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关键词： 青蒿素   宫颈癌   网络药理学   分子对接   实验验证  

摘要： 目的利用网络药理学、分子对接技术和实验研究青蒿素对宫颈癌的潜在治疗机制。方法用Pub Chem、GeneCards数据库获得青蒿素治疗宫颈癌的潜在靶点,并将其导入String数据库、利用Cytoscape3.6.1软件筛选出核心靶点;再利用David数据库进行GO富集分析和KEGG通路分析;用TCMSP、PDB蛋白数据库和Autodock Vina1.1.2软件完成分子对接并计算亲和力;最后用qPCR检测核心基因mRNA表达水平。结果通过数据库分析得到青蒿素治疗宫颈癌的潜在靶点35个,用Cytoscape3.6.1软件筛选出7个核心靶点分别为EGFR、HSP90AA1、MAP2K1、MAPK14、CCNE1、JAK1、PDGFRB,通过GO和KEGG分析,这些靶点可能与EGFR介导的JAK1通路有关。分子对接结果提示青蒿素与核心靶点EGFR、HSP90AA1和JAK1之间可能存在很好的结合作用和匹配度。体外实验验证了青蒿素能抑制EGFR、JAK1基因的转录,这说明与网络药理学预测结果一致,青蒿素对宫颈癌的抑制作用可能与抑制EGFR通路有关。结论本研究阐明了青蒿素治疗宫颈癌的潜在治疗靶点和机制,为宫颈癌临床治疗提供新的思路。

关键词： 消包丸   包虫病   网络药理学   分子对接  

摘要： 研究旨在利用网络药理学和分子对接技术,深入分析消包丸治疗包虫病的分子作用机制。试验通过检索中药系统药理学数据库与分析平台和相关文献资料,对消包丸中的主要活性成分及其可能的作用靶点进行了筛选和预测;借助人类基因数据库、疾病相关基因数据库和药物靶标数据库等检索包虫病相关靶点,并用蛋白质数据库查询靶点对应的基因,筛选出消包丸与包虫病共同的作用靶标;借助STRING数据库构建PPI网络以挖掘潜在蛋白质,使用网络拓扑参数分析筛选关键靶点蛋白。使用分子对接软件对结合活性最强的活性成分进行分子对接验证;用富集分析在线工具进行基因本体分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析,进一步阐明了“药物-活性成分-靶点-疾病-信号通路”的生物过程及相互作用。结果显示,消包丸治疗包虫病涉及46个作用靶点,其中关键活性成分包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、异鼠李素和黄芪熊竹素,具有高度结合能力和显著的生物活性。在生物过程通路方面,消包丸主要影响包括Th17细胞分化、弓形虫病和癌症中的蛋白聚糖等信号通路,功能集中在调节炎症细胞因子、免疫机制以及直接对寄生虫的作用。研究表明,消包丸治疗包虫病具有直接的抗寄生虫效果,可增强免疫力和减轻炎症反应来提升机体的整体健康状况。

关键词： 脊髓损伤   黄芪   当归   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:联合网络药理学和分子对接技术探究黄芪-当归治疗脊髓损伤的机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台查找黄芪-当归的活性成分,利用Swiss Target Prediction、TCMSP数据库筛选成分对应的靶点;采用GeneCards和OMIM数据库查找脊髓损伤相关靶点;运用软件venny2.1取两者交集,得到治疗SCI的潜在靶点。利用Cytoscape构建“药物-成分-靶点-疾病”网络;运用STRING数据库建立蛋白质互作网络,并通过Cytoscape-CytoNCA筛选核心靶点。通过Metascape平台对靶基因进行GO和KEGG信号通路分析,最后运用AutoDockVina验证关键活性成分与核心靶点间的结合能力。结果:共得到黄芪-当归药对22个活性成分,219个脊髓损伤相关靶点。分子网络显示华良姜素(Jaranol)、槲皮素(quercetin)、7-Omethylisomucronulatol、3,9-di-O-methylnissolin、白桦脂酸(Mairin)、山奈酚(kaempferol)等是主要的活性成分,TP53、AKT1、ESR1、SRC、JUN、EGFR等为核心靶点,黄芩-当归可能通过PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路及细胞凋亡等相关信号通路,参与调控蛋白激酶活性、转录因子结合等生物学途径发挥治疗SCI的作用。结论:黄芪-当归可能通过调控SCI后的细胞凋亡等相关途径发挥治疗脊髓损伤的作用。

关键词： “黄芪-玉竹-灵芝”配伍   慢性支气管炎   代谢组学   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用血清代谢组学、网络药理学及分子对接技术探讨“黄芪-玉竹-灵芝”(HYL)配伍治疗慢性支气管炎(CB)的作用机制。方法采用烟熏法建立SD大鼠CB模型,将模型成功大鼠随机分为模型组、阳性药(盐酸氨溴索分散片0.92 mg·kg^(−1))组和HYL高、中、低剂量(10.71、3.57、1.19 g·kg^(−1))组,运用酶联免疫吸附法(ELISA)测定大鼠血清中炎症因子白细胞介素8(IL-8),肿瘤坏死因子(TNF-α),一氧化氮(NO)、肺组织中P物质(SP)的表达水平。运用UPLC-Q/TOF-MS/MS技术对大鼠血清代谢谱进行分析,筛选差异代谢物及相关代谢通路;采用网络药理学,构建HYL治疗CB的“成分-靶点-通路-疾病”图。采用分子对接法验证活性成分与核心靶点的相互作用。将血清代谢组学与网络药理学联合分析,构建“靶点-代谢途径-代谢物”网络图。结果与对照组比较,模型组大鼠血清中IL-8、TNF-α及SP水平显著降低,血清中NO水平升高;通过代谢组学技术,从血清中筛选出20个差异代谢物,与模型组相比,HYL能回调这些差异代谢物水平。筛选出5条关键代谢途径(细胞色素P450、叶酸合成、鞘脂代谢、类固醇激素生物合成、戊糖和葡萄糖醛酸相互转化)。网络药理学分析表明,HYL治疗CB主要作用于PIK3CA、MAPK3、MAPK1等靶点蛋白,与癌症通路、脂质与动脉粥样硬化等信号通路密切相关。整合分析显示细胞色素P450和类固醇激素生物合成代谢是HYL治疗CB的关键代谢途径。结论HYL可通过调节血清代谢物调控炎症相关核心靶点基因,降低炎症水平,缓解机体代谢紊乱发挥治疗CB的作用。

关键词： 新型冠状病毒感染   肺纤维化   中药组方预测   逆向网络药理学   分子对接  

摘要： 目的探讨新型冠状病毒感染(新冠感染,COVID-19)后肺纤维化的发病机制,并基于逆向网络药理学思维进行中药组方预测。方法于Genecards数据库获取COVID-19和PF的靶点取交集得出二者共有靶点后,通过String平台进行蛋白互作网络分析,运用Cytoscape软件计算Degree值以确定关键靶点,而后进行GO和KEGG富集分析以明确发病机制与通路。关键靶点通过Uniprot数据库转换后于TCMSP数据库逆向收集中药成分,选用度值较高的靶点与有效成分进行分子对接验证,再由有效成分收集对应中药,构建关键靶点-有效成分-中药网络,确定度值较高中药并整理其性、味、归经。结果共获取142个COVID-19与PF的共有靶点,保留度值较高的50个关键靶点,其中有32个关键靶点能于TCMSP数据库中匹配到中药成分化合物信息,筛选后有18个关键靶点匹配到31种有意义的中药成分,以度值最高的4个靶点蛋白与度值≥3的7种中药成分进行28次分子对接验证,结果稳定且良好。GO富集分析主要得出炎症反应、血管系统发育的调节等生物过程,KEGG富集分析显示冠状病毒病-新冠肺炎、Th17细胞分化、HIF-1信号通路、IL17信号通路等信号通路。逆向收集到287种中药,其中度值≥3的73种中药以寒性药、苦味药居多,其次为温性药、辛味药,并且肝、肺经居多,度值≥6的中药分别为苦参、连翘、木蝴蝶、山豆根。结论运用逆向网络药理学思维及分子对接技术对新冠感染后肺纤维化进行靶点、通路、成分和中药预测,为今后临床辨证论治中药组方拓宽思路。

关键词： 淫羊藿-骨碎补   肾性骨病   网络药理学   作用机制   分子对接  

摘要： 本研究采用网络药理学和分子对接技术,探讨肾性骨病(ROD)即慢性肾脏病矿物质和骨代谢紊乱(CKD-MBD)与中药复方药品“淫羊藿-骨碎补”(YG)的相关作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库(TCMSP),筛选目标药物的活性因子及基因靶点,并根据口服生物利用度和药物相似度筛选得到有效数据。通过疾病基因数据库如GeneCard、PharmGkb、Disgent、TTD等筛选肾性骨病的基因靶标。使用维恩图交集体现药物与疾病共同靶基因,并构建“药物活性成分-基因靶标-肾性骨病”可视化交通网络图。通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用GO功能富集分析和KEGG信号通路分析研究核心靶点数据,揭示其主要生物活动过程。通过AutoDockTools软件将目标药物的活性成分与核心靶点进行分子对接验证有效结合度。结果 中药复方共筛选得到有效活性成分39个,相关靶点115个,基因数据库获得肾性骨病相关靶点6946个,中药活性成分-疾病核心靶点共99个,GO功能富集分析显示药物的有效分子生物功能主要涉及核受体活动、DNA结合转录因子结合及配体激活的转录因子活性等,KEGG通路分析显示药物治疗肾性骨病的潜在信号通路主要包括AGE-RAGE、脂质和动脉粥样硬化、TNF等通路。分子对接结果验证了“淫羊藿-骨碎补”中的有效活性成分与IL6、ESR1靶点能较好对接。结论 该研究初步揭示了“淫羊藿-骨碎补”复方治疗肾性骨病表现为“多成分-多靶点-多通路”的协同治疗模式,与传统药理学生物实验相比另辟蹊径,为中药复方治疗临床疾病的研究提供了新的理论依据和思路。

关键词： “药理学”课程   “双线混融”教学   新医科  

摘要： 文章首先分析了新医科背景下“药理学”课程“双线混融”教学的困境,然后提出了新医科背景下“药理学”课程“双线混融”教学的优化策略,包括教学组织与实施和教学优化建议两个方面。

关键词： 药理学   课程思政   教学改革   思政元素  

摘要： 药理学是医与药的良好思政融合载体,然而,在药理学课程思政的实施过程中,目前主要存在两点不足:一是"蜻蜓点水"式片面地把思政元素加入课程;二是"喧宾夺主"式直接把专业课上成思政课.如何发掘药理课程中的思政元素,并恰当地把思政元素融入专业知识中成为亟待解决的问题.文章提出了线上线下混合模式的创新课程体系,深度挖掘思政素材,并对相关知识点进行思政渗透,春风化雨,润物无声.