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关键词： BOPPPS教学模式   音乐课堂   药理学  

摘要： 目的探索BOPPPS与“音乐课堂”相结合的教学模式在药理学课程教学中的应用效果。方法以韶关学院2020级临床医学专业两个班的学生为研究对象。实验组采用BOPPPS与“音乐课堂”相结合的教学模式,对照组采用以教师讲授为主的传统教学模式。教学后对学生进行理论考试,同时对实验组进行问卷调查。结果实验组考试成绩明显优于对照组(P<0.05),且实验组学生对BOPPPS与“音乐课堂”相结合的教学模式认可度较高。结论BOPPPS与“音乐课堂”相结合的教学模式教学效果较好,可在药理学教学中应用和推广。

关键词： 心肌缺血损伤   新塔花-丹参-降香   天香丹   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨“新塔花-丹参-降香”改善心肌缺血损伤的药效物质基础和分子作用机制。方法 借助TCMSP、UniProt和PubChem数据库及文献补充获得“新塔花-丹参-降香”的主要活性成分,并将与活性成分相联系的靶基因借助UniProt数据库翻译成相应基因。利用GeneCards、OMIM和TTD数据库得到疾病相关靶点,对主要活性成分与疾病靶点取交集后采用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后通过AutoDock Vina软件对关键靶点和主要活性成分进行分子对接验证。结果 筛选“新塔花-丹参-降香”针对心肌缺血损伤的101个活性成分和338个潜在作用靶点。蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络拓扑分析筛选得到关键靶点白细胞介素-17(IL-17)、HIF-1、核转录因子-κB(NF-κB)、TNF等。GO功能分析发现“新塔花-丹参-降香”生物过程集中在RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录正调控、基因表达的正向调控、凋亡过程的负调控、对外源刺激的反应等多个方面。KEGG信号富集分析显示涉及血脂与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、细胞凋亡、IL-17信号通路、前列腺癌、HIF-1信号通路、cAMP信号通路、NF-κB信号通路、mTOR信号通路等。分子对接显示活性物质与靶点蛋白之间存在较强的结合力,其中槲皮素与TNF的结合力最强。结论“新塔花-丹参-降香”配伍治疗心肌缺血损伤具有多成分、多靶点、多通路相互协同的特点,可为防治心肌缺血损伤的研究提供参考。

关键词： 肾苏合剂   糖尿病肾病   网络药理学   分子对接  

摘要： [目的]基于网络药理学和分子对接技术探究名老中医曹式丽教授“辛通畅络法”的代表方剂—肾苏合剂治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。[方法]通过TCMSP、BATMAN平台筛选肾苏合剂的活性成分,通过R studio软件获取活性成分的相关靶点,并添加靶点名称的缩写,将方剂的靶点信息与Uniprot数据库信息进行规范化。通过Gene Cards、OMIM、CTD数据库获取DN的相关靶点。运用韦恩图在线绘制平台获取药物、疾病的交集靶点,通过Cytoscape软件将“药物活性成分、疾病、靶点”可视化。将交集靶点输入STRING数据库进行分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,对交集靶点进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。[结果]共获得肾苏合剂活性成分66个,靶点504个,DN靶点2646个,交集靶点243个。共获得PPI靶点241个(2个游离节点被删去),包括清蛋白基因(ALB)、AKT丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT1)、白介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、胰岛素基因(INS)、白介素-1β(IL-1β)等。GO富集分析主要涉及:DNA-转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ-特异性DNA-转录因子结合、受体配体活性等。KEGG富集分析主要涉及:脂质和动脉粥样硬化、人巨细胞病毒感染、流体剪切应力与动脉粥样硬化等。[结论]肾苏合剂可能通过多个靶点、通路治疗DN,本研究为肾苏合剂的临床使用提供了理论依据。

关键词： 急性胰腺炎   大柴胡汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 基于网络药理学、分子对接的方式揭示大柴胡汤治疗急性胰腺炎的作用靶点和分子机制。方法 2024年3月-5月,从中药系统药理学数据库与分析平台检索大柴胡汤的活性成分和靶点,应用GeneCards数据库获得急性胰腺炎靶点,取交集得大柴胡汤治疗急性胰腺炎的交集靶点。采用STRING平台构建蛋白互作网络,Cytoscape 3.9.1软件进行网络拓扑计算筛选核心靶点与核心成分,利用Metascape平台进行基因本体功能富集分析以及京都基因和基因组数据库通路富集分析并导入Python 3.8软件绘制气泡图。用AutoDock 1.5.6软件进行分子对接,预测核心成分和核心靶点的结合性能。结果 筛选出大柴胡汤治疗急性胰腺炎的交集靶点84个。核心成分为槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、木犀草素、黄芩素。核心蛋白为AKT1、B细胞淋巴瘤蛋白2(B-cell leukemia/lymphoma 2, BCL2)、Jun原癌基因(Jun proto-oncogene, JUN)、白细胞介素1β(interleukin 1 Beta, IL1B)、核因子κB亚基1(nuclear factor kappa B subunit 1, NFKB1),均富集于脂质与动脉粥样硬化通路、PI3K-Akt信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、凋亡通路。部分核心成分与核心蛋白的结合能值在–5.0 kJ/mol以下。结论 大柴胡汤可能通过调控急性胰腺炎中脂质与动脉粥样硬化通路、PI3K-Akt信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、凋亡通路的AKT1、BCL2、JUN、IL1B、NFKB1关键蛋白靶点从而发挥抗炎和抗凋亡作用潜力。

关键词： 广泛性焦虑障碍   茯苓-酸枣仁   网络药理学   分子对接技术   作用机制  

摘要： 目的:利用网络药理学和分子对接技术探讨茯苓-酸枣仁药对治疗广泛性焦虑障碍(GAD)的作用机制。方法:以化合物的口服生物利用度(OB)和类药性(DL)为标准,依据中药药理学技术平台(TCMSP)数据库、小分子靶点预测平台(SwissTargetPrediction)预测和筛选茯苓、酸枣仁的活性成分和靶点,利用GeneCards数据库筛选治疗GAD的作用靶点,并通过Cytoscape 3.7.2软件构建茯苓-酸枣仁的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点,使用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,推断其作用机制。运用AutoDock Vina和PyMOL软件对茯苓-酸枣仁药对主要活性成分和关键靶点进行分子对接验证。结果:共筛选出15个茯苓活性成分,9个酸枣仁活性成分,与GAD有85个交集靶点,筛选出多巴胺-2受体,5-羟色胺等10个关键靶点;参与调节神经活性配体-受体相互作用、5-羟色胺能突触、多巴胺能突触等关键代谢通路;参与信号传导、内分泌代谢、循环系统调节等多种生物过程。分子对接结果显示,筛选出的4位活性成分与关键靶点对接结果均≤-4.25 kcal/mol,提示药物活性成分与关键交集靶点有较好的结合活性。结论:茯苓-酸枣仁可能通过调控DRD2,ESR1,HTR2A等靶点,调节神经活性配体-受体相互作用等通路发挥抗焦虑的作用,为茯苓-酸枣仁配伍治疗GAD作用机制的研究提供参考。

关键词： 黄芪   地龙   痛性糖尿病周围神经病变   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:探索黄芪-地龙药对治疗痛性糖尿病周围神经病变的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄芪的活性成分,在中国知网、万方、维普等平台搜索有关地龙成分的文献,对得到的成分进行机体对外源化学物的吸收、分布、代谢和排泄筛选,并在SwissTargetPretection网站中预测作用靶点。在人类基因数据库(GeneCards)、人类在线孟德尔遗传数据库(OMIM)中找出痛性糖尿病周围神经病变的相关靶点,运用微生信平台绘制韦恩图,得到交集靶点。在David数据库中进行生物信息学基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用Cytoscape及STRING数据库构建药物-活性成分-靶点网络图和蛋白质-蛋白质相互作用网络图,并筛选出核心靶点。最后运用AutoDock进行分子对接,将对接结果用PyMOL可视化。结果:得到黄芪-地龙的有效成分47个、作用靶点631个,疾病靶点5381个,两者交集靶点391个,筛选出核心靶点77个。GO富集分析主要涉及对外源性刺激的反应、蛋白质磷酸化、蛋白质自磷酸化等生物过程。KEGG通路主要包括癌症通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路、前列腺癌、脂质和动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路等。分子对接显示化合物与核心靶点均具有较好的结合力,尤其是槲皮素与肿瘤坏死因子。结论:黄芪-地龙药对通过多成分、多靶点、多通路实现对痛性糖尿病周围神经病变的治疗作用,为后续研究提供了理论依据及新思路。

关键词： 肛周湿疹   祛风汤   NF-κB信号通路   网络药理学   作用机制   小鼠  

摘要： 目的:基于网络药理学方法探究祛风汤治疗肛周湿疹的作用机制,并通过动物实验对关键靶点及信号通路进行验证。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库获得祛风汤10味中药相关活性成分及作用靶点;通过GeneCards数据库和OMIM数据库筛选肛周湿疹的疾病靶点,并采用Venny 2.1.0在线软件作图工具平台获取两者交集基因;基于String数据库构建祛风汤治疗肛周湿疹交集靶点PPI网络,并通过构建Hub网络筛选核心靶点。应用DAVID6.8数据平台对交集靶点的基因本体论(GO)生物学过程富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路进行注释分析。通过Cytoscape构建祛风汤“活性成分-靶点-通路”网络筛选主要活性成分。构建肛周湿疹小鼠模型,验证祛风汤治疗肛周湿疹的关键靶点及信号通路。结果:祛风汤共有135个活性成分,对应268个作用靶点,其中35个作用靶点与治疗肛周湿疹有关。PPI网络分析得到白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、CXCL8(IL-8)等核心靶点。GO富集分析共得到267个条目;KEGG富集分析共筛选得到60条通路,主要涉及TNF信号通路、核因子κB(NF-κB)信号通路、类风湿关节炎等。动物实验结果显示,祛风汤可改善肛周湿疹小鼠皮肤损伤,减少局部炎症浸润;祛风汤能减少肛周湿疹小鼠血清IL-6含量(P<0.05),下调湿疹皮肤组织中NF-κB信号通路相关蛋白NF-κB和TNF-α表达水平(P<0.05)。结论:祛风汤治可能通过调控NF-κB信号通路发挥疗治疗肛周湿疹的作用。

关键词： 胃癌   中药复方   国家专利   数据挖掘   网络药理学   配伍规律   白花蛇舌草   半枝莲   黄芪  

摘要： 目的基于数据挖掘和网络药理学探讨国家专利数据库的中药复方治疗胃癌的用药规律及作用机制。方法检索中国专利公布公告网自建库至2023年10月治疗胃癌中药复方专利,运用古今医案云平台和IBM SPSS Modeler将规范后的数据进行频次、中药属性、关联规则、聚类等分析。运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取白花蛇舌草、半枝莲和黄芪的有效成分及作用靶点;用GeneCards、DrugBank、OMIM、PharmGkb、TTD数据库获得胃癌的疾病靶点;运用R语言筛选出共同作用靶点;采用STRING数据库构建靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;运用Cytoscape软件构建药物成分-疾病靶点网络图及筛选共同靶点中的核心靶点;运用R语言进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共纳入专利287项,包含中药838味;来源于24个省、市及自治区;药性以温、平、寒为主;药味以甘、苦、辛为主;归经以脾、肝、肺为主;高频单味药有白花蛇舌草、黄芪、甘草、白术、半枝莲等;最常用药对是白花蛇舌草-黄芪和白花蛇舌草-半枝莲;关联分析获得药组15个;高频药物聚类分析获得3个核心药物组合。高频药对白花蛇舌草、半枝莲和黄芪有效成分44个,272个作用靶点;胃癌8961个靶点,筛选得到共同靶点198个。KEGG通路富集分析得到83条相关通路,主要富集在癌症信号通路、凋亡信号通路、P53信号通路等。结论中药复方专利治疗胃癌有规律可循,组方可寒温并用,以补虚健脾,解毒抑瘤为基本治法。其作用机制具有多成分、多靶点、多通路的特点。

关键词： 脊柱炎   强直性   丹参酮ⅡA   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨丹参酮ⅡA治疗强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)的作用机制。方法运用PubChem数据库、Swiss Target Prediction数据库和SuperPred数据库收集丹参酮ⅡA的主要作用靶点,通过GeneCards数据库、TTD数据库和DisGeNET数据库获取AS的主要靶点,筛选药物与疾病的共同靶点,构建药物—疾病—作用靶点网络图,并借助STRING平台构建蛋白—蛋白互作(protein-protein interaction networks,PPI)网络,采用DAVID数据库行GO(gene ontology)功能富集分析与KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,明确丹参酮ⅡA治疗AS的核心靶点及作用机制,运用AutoDockTools1.5.6软件对关键活性成分与核心潜在靶点进行分子对接。结果共获取丹参酮ⅡA作用靶点138个,AS疾病靶点2676个,丹参酮ⅡA-AS交集靶点29个,丹参酮ⅡA治疗AS的核心靶点为EGFR(epidermal growth factor receptor)、HSP90AA1(heat shock protein 90 alpha family class a member 1)、KDR(kinase insert domain receptor)、GSTP1(glutathione S-transferase P1)、MAPK14(mitogen-activated protein kinase 14);GO功能富集分析发现1182个结果,KEGG通路富集分析发现56个结果,丹参的关键活性成分丹参酮ⅡA与5个潜在靶点进行分子对接,结果显示预测的关键成分与核心靶点具有较好的结合活性。结论丹参酮ⅡA治疗AS具有多靶点、多通路的作用机制,为临床治疗AS提供了新思路。

关键词： 柴胡疏肝散   乳腺增生   网络药理学  

摘要： 目的:通过网络药理学的方法,探究柴胡疏肝散治疗乳腺增生症的潜在靶点和作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选柴胡疏肝散的有效活性成分及其作用靶点,利用GeneCards数据库检索乳腺增生症的相关靶点。映射疾病靶点与药物靶点,通过String数据库预测两者间关键靶点的相互作用,构建“药物–有效成分–作用靶点”网络图,并对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,分析柴胡疏肝散治疗乳腺增生症的潜在作用机制。结果:共获得50个活性成分,对应作用靶点681个,乳腺增生疾病对应靶点1970个,交集靶点187个,核心靶点37个,并得出排名前10位的GO富集结果和排名前30位的KEGG富集结果。结论:柴胡疏肝散中,槲皮素、山柰酚、柚皮素等多种成分,通过作用于STAT3、AKT1、MAPK3、ESR1、JAK2等靶点,从而调控PI3K/Akt/mTOR、JAK-STAT、TP53-MAPK等通路的信号表达,以发挥治疗乳腺增生的作用。Objective: To explore the potential targets and mechanisms of Chaihu Shugan Powder in the treatment of breast hyperplasia through network pharmacology. Methods: The Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP) was used to screen the effective active components and their targets of Chaihu Shugan Powder. The GeneCards database was utilized to retrieve the related targets of breast hyperplasia. Disease targets and drug targets were mapped, and the interactions between key targets were predicted using the STRING database. A “drug-active component-target” network diagram was constructed, and Gene Ontology (GO) enrichment analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) enrichment analysis were performed on the key targets to analyze the potential mechanisms of Chaihu Shugan Powder in treating breast hyperplasia. Results: A total of 50 active components were identified, corresponding to 681 targets. There were 1970 targets associated with breast hyperplasia, with 187 intersection targets and 37 core targets. The top 10 GO enrichment results and top 30 KEGG enrichment results were obtained. Conclusion: Multiple components in Chaihu Shugan Powder, such as quercetin, kaempferol, and naringenin, act on targets like STAT3, AKT1, MAPK3, ESR1, and JAK2, regulating the signal expression of pathways such as PI3K/Akt/mTOR, JAK-STAT, and TP53-MAPK, thereby exerting a therapeutic effect on breast hyperplasia.