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关键词： 白癜风   蒺藜   旱莲草   数据挖掘   用药规律   网络药理学   禤国维  

摘要： 【目的】利用数据挖掘技术深层次探究国医大师禤国维教授治疗白癜风的药物配伍原则,并通过网络药理学分析其核心药对的潜在作用机制。【方法】整理禤国维教授治疗白癜风的原始医案,再用中医传承辅助平台软件,采用关联规则方法,确定处方中药物频次、药物之间的关联规则和核心组合等,根据数据挖掘结果得出禤国维教授治疗白癜风的核心药对,再利用网络药理学方法对核心药对的作用机理进行分析讨论。【结果】收录处方243首,其中高频次药物为甘草、蒺藜、旱莲草、菟丝子、玄参、白芷等,核心药对为蒺藜-旱莲草。蒺藜-旱莲草治疗白癜风的主要成分为槲皮素、山奈酚等,活性成分与疾病交集靶点47个,其中TP53、TNF、IL-1β、CASP3、VEGFA、PTGS2、IL10、IL2、IFNG、IL4可能是蒺藜-旱莲草治疗白癜风的核心靶点。蒺藜-旱莲草药对对抗疾病的主要通路有PI3K-Akt信号通路、NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路、MAPK信号通路等。【结论】禤国维教授治疗白癜风的核心药对是蒺藜-旱莲草,涉及的靶点有TP53、TNF、IL-1β、CASP3、VEGFA、PTGS2、IL10、IL2、IFNG、IL4等,可能是通过PI3K-Akt信号通路、NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路、MAPK信号通路等起作用。

关键词： 网络药理学   分子对接   芹菜素   胃癌  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接技术结合CCK8法、细胞划痕、细胞侵袭、平板克隆形成实验探讨芹菜素治疗胃癌作用。方法:本文通过ChEMBL、UniProt、GeneCards等数据库及jvenn获得芹菜素治疗胃癌的潜在靶点,结合蛋白质相互作用(PPI)分析,基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析进行作用机制探讨,进一步采用Auto dock软件进行分子对接,最后通过细胞增殖与毒性实验(Cell counting kit-8,CCK8)验证芹菜素对胃癌细胞的抑制作用。结果:芹菜素治疗胃癌潜在作用靶点为52个;GO分析表明,芹菜素抗胃癌机制可能与调节信号传导、化学突触传递、蛋白水解等有关;KEGG分析发现其通过调节神经活性配体-受体相互作用、氮代谢等信号通路发挥抗癌作用;分子对接结果显示配体和受体的结合能为ACHE|-9.1|>MAOA|-8.8|>CA2|-7.4|>DPP4|-7.3|>CA1|-7.2|=GRM5|-7.2|>ADA|-6.8|>CASP3|-5.8|,表明配体和受体具有良好的结合性。体外实验表明,芹菜素对胃癌细胞系有明显的抑制作用,其可能是通过降低MAOA、DPP4、AChE的表达,升高CA2的表达对胃癌起到抑制作用。结论:芹菜素具有抗胃癌的作用,其发挥作用涉及到的主要靶点有AChE、CA1、CA2、CASP3、ADA、MAOA、DPP4、GRM5,展现了芹菜素多成分、多靶点、多途径的优点,为后续研究芹菜素抗胃癌作用提供参考。

关键词： 糖尿病视网膜病变   蒲黄   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学方法探讨蒲黄治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的作用机制。方法:运用中药系统药理分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)提取蒲黄的活性成分及对应靶点,借助UniProt数据库对靶点进行规范化,通过GeneCards数据库和OMIM数据库获取DR的相关靶点,并利用R语言筛选药物与疾病的交集靶点。通过Cytoscape软件构建蒲黄“活性成分-疾病靶点”可视化调控网络,利用STRING数据库构建蛋白互相作用网络,并借助Bioconductor平台进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集通路分析。结果:共获得蒲黄6个活性成分,药物与疾病127个交集靶点,核心靶点包含蛋白激酶B、血管内皮生长因子A、肿瘤蛋白53等;GO功能富集分析涉及转录因子活性、酶活性、受体活性及生物化学过程调控等过程,KEGG通路富集分析涉及动脉粥样硬化、AGEs-RAGE等通路。结论:蒲黄中的槲皮素等活性成分作用于Akt1等疾病靶点,参与酶结合、应激反应等生物学功能调控AGEs-RAGE等信号通路,从而治疗DR。

关键词： 石南藤   墙草碱   镇痛   网络药理学   胆碱能神经元  

摘要： 目的探究石南藤镇痛活性成分的作用机制。方法采用网络药理学方法筛选石南藤镇痛相关的核心靶点,利用DAVID数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。经硅胶柱采用石油醚-乙酸乙酯分离系统体系梯度(95:5~50:50)洗脱石南藤阳离子洗脱液部位分离得墙草碱,用HPLC测定纯度。选择ICR小鼠随机分为空白组,阳性对照(阿司匹林120 mg·kg^(-1))组,模型组和墙草碱低、中、高剂量(150、300、600 mg·kg^(-1))值(均n=8),连续给药7 d,未次给药后,除空白组,各组按每10 g体重腹腔注射0.7%醋酸0.1 mL,考察各组小鼠扭体反应次数及潜伏期;ELISA法检测血清中肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-6、IL-1β的含量,检测脑组织中胆碱乙酰转移酶(ChAT)、乙酰胆碱(ACh)、乙酰胆碱酯酶(AChE)的浓度。结果网络药理学结果显示,石南藤筛选出墙草碱、风藤酰胺等核心成分;富集到关键通路有神经信号传导通路、胆碱能突触通路等。分离墙草碱纯度为90.42%。动物实验显示,与模型组比较,墙草碱低、中、高剂量组扭体次数显著减少(P<0.05),血清中TNF-α、IL-6、IL-1β含量显著降低(P<0.01);墙草碱三个剂量组脑组织中ChAT显著升高(P<0.01),中、高剂量组ACh浓度显著增加(P<0.01),低、中、高剂量组AChE浓度显著降低(P<0.05)。结论石南藤镇痛发挥镇痛的关键活性成分是墙草碱,通过上调ChAT、ACh活性和下调AChE参与胆碱能突触通路,减少疼痛。

关键词： 老年2型糖尿病合并肌少症   金匮肾气丸   网络药理学   分子对接   IL-17信号通路  

摘要： 目的:基于网络药理学及分子对接探讨金匮肾气丸(JKSQW)治疗老年2型糖尿病合并肌少症的作用机制。方法:利用基因表达综合数据库(GEO)下载肌少症和2型糖尿病的数据集,取交集获得老年2型糖尿病合并肌少症的相关靶点。利用中药系统药理学(TCMSP)数据库筛选JKSQW的有效成分和靶点并可视化,与疾病靶点取交集后,导入STRING数据库,创建PPI网络图,采用Cytoscape_v3.9.1分析核心靶点,进行基因本体富集(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。最后采用AutoDock Tools 1.5.6软件进行分子对接。结果:筛选出JKSQW治疗老年2型糖尿病合并肌少症的靶点205个,关键成分为槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇等,可能通过白细胞介素(IL)6、肿瘤坏死因子(TNF)、IL1α、趋化因子CCL2、IL1β等核心靶点,参与糖尿病并发症和细胞衰老、癌症、脂质和动脉粥样硬化、IL-17和TNF等信号通路进行调控。分子对接结果显示豆甾醇、β-谷甾醇与IL6、TNF、CCL2、IL1β具有良好的结合能力。结论:JKSQW治疗老年2型糖尿病合并肌少症的作用机制可能与IL-17信号通路有关,而豆甾醇、β-谷甾醇与IL6、TNF、CCL2、IL1β靶点显示出良好的对接结果。

关键词： 肥胖   痰湿型   连陈汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨连陈汤治疗痰湿型肥胖的作用机制。方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取连陈汤有效活性成分及作用靶点。通过人类基因组数据库(GeneCards)、药物靶标数据库(TTD)和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIMO)获取疾病靶点。通过证候本体数据库及多维定量关联计算平台(SoFDA)获取痰湿型相关靶点。通过Cytoscape 3.10.1软件构建网络,拓扑分析筛选关键活性成分、核心靶点。使用微生信平台对潜在作用靶点进行基因主体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。利用AutoDockVina软件对成分和靶点进行分子对接。结果:获得连陈汤靶点148个、疾病靶点9958个、痰湿型靶点896个。将靶点取交集,获得潜在作用靶点106个。网络拓扑分析获得甘油、米桔素、穆坪马兜铃酰胺为关键活性成分。PPI网络分析筛选出MC4R、PPARG、FTO、GHRL等活跃的靶点。GO功能富集分析显示,包括生物学过程、细胞组件及分子功能3个部分。KEGG通路富集分析显示,靶点主要富集在胰岛素抵抗等相关通路。结论:连陈汤可能通过甘油、米桔素、穆坪马兜铃酰胺等关键活性成分作用于MC4R、PPARG、FTO、GHRL等核心靶点调控胰岛素抵抗通路、胰岛素信号通路等信号通路发挥治疗痰湿型肥胖的作用。

关键词： 芍药汤   溃疡性结肠炎   PPARG   NF-κB   网络药理学   分子对接   大鼠  

摘要： 目的:采用网络药理学、分子对接及动物实验探索芍药汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用机制。方法:检索芍药汤与UC的作用靶点,从而获取两者的交集靶点。基于蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,采用CytoNCA插件进行拓扑分析,筛选关键靶点。针对交集靶点进行京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。构建“活性成分-靶点-通路”网络以筛选核心靶点,最后进行分子对接验证。从40只大鼠中随机选取10只作为空白组,其余大鼠使用葡聚糖硫酸钠(dextran sulfate sodium,DSS)诱导UC模型。造模成功的大鼠随机分为模型组、芍药汤组(32 g·kg-1)、美沙拉秦组(0.5 g·kg-1),连续灌胃10 d。末次灌胃后,计算大鼠的疾病活动指数(disease activity index,DAI)评分及结肠血液流变学指标。采用HE染色观察结肠病理形态,ELISA法检测血清白细胞介素(interleukin,IL)-6、IL-1β、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)含量,Western blot法检测结肠核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(peroxisome proliferator activated receptor-γ,PPAR-γ或PPARG)表达水平。结果:芍药汤靶点262个,UC靶点2801个,两者的交集靶点169个。关键靶点包括基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase 9,MMP9)、PPARG、IL-6、信号转导和转录激活因子3(signal transducers and activators of transduction 3,STAT3)等。KEGG通路主要包括NF-κB信号通路、IL-17信号通路、趋化因子信号通路等。分子对接显示,活性成分与关键/核心靶点的结合能小于-5 kcal·mol^(-1)。动物实验显示,模型组大鼠DAI评分较空白组增加(P<0.05),经芍药汤组与美沙拉秦治疗后减少(P<0.05)。与空白组比较,模型组大鼠结肠血流灌注量、血细胞移动速度下降,移动血细胞浓度升高(P<0.05);芍药汤治疗后上述指标的趋势得到逆转(P<0.05)。HE染色显示,空白组大鼠结肠组织结构正常;模型组大鼠结肠黏膜溃疡,腺体缺损,伴有炎症细胞浸润;美沙拉秦组和芍药汤组大鼠结肠病理形态较模型组改善。模型组大鼠血清TNF-α、IL-6、IL-1β含量较空白组升高(P<0.05),芍药汤和美沙拉秦干预后降低(P<0.05)。与空白组比较,模型组大鼠结肠NF-κB蛋白表达水平升高,PPAR-γ蛋白表达水平降低(P<0.05);经芍药汤与美沙拉秦干预后上述蛋白的趋势被逆转(P<0.05)。结论:芍药汤可能通过调控NF-κB、IL-17等信号通路,作用于PPARG、IL-6、IL-1β等靶点,有效改善UC大鼠的症状。

关键词： 酸枣仁汤   体内化学成分   高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱法   网络药理学   质量标志物  

摘要： 目的研究酸枣仁汤进入体内的原型化学成分,利用网络药理学进行质量标志物(quality markers,Q-Marker)的预测分析,为经典名方酸枣仁汤的质量控制提供参考依据。方法首先大鼠灌胃给予酸枣仁汤,于给药后采集4 h的血样和24 h的尿样,检测血和尿中的原型化合物;然后基于进入体内的化学成分,利用网络药理学获得关键作用靶点及关键通路,绘制“成分-靶点-通路”网络图,以预测酸枣仁汤抗失眠、焦虑、抑郁的质量标志物。结果在大鼠体内共检测到20种原型化合物;通过网络药理学预测核心靶点23个,进入体内的14种原型成分酸枣仁皂苷A、甘草次酸、阿魏酸、木兰花碱、甘草素、异甘草素、茯苓酸A、斯皮诺素、乌药碱、知母皂苷BⅡ、甘草酸、酸枣仁皂苷B、甘草苷、洋川芎内酯A与之相关联,发挥多靶点调控失眠、焦虑、抑郁等通路的作用。结论通过分析体内原型化学成分结合网络药理学预测的14种化学成分可作为酸枣仁汤的潜在质量标志物,为酸枣仁汤的质量控制提供参考,同时也为阐明其药效物质的作用机制奠定基础。

关键词： 羊踯躅   指纹图谱   质量标志物   化学模式识别   网络药理学  

摘要： 目的 基于高效液相色谱-蒸发光散射检测器(HPLC-ELSD)和网络药理学筛选羊踯躅质量标志物(quality markers, Q-marker),比较羊踯躅不同部位、不同花期、不同产地Q-marker含量,挖掘羊踯躅潜在药用价值并推测其可能的作用机制。方法 采用HPLC-ELSD建立羊踯躅指纹图谱,进行聚类分析(hierarchical cluster analysis, HCA)、主成分分析(principal component analysis, PCA)、正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least squares discriminant analysis, OPLS-DA),利用网络药理学方法构建“成分-靶点-通路-药理作用-功效”网络图,并进行疾病预测,筛选羊踯躅的Q-marker并进行定量分析。结果 本研究建立了11批羊踯躅药材的指纹图谱,共标定10个共有峰,经分析得到4个差异性成分,预测闹羊花毒素-Ⅲ、闹羊花毒素-Ⅱ、金丝桃苷、槲皮苷为羊踯躅的Q-marker候选成分并进行网络药理学分析,涉及84个靶点蛋白,包括ATK1、TNF、INS等,作用于159条信号通路,对肿瘤、自身免疫性疾病、心血管疾病等存在潜在治疗作用。成分含量测定结果显示羊踯躅以盛开期花入药可能具有更好的疗效,并以S10产地最优。结论 通过化学模式识别、指纹图谱及网络药理学预测了羊踯躅的Q-marker,证明羊踯躅可通过多靶点、多途径治疗疾病,为完善建立羊踯躅质量控制标准及其对疾病治疗机制的进一步探索提供参考。

关键词： 网络药理学   壮骨止痛方   绝经后骨质疏松症  

摘要： 运用网络药理学方法,研究壮骨止痛方治疗绝经后骨质疏松症(postmenopausalosteoporosis,PMOP)的活性成分、作用靶点和分子通路,揭示壮骨止痛方治疗PMOP的分子机制。探讨在网络药理学的基础上将壮骨止痛方应用在绝经后骨质疏松症(postmenopausalosteoporosis,PMOP)中的分子机制。方法 使用数据库检索并筛选得到壮骨止痛方的活性成分靶点和PMOP靶点;交集得到共同靶点;构建“药物-成分-靶点”关系网络图对交集基因进行GO和KEGG富集分析。结果 壮骨止痛方中筛选出核心成分;治疗PMOP的重要靶点MAPK1和MAPK3;富集分析中,结果 以及KEGG的结果表明,壮骨止痛方能够对该过程的细胞组成以及分子功能等产生重要影响,并且其功能主要体现在动脉粥样硬化等信号通路。结论 壮骨止痛方多成分、靶点及通路可共同作用来改善PMOP患者的骨密度,为临床疗效提供理论依据。