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关键词： 刺五加   肉苁蓉   帕金森病   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨刺五加-肉苁蓉治疗帕金森病的作用机制。方法:通过BATMAN-TCM数据库筛选刺五加-肉苁蓉的化学成分及其相关靶点,并从GeneCards、OMIM、TTD中搜集帕金森病的相关靶点,提炼出药物与疾病两者的交集靶点。运用Cytoscape 3.10.1软件和STRING绘制“药物-成分-靶点-疾病”可视化网络图,并筛选出核心成分和关键靶点。借助DAVID对靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,使用TCMSP、RCSB PDB、Autodock vina、PyMOL 2.1.0软件进行化合物与关键靶点分子配体与靶基因蛋白受体对接及可视化处理。结果:共筛选出33种药物有效活性成分,876个药物靶点,9377个疾病相关基因。获得药物、疾病交集基因598个,其中关键靶点为鸟嘌呤核苷酸结合蛋白α亚基基因(GNAS)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、原癌基因(JUN)、谷氨酸-草酰乙酸转氨酶2(GOT2)。GO功能富集分析共获得1723条条目,主要包括电压门控钠通道活性、突触后膜电位的调节等生物过程;KEGG通路主要涉及代谢通路、神经退行性变的途径-多种疾病等158条相关通路。分子对接结果表明,药物有效成分槲皮素与关键靶点GNAS有较强结合能力。结论:刺五加-肉苁蓉可多成分、多途径、多靶点治疗帕金森病,为进一步研究该药对治疗帕金森病的作用机制提供了参考。

关键词： 网络药理学   软坚清脉颗粒   动脉硬化闭塞症   ApoE^(-/-)小鼠   胆固醇代谢   脂质代谢   机制  

摘要： 目的:运用网络药理学探索软坚清脉颗粒(RJQM)治疗动脉硬化闭塞症(ASO)的潜在治疗靶点及机制,并利用载脂蛋白E基因缺陷(ApoE^(-/-))小鼠验证。方法:利用数据库分析RJQM作用于ASO的交集靶点,进行GO、KEGG信号通路分析。30只ApoE^(-/-)小鼠高脂饮食,随机分为模型组,RJQM低、中、高剂量组及阳性药组,每组6只。以同周龄C57BL/6J小鼠作为空白对照组。连续灌胃18周。测定血清中总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平,HE染色检测肝脏、主动脉弓形态学变化,油红O染色观察主动脉弓根部的病变程度,并结合qRT-PCR检测肝脏中ABCA1、ABCG5、ABCG8mRNA表达情况。结果:KEGG通路富集分析发现RJQM可能通过调节脂质代谢信号通路发挥治疗作用。与模型组比较,RJQM高剂量组TG水平显著降低(P<0.05);RJQM各剂量组肝脏细胞肿胀与脂肪空泡样得到改善,主动脉弓中粥样斑块面积显著减小(P<0.01),油红着色脂滴面积显著减小(P<0.05);RJQM高剂量组肝脏中ABCA1、ABCG5 mRNA表达显著上调(P<0.01);RJQM各剂量组ABCG8 mRNA表达显著下调(P<0.01)。结论:RJQM能够调控脂质和动脉硬化信号通路,通过影响脂质代谢途径发挥干预ASO的作用。

关键词： 痛风性肾病   铁死亡   四妙散   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接探讨四妙散调控铁死亡治疗痛风性肾病(Gouty Nephropathy,GN)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取四妙散活性成分并预测相关作用靶点,构建有效成分-靶点数据库。在人类基因数据库(GeneCards)和疾病基因数据库(DisGeNET)获取GN相关靶点。利用微生信网站获取四妙散和GN的交集靶点。利用Cytoscape 3.10.0软件绘制药物-成分-疾病-靶点网络图。通过STRING数据库分析蛋白质-蛋白质相互作用关系并绘制网络图。利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。在FerrDB数据库获取铁死亡相关靶点,综合分析四妙散、GN和铁死亡之间的关系,并将度值居前5位的活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果:共得到四妙散72种活性成分、对应靶点757个,GN靶点181个,铁死亡靶点511个,取三者的交集,共获得14个靶点。由蛋白质-蛋白质相互作用网络分析发现,丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)1、信号转导和转录激活因子(Signal Transducer and Activator of Transcription,STAT)3、V-rel网状内皮细胞病毒癌基因同源物A(Recombinant V-Rel Reticuloendotheliosis Viral Oncogene Homolog A,RELA)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(Peroxisome Proliferator Activated Receptor γ,PPARγ)、Toll样受体(Toll-like Receptor,TLR)4及非受体酪氨酸激酶(Non-Receptor Tyrosine Kinase,SRC)为调控铁死亡的核心靶点。KEGG富集分析显示,四妙散调控铁死亡治疗GN主要通过介导肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、核因子-κB(Nuclear Factor kappa B,NF-κB)及MAPK信号通路实现。分子对接结果表明,四妙散主要活性成分与核心靶点有较好的结合能力。结论:四妙散治疗GN主要通过多成分、多靶点、多通路,推测调控铁死亡通路可能为重要的作用机制。

关键词： 覆盆子   酒制   盐制   发酵   药理作用  

摘要： 覆盆子是典型药食两用中药,化学成分多样、营养丰富,具有显著地药理活性和极高的营养保健价值,拥有悠久的药用和食用历史。通过查阅古代和现代文献,对覆盆子历代加工与炮制方法进行总结、整理、分析,并对其现代炮制研究进行梳理。覆盆子炮制方法最初记载于《雷公炮炙论》中,以酒拌蒸一宿,然后逐渐衍生出酒洗、酒浸焙、酒浸炒、蜜制、盐制、发酵等一系列加工方式,但由于覆盆子相应的炮制工艺标准及质量标准建立不完善,其质量可能参差不齐,进而影响临床疗效。目前,2020版《中华人民共和国药典》对覆盆子的炮制方法未做记载。现代研究表明,随着炮制方法、炮制工艺的改变,覆盆子的化学成分、药理作用也随之受到影响。因此,从覆盆子炮制方法及炮制后对覆盆子质量影响的角度进行综述,以期为覆盆子的炮制发展、临床应用提供参考。

关键词： 藁本内酯   药理作用   运动系统疾病   药代动力学  

摘要： 藁本内酯是从伞形科植物当归、川芎中提取出来的一种苯酞类化合物,已被证实具有抗炎、抗肿瘤、抗动脉粥样硬化、抗缺血性脑卒中损伤、抗阿尔茨海默病等多种药理活性。近年来,其在治疗运动系统疾病方面显示出巨大潜力。研究显示藁本内酯对多种运动系统疾病,包括骨质疏松症、骨关节炎、股骨头坏死、骨肉瘤、肌肉衰老损伤等具有显著治疗作用。其作用机制包括增强造骨细胞(OBs)分化能力,抑制破骨细胞(OCs)生成能力、下调炎症因子、促进细胞外基质(ECM)合成、改善股骨头局部供血、平衡脂质代谢、抑制骨肉瘤细胞增殖迁移,诱导周期阻滞、加强骨骼肌对糖的利用、调控细胞自噬和凋亡等。但其结构不稳定、水溶性差、生物利用度低等缺陷严重限制其临床应用,目前借助制剂手段,如滴丸、微丸、包合物、脂质体等,改善了其稳定性和水溶性,提高了药物疗效。该文通过对近年来国内外藁本内酯治疗运动系统疾病的作用、作用机制及其单体和制剂的药代动力学研究进行归纳总结,以期为藁本内酯在治疗运动系统疾病方面的进一步开发应用提供参考和指导。

关键词： 苍耳子   网络药理学   分子对接   肝毒性   炮制减毒   实验验证  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术并结合体内外实验研究炮制对苍耳子肝毒性的影响。方法通过中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)、毒性与基因比较数据库(The Comparative Toxicogenomics Database,CTD)筛选苍耳子的毒性成分,利用Swiss Target Prediction数据库获取毒性成分作用靶点;检索Genecards数据库和DisGeNET数据库中肝相关疾病靶点,通过绘制韦恩图获取苍耳子毒性成分靶点和肝疾病相关靶点的交集;通过Cytoscape软件构建“药物-毒性成分-靶点”网络,利用STRING数据库对苍耳子肝毒性作用靶点进行蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)分析并筛选关键靶点;利用Metascape数据库对上述关键靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopediaof Genesand Genomes,KEGG)通路富集分析。使用Auto Docktools和PyMOL软件对苍耳子的肝毒性成分和核心靶点进行分子对接验证。体外实验采用MTS法比较苍耳子不同炮制品对正常肝细胞株(L-02)毒性,并测定培养液中乳酸脱氢酶(lactatedehydrogenase,LDH)释放,利用流式细胞仪检测细胞的凋亡情况。体内实验检测灌服苍耳子不同炮制品小鼠血清中谷丙转氨酶(Alanineaminotransferase,ALT)和谷草转氨酶(Aspartateaminotransferase,AST)活性。结果网络药理学分析苍耳子肝毒性成分主要包括羧基苍术苷(carboxyatractyloside)、谷甾醇(sitosterol)、豆甾醇(stigmasterol)等,其核心靶点主要为PPARG、PPARA、NR1H3等。GO功能富集到脂质定位和储存的正、负调节和脂质代谢过程调节等生物过程;转录调节复合物、神经细胞体和受体复合物等细胞组分,转录因子结合、核受体结合和蛋白质结构域特异性结合等分子功能。KEGG通路富集到非酒精性脂肪肝、脂质和动脉粥样硬化、酒精肝、胰岛素抵抗和PPAR等信号通路。分子对接结果显示,肝毒性化合物与核心靶点能较好地结合。体外实验结果显示,苍耳子生品明显促进L-02细胞LDH释放,显示具有明显的细胞毒性,并能诱导细胞凋亡(P<0.05),炮制品能减少LDH释放,降低细胞毒性,诱导细胞凋亡作用减弱,其中酒炙品效果更明显。体内实验结果显示,苍耳子生品显著升高正常小鼠血清中AST和ALT的活性(P<0.05),炮制品无显著影响(P>0.05)。结论炒制和酒炙炮制方法可能通过减弱PPARA、PPARG和NR1H3等肝毒性靶点效应改善脂质代谢信号通路异常,从而降低苍耳子肝毒性,且酒炙法减毒效果更好。

关键词： 网络药理学   细菌性肠胃炎   分子对接   大黄   决明子  

摘要： 背景:已有基于大黄、决明子、枳实、三七治疗细菌性肠炎的临床给药策略,但其靶向机制不明确,作用具体位点不清晰。目的:阐明大黄、决明子、枳实、三七联合用药的作用机理和靶向机制。方法:采用TCMSP等药理学数据库获得潜在靶点,构建PPI和“中药–活性成分–靶点”网络图,筛选核心成分靶点并进行分子对接。结果:四种药物的活性成分包括大黄素、泽兰黄醇、豆甾醇等。该药物治疗交集靶点49个,KEGG筛选出富集得到的14条相关信号通路,分子对接结果表明,关键活性成分与核心靶点都有较好的亲和力。结论:大黄、决明子、枳实、三七中的大黄素、裘皮素、木犀草素、β-谷甾醇等主要通过AKT1、SRC等通路调控疾病进展。Background: Clinical drug delivery strategies based on Rhubarb, Cassia, Citrus aurantium and Panax ginseng for the treatment of bacterial enteritis have been developed, but the targeting mechanism is unclear and the specific site of action is not clear. Objective: To elucidate the mechanism of action and targeting mechanism of the combination of Rhubarb, Cassia, Citrus aurantium and Panax ginseng. Methods: TCMSP and other pharmacological databases were used to obtain potential targets, construct PPI and “TCM-active ingredient-target” network diagrams, and screen the core component targets and perform molecular docking. Results: The active ingredients of the four drugs included rhodopsin, zeylanol and stigmasterol. The drug therapy intersected 49 targets, and KEGG screened 14 relevant signaling pathways obtained from the enrichment, and the molecular docking results showed that the key active ingredients had good affinity with the core targets. Conclusion: Rhubarb, Cassia, Citrus aurantium and Panax ginseng in rhubarb, cucurbitacin, lignocerosin, and β-sitosterol mainly regulate the disease progression through the pathways of AKT1, SRC, and so on.

关键词： 唐草片   艾滋病   网络药理   分子对接  

摘要： 目的 通过网络药理学与分子对接技术解析唐草片对艾滋病的治疗机制。方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)收集唐草片活性成分,通过SwissTargetPrediction数据库预测其成分靶点,利用GeneCards、OMIM数据库检索疾病靶点。利用STRING平台绘制PPI网络图,并通过CytoScape 3.9.1软件构建中药-成分-靶点网络,利用DAVID数据库进行GO分析与KEGG分析,借助AutoDockTools1.5.7软件进行分子对接验证。结果 唐草片治疗艾滋病的核心活性成分为槲皮素、木犀草素、山柰酚、黄芩素、异鼠李素等,核心靶点为AKT1、IL-6、TNF、STAT3、EGFR等。GO分析主要涉及磷酸化、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、信号转导等生物过程,KEGG分析主要涉及PI3K-Akt、MAPK、Ras等信号通路。分子对接显示,关键成分与核心靶点结合活性良好。结论 唐草片可能通过槲皮素、木犀草素、山柰酚、黄芩素、异鼠李素等成分,作用于AKT1、IL-6、TNF、STAT3、EGFR等靶点,调节PI3K-Akt、MAPK、Ras等信号通路治疗艾滋病。

关键词： 理中丸   慢性萎缩性胃炎   网络药理学   体外实验   细胞凋亡  

摘要： 目的运用网络药理学及体外实验方法探究并验证理中丸治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的分子机制。方法借助中药系统药理学数据库和分析平台筛选理中丸的有效活性成分,并通过PubChem、Swiss Target Prediction数据库获取理中丸的相关作用靶点。借助GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库获取CAG的相关靶点。利用Venn工具获得理中丸治疗CAG的药物-疾病共同靶点,借助STRING数据库构建理中丸治疗CAG的药物-疾病共同靶点互作网络。应用Cytoscape软件构建理中丸治疗CAG的“药物-疾病-靶点-通路”网络,对理中丸治疗CAG的药物-疾病共同靶点进行基因功能和通路富集分析。运用Moe软件对药物活性成分与关键靶点进行分子对接和结合能力预测。构建脾胃虚寒型CAG大鼠模型,观察理中丸对大鼠胃组织形态改变、胃黏膜细胞凋亡及CAG关键靶点信使RNA(messenger RNA,mRNA)和蛋白水平表达的影响。结果共筛选出理中丸有效活性成分57种,包括花生四烯酸、人参皂苷Rg5、五味子酯乙、阿朴天仙子碱和人参皂苷Rh2等;获得理中丸相关作用靶点869个。获得理中丸与CAG的共同靶点47个,其中关键靶点包括肿瘤蛋白P53(tumor protein P53,TP53)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、B细胞淋巴瘤2(B-cell lymphoma 2,Bcl-2)等。通路富集分析共获得135条通路,主要包括肿瘤的发病途径、肿瘤中的蛋白聚糖、胆碱能突触、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路等。分子对接结果显示,TP53、IL-6、TNF-α、EGFR、Bcl-2与五味子酯乙和人参皂苷Rh2有较好的结合活性。体外实验发现,模型组大鼠的脾胃虚寒证候评分显著高于空白组;理中丸可改善CAG大鼠的病理变化,显著减少胃黏膜细胞凋亡,降低胃黏膜组织中TP53、IL-6、TNF-α、EGFR、Bcl-2 mRNA和蛋白表达水平。结论理中丸治疗脾胃虚寒型CAG的作用可能与其调控TP53、IL-6、TNF-α、EGFR、Bcl-2的表达、减轻炎症反应、减少胃黏膜细胞凋亡有关。

关键词： 附子-龙骨-牡蛎角药   失眠   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接技术研究附子-龙骨-牡蛎角药配伍治疗失眠的作用机制。方法收集附子、龙骨、牡蛎活性成分并预测其作用靶点;通过GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库筛选失眠靶点,取药物与疾病的交集靶点;采用STRING数据库获得蛋白互作关系,并通过Cytoscape3.9.1进行可视化分析,预测附子-龙骨-牡蛎角药治疗失眠的关键靶点;采用Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,获得潜在作用通路;采用AutoDock Vina1.1.2软件对核心靶点与主要活性成分进行分子对接。结果获得附子、龙骨、牡蛎43个活性成分,涉及失眠作用靶点34个,其中主要活性成分为磷酸钙、benzoylnapelline、去乙基德利卡因B、蛋氨酸、新芥酸B等,核心靶点为ALB、GSK3B、TGFB1、ESR1、PPARG、SERPINE1、FGFR1等。KEGG通路富集分析结果显示,附子-龙骨-牡蛎角药治疗失眠主要涉及癌症通路、5-羟色胺能突触通路、MAPK信号通路、多巴胺能突触通路等。分子对接验证显示,benzoylnapelline、去乙基德利卡因B、新芥酸B等主要活性成分与ALB、GSK3B、TGFB1等核心靶点有较强的结合活性。结论附子-龙骨-牡蛎角药配伍使用可能通过磷酸钙、蛋氨酸、Benzoylnapelline、去乙基德利卡因B、新芥酸B等成分,通过作用于ALB、ESR1、PPARG、GSK3B、TGFB1等核心靶点,作用于神经递质调节、炎症因子等信号通路,发挥调节抑郁情绪、改善失眠的作用。