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关键词： 四君子汤   失笑散   胃癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学方法探讨四君子汤联合失笑散治疗胃癌的作用机制,并进行分子对接验证。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药分子机理的生物信息学分析工具(BATMAN–TCM)检索四君子汤和失笑散的活性成分及其靶点;通过OMIM、GeneCards、DrugBank、TTD数据库检索胃癌相关基因;应用韦恩在线绘制平台获取疾病和中药相互作用交集靶点。应用CytoScape 3.7.1软件构建“中药–成分–交集靶点”网络图。将疾病和中药相互作用交集靶点通过STRING 12.0数据库进行相互作用分析,构建蛋白质–蛋白质相互作用网络图,获取核心靶点。通过微生信在线平台进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过分子对接验证核心成分与靶点的结合可能性。结果:筛选得到四君子汤联合失笑散有效成分126个,与胃癌对应作用靶点161个。获得GO富集分析条目892个(P<0.05),其中生物过程条目698个,分子功能条目126个,细胞组分条目68个。KEGG通路富集筛选得到156条信号通路(P<0.05),主要涉及磷脂酰肌醇3激酶–蛋白激酶B(Phosphoinositide 3–Kinase–Akt,PI3K–Akt)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen–Activated Protein Kinase,MAPK)信号通路、癌症通路等。分子对接验证结合性好。结论:四君子汤联合失笑散治疗胃癌具有“多成分–多靶点–多途径”的特点与优势,可为四君子汤联合失笑散治疗胃癌的物质基础与分子机制提供理论依据。

关键词： 健脾祛湿方   网络药理学   异病同治   慢性腹泻   慢性疲劳综合征   作用机制   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨健脾祛湿方“异病同治”慢性腹泻和慢性疲劳综合征的作用机制。方法检索TCMSP数据库获取健脾祛湿方中中药活性成分,预测其作用靶点,利用UniProt数据库转换靶点基因信息;应用GeneCards和OMIM数据库筛选两种疾病相关疾病靶点;利用Venny 2.1.0绘制韦恩图,将获得的靶点蛋白与疾病靶点进行汇总取交集,获得三者共有靶点;导入String数据库构建核心靶点蛋白质相互作用图,通过Cytoscape3.7.0构建“单味中药-交集靶点-疾病”网络图;根据度值筛选健脾祛湿方治疗慢性腹泻和慢性疲劳综合征的关键靶点基因,应用David数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,微生信平台进行可视化处理;运用AutoDock Tools-1.5.7模拟活性成分与关键靶点分子对接,Pymol软件结果可视化。结果筛选后得到健脾祛湿方有效成分197个,作用靶点248个,与两种疾病三者交集靶点195个;“单味药-交集靶点-疾病”网络图获槲皮素、木犀草素、山柰酚、豆甾醇等5个主要活性成分;PPI网络图中核心靶点为细胞肿瘤抗原p53(TP53)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、白细胞介素6(IL6)等6个;GO功能富集分析涉及细胞组成(CC)106项,分子功能(MF)166项,生物过程(BP)829项;KEGG通路富集分析主要涉及TNF、脂质与动脉粥样硬化、人巨细胞病毒感染、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号、IL-17信号等通路;分子对接结果表明,各主要活性成分与靶点蛋白结合良好。结论健脾祛湿方通过多种药物成分,调节多条信号通路,关联多个关键靶点,从而发挥对慢性腹泻和慢性疲劳综合征的“异病同治”作用。

关键词： 广藿香油   提取方法   化学成分   药理作用   制剂开发   综述  

摘要： 广藿香为唇形科植物广藿香Pogostemon cablin(Blanco) Benth.的地上干燥部分,广藿香油为广藿香的主要活性物质。至今已从广藿香油中分离出近百种化合物,其中百秋李醇、广藿香酮及广藿香烯为主要活性成分。广藿香油具有解热、镇痛、抗炎、抗菌及抗肿瘤等多种药理作用。归纳10年来国内外有关广藿香油的研究进展,对不同产地和提取方法对广藿香油的化学成分进行比较,对其药理作用和开发现状进行梳理。

关键词： 草归除湿活血颗粒   高尿酸血症   制备工艺   UPLC-Q-TOF-MS   网络药理学  

摘要： 目的考察草归除湿活血颗粒剂的提取工艺,并探究其通过降尿酸治疗高尿酸症的机制。方法通过HPLC测定草归除湿活血颗粒水提液中各成分的含量,筛选最佳提取条件;利用UPLC-Q-TOF-MS分析其活性成分,再将得到的活性成分结合高尿酸血症的潜在靶点,进行PPI网络构建及GO、KEGG分析。结果最佳提取工艺为10倍水浸泡0.5 h,加热回流提取2次,每次1 h。UPLC-Q-TOF-MS得221个活性成分,网络药理学分析得到183个潜在交集靶点,富集分析得到PI3K-Akt信号通路、脂质和动脉粥样硬化、HIF-1等信号通路。结论草归除湿活血颗粒可能通过调节PI3K-Akt信号通路、脂质和动脉粥样硬化、HIF-1等信号通路来发挥降尿酸的作用。

关键词： 姜黄素   成骨分化   网络药理学   分子对接   Wnt/β-catenin信号通路  

摘要： 目的研究姜黄素对成骨分化过程的潜在调控机制。方法通过网络药理学方法获取姜黄素调控成骨分化的靶点基因,构建蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行GO、KEGG富集分析及分子对接处理。结果筛选出姜黄素调控成骨分化的靶点基因92个,主要涉及细胞凋亡,细胞凋亡负向调控及肌细胞增殖等生物过程;突触、膜筏及细胞连接等细胞成分;磷酸酶结合,蛋白激酶结合及酶结合等分子功能。靶点基因PRKACA、GSK3β、EP300在Wnt/β-catenin信号通路中处于重要位置,且均可以与姜黄素良好对接。结论姜黄素可以通过PRKACA、GSK3β、EP300调控Wnt/β-catenin信号通路来调控成骨分化过程。

关键词： 桂枝加厚朴杏子汤   慢性阻塞性肺疾病   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的通过网络药理学和分子对接技术探究桂枝加厚朴杏子汤治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的主要活性成分、关键靶点和作用机制。方法利用相关数据库分别获取药物活性成分及其靶点以及疾病靶点,取交集靶点后利用Cytoscape3.10.0制作“药物-活性成分-核心靶点”网络图,运用STRING平台获取交集靶点相互作用关系。通过Metascape数据库对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。选取主要活性成分与关键靶点由AutoDock Vina进行分子对接验证。结果共筛选得到122个药物活性成分,268个药物靶点,1595个疾病靶点,148个交集靶点。GO功能富集分析得到条目2233个(P<0.01),KEGG通路富集分析得到197条信号通路(P<0.01)。分子对接的结果显示主要活性成分和关键靶点有结合性良好。结论桂枝加厚朴杏子汤可通过多成分、多靶点、多通路协同作用治疗COPD,其主要作用机制可能与介导IL-17、PI3K/AKT、TNF等信号通路抑制炎症有关。

关键词： 中医药   脓毒症   数据挖掘   网络药理学   机制  

摘要： 目的基于数据挖掘及网络药理学探究中医药治疗脓毒症的用药规律及其作用机制。方法检索中国知网、维普及万方数据库自建库以来治疗脓毒症的处方,依据纳排标准筛选,采用中医传承计算平台V3.0、IBM SPSS Statistics 29软件分析处方的药物频次、四气五味、功效归经、药物组合规律、关联规则,归纳中药治疗脓毒症的用药规律及配伍规律;再通过TCMSP数据库获取核心药物活性成分及其相关靶点,GeneCards数据库获取脓毒症的潜在作用靶点,将脓毒症与核心药物的交集靶点导入String 11.5数据库与Cytoscape 3.9.1获取核心靶点,对二者的交集靶点进行GO及KEGG富集分析,取前20条通路,利用Cytoscape 3.9.1构建“核心药物-靶点-通路”网络。结果通过检索文献,依据纳排标准筛选,最终获得治疗脓毒症的处方78首,涉及中药132味,药物使用频次前8的依次为大黄、甘草、黄芪、生地黄、黄芩、枳实、当归、金银花;四气频次靠前的为寒、温、平;五味频次靠前的为苦、甘、辛;归经频次靠前的为脾、肺、胃;功效频次靠前的为清热类、补虚类、活血化瘀类;关联规则分析显示枳实、厚朴→大黄支持度与置信度最高,聚类分析将药物分为3类。对“当归-黄芪-大黄-枳实-厚朴-桃仁”进行网络药理学分析,获取脓毒症与核心药物交集靶点113个,核心靶点10个:AKT1、JUN、TNF、RELA等,涉及通路246条,主要包括癌症通路、NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路、TNF信号通路等。结论核心药物“当归-黄芪-大黄-枳实-厚朴-桃仁”的主要活性成分可能通过AKT1、IL-6、TNF等靶点,参与NF-κB信号通路、TNF信号通路、JAK-STAT信号通路等以抑制炎症因子的产生及细胞凋亡的发生,改善脓毒症患者症状,为中医药治疗脓毒症,延缓疾病发展提供数据支持及理论依据。

关键词： 宣肺振心方   网络药理学   分子对接   射血分数保留型   心力衰竭   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接探究宣肺振心方治疗射血分数保留型心力衰竭(HFpEF)的作用机制。方法:使用TCMSP数据库及已发表文献,检索宣肺振心方组成中药物黄芪、刺五加、红景天、丹参、川芎、防己、水红花子、延胡索的活性成分,利用SwissTargetPrediction平台进行有效成分靶点预测。通过GeneCards数据库及OMIM数据库检索HFpEF相关靶点,与中药有效成分相关靶点取交集,整合并运用Uniprot数据库进行基因校正。将交集靶点导入String中获取蛋白质互作网络PPI,并运用Cyoscape 3.7.0软件筛选核心靶点,构建“中药—成分—靶点”网络并进行拓扑分析。借助Metascape运用交集靶点进行基因本体GO功能富集分析及京都基因与基因组百科全书KEGG信号通路富集分析,筛选数据导入微生信网站进行可视化绘图。筛选核心靶点及对应活性成分进行分子对接处理。结果:通过TCMSP数据库及现有文献检索宣肺振心方组方中药活性成分,预测并去重后获得相关靶点390个。在GeneCards和OMIM数据库搜索HFpEF并去重后获得疾病靶点2053个,与中药活性成分靶点交集靶点167个。PPI网络分析并筛选出TNF、IL-6、IL-1β等7个核心靶点。“中药—成分—靶点”网络分析显示槲皮素、山柰酚、草质素、β-谷甾醇等为核心活性成分。GO功能富集分析显示主要与蛋白激酶活性、G蛋白偶联胺受体活性、氧化还原酶活性等功能相关。KEGG通路富集分析筛选得到199条信号通路。结论:宣肺振心方中的槲皮素、山柰酚、草质素、β-谷甾醇等有效成分可能通过作用于TNF、IL-6、IL-1β等核心靶点,干预cGMP-PKG、钙、脂质和动脉粥样硬化等信号通路,从而对射血分数保留型心力衰竭患者起到干预心肌重构及改善心血管疾病预后的作用。

关键词： 拳参   药理作用   化学成分   质量标志物  

摘要： 拳参是常用的中药材,具有广泛的药理活性。近年来,国内外学者对于拳参的研究逐渐深入。本文在对拳参化学成分及药理作用综述的同时进行了质量标志物预测分析,结果拳参主要含有挥发油、有机酸类、黄酮类、酚类、糖苷类、甾体皂苷、萜类化合物、苯丙素类、生物碱类以及其他类型的化合物,具有抗氧化、抗肿瘤、抗病原微生物、抗炎及保护心脑血管等作用。并从拳参特有化学成分、可测成分、传统药性药效、用药配伍、现代药理作用等方面对拳参质量标志物进行了预测分析,发现拳参潜在质量标志物有没食子酸、绿原酸、儿茶素、5-戊二烯-3-酮、无羁萜醇、鞣质等,其中没食子酸、绿原酸和儿茶素是拳参最关键的有效活性成分。

关键词： 补肾促卵方   卵巢颗粒细胞   自噬   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学与分子对接探究补肾促卵方调控卵巢颗粒细胞自噬的分子作用机制。方法采用网络药理学分析补肾促卵方抗卵巢颗粒细胞的主要活性成分与作用通路富集,并通过分子对接进行验证。结果TCMSP数据库中筛选到补肾促卵方有效活性成分靶点725个;GeneCards、CTD、DisGeNET数据库检索到卵巢颗粒细胞自噬疾病靶点551个;筛选两者共同基因靶点154个,GO、KEGG功能分析显示补肾促卵方调控卵巢颗粒细胞自噬的通路主要富集在PI3K-Akt信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、内分泌抵抗等;分子对接结果显示各基因靶点结合能低于-5.9 kcal/mol,提示补肾促卵方可有效调控卵巢颗粒细胞自噬。结论补肾促卵方或通过靶向PIK3R1、PIK3CA等基因,影响细胞信号传导和蛋白磷酸化来促进或抑制卵巢颗粒细胞自噬。