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关键词： 慢性萎缩性胃炎   乌梅   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学分析乌梅治疗慢性萎缩性胃炎的靶点通路,并通过分子对接技术验证其活性成分与相关靶点结合的稳定性,为其临床应用提供依据。方法在TCMSP数据库中查询乌梅的有效成分并获取相关靶点;并在GeneCards、Disgenet数据库收集CAG靶点,在Venny2.1平台构建交集基因;构建蛋白互作网络,利用David数据库进行GO及KEGG富集分析。最后用AutoDockTools软件进行药物活性成分和靶点的分子对接,验证其可行性及合理性。结果筛选出乌梅中有8种药物活性成分,256个靶点蛋白,58个药物疾病共同靶点。KEGG通路富集分析得到122条信号通路,GO通路富集分析得到441条结果。其中肿瘤通路、癌症蛋白多糖、胃癌、细胞凋亡信号通路与治疗CAG密切相关。结论乌梅的主要活性成分通过调控AKT_(1)、BCL2、MMP9、SRC、EGFR等表达激活或抑制相关信号通路,调控胃癌细胞凋亡和保护胃黏膜等,从而治疗CAG。

关键词： 信息化时代   高职院校   药理学   教学改革   虚拟实验  

摘要： 为了适应信息化时代对高职院校药理学课程教学的要求,提升教学质量和学生实践能力,本文分析了信息化时代对药理学教学的影响,剖析了当前教学中存在的课程设计单一、实践教学不足、信息化应用水平有限和师资力量不足等问题。通过构建高质量信息化教学资源平台、推广混合式教学模式、加强虚拟仿真实验与实践教学、提高教师信息化教学能力等策略,研究表明信息化手段可以显著改善药理学教学效果,激发学生学习兴趣,提升教学效率与实践能力。建议高职院校继续深化信息化技术在药理学教学中的应用,为培养高素质医药人才提供支持。

关键词： 葶苈大枣泻肺汤   支气管哮喘   网络药理学   作用机制  

摘要： 本研究旨在运用网络药理学的方法,探讨葶苈大枣泻肺汤在治疗支气管哮喘方面的机制。方法 使用中药系统药理学平台(TCMSP)收集葶苈大枣泻肺汤中的活性成分,随后从GeneCards和OMIM数据库中提取与支气管哮喘相关的靶点,并利用String数据库绘制葶苈大枣泻肺汤与支气管哮喘靶点交集的韦恩图。运用Cytoscape 3.10.0构建葶苈大枣泻肺汤的有效成分与靶点之间的网络图,并制作蛋白质间相互作用的网络图,从中提取出核心成分及其对应靶点。采用DAVID数据库开展GO富集及KEGG通路的分析。结果 葶苈大枣泻肺汤的研究揭示其包含29种具有生物活性的成分以及290个交互靶点,而这些靶点的核心主要包括TNF、CASP3、AKT1、HIF1A、IL6、BCL2、TP53、STAT3、CTNNB1、MYC、ALB、SRC、ESR1、EGFR、JUN等。生物过程的GO功能富集分析表明,相关机制涉及对脂多糖的反应、蛋白质的磷酸化反应、炎症的发生,以及凋亡过程的负向调控等。KEGG通路分析结果表明,主要涉及的通路包括肿瘤信号通路、AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路以及白介素-17信号通路等。结果 槲皮素、山奈酚和β-谷甾醇等葶苈大枣泻肺汤的有效成分能够调节TNF、AKT1、BCL-2和JUN等相关靶点,其治疗效果可能与对多种生物过程(如脂多糖反应、蛋白质磷酸化、炎症反应及凋亡过程的负调节等)的影响,以及通过多种代谢路径(例如IL-17信号通路和AGE-RAGE信号通路等)的调控有关。

关键词： 苏苏小儿止咳颗粒   止咳   祛痰   支气管炎   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术,探讨苏苏小儿止咳颗粒(SSXCG)治疗小儿咳嗽、咳痰、支气管炎疾病的作用机制和关键靶点。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)等对SSXCG中的化橘红、紫苏叶、桔梗和甘草的靶点进行收集,通过查阅文献及靶点预测收集鞘蕊苏的作用靶点;通过GeneGards(https://***/)和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)收集咳嗽、咳痰、支气管炎疾病的靶点。使用Metascape软件对收集靶点进行韦恩(venn)交集及富集分析。利用蛋白质相互作用网络数据库(STRING)平台和Cytoscape软件构建蛋白互作(PPI)网络。通过PyMOL和Autodock进行分子对接验证SSXCG活性成分与关键靶点之间的相互作用。结果通过网络药理学分析得到疾病和药物的共同潜在靶点558个,PPI分析得到核心靶点47个,京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集到184条信号通路,将前20条进行可视化。豆甾醇、Forskoditerpene F、香蜂草苷、紫苏醛、柚皮苷可能是苏苏小儿止咳颗粒止咳、抗炎、治疗支气管炎的关键成分;基因本体(GO)与KEGG富集分析提示生物学主要过程集中于调节炎症反应,调节氧化应激、蛋白酪氨酸激酶活性等;作用通路可能是磷脂酰肌醇3-激酶/Akt通路、丝裂原活化蛋白激酶、人巨细胞病毒感染等信号通路;分子对接结果显示AKT1、STAT3等靶点可能是关键靶点。结论苏苏小儿止咳颗粒在对小儿咳嗽、咳痰、支气管炎疾病的治疗上具有多靶点、多通路、多系统的特征,为后续临床研究提供了新思路。

关键词： 多囊卵巢综合征   2型糖尿病   三仁汤   异病同治  

摘要： 目的:应用网络药理学方法探讨三仁汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)和2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的作用机制,为中药“异病同治”提供科学的理论依据。方法:利用中药数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药综合数据库(traditional Chinese medicine integrated database,TCMID)、中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine,TCMIP)、中药成分靶点平台2.0(HIT 2.0)、传统中医分子机制生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechANism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)、草药-中医证候-西医症状-成分-靶标-疾病关联网络数据库(symmap integrates traditional Chinese medicine,SymMap)等平台获取和筛选三仁汤的活性成分,并判断其生物活性;得到有效活性成分对应的靶点基因,输入Uniprot数据库,将靶点标准化;利用人类基因组数据库(the Human Gene database,GeneCards)、药物靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、比较毒物基因组学数据库(the comparative toxicogenomics database,CTD)和药物银行数据库(DrugBank)获取PCOS和T2DM疾病靶点,得到三仁汤治疗PCOS和T2DM的共同作用靶点;采用Cytoscape 3.7.1软件绘制三仁汤“异病同治”的“单味药-活性成分-共同靶点”网络图;利用STRING平台绘制蛋白相互作用网络;通过注释、可视化和综合发现数据库(the database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)、R语言(R studio)等平台进行生物过程分析,获得Mode节点分析、基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析结果。结果:共筛选得到三仁汤有效活性成分50个、PCOS疾病靶点23332个、T2DM疾病靶点28438个,三仁汤“异病同治”PCOS和T2DM的共同靶点214个;蛋白质相互作用(protein-protein interaction networks,PPI)筛选出39个关键靶点;GO及KEGG富集分析结果显示:三仁汤“异病同治”主要涉及炎症反应、缺氧反应、凋亡过程、HIF-1信号通路、钙离子信号通路、胰岛素抵抗等;MCODE分析结果显示:三仁汤“异病同治”可能与活性氧反应、凋亡相关信号通路、白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路、脂肪酸代谢过程等相关;三仁汤“异病同治”的关键靶点为蛋白激酶B1(protein kinase b alpha,AKT1)、肿瘤蛋白53(tumor protein p53,TP53)、半胱天冬酶3(caspase 3,CASP3)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)及IL-6等。结论:三仁汤可能通过多靶点、多通路、多途径的作用机制,对PCOS和T2DM患者发挥作用,取得异病同治的效果。

关键词： 不寐   心不藏神   数据挖掘   网络药理学  

摘要： 目的 利用数据挖掘方法分析张星平教授治疗心不藏神不寐用药规律,并通过网络药理学技术探索核心处方的作用机制。方法 以中医传承计算平台(V3.0)建立张星平教授治疗心不藏神不寐数据库,统计药物使用频次、性味归经,并进行关联规则分析、聚类分析,挖掘核心药物组合。收集核心处方的作用靶点和心不藏神不寐的靶点,筛选共同靶点,构建蛋白质相互作用(PPI)网络获得关键靶点,利用富集分析方法分析作用机制。结果 共纳入处方288张,包含145味中药,使用频次>200次的药物共有12味,药性以寒为主,药味以苦、辛为主,归经以肝经、脾经为主;功效以清热、补虚、理气为主;组方规律分析获得核心处方包括黄连、黄芩、夏枯草、柴胡、赤芍、白芍、郁金、陈皮、半夏、白术、茯苓、甘草。核心处方治疗心不藏神不寐的核心靶点为AKT1、IL-1β、IL-6、CASP3等;作用的生物学过程主要有对脂多糖的反应、调节血管直径、循环系统中的血管过程、对氧化应激的反应等;作用的主要通路包括脂质与动脉硬化、TNF通路、IL-17通路等,涉及的机制主要包括炎症、凋亡等。结论 张星平教授治疗心不藏神不寐以心为主,兼顾肝脾,以清心宁神为法,辅以疏肝安魂、运脾存意,核心处方清心宁神汤治疗心不藏神不寐的作用机制可能与调控炎症反应与细胞凋亡有关。

关键词： 丹参   传统中药   网络药理学   分子对接   非小细胞肺癌  

摘要： 目的利用网络药理学和生物信息学方法及分子对接和分子动力学模拟技术探讨丹参抗非小细胞肺癌的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选丹参主要活性成分,利用SwissTargetPrediction和PharmMapper数据库对活性成分进行靶标预测,利用GeneCards、DisGeNET和在线人类孟德遗传(OMIM)数据库获得肺癌相关靶点,取二者交集为丹参-肺癌靶点。在癌症基因组图谱数据库-肺腺癌&肺鳞癌(TCGA-LUAD&LUSC)以及GSE159857数据集中作差异分析获得公共的差异表达基因,与丹参-肺癌靶点取交集后鉴定出丹参抗非小细胞肺癌的核心靶点。对核心靶点进行GO和KEGG富集分析探究其参与的生物学过程和信号通路,用STRING数据库和Cytoscape 3.10.0软件构建核心靶点的互作网络。利用AutoDock Tools 1.5.6和AutoDock Vina 1.2.0软件对核心靶点进行分子对接验证,最后采用Gromacs 2022.4软件对分子对接复合物进行分子动力学模拟分析。结果本研究中筛选出26种丹参活性成分,并鉴定了61个丹参作用非小细胞肺癌的核心靶点。丹参活性成分通过细胞周期调控、细胞外基质重塑、氧化应激反应和代谢重编程等生物学过程以及p53、聚腺苷二磷酸核糖聚合酶(PARP)、单磷酸腺苷激活的蛋白激酶(AMPK)和核因子κB(NF-κB)等信号通路治疗非小细胞肺癌,通过直接靶向细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)4、极光激酶B(AURKB)、Polo样激酶1(PLK1)、CDK1和胸苷酸合成酶(TYMS)抑制非小细胞肺癌恶性进展。其中丹参酮IIA与CDK4的结合能最强,二者之间能够形成稳定的复合物。结论丹参通过调控多种生物学过程、多条信号通路和多个靶点协同作用,对非小细胞肺癌产生治疗效果。

关键词： 苦参碱   药理学   肿瘤   白血病   血液肿瘤  

摘要： 苦参碱以剂量依赖方式诱导白血病细胞凋亡、自噬和分化,有效抑制人急性髓系白血病细胞的增殖、迁移和侵袭能力。急性髓系白血病细胞中苦参碱具有早期自噬诱导剂和晚期自噬抑制剂的双重功效。其抗HL60细胞作用机制主要涉及激活Caspase死亡受体途径,诱导线粒体及内质网应激,诱发线粒体和内质网应激,增强癌细胞对放疗、化疗的敏感度。苦参碱通过强化机体免疫调节功能,发挥抗癌作用,在放化疗过程中有效抵御免疫抑制引发的毒性及不良反应。整理苦参碱在抗白血病近年的药理研究,探讨未来研究方向与策略。

关键词： 自拟通便汤   功能性便秘   肝郁气滞   网络药理学  

摘要： 目的运用网络药理学与分子对接探究自拟通便汤治疗功能性便秘的作用机制。方法在TCMSP、PubChem、SwissADME数据库中筛选收集自拟通便汤中药物的主要活性成分及相关作用靶点,在GeneGards数据库中检索功能性便秘相关疾病靶点,应用Cytoscape 3.10.1软件构建有效活性成分-靶点网络;基于STRING数据库构建PPI网络,Metascape数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并提取前20条结果构建可视化图形。结果自拟通便汤中有152种活性成分和980个相应靶点。功能性便秘共有6199个相关靶点。最终筛选获得638个潜在治疗靶点和239个信号通路,包括PI3K/Akt信号通路、MAPK信号通路等。自拟通便汤治疗功能性便秘的主要活性成分为木犀草素、柚皮素、槲皮素等,关键靶点为PIK3R1、AKT1、PIK3CA、MAPK1等。分子对接显示木犀草素、柚皮素、槲皮素分别与PIK3R1、AKT1、PIK3CA、MAPK1结合良好。结论自拟通便汤能通过木犀草素、柚皮素、谷甾醇、槲皮素作用于PIK3R1、AKT1、PIK3CA、MAPK1等靶点,从而激活PI3K/Akt、MAPK等多条信号通路治疗功能性便秘。

关键词： 骨质疏松症   藁本内酯   H型血管   EGFR   PI3K/Akt信号通路   分子机制  

摘要： 目的基于网络药理学与分子对接技术探讨藁本内酯调控H型血管防治骨质松疏松症的生物学机制,并结合动物实验进行验证。方法网络药理学预测藁本内酯调控H型血管防治骨质疏松症的可能机制,分子对接验证核心靶标EGFR与藁本内酯的结合能力。建立骨质疏松大鼠模型,分为假手术组、模型组、藁本内酯高、中、低剂量(80、40、20 mg·kg^(-1))组,HE染色观察股骨组织病理改变,免疫荧光检测胫骨干骺端CD31、EMCN、OSX+、RUNX2+蛋白表达,Western blot检测p-EGFR、p-PI3K、p-Akt蛋白表达。结果网络药理学结果显示,共得到20个交集靶点,EGFR、PTGS2、ESR1、ICAM1等属于核心靶标,分子对接显示EGFR与藁本内酯具有强烈的结合力。藁本内酯通过调控H型血管表达防治骨质疏松症的信号通路主要富集在PI3K-Akt、TNF等。与模型组比较,藁本内酯能明显增加骨小梁数量,改善骨微结构的破坏;明显提高CD31、EMCN、OSX+、RUNX2+蛋白表达(P<0.01,P<0.05),促进H型血管的生成,提高p-EGFR、p-PI3K、p-Akt蛋白表达(P<0.01,P<0.05)。结论藁本内酯能增加去势大鼠骨组织H型血管的表达,减轻骨小梁的破坏、改善骨微结构,EGFR介导的PI3K/Akt信号通路可能是其发挥生物学效应的关键途径。