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关键词： 清心莲子饮   网络药理学   分子对接   肾性蛋白尿  

摘要： 目的采用网络药理学和分子对接技术探讨清心莲子饮治疗肾性蛋白尿的潜在作用机制。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等及相关文献,获取清心莲子饮复方活性成分及作用靶点;通过GeneCards等获取肾性蛋白尿相关靶点。筛选复方治疗疾病的活性成分及作用靶点,用Cytoscape 3.9.0软件构建“复方-成分-靶点-疾病”相互作用网络,构建PPI网络并筛选核心靶点,对关键靶点进行基因本体论(GO)富集及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。最后,将复方关键成分和核心靶点进行分子对接。结果通过构建相互作用网络发现,复方中118个活性成分可作用于疾病相关的144个靶点,其中槲皮素等成分是关键药效成分。筛选得到核心靶点5个,包括TP53等。GO富集分析得到条目2409个,KEGG分析得到条目183个。分子对接结果显示,关键成分和关键靶点均能实现自发结合。结论复方清心莲子饮中,槲皮素等活性成分可能通过PI3K/Akt等信号通路实现对疾病的治疗。

关键词： 人参-当归   药对   网络药理学   分子对接   缺血性脑卒中  

摘要： 目的:基于分子对接技术及网络药理学拓扑分析,探究人参-当归药对治疗缺血性脑卒中的可能机制。方法:使用中药系统药理数据库,收集人参和当归的化学成分,并在Uniprot中进行基因定位;并分析GeneCards、OMIM、TTD和DisGeNET数据库中与缺血性脑卒中相关的靶点,将其与药物作用靶点进行映射,并利用STRING和Cytoscape构建蛋白互作网络,以更好地检索关键靶蛋白;通过生物功能和通路富集分析,更深入地研究关键靶点蛋白,并使用R-studio将结果可视化。最后,借以分子对接筛选出人参-当归有效成分中与核心治疗靶点结合能力较强的化学成分。结果:发现人参-当归中含有22种化学成分,已探明靶点有110个。缺血性脑卒中相关靶点有2157个,关键靶蛋白54个。蛋白互作拓扑网络包含AKT-1、TNF等关键靶蛋白。通路富集分析发现122条相关通路,其中包括AGE-RAGE等,均与缺血性脑卒中有着密切的联系(P<0.05)。分子对接筛选到β-谷甾醇、豆甾醇等成分与AKT-1、NOS3和MAPK8有强烈结合能力。结论:人参-当归可以与AKT-1、NOS3等靶点相互作用,参与调节多种生物学反应,包括抗炎、抗氧化应激等,从而预防和治疗缺血性脑卒中。

关键词： 清热凉血方   寻常型银屑病   网络药理学   分子对接   分子机制  

摘要： 目的探讨清热凉血方治疗寻常型银屑病的分子机制。方法通过本草组鉴数据库、中国知网、PubChem、Swiss Target Prediction、UniProt数据库检索清热凉血方的活性成分和靶点;通过GeneCards、Therapeutic Target Database、DrugBank、phramGKB、OMIM数据库检索疾病靶点;绘制维恩图,筛选方剂与疾病的共有靶点;利用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape3.9.1软件筛选方剂治疗疾病的核心靶点;利用Cytoscape 3.9.1软件构建药物-活性成分-共有靶点网络,筛选度中心性排名前10的主要活性成分,并结合文献预测关键成分;通过Metascape数据库和RStudio的clusterProfiler包对共有靶点分别进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用Cytoscape 3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点-通路网络,选取与PPI网络共有的靶点,并结合相关文献,筛选关键靶点。利用AutoDock 1.5.7软件对关键成分和关键靶点进行分子对接验证。结果共获得80种活性成分及449个靶点、1122个疾病靶点、115个共有靶点。共获得MAPK1、RELA、JAK2等10个核心靶点。关键成分包括槲皮素、山柰酚、常春藤苷元、黄芩素。GO功能富集分析获得生物学过程1904条、细胞组分56条和分子功能155条,包括炎性反应、激素反应、脂质结合等;KEGG通路富集分析获得8条主要路径,包括PI3K-Akt、HIF-1、IL-17信号通路等。关键靶点包括IL-6、VEGFA、TNF、EGFR。分子对接结果证明4种关键成分与其相应关键靶点均有较好的结合活性(≤5 kJ/mol)。结论清热凉血方治疗寻常型银屑病具有多成分-多靶点-多通路的特点,其作用机制可能与免疫、氧化应激、能量代谢等有关。

关键词： 网络药理学   桫椤叶   分子对接   非小细胞肺癌   药效成分  

摘要： 本研究基于网络药理学与分子对接的方法,探讨桫椤叶活性成分可能作用于非小细胞肺癌治疗的药效物质基础、潜在靶标及作用机制。通过文献调研与数据库筛选,构建药物-疾病共同靶点,数据分析可视化后,寻找药物作用非小细胞肺癌的核心靶点以及信号通路机制,最后进行分子对接进行结合能评估。前期实验室研究以及文献检索获得桫椤叶中6种核心有效成分:山奈酚、β-谷甾醇、牡荆素、异荭草素、咖啡酸和原儿茶酸,其中筛选药物治疗相关靶点544个,筛选出治疗非小细胞肺癌相关靶点381个,药物-疾病共同靶点82个。预测分析得到5个核心靶点蛋白SRC、STAT3、EGFR、ATK1和PTGS,通过分子对接发现主要靶点SRC、EGFR、ATK1和PTGS可能是药物与靶点相互作用发挥治疗非小细胞肺癌的作用。本研究揭示了桫椤叶通过调控多靶点、多途径发挥对非小细胞肺癌的治疗作用,为桫椤叶的研究和应用奠定了基础。

关键词： 转录组学   网络药理学   免疫应激   肉鸡   中药预测  

摘要： 为了基于转录组学和网络药理学方法揭示肉鸡免疫应激的可能发生机制,并进行有效中药的预测。本试验将8只红羽肉鸡随机分成对照组和模型组[注射脂多糖(LPS)诱导免疫应激],采用转录组学技术筛选差异表达基因;通过STRING数据库将差异表达基因构建蛋白-蛋白互作网络,应用MCODE和CytoHubba插件筛选网络中显著模块和关键靶点;分别利用DAVID和Metscape数据库对关键靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;应用Coremine Medical数据库预测作用于关键靶点的中药。结果显示,共获得129个差异表达基因,利用Cytoscape插件筛选出15个关键靶点,主要富集于蛋白质折叠,对内质网应激的反应,内质网中的蛋白质加工,脂肪酸降解(β-氧化),缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解以及过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等;有效中药预测结果显示,补益药和清热药可能是预防和治疗肉鸡免疫应激的有效中药。肉鸡免疫应激核心靶点的预测和分析揭示了肉鸡免疫应激的发病机制,内质网应激和脂肪酸代谢调控网络失衡可能是肉鸡免疫应激发生发展中的关键环节。本试验结果为养殖过程中肉鸡免疫应激的防治提供了参考依据。

关键词： 失眠症   落花生枝叶   花生脯呤   网络药理学   神经递质   炎症因子  

摘要： 目的 基于网络药理学和动物实验探究落花生Arachis hypogaea枝叶(PSL)治疗失眠症的作用机制。方法 借助数据库和在线平台筛选PSL活性成分及其靶点,以及失眠症相关靶点,利用Venny 2.1.工具获取PSL与失眠症交集靶点,并通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析。利用Cytoscape 3.9.1软件进行拓扑分析筛选出核心靶点,并对核心靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。通过构建对氯苯丙氨酸(parachlorophenylalanine,PCPA)诱导的失眠大鼠模型对网络药理学结果进行体内实验验证。结果 网络药理学结果表明PSL治疗失眠症可能与丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine-protein kinase 1,AKT1)、多巴胺D1受体(dopamine receptor D1,DRD1)、多巴胺D2受体(dopamine receptor D2,DRD2)、γ-氨基丁酸A型受体1(γ-aminobutyric acid receptor A1,GABRA1)等靶点以及血清素能突触、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,c AMP)信号通路、谷氨酸能突触、多巴胺能突触及胆碱能突触等通路相关。动物实验结果显示,PSL显著减少失眠大鼠的运动距离、运动速度和运动时间(P<0.01),增加静止时间(P<0.01),使其运动轨迹有序,从而改善大鼠的失眠以及焦虑样行为;PSL能够改善大鼠海马神经元病理形态,显著上调下丘脑中5-羟色胺(serotonin,5-HT)、γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)、GABA/谷氨酸(glutamic acid,Glu)水平以及γ-氨基丁酸A型受体α1(γ-aminobutyric acid receptor Aα1,GABAAα1)、AKT1的表达(P<0.05、0.01、0.001),并显著下调下丘脑中Glu、多巴胺(dopamine,DA)水平及DRD1表达和血清中肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)水平(P<0.05、0.01)。结论 PSL可能通过调节5-HT、Glu、GABA和DA等神经递质以及AKT1、TNF-α、IL-1β等炎症物质,从而治疗失眠症。

关键词： 药理学   康复医学   成绩分析  

摘要： 采用教育测量学方法分析某医科大学2022级康复物理治疗、康复作业治疗、听力与言语康复学3个专业学生的药理学期末考试成绩。结果表明,3个不同康复医学专业的药理学期末考试成绩总体分数偏低,成绩呈左偏态分布,平均分为53.34分,标准差为15.64,及格率为58.04%,优秀率为1.40%。分析发现,该试卷具有分析价值,本次药理学期末考试难度适中、区分度良好,为进一步完善康复医学相关专业药理学教学提供参考。

关键词： 苏杏痰咳合剂   慢性阻塞性肺疾病急性加重期   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:采用网络药理学方法研究苏杏痰咳合剂治疗慢性阻塞性肺疾病急性加重期(Acute Exacerbation of Chronic Obstructive Pulmonary Disease,AECOPD)的主要活性成分与作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索苏杏痰咳合剂组方中药物的主要活性成分及其作用靶点,应用GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank数据库检索AECOPD治疗靶点,运用Venny 2.1工具获取活性成分与治疗AECOPD的交集靶点,利用STRING平台进行蛋白质-蛋白质相互作用分析并获取核心靶点,运用Cytoscape 3.8.2软件构建中药-活性成分-靶点-疾病网络图及蛋白质-蛋白质相互作用网络图,通过MetaScape数据库对核心靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后将网络中度值较高的10种活性成分与核心靶点利用AutoDock 4.2.6软件进行分子对接。结果:筛选出苏杏痰咳合剂主要活性成分227个、作用靶点243个,以及AECOPD靶点3242个,二者的交集靶点有186个。对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,发现肿瘤蛋白P53(Tumor Protein P53,TP53)、JUN原癌基因(Jun Proto-oncogene,JUN)、α-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(RAC-alpha Serine/Threonine-protein Kinase,AKT1)、信号转导因子和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)为苏杏痰咳合剂治疗AECOPD的核心靶点。核心靶点GO功能富集和KEGG通路富集分析结果提示苏杏痰咳合剂发挥治疗AECOPD作用的机制与药物化学反应、氧化反应、DNA结合转录等生物学过程以及晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Advanced Glycation End Product Receptor,RAGE)、癌症、炎症等信号通路有关。分子对接结果显示各活性成分与核心靶点均可进行自发结合。结论:苏杏痰咳合剂通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗AECOPD的作用,作用机制可能与通过TP53、JUN、AKT1、STAT3等靶点干预AGE-RAGE、癌症、炎症等信号通路有关。

关键词： 桃红四物汤   肺动脉高压   网络药理学   GO功能富集分析   KEGG通路富集分析   分子对接  

摘要： 目的:利用网络药理学分析桃红四物汤治疗肺动脉高压的机制,并以分子对接进行验证。方法:在中草药系统药理学平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)数据库中检索桃红四物汤药物活性成分筛选靶基因;以“pulmonary hypertension”为关键词在Genecards、OMIM、Drugbank数据库中检索疾病相关基因;获取药物-疾病共同基因;绘制蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction network,PPI)并获取关键基因;利用R3.5.2软件对共同基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析;选取有效成分和关键基因,利用Autoduck软件进行分子对接。结果:桃红四物汤有143个有效活性成分,127个靶点;肺动脉高压靶基因5729个,药物-疾病共同基因111个,筛选白细胞介素-6、血管内皮生长因子A、丝裂原活化蛋白激酶8等15个关键基因,GO功能富集分析和KEGG通路富集分析主要富集在氧化应激反应、磷脂肌醇-3激酶(phosphoinositide-3 kinase,PI3K)-蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又称AKT)、肿瘤坏死因子等信号通路中。分子对接结果,槲皮素、木犀草素、芍药苷作用于白细胞介素-6和血管内皮生长因子。结论:桃红四物汤能够通过槲皮素、木犀草素等成分作用于白细胞介素-6、血管内皮生长因子,调控PI3K-Akt、肿瘤坏死因子等信号通路,抑制炎症反应,抑制内皮细胞增生,延缓血管重塑治疗肺动脉高压。

关键词： 壮肝逐瘀煎   肝纤维化   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学及分子对接探讨壮肝逐瘀煎治疗肝纤维化的潜在靶点和作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台、BATMAN-TCM数据库筛选出壮肝逐瘀煎的活性成分及其对应靶点。采用Disgenet、GeneCards及OMIM数据库预测肝纤维化相关靶点,聚焦共同靶标,得到壮肝逐瘀煎治疗肝纤维化的关键靶点,将获得的关键靶点导入STRING数据库进行分析,并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,通过Cytoscape 3.8.0软件可视化。通过Metascape数据库对关键靶点进行基因本体论(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用AutoDock Vina软件进行分子对接验证,并用PyMOL软件对结果进行可视化处理。结果:网络药理学分析表明,壮肝逐瘀煎治疗肝纤维化的核心药物活性成分有槲皮素、木犀草素、维生素D_(3)、山柰酚、柚皮素、黄芩苷,核心靶点有白细胞介素(Interleukin,IL)-6、IL-1β、肿瘤坏死因子、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、表皮生长因子受体,主要通过磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B、缺氧诱导因子-1、IL-17等信号通路作用于肝纤维化。分子对接验证结果提示,核心靶点与核心药物活性成分具有较强的结合力。结论:本研究初步揭示了壮肝逐瘀煎治疗肝纤维化的有效成分和可能的作用机制,为深入研究壮肝逐瘀煎的药效物质基础、作用机制及临床应用提供了科学参考。