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关键词： 涤痰汤   脑卒中   网络药理学   活性成分   GO富集分析   KEGG通路分析  

摘要： 目的:通过网络药理学方法探索涤痰汤在脑卒中治疗中的分子机制,为其在未来脑卒中治疗中的应用和进一步的实验室研究提供科学依据和参考。方法:利用TCMSP数据库,筛选涤痰汤中的活性成分,并预测其潜在靶点。使用SwissTargetPrediction数据库和UniProt数据库对这些靶点进行验证和修正。通过Cytoscape软件构建“中药—成分—靶点”网络图,进而使用R语言中的clusterProfiler包进行GO富集和KEGG通路分析,以揭示涤痰汤的作用通路。结果:研究发现涤痰汤共有2 995个活性物质和447个潜在作用靶点。这些活性成分主要关联了调控凋亡、血管功能改善、抗炎作用等生物学过程。涤痰汤的关键作用靶点包括GAPDH、STAT3、TNF等,这些蛋白质在脑卒中的病理过程中发挥重要作用。KEGG通路分析揭示了涤痰汤可能影响的主要信号通路,如癌症信号通路、脂质与动脉粥样硬化等。结论:涤痰汤通过多种生物学通路和靶点发挥治疗脑卒中的作用,显示出显著的抗炎、抗氧化和血管功能改善等效果。这些结果为涤痰汤的临床应用提供了分子机制上的证据,支持了其在传统中医治疗脑卒中中的有效性。

关键词： 枸杞   药食同源   药理学   应用   研究进展  

摘要： 药食同源食品因兼具食品和中药双重属性而受到了前所未有的关注。枸杞因含有多种生物活性成分,具有高价值保健功效。现代医学发现枸杞具有提高免疫力、延缓衰老、调节血脂和降血糖、抗辐射和抗肿瘤等多重药理作用,是卫健委批准的药食同源的中药材。本文从枸杞“药食同源”的理论基础、药理作用和开发策略等方面进行综述,以期为枸杞子的研发利用提供宝贵经验。

关键词： 网络药理学   分子对接   上中下通用痛风方   类风湿关节炎   骨关节炎   痛风性关节炎  

摘要： 目的探讨中药复方上中下通用痛风方“异病同治”类风湿关节炎(RA)、痛风性关节炎(GA)和骨关节炎(OA)的潜在靶点,并从铁死亡角度分析其可能的作用机制。方法基于TCMSP、HERB数据库获取上中下通用痛风方化学成分及相关靶点;检索Genecards、Drugbank、OMIM、TTD、FerrDb数据库搜集RA、OA、GA疾病靶点和铁死亡基因靶点;将化学成分对应的靶点与疾病靶点以及铁死亡靶点取交集获得上中下通用痛风方治疗RA、OA和GA的交集靶点以及与铁死亡相关的靶点;然后使用Cytoscape3.9.1软件构建“药物-成分-靶点”网络图,并将交集靶点输入STRING平台建立PPI网络,然后利用DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,最后将主要成分与核心靶点进行分子对接验证。结果共获得上中下通用痛风方103个活性成分,相关靶点280个;检索疾病相关数据库,获取2172个RA、1625个OA、1554个GA疾病靶点和564个铁死亡相关基因。将交集映射后得到交集靶点1和2分别输入STRING平台构建PPI网络,筛选得到IL6、PTGS2、IL1B、TGFB1、ALB等核心靶点;再将交集靶点1输入DAVID数据库,分别进行GO功能和KEGG通路富集分析,GO功能富集分析得到519个BP,51个CC,93个MF,KEGG共富集得到144条通路;将交集靶点2进行KEGG富集分析主要有HIF-1、MAPK、IL-17、AGE-RAGE、Th17细胞分化以及破骨细胞分化等112条通路。结论上中下通用痛风方中β-谷甾醇、槲皮素、豆甾醇、山柰酚、木犀草素和汉黄芩素等核心成分可作用于IL6、PTGS2、IL1B、TGFB1、ALB等核心靶点,调控破骨细胞分化、IL-17、TNF、MAPK、PI3K-Akt等信号通路;还可通过作用于HIF-1、AGE-RAGE、Th17细胞分化等通路,调控铁死亡,发挥“异病同治”作用于RA、GA、OA。

关键词： 原发性高血压   网络药理学   数据挖掘   用药规律   作用机制   马晓昌  

摘要： 目的:基于数据挖掘及网络药理学方法探讨马晓昌教授辨治原发性高血压的用药规律及相关机制。方法:收集原发性高血压病人的中药处方资料,使用中医传承辅助平台V3.0系统对纳入药物的性味归经及使用频次等进行分析,筛选核心处方。采用网络药理学方法对核心处方进行蛋白-蛋白互作网络、通路和相关靶点的分析。结果:数据挖掘共得到处方323首,涉及中药157味。使用频次居前6位的中药包括葛根、陈皮、茵陈、茯苓、半夏、白术。药物-疾病的共同靶点102个,主要成分包括川陈皮素、槲皮素、柚皮素等57个高频药物。药物的主要靶点包括白细胞介素-6、肿瘤坏死因子、丝氨酸/苏氨酸激酶、白细胞介素-1β等。信号通路涉及流体剪切应力、脂质与动脉粥样硬化通路等。结论:初步得到马晓昌教授治疗原发性高血压的用药特点及核心组方多成分、多靶点、多通路的作用机制。

关键词： 超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱   滑膜炎制剂   化学成分表征   质量标志物   化学计量学   网络药理学  

摘要： 目的:对滑膜炎系列制剂(片剂、颗粒剂、胶囊剂)的化学成分进行表征,并结合化学计量学和网络药理学分析识别滑膜炎制剂的质量标志物。方法:采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱(UHPLC-Q-TOF-MS)对52批滑膜炎制剂进行化学成分表征,以鉴定出的化学成分为研究对象,结合主成分分析和正交偏最小二乘判别分析筛选出不同产品间的差异性成分,并对差异性成分进行网络药理学分析,最终识别出滑膜炎制剂的质量标志物。结果:在正、负离子扫描模式下,共鉴别出141个化合物,通过化学模式识别分析筛选出其中的17个差异成分,最终结合网络药理学识别出迷迭香酸、紫草酸、丹酚酸B、丹酚酸A、新落新妇苷、黄杞苷、壬二酸、丹酚酸C等8个成分可能为滑膜炎制剂的潜在质量标志物。结论:不同滑膜炎产品中化学成分组成相似,但相对含量差别较大。通过结合化学成分表征、化学模式识别及网络药理学分析,筛选出了滑膜炎制剂与药效相关联的质量标志物,为滑膜炎制剂的质量控制和作用机制研究的进一步研究提供了参考和依据。

关键词： 网络药理学   分子对接模拟   雷公藤   肾病综合征  

摘要： 目的通过网络药理学及分子对接技术分析雷公藤治疗肾病综合征的作用靶点,为后续该病治疗及药物开发提供理论基础。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选出雷公藤的活性成分及活性靶点;利用PubChem和Swiss Target Prediction数据库将活性成分转化为基因名;通过Disgenet、GeneCards数据库获取肾病综合征的疾病靶点;利用Venny 2.1软件绘制雷公藤与肾病综合征基因的共同靶点韦恩图;应用Cytoscape3.2.1软件构建"雷公藤-主要成分-肾病综合征"交集基因网络图;利用STRING数据库对其作用靶点构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络分析;使用DAVID数据库对这些靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KFGG)通路富集分析;利用AutoDockTools软件对核心靶点和雷公藤活性成分进行分子对接。结果筛选得到雷公藤有效活性成分418个,肾病综合征对应靶点2382个,药物-疾病共同作用交集靶点171个。GO功能富集分析显示:有34个核心靶点相互作用关系,其中蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素(IL)-6、缺氧诱导因子1亚基α(HIF1A)、肿瘤蛋白P53(TP53)与转录激活因子(STAT3)等最为重要,可能是雷公藤治疗肾病综合征的潜在治疗靶点;核心通路有癌症的发病途径、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、乙型肝炎、癌症中的蛋白聚糖和脂质与动脉粥样硬化等关键通路。分子对接显示:滇南蛇藤碱、山奈酚、异黄腐醇、化合物A和化合物B等5个活性成分与Akt1、IL-6、HIF1A、TP53、STAT3、表皮生长因子受体(EGFR)、肿瘤坏死因子(TNF)、半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)等8个靶点具有结合潜力,其中以山奈酚与Akt1、TP53、EGFR和CASP3等4个靶点的结合能最低,稳定性最好。结论雷公藤可通过多成分、多靶点、多通路在治疗肾病综合征中发挥作用。

关键词： 四黄散   膝关节滑膜炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学探讨四黄散治疗膝关节滑膜炎的作用机制。方法通过TCMSP数据库获取四黄散组成药物的活性成分及对应靶标,利用Cytoscape 3.9.1软件绘制“药物⁃活性成分⁃靶点”网络图,并与OMIM、Gene Cars数据库所获疾病靶点交集以得到核心靶点,基于STRING平台构建靶点蛋白质⁃蛋白质相互作用网络。通过DAVID数据库对核心靶点进行基因本体论(GO)/京都基因和基因组百科全书(KEGG)可视化分析,得到核心生物功能和相关信号通路。将所得结果导入Autodock Tools软件,使用AutoDock Vina进行分子对接分析,运用PyMol绘制3D图。结果分析得到四黄散68个活性成分和244个药物靶点,核心靶点有肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素6(IL⁃6)、蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤蛋白p53(TP53)等18个;KEGG富集分析获得118条信号通路;分子对接结果显示四黄散中成分槲皮素、山柰酚、黄芩苷元、汉黄芩素与关键靶点亲和力强。结论四黄散治疗膝关节滑膜炎具有成分多元、靶点多样、多信号通路等特点,为进一步的基础实验研究奠定了基础,也为后续挖掘此方治疗膝关节滑膜炎的作用机制提供了参考。

关键词： 养肝安魂汤   肝不藏魂   不寐   网络药理学   大鼠  

摘要： 目的采用网络药理学方法探究养肝安魂汤治疗肝不藏魂型不寐的作用机制,并进行动物实验验证。方法通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库检索养肝安魂汤的药物活性成分及靶点,借助GeneCards、NCBI、DisGeNET数据库检索肝不藏魂型不寐相关疾病靶点,通过蛋白相互作用(PPI)网络构建及GO、KEGG通路富集分析确定养肝安魂汤治疗肝不藏魂型不寐的信号通路,对主要活性成分与核心靶点进行分子对接。将24只SD大鼠随机分为正常组、模型组、中药组、西药组,每组6只,采用复合多因素刺激法构建肝不藏魂型不寐模型,给药干预14 d;通过Morris水迷宫实验检测大鼠认知记忆能力,尼氏染色观察下丘脑尼氏体形态及数量,ELISA检测血清白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)含量,免疫组化检测下丘脑IL-6、TNF-α、Bcl-2、Bax蛋白表达,Western blot检测下丘脑p38 MAPK、p-p38 MAPK、Bcl-2、Bax蛋白相对表达。结果共得到养肝安魂汤活性成分301个及其治疗肝不藏魂型不寐的潜在靶点321个,其中关键靶点92个,筛选得到槲皮素、山柰酚、毛地黄黄酮、黄芩素、乌臼酸、β-谷甾醇等关键活性成分及MAPK、IL6、TNF等核心靶点,关键靶点主要集中在TNF信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、多巴胺能突触、神经活性配体-受体相互作用等信号通路;山柰酚、槲皮素、毛地黄黄酮等与MAPK、TNF、IL6等均具有较好的结合活性及稳定性。动物实验结果显示,与正常组比较,模型组大鼠认知记忆能力下降(P<0.05),尼氏体染色较浅、密度较低、胞体皱缩变形、胞核出现破碎及溶解,血清及下丘脑IL-6、TNF-α升高(P<0.05),下丘脑p-p38 MAPK/p38 MAPK、Bax表达升高(P<0.05),Bcl-2、Bcl-2/Bax表达降低(P<0.05);与模型组比较,中药组、西药组认知记忆能力有所改善,尼氏体数量明显增多,胞核清楚、胞体皱缩及变形情况好转,血清及下丘脑IL-6、TNF-α降低(P<0.05),p-p38 MAPK/p38 MAPK、Bax表达均降低,Bcl-2、Bcl-2/Bax表达均升高(P<0.05)。结论养肝安魂汤可能通过调控MAPK、TNF、IL6、Bcl-2、Bax等核心靶点及干预p38MAPK信号通路,发挥治疗肝不藏魂型不寐作用。

关键词： 神经根型颈椎病   颈痛颗粒   网络药理学   机制  

摘要： 目的通过网络药理学及分子对接技术探讨颈痛颗粒治疗神经根型颈椎病(CSR)的作用机制。方法通过TCMSP及SwissTargetPrediction数据库搜索颈痛颗粒的化学成分、对应靶点,用DisGeNET等数据库获取CSR相关靶点。应用Cytoscape软件构建“中药-活性成分-靶点网络”图,通过STRING数据库对药物和疾病交集靶点进行PPI分析,通过DAVID进行GO富集分析、KEGG通路分析,最后用Schrodinger′s Maestro软件对活性成分与关键靶点进行验证。结果筛选得到颈痛颗粒中93个化合物,预测得到颈痛颗粒保护CSR的潜在靶点309个,关键靶点涉及SRC、TP53、Akt1、MAPK1、RELA等。分子对接结果表明颈痛颗粒中主要活性成分与关键靶点有一定结合能力。结论颈痛颗粒可能通过抗炎、抗凋亡来减缓椎间盘退变过程从而缓解CSR症状。

关键词： 结直肠腺瘤   黄连解毒汤   Bcl-2/Bax/Caspase-3信号通路   细胞凋亡   网络药理学   分子对接   动物实验   小鼠  

摘要： 目的:研究黄连解毒汤通过调控Bcl-2/Bax/Caspase-3信号通路发挥抗结直肠腺瘤(CRA)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取黄连解毒汤的活性成分及作用靶点;通过在线人类孟德尔遗传病数据库(OMIM)和人类基因组数据库(GeneCard)获取CRA疾病靶点;通过Venny 2.1软件获得黄连解毒汤与CRA的交集靶点;通过String数据库和Cytoscape 3.9.1软件绘制蛋白互作网络,并筛选黄连解毒汤治疗CRA的核心作用靶点;通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;通过Auto Dock Tools 1.5.6软件将前5位药物活性成分与前5位关键靶点进行分子对接验证。采用随机数字表法将60只小鼠分为正常组、模型组、黄连解毒汤低剂量组、黄连解毒汤中剂量组、黄连解毒汤高剂量组、阿司匹林组,每组10只。采用氧化偶氮甲烷(AOM)/葡聚糖硫酸钠(DSS)联合诱导小鼠CRA模型,同时各组予相应药物进行灌胃干预9周。苏木精-伊红染色法(HE)观察小鼠肠组织的病理变化;原位末端转移酶标记法(TUNEL)观察肠组织细胞凋亡;实时荧光定量聚合酶链式反应(Realtime PCR)检测腺瘤组织B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)mRNA、Bcl-2相关X蛋白(Bax)mRNA、细胞色素C(Cyt C)mRNA、胱天蛋白酶-9(Caspase-9)mRNA、胱天蛋白酶-3(Caspase-3)mRNA表达水平;蛋白免疫印迹法(Western blotting)法检测腺瘤组织Bcl-2、Bax、Cyt C、Caspase-9、Caspase-3蛋白的表达水平。结果:网络药理学共筛选得到黄连解毒汤80个活性成分,药物-疾病交集靶点170个;通过药物-成分-靶点-疾病调控网络的构建,筛选出槲皮素(quercetin)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、豆甾醇(Stigmasterol)、黄连素(berberine)、汉黄芩素(wogonin)等核心活性成分;通过构建蛋白互作网络,筛选出AKT1、JUN、HSP90AA1、CASP3、IL-6等关键靶点;GO与KEGG富集分析发现黄连解毒汤可能通过调控细胞凋亡途径发挥治疗CRA的作用;槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、黄连素、汉黄芩素与核心靶点AKT1、JUN、HSP90AA1、CASP3、IL-6具有较为稳定的结合活性,展现了良好的亲和力。动物实验结果显示,模型组小鼠肠道质量、腺瘤数量高于正常组(P<0.01),结直肠长度低于正常组(P<0.01);黄连解毒汤高、中、低剂量组小鼠肠道质量、腺瘤数量均低于模型组(P<0.01);黄连解毒汤高、中剂量组小鼠结直肠长度均高于模型组(P<0.01)。模型组小鼠腺瘤组织细胞凋亡率低于正常组(P<0.01);黄连解毒汤低、中、高剂量组小鼠腺瘤组织细胞凋亡率均高于模型组(P<0.01)。模型组小鼠腺瘤组织Bcl-2 mRNA和Bcl-2蛋白相对表达量高于正常组(P<0.01),Bax mRNA、Cyt C mRNA、Caspase-9 mRNA、Caspase-3 mRNA和Bax、Cyt C、Caspase-9、Caspase-3蛋白相对表达量低于正常组(P<0.01或P<0.05)。黄连解毒汤高、中剂量组小鼠腺瘤组织Bcl-2 mRNA及Bcl-2蛋白相对表达量均低于模型组(P<0.01),Bax mRNA、Cyt C mRNA、Caspase-9 mRNA、Caspase-3 mRNA及Bax、Cyt C、Caspase-9、Caspase-3蛋白相对表达量均高于模型组(P<0.05或P<0.01);黄连解毒汤低剂量组小鼠Caspase-9 mRNA及Bax、Cyt C、Caspase-3蛋白相对表达量高于模型组(P<0.05或P<0.01)。结论:黄连解毒汤可能通过调控Bcl-2/Bax/Caspase-3信号通路发挥治疗CRA的效应。