用Metascape数据库对共同靶点进行GO和KEGG富集分析。通过AutoDock Vina软件对关键成分与核心靶点进行分子对接验证。结果:筛选得到105个FRG活性成分和285个靶点,FRG与肝纤维化血管新生有116个共同靶点。“中药-成分-共同靶点”网络分析得出关键成分为槲皮素、木犀草素、山奈酚等;PPI网络分析得出核心靶点为STAT3、IL-6、TNF、VEGFA、IL1B。GO富集分析主要涉及缺氧反应、炎症反应及类固醇代谢等生物过程;KEGG富集分析主要涉及PI3K/Akt信号通路、HIF-1信号通路、IL-17信号通路等。分子对接结果表明,关键成分和核心靶蛋白之间具有良好的结合能力。结论:FRG可能通过作用于STAT3、VEGFA、TNF等蛋白来干预肝纤维化血管新生,其机制可能与其抑制P13K/Akt/HIF-1α信号通路有关。

关键词： 网络药理学   三黄泻心汤   大黄   黄芩   黄连  

摘要： 探讨中药复方“三黄泻心汤”对高脂血症和动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的治疗机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)平台筛选收集三黄泻心汤中各药主要活性成分,通过数据库Gene Cards筛出疾病靶点,用Cytoscape 3.6.1构建化合物的成分-靶点网络,分析其度(degree)值。通过Cytoscape 3.8.2软件和String数据库做蛋白相互作用网络图,然后通过数据库Web Gestal对基因靶点做GO富集及KEGG富集分析。结果显示,三黄泻心汤的抗AS和高脂血症的成分-靶点-信号通路网络中有成分283种,靶点36个、信号通路168条。度值较高的候选化合物分子如芦荟大黄素(Rhein)等,主要靶点主要有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)等,涉及信号通路主要包括IL-17信号通路、PI3K-Akt信号通路等。研究发现,三黄泻心汤通过调节IL-17、PI3K-Akt等信号通路,参与高脂血症和AS的发生发展。

关键词： 中药化学成分   茅莓根   UPLC-MS/MS   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的基于超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)技术分析茅莓根成分,并结合网络药理学方法探讨其治疗感冒高热、咽喉肿痛、炎症相关疾病的作用机制。方法根据质谱信息结合对照品、文献和数据库对茅莓根化学成分进行指认。采用网络药理学法分析其化学成分对应靶点及相关通路,绘制“活性成分-靶点-通路”网络。通过PyMOL 2.5.7软件对活性成分与核心靶点进行分子对接。结果经UPLC-MS/MS鉴定出20个化学成分,通过网络药理学获得茅莓根治疗感冒高热、咽喉肿痛、炎症的23个核心靶点,15个潜在活性成分,分别为己内酰胺、(E)-3-吲哚丙烯酸、隐绿原酸、原花青素C2、原花青素B3、表儿茶素、3-O-阿魏酰奎宁酸、辛二酸、鞣花酸、壬二酸、2α,3β,19α,23-四羟基乌苏-12-烯-28-羧酸、己二酸二(2-乙基己)酯、金色酰胺醇酯、邻苯二甲酸二异壬酯、野鸦椿酸。分子对接结果显示,5个经对照品比对的成分均能较好地与疾病靶点结合。结论茅莓根中的己内酰胺、(E)-3-吲哚丙烯酸等15个活性成分可能通过作用于AKT1、TNF等靶点,发挥对感冒高热、咽喉肿痛、炎症的治疗作用,为后续茅莓根的临床应用提供了一定参考。

关键词： 柏苓化浊丸   慢性前列腺炎   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接探讨柏苓化浊丸改善慢性前列腺炎(CP)的作用机制。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选柏苓化浊丸的有效成分和作用靶点,从GeneCard数据库和比较毒理基因组学数据库获取疾病靶点,与作用靶点取交集,将交集基因上传至检索基因/蛋白相互作用(STRING)数据库进行蛋白相互作用分析,采用Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络和活性成分-交集基因网络。采用R软件进行基因本体(GO)生物学功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析预测柏苓化浊丸的作用机制。采用PyMOL、AutoDockTools和Vina软件进行分子对接验证。结果柏苓化浊丸共获得交集靶点103个,药物活性成分98个。关键活性成分为槲皮素、汉黄芩素、木犀草素等,核心靶点为V-JUN肉瘤病毒癌基因同源物(JUN)、雌激素受体1(ESR1)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、胱天蛋白酶3(CASP3)、细胞周期素D1(CCND1)等。柏苓化浊丸可通过调控磷脂酰肌醇3-激酶-丝苏氨酸蛋白激酶(PI3K-Akt)、白介素(IL)-17、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、Janus激酶信号转导与转录激活因子(JAK-STAT)等多条信号通路改善CP。分子对接结果显示,关键活性成分与核心靶点结合力较好。结论柏苓化浊丸可通过多靶点、多信号通路抑制炎性因子的产生,调控细胞凋亡、免疫反应和氧化应激,从而改善CP。

关键词： 网络药理学   分子对接   银杏叶   冠状动脉粥样硬化性心脏病   生物信息学  

摘要： 目的:结合网络药理学、分子对接和基因表达综合数据库(GEO)临床队列验证的方法研究银杏叶治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的分子机制。方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),获取银杏叶活性成分及靶点。通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取冠心病靶点,采用Cytoscape构建银杏叶治疗冠心病活性成分–靶点网络图。将靶点蛋白导入STRING数据库,构建蛋白质–蛋白质相互作用网络,并进行拓扑分析,筛选出银杏叶治疗冠心病的核心靶点。通过AutoDock Tools和Vina软件对关键活性成分和关键靶点进行分子对接。最后通过GEO的GSE20681数据集进行临床队列分析,获得冠心病患者与对照组患者在核心靶点mRNA表达方面的差异。结果:获得银杏叶治疗冠心病的活性成分14个、作用靶点42个。通过网络拓扑分析筛选到13个核心靶点。银杏叶治疗冠心病的关键活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、异鼠李素、豆甾醇,度值居前5位的关键靶点为白细胞介素(Interleukin,IL)–6、IL–10、基质金属蛋白酶(Matrix Metalloproteinase,MMP)9、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(Peroxisome Proliferator Activated Receptor Gamma,PPARG)和C–C基序趋化因子配体2(Chemokine C–C Motif Ligand 2,CCL–2),分子对接证明关键活性成分与关键靶点结合活性良好。通过GEO GSE20681数据集验证MMP9在冠心病患者中的表达显著高于对照组患者(P=0.002)。结论:研究揭示了银杏叶的多个活性成分通过MMP9介导的多个通路发挥抗冠心病效应,为进一步探索银杏叶治疗冠心病的分子机制及临床合理使用银杏叶提取物提供理论基础。

关键词： 广藿香油   指纹图谱   网络药理学   抗菌  

摘要： 目的:建立广藿香油的气相色谱法(GC)指纹图谱,结合体外抗菌实验和网络药理学探讨广藿香油抗菌作用机制。方法:采用GC构建18批广藿香油的指纹图谱并标定共有峰;通过相似度评价和聚类分析对广藿香油进行分类,并开展体外抗菌实验,利用正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)筛选共有峰组间主要差异成分;运用网络药理学方法构建成分-靶点-疾病-通路网络,分析广藿香油抗菌的靶点和对应通路。结果:GC指纹图谱研究结合相似度评价和聚类分析结果显示,18批广藿香油分为2类,即市售广藿香油和自提广藿香油,两者之间有一定的差异;体外抗菌实验结果表明,自提广藿香油对6种致病菌有抑制作用,而市售广藿香油抑菌活性低;OPLSDA显示,广藿香油抑菌效果组间主要差异成分有2个,即百秋李醇和广藿香酮;网络药理学分析表明,2个成分主要通过作用于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B1(Akt1)、磷酸肌醇3-激酶催化亚基β肽(PIK3CB)、表皮生长因子受体(EGFR)和络氨酸激酶受体2(ERBB2),调控缺氧诱导因子-1(HIF-1)、表皮生长因子受体(ErbB)、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt等信号通路,进而发挥抗菌作用。结论:建立的广藿香油GC指纹图谱方法简便,筛选的2个活性成分百秋李醇和广藿香酮可作为广藿香油抗菌的质量标志物,为广藿香油的质量控制和抗菌作用机制研究提供参考。

关键词： 咳嗽变异性哮喘   网络药理学   作用机制   研究进展  

摘要： 咳嗽变异性哮喘(CVA)是一种以慢性咳嗽为主要症状的特殊类型哮喘。中药治疗CVA有丰富的临床经验和确切疗效。随着多组学技术的兴起,基于网络药理学探讨中药治疗CVA的潜在机制已成为研究焦点。文章通过对相关文献进行总结分析,从单味中药、中药药对、中药复方及中成药等角度对治疗CVA的作用机制进行分类阐述,旨在为今后中医药治疗CVA的临床应用研究及相关机制研究提供更多的依据与参考。

关键词： 药理学   课程思政   案例教学   教学方法   教育  

摘要： 思想政治教育是关系高校人才培养质量的根本问题。如何将思想政治教育潜移默化地融入专业教育,是当前高校教育改革的目标和挑战。“药理学”是连接医学和药学的桥梁,是医药专业学生必修的专业基础课程。从“药理学”课程中挖掘思政元素,有利于将思政教育贯穿到大学专业教育的全过程。结合“药理学”课程特点,从不同章节结合专业知识点深入挖掘思政元素,引导学生树立正确的世界观、人生观和价值观,为高校“药理学”课程思政教学提供材料与建议。

关键词： 冠心病   生脉陷胸汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的本研究项目计划采用网络药理学和分子对接模拟作为主要的研究手段,深入探索生脉陷胸汤在治疗冠状动脉心脏病(coronary heart disease,CHD)中的作用机制和潜在疗效。方法通过使用TCMSP数据库检索“丹参”、“人参”、“瓜蒌皮”、“法半夏”、“炙甘草”、“黄连”、“五味子”、“砂仁”,以及文献收集“麦冬”中的有效成分及对应的靶蛋白的筛选;使用GeneCard、OMIM、DisGeNET数据库选出与CHD发生发展密切相关的作用靶点。运用STRING数据库以及Cytoscape软件构建PPI网络图,并运用Cytoscape软件构建“中药—组分—靶点”网络图。利用R软件对中药—疾病交集靶点进行KEGG和GO富集分析。使用AutoDockTools-1.5.6进行分子模拟对接。结果在治疗冠心病(CHD)方面,生脉陷胸汤的核心成分主要包括槲皮素(quercetin)、木犀草素(luteolin)、异鼠李素(isorhamnetin)、山柰酚(kaempferol)、丹参酮IIa(tanshinone IIa)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、柚皮素(naringenin)、刺芒柄花素(formononetin)、二氢丹参内酯(dihydrotanshinlactone)、以及7-甲氧基-2-甲基异黄酮(7-Methoxy-2-methyl isoflavone)等;核心靶点有肿瘤蛋白P53(TP53)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、信号传导转录激活因子3(STAT3)、JUN转录因子(JUN)、环状素受体1(ESR1)、热休克蛋白90(HSP90AA1)、白细胞介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、人表皮生长因子受体(EGFR)、MYC原癌基因(MYC)等;在治疗冠心病(CHD)方面,生脉陷胸汤作用于多个关键生物通路,这些内容包括动脉粥样硬化中的脂质代谢(Lipid and atherosclerosis)、乙型肝炎病毒感染(Hepatitis B)、前列腺癌的病理机制(Prostate cancer)、TNF信号通路的调节作用(TNF signaling pathway)、胰腺癌的发展机制(Pancreatic cancer)以及IL-17信号通路的作用(IL-17 signaling pathway)等;分子模拟对接结果显示,生脉陷胸汤中槲皮素与TP53和AKT1均能实现较好的结合。结论生脉陷胸汤可通过槲皮素、木犀草素、山柰酚等活性成分作用于多种信号通路及多个基因靶点治疗CHD。本研究对生脉陷胸汤的临床运用提供理论依据。