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关键词： 网络药理学   补中益气汤   慢性心力衰竭   分子对接   信号通路  

摘要： 目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨补中益气汤治疗慢性心力衰竭(CHF)的作用机制。方法 运用TCMSP、TCM-MESH、ETCM筛选补中益气汤的主要活性成分,通过Genecards、OMIM、Disgenet、TTD数据库获取CHF相关靶点。构建中药-疾病-有效成分-靶点网络,筛选中药核心成分。构建补中益气汤-CHF预测靶点的蛋白互作关系,筛选出核心靶点并进行GO和KEGG富集分析以及分子对接。结果 共获得135个活性成分,200个药物靶点,1 792个CHF靶点,104个交集基因。中药核心成分为槲皮素、山奈酚、柚皮苷、川陈皮素。核心靶点为AKT1、TNF、IL-6、IL-1β。GO分析主要富集于对激素的反应、细胞对细胞因子刺激的反应、激酶结合蛋白、蛋白质同源二聚化活性、脂筏、质膜蛋白复合物等。KEGG主要通路为癌症的信号转导通路、脂质和动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路。分子对接结果显示核心成分与核心靶点蛋白结合良好。结论 补中益气汤治疗慢性心力衰竭的作用机制,可能与其4个核心成分作用于AKT1、TNF、IL-6、IL-1β核心靶点,调控多个通路,起到抑制炎症、调节糖脂代谢和免疫反应等作用有关。

关键词： 升陷汤   肺癌   作用机制   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学及分子对接技术探究升陷汤干预肺癌的活性成分、作用靶点及可能作用机制,并通过体外试验进行初步验证。方法:通过TCMSP数据库与文献筛选升陷汤的化合物,运用GeneCards、OMIM和Drugbank数据库获取肺癌相关靶点。使用Cytoscape构建“升陷汤-活性成分-潜在作用靶点”网络,拓扑分析获得关键化合物。利用STRING构建升陷汤-肺癌靶点PPI网络,MCODE cluster识别升陷汤的核心靶点。Metascape对核心靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。Autodock进行分子对接验证。开展细胞试验测定升陷汤含药血清对A549细胞增殖、侵袭和凋亡的影响,Western blot、qRT-PCR检测关键通路蛋白和基因的表达。结果:确定了升陷汤活性成分76种,与肺癌关联靶点142个,主要活性成分为槲皮素、山奈酚、豆甾醇、木犀草素和异鼠李素。PPI确定了AKT1、IL-6、VEGFA、JUN和IL-1β等20个核心靶标。GO和KEGG通路富集分析提示,升陷汤抗肺癌的机制涉及细胞凋亡、细胞增殖、细胞周期、DNA转录、PI3K-Akt、NF-κB和VEGF信号通路等。分子对接结果表明,这些化合物与AKT1之间具有很强的结合力和稳定性。体外试验结果表明,升陷汤能有效抑制肺癌A549细胞的增殖、侵袭水平,并促进其凋亡。RT-qPCR结果显示,与空白对照组比较,升陷汤含药血清高、中、低剂量组均能显著下调PI3K,AKT mRNA的表达(P<0.01),Western blot结果显示,升陷汤含药血清高剂量组能显著下调A549细胞p-PI3K、p-AKT蛋白的表达水平(P<0.01)。结论:升陷汤可能通过调控PI3K/AKT信号通路,有效抑制肺癌细胞的增殖、侵袭,促进其凋亡,发挥抗肺癌作用,为后续效用机制验证及临床应用提供参考。

关键词： 老年   葛根芩连汤   肾纤维化   网络药理学   转化生长因子β1   上皮--间质转化  

摘要： 目的 通过网络药理学结合体外细胞实验探究葛根芩连汤治疗肾纤维化的潜在作用。方法 借助本草组鉴(HERB)、 PubChem数据库、 SwissADME平台及SwissTargetPrediction数据库获取葛根芩连汤的主要活性成分及作用靶点,利用DisGenet数据库获得肾脏纤维化相关的靶点基因。同时通过蛋白质免疫印迹法(WB)检测TGF-β1表达。利用RT-qPCR法检测Bcl-2、 STAT3和FN1表达。结果 筛选并得到葛根芩连汤与肾纤维化的共同作用靶点157个。GO/KEGG富集分析筛选GeneRatio在前15名的细胞成分、生物过程、分子功能和信号通路,这些靶点主要参与各种氧化应激反应,并通过MAPK信号通路和P13K-Akt信号通路调控细胞增殖和凋亡。体外实验证明葛根芩连汤含药血清干预可降低TGF-β1诱导HK-2细胞TGF-β1、 STAT3和FN1的表达,同时提高Bcl-2的表达水平。结论 葛根芩连汤改善肾脏纤维化可能与抑制TGF-β的表达以减少EMT发生,同时通过上调凋亡相关基因Bcl-2的表达、抑制STAT3的表达从而阻断细胞凋亡以减轻或逆转炎症状态有关。

关键词： 胃癌   复方川芎嗪   MPO   ELANE  

摘要： 目的利用网络药理学,结合基因功能注释及临床数据分析,探索复方川芎嗪在胃癌中的潜在作用位点以及机制。方法首先利用SwissTargetPrediction数据库筛选复方川芎嗪的潜在药物作用位点,并结合OMIM和Genecard数据库获取胃癌相关靶点。通过交集分析确定潜在的治疗靶点。随后,利用ClusterProfiler的方法对交集下游靶点进行功能注释。同时,利用TCGA数据库获取胃癌患者的原始数据,进行免疫浸润分析、miRNA分析、关键基因的转录调控分析、基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、基因集差异分析(gene set variation analysis,GSVA)、nomogram模型构建以及全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)分析等。结果通过网络药理学筛选,共发现川芎嗪作用于胃癌有14个潜在治疗靶点。功能注释结果显示,这些靶点主要涉及激素代谢、药物代谢和信号转导等通路。基于log rank检验,关键基因ELANE和MPO的表达在胃癌生存曲线的比较中,差异有统计学意义(P<0.05),并与免疫细胞浸润密切相关。此外,GSEA和GSVA结果提示,ELANE和MPO可能通过多条信号通路影响胃癌的发展。结论本研究通过综合多种分析方法,揭示了复方川芎嗪可能通过调节潜在靶点ELANE和MPO,以及相关的信号通路,对胃癌起治疗作用。

关键词： 活血通降方   网络药理学   分子对接   反流性食管炎   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学以及分子对接技术来研究活血通降方治疗反流性食管炎的分子靶点及作用机制。方法:通过检索TCMSP数据库获取活血通降方中7味中药相关化学成分和作用靶点;结合GeneCards数据库筛选反流性食管炎疾病主要靶点;利用Venny2.1软件筛选活血通降方活性成分与反流性食管炎的共同作用靶点;提交二者交集靶点至STRING平台,分析二者的蛋白质互作网络;利用DAVID平台对其进行基因本体(GO)分析和通路富集(KEGG)分析。利用Cytoscape3.8.2和String数据库构建“药物活性成分-靶点”网络、蛋白质相互作用(PPI)网络、“活性成分-作用靶点-通路”网络以及利用Cytoscape3.8.2软件对该网络进行拓扑分析。利用分子的对接技术,由Autodock Vina实现核心成分白细胞介素(IL)-6与关键靶点分子对接。结果:本研究共筛选出活血通降方119个活性成分及相应靶点268个。反流性食管炎潜在作用靶点89个。经Cytoscape拓扑分析得到STAT3、TP53、JUN、AKT1、IL6、TNF等17个核心靶点,槲皮素、木犀草苷、山奈酚、黄芩素、柚皮素等20个核心活性成分。生物信息学富集分析中共获得711个GO条目,其中包括571个生物过程(biological process,BP)、53个细胞组成(cellular component,CC)、87个分子功能(molecular function,MF)。KEGG通路富集分析得到106条通路,主要涉及癌症通路(pathways in cancer)、HIF-1信号传导途径(HIF-1 signaling pathway)、TNF信号传导途径(TNF signaling pathway)等。利用分子对接技术发现黄芩苷元、柚皮素、川陈皮素与IL-6靶点有较强的亲和能力。结论:活血通降方通过降低炎症通路的激活,导致炎症因子分泌减少,从而起到修复食管黏膜炎症的作用。系统性揭示了活血通降方多途径、多靶点、多层次的调节作用,为活血通降方治疗反流性食管炎的临床应用研究提供了参考。

关键词： 石菖蒲   川芎   阿尔茨海默病   网络药理学  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探索中药药对石菖蒲-川芎在治疗阿尔茨海默病(AD)的有效成分和作用靶点。方法采用TCMSP平台对石菖蒲和川芎的有效成分及相关靶点进行筛选。从GEO数据库中获得AD的差异表达基因,并通过Perl5.***.2.1软件获得疾病和药物的交叉差异基因。对交叉差异基因进行蛋白质相互作用(PPI)构建、GO功能富集分析、KEGG通路富集分析。使用AutoDockTools1.5.6软件将主要活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果共筛选出14个活性成分,其中山柰酚、β-细辛醚、8-异戊烯基-山柰酚、(1R,3aS,4R,6aS)-1,4-双(3,4-二甲氧基苯基)-1,3,3a,4,6,6a-六氢呋喃[4,3-c]呋喃、杨梅酮、香兰素、川芎哚7个活性成分被确定为与大多数靶基因相关的活性成分。获得交叉差异基因21个。通过拓扑分析,发现强相关蛋白18个,其中10个靶点为预测的核心靶点。细胞组分富集67个,分子功能富集73个,生物过程富集465个;KEGG共富集信号通路31条。分子对接结果表明,7个关键成分具有与目的基因HSP90AA1、ADRA2C、GABRA1、CHRM3具有较好的亲和力。结论石菖蒲-川芎主要活性成分可能通过神经活性配体受体相互作用、流体剪切应力和动脉粥样硬化、钙信号通路等信号通路,作用于HSP90AA1、ADRA2C、GABRA1、CHRM3等靶点,从而发挥治疗AD的作用。

关键词： 数据挖掘   网络药理学   中药   高尿酸血症   机制  

摘要： 目的基于数据挖掘和网络药理学技术探寻高尿酸血症的用药规律和新方药物组合并探讨该新方的理论基础和潜在机制.方法检索建库至2021年12月中国知网、维普数据库、万方数据库关于中医药治疗高尿酸血症的相关文献.采用中医传承辅助平台对其用药频次、四气五味等进行显性规律分析,通过熵聚类对其进行潜在规律分析,得到符合临床的新方药物组合.在此基础上采用网络药理学和分子对接的方法,通过Cytoscape软件,按照标准依次筛选核心靶点,最后通过DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,研究新方的生物信息通路并分析其作用机制.结果通过纳入及排除标准对文献进行筛选,最后得到符合标准的文献150篇,包含方剂160首,涉及中药196味.基于系统聚类分析获得新方(黄柏、牛膝、白术、茯苓),诸药合用有清热利湿、活血通络、健脾化浊之功,配伍恰当,直指病机,故选其进行下一步的蛋白质靶点和信号通路预测.对新方药物组合进行分析,得到治疗高尿酸血症的核心靶点20个.通过KEGG通路分析,其中P<0.05的通路共有121条.分子对接实验发现PTGS2和MAPK8可能是槲皮素的潜在靶点,TNF、EGFR、IL6和SIRT1可能是豆甾醇的潜在靶点.结论中药治疗高尿酸血症多以清热利湿、健脾益气、固肾泄浊为主,新方防治高尿酸血症的主要有效成分包括:小檗碱、槲皮素、黄藤素、汉黄芩素、豆甾醇等,作用于PTGS2、IL6、TNF、EGFR和MAPK8等关键靶点,调控脂质和动脉粥样硬化、IL-17信号通路、TNF信号通路,从而发挥抗炎、促进脂肪分解、改善胰岛素抵抗、调控细胞周期来起到降尿酸的作用.

关键词： 人参   皮肤炎症   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学探讨人参治疗人体皮肤炎症的相关靶点及其作用机制。方法采用多个数据库获取人参的化学成分、活性成分靶点及皮肤炎症的疾病靶点。通过药物与疾病的共同靶点,构建“药物-成分-靶点-疾病”网络图和蛋白互作网络(PPI),筛选出核心靶点。对潜在作用靶点进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果筛选得到22个人参潜在活性成分和106个药物靶点,获得了496个皮肤炎症的疾病靶点。两组数据取交集后,得到27个药物-疾病共同靶点。关键成分包括山柰酚、β-谷甾醇、山槐素、灌木远志酮A、稀有人参皂苷Rh2等。拓扑分析结果显示,白细胞介素-1β(IL1B)、MAPK8相关膜蛋白(MAPK8)、信号转导和转录激活因子1-α/β(STAT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、核因子κ-B激酶亚基β抑制剂(IKBKB)、转录因子p65(RELA)等蛋白为核心靶点。GO功能富集分析结果显示,人参的作用靶点与RNA聚合酶II启动子、DNA模板转录的正向调控相关。KEGG通路富集分析结果显示,人参的作用靶点与皮肤炎症并发症鞘脂信号通路相关。结论人参可通过调控多成分多靶点多通路治疗皮肤炎症。

关键词： 白鲜皮   湿疹   体内实验   网络药理学   靶点   炎症因子  

摘要： 目的:通过体内实验初步验证白鲜皮治疗湿疹的有效性,并通过网络药理学及实验验证探讨白鲜皮治疗湿疹的主要活性成分及其潜在作用机制。方法:30只雌性Balb/c小鼠,随机分为空白对照组、模型组、白鲜皮组,每组各10只。除空白对照组外,其余各组采用2,4-二硝基氯苯(DNCB)涂于小鼠腹部诱导致敏反应,建立湿疹模型。白鲜皮组小鼠灌胃给予白鲜皮水提液0.5 g生药/(kg·d),空白对照组和模型组经灌胃给予等体积0.9%NaCl溶液。采用中药系统药理分析平台(TCMSP)检索白鲜皮活性成分并获取相应靶点,在GeneCards数据库中检索湿疹靶点,运用Cytoscape软件构建“白鲜皮-活性成分-潜在靶标”网络,通过STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,将潜在靶点导入DAVID数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测各组小鼠血清中白介素(IL)-6、IL-10和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平,验证网络药理学分析结果。结果:体内试验结果显示,白鲜皮能缓解湿疹造成的小鼠耳片肿胀,明显降低小鼠耳片肿胀率(P<0.01)。网络药理学分析显示,白鲜皮中的主要活性成分为白鲜碱、槲皮素、黄柏酮、汉黄芩素、甘遂烷、β-谷甾醇、前茵芋碱。白鲜皮作用于湿疹的潜在靶点有44个,关键靶标主要包括TNF-α、IL-1β、IL-6等。富集分析显示,白鲜皮治疗湿疹涉及的生物过程和信号通路主要有脂多糖应答、炎症反应、IL-17信号通路、细胞凋亡信号通路等。ELISA检测结果显示,与对照组比较,模型组小鼠血清中IL-6、IL-1β、TNF-α水平明显升高(P<0.01);与模型组比较,白鲜皮组小鼠血清中IL-6、IL-1β、TNF-α水平明显降低(P<0.01)。结论:白鲜皮可能通过多成分、多靶点、多通路的方式治疗湿疹,并能够降低相关炎症因子(IL-6、IL-10、TNF-α)水平。

关键词： 过程性评价   线上线下混合式教学   药理学  

摘要： 课程的过程性评价既有反馈功能,又有导向功能。药理学课程的线上线下混合式教学模式需要建立过程性评价新体系。该评价体系把考试作为检索学习工具,强化学生记忆;结合线上教学特点,扩充事实型试题、应用型试题、图示题、开放综述题等,建立药理学过程性评价题库;应用慕课和SPOC课程,在不同时点进行过程性评价,教师通过实时反馈数据适度调整教学,完成教学闭环。