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关键词： 优秀学术期刊   基础科学研究   学术核心期刊   办刊宗旨   科研成果   药理学与毒理学   学术质量   医学期刊  

摘要： 《中国药理学与毒理学杂志》(Chinese Journal of Pharmacology and Toxicology,CJPT)是由军事科学院主管、军事医学研究院主办的学术性刊物,月刊,国内外公开发行。本刊以传播最新药理学与毒理学知识、交流最新科研成果、引领学科发展为办刊宗旨,主要刊登药理学和毒理学各分支学科的研究成果,为从事药理学、毒理学、医学和生物基础科学研究的工作者提供学习交流的平台。目前设有“前沿论坛”、“论著”、“综述”、“实验方法”等栏目,中英文兼收。本刊于1986年创刊,曾荣获优秀国防科技期刊二等奖、首届优秀学术期刊二等奖、全国优秀科技期刊评比三等奖、中国学术核心期刊(A)、全军优秀医学期刊和全军医学学术质量优秀期刊等奖项。

关键词： 酸枣仁汤   围绝经期失眠症   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学对酸枣仁汤治疗围绝经期失眠症的机制进行探讨。方法:通过TCMSP数据库获得酸枣仁汤有效成分和靶点,借助GeneCards、disGeNET和TTD数据库获得围绝经期失眠症靶点,利用Venny图得到两者的交集靶点后进行中药-活性成分-有效靶点网络和PPI网络构建,GO和KEGG富集分析,采用Discovery Studio 2016进行分子对接验证。结果:经过筛选得到酸枣仁有效成分116种,237个靶点数,203个疾病靶点,38个交集靶点,活性成分主要为槲皮素、山奈酚、芒柄花素、柚皮素、豆甾醇,核心靶点为IL-6、TNF、IL-1β、ESR1、PPARG。涉及BP265个条目、CC19个条目、MF46个条目,KEGG生物通路80条。分子对接结果验证了活性成分和核心靶点之间能自发结合,且相互作用较强。结论:通过网络药理学筛选出活性成分和核心靶点,为开展基础研究深入探讨酸枣仁汤治疗围绝经期失眠症提供参考。

关键词： 糖尿病肾病   丹红注射液   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨丹红注射液治疗糖尿病肾病可能的作用靶点及相关分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集丹红注射液的有效成分及其靶点,从GeneCards数据库中检索糖尿病肾病靶点,将疾病靶点与丹红注射液有效成分靶点取交集,获得丹红注射液治疗糖尿病肾病的潜在作用靶点。应用Cytoscape 3.9.1软件构建中药-活性成分-疾病靶点可视化网络,并分析网络节点度值以筛选关键的有效成分。通过蛋白质-蛋白质相互作用网络分析得到丹红注射液治疗糖尿病肾病的关键蛋白靶点,利用David数据库对丹红注射液治疗糖尿病肾病的潜在靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制。借助AutoDockTools 1.5.6软件进行分子对接,分析关键的有效成分与蛋白靶点的相互作用关系。结果:共收集丹红注射液有效成分84个,其治疗糖尿病肾病的潜在靶点有195个。蛋白质-蛋白质相互作用网络分析显示,肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、信号转导和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6等为丹红注射液治疗糖尿病肾病的关键靶点。KEGG富集分析涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Advanced Glycation End Product Receptor,RAGE)信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-Kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路及缺氧诱导因子-1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路等。分子对接显示,丹红注射液主要的有效活性成分与关键靶点分子TP53、AKT1、STAT3能够自发结合,其中丹参酮ⅡA与AKT1的结合能力最强。结论:丹红注射液通过多成分、多靶点及多通路发挥其治疗糖尿病肾病的作用。

关键词： 四逆散   卒中后抑郁   抑郁   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨四逆散治疗卒中后抑郁的分子机制。方法:通过TCMSP数据库检索四逆散中的药物活性成分及治疗靶点,采用GeneCards、OMIM、PharmGkb数据库收集卒中后抑郁的基因靶点,取交集靶点作为潜在的作用靶点导入String数据库建立蛋白相互作用(protein protein interaction,PPI)网络,以Cytoscape软件进行网络拓扑分析。将PPI靶点导入R进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因组百科全书(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes,KEGG)通路富集分析。构建“通路–靶点”网络并筛选其中关键靶点,采用AMDock平台将作用靶点与活性成分进行分子对接以筛选潜在药效成分。结果:从数据库中获得四逆散药物化学成分104种、靶点235个,1 001个疾病靶基因,其中药物核心成分7种,与疾病交集基因77个,最终通过软件分析得出MMP9、AKT1、IL-10、ESR1、IL-6、HIF1A、IL-1B、CASP3、TNF为核心基因;GO富集分析显示主要是通过蛋白酶结合、核受体活性、细胞因子活性、雌激素反应元件结合等分子功能,在膜筏、膜微区、质膜筏、Bcl-2家族蛋白复合体、质膜外侧、神经元细胞体、内质网腔等作用部位,发生对氧含量降低的反应、调控细胞凋亡信号通路、对脂多糖的反应等过程发挥作用。KEGG分析得出AGE-RAGE信号通路、p53信号通路、TNF信号通路、雌激素信号通路、HIF-1信号通路等主要信号通路。结论:四逆散可能通过槲皮素、木犀草素、山奈酚、川陈皮素、柚皮素、异鼠李素、芒柄花素等多种有效成分作用于MMP9、IL-6、HIF1A、IL-1B、CASP3等多个潜在靶点,介导AGE-RAGE信号通路、雌激素信号通路、HIF-1信号通路等多条信号通路发挥效用。

关键词： 新工科   工程教育认证   药理学   教学改革   制药工程  

摘要： 随着新工科和工程认证背景下工程教育改革的推进,制药工程专业的课程设置也逐渐受到了关注。作为制药工程专业的核心课程之一,药理学在制药工程中具有重要的地位。为提高药理学对工科专业的支撑度,针对我校制药工程专业药理学课程的现状,结合自身的教学体会,探讨如何在新工科和工程认证的背景下对制药工程专业的药理学课程进行改革和创新。

关键词： 参苓白术散   网络药理学   脾气虚   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学研究参苓白术散治疗脾气虚的作用机制,并结合动物实验验证。方法基于PubMed、中国知网等数据库分析脾气虚的现代科学含义,并采用GeneCards、BATMAN-TCM等挖掘参苓白术散治疗脾气虚的相关靶点;再结合动物实验,对网络药理学分析结果进行验证。结果共检索出脾气虚相关疾病靶点440个,去重后共得到126个,筛选出核心靶点16个,如C反应蛋白(CRP)、白细胞介素-6(IL-6)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)等;通过京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路处理分析,发现71个交集靶点主要富集在20条相关信号通路上。ELISA试剂检测显示,大鼠血清靶蛋白CRP、IL-6、PTGS2浓度均显著下降。结论参苓白术散通过各种途径、靶点和信号通路,调节细胞增殖、分化和凋亡以及免疫系统等过程,达到治疗脾气虚疾病的效果。

关键词： 黄芪   茯苓   肝纤维化   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:运用网络药理学探讨黄芪–茯苓药对治疗肝纤维化的作用机制。方法:利用中医药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)分别检索黄芪、茯苓的活性成分和有效作用靶点信息,分别通过DrugBank、GeneCards、OMIM和PharmGKB数据库检索肝纤维化疾病靶点,通过微生信–在线生物信息分析平台对已检索的药物作用靶点和疾病靶点取交集,利用Cytoscape 3.10.1软件构建“药物–活性成分–靶点”网络图。并通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作网络(PPI)分析,计算出核心靶点相关信息,将核心靶点分析结果导入Cytoscape 3.10.1软件构建核心靶点PPI网络,利用Metascape数据库进行GO生物过程与KEGG通路富集分析,将所分析结果通过微生信–在线生物信息分析、可视化云平台制作富集分析图,研究其作用机制。结果:黄芪–茯苓药对共筛选出活性成分35种,靶点207个,肝纤维化疾病靶点共1347个,对药物和疾病靶点分别删除重复值后取交集,黄芪–茯苓药对和肝纤维化的交集靶点共103个,通过对PPI网络分析,二者核心靶点主要是TNF、AKT1、IL-6、IL1B、TP53等。GO富集分析发现,富集的生物过程主要包括细胞迁移、对激素的反应、对细菌分子的反应、对细胞因子刺激的反应、正调控磷代谢过程等方面。KEGG通路富集分析发现了癌症通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、化学致癌作用——受体激活通路等。黄芪–茯苓通过调控癌症通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路等发挥治疗肝纤维化的作用。结论:该研究预测了黄芪–茯苓药对可能通过某些靶点及通路对肝纤维化起治疗作用。Objective: The mechanism of astragalus and poria in treating liver fibrosis was studied by network pharmacology. Method: Active ingredients and effective target information of Astragalus and poria were retrieved using TCM Systematic Pharmacology database and Analysis Platform (TCMSP), and liver fibrosis disease targets were retrieved through DrugBank, GeneCards, OMIM and PharmGKB databases, respectively. Cytoscape 3.10.1 software was used to construct the “drug-active ingredients-target” network diagram by taking the intersection of drug action targets and disease targets retrieved on the Weishengxin online biological information analysis platform. In addition, the protein interaction network (PPI) analysis of intersecting targets was carried out using STRING database to calculate the relevant information of core targets. The core target analysis results were imported into Cytoscape 3.10.1 software to build core target PPI network, and the enrichment analysis of GO biological process and KEGG pathway was carried out using Metascape database. The results were analyzed by using Weisheng online bioinformation analysis and visualization cloud platform to make enrichment analysis diagram and study its mechanism. Results: A total of 35 active ingredients

关键词： 松三糖   肝纤维化   网络药理学   分子对接   磷脂酰肌醇3-激酶   蛋白激酶B   丝裂原活化蛋白激酶  

摘要： 目的利用网络药理学、分子对接技术研究松三糖治疗肝纤维化潜在机制,并对核心靶点进行实验验证。方法从Swiss Target Prediction数据库中筛选松三糖治疗疾病相关靶点;从OMIM、GeneCards、Disgenet数据库中筛选出肝纤维化的相关靶点。对STRING数据库进行蛋白质相互作用网络,将tsv格式数据结果导入Cytoscape 3.9.1软件中进行可视化分析。进一步使用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)分析和京都基因和基因组的百科全书(KEGG)富集分析,并进行分子对接。通过MTT法检测小鼠肝星状细胞系JS-1细胞活力;Western blotting验证核心靶点的蛋白表达水平。结果KEGG富集分析显示交集靶点涉及信号通路64条,主要为磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路。分子对接提示松三糖与核心靶点能较好结合。Western blotting结果显示,在不同浓度松三糖作用下,JS-1细胞中磷酸化的PI3K/Akt以及MAPK的蛋白表达量均显著降低。结论松三糖可能通过作用于PI3K/Akt及MAPK等多个靶点,发挥抗肝纤维化作用。

关键词： 西洋参水煎液   山东产西洋参   美国产西洋参   焦亡   胃癌   凋亡   网络药理学  

摘要： 考察西洋参抗胃癌的活性及机制,并初步对进口(美国)西洋参水煎液(JK-AG)与国产(山东)西洋参水煎液(SD-AG)体内抗胃癌的药效进行比较。在网络药理学预测基础上,建立LUC-MGC803细胞异位接种胃癌裸小鼠模型,分别灌胃给予JK-AG和SD-AG 1 g·kg^(-1),连续21 d,阳性组隔日腹腔注射5-氟尿嘧啶(5-FU)20 mg·kg^(-1),期间测量瘤体体积;实验结束时,采用超高分辨超声成像系统进行瘤体大小以及活体成像仪观察瘤体荧光表达量;剖取瘤体组织称重和进行病理组织学检查;脱氧核糖核苷酸末端转移酶介导的缺口末端标记法(TUNEL)及TUNEL+含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶1(caspase-1)荧光双染检测组织凋亡和caspase-1表达;采用免疫组织化学、蛋白免疫印迹和实时荧光定量PCR(RT-qPCR)等技术检测瘤体组织中预测的凋亡和焦亡关键蛋白和基因的表达。网络药理学预测显示,西洋参具有抗胃癌活性,主要有效物质为人参皂苷类;肿瘤坏死因子-α(TNF-α)激活诱导的细胞凋亡和caspase-1可能是西洋参抗胃癌的重要分子机制之一。在体内抗肿瘤研究中,与模型组比较,JK-AG和SD-AG均不影响小鼠的体质量及脏器指数,而5-FU使小鼠体质量明显降低(P<0.05),肺、肝脏指数明显升高(P<0.05),JK-AG和SD-AG的抑瘤率分别为29.76%、27.97%,低于5-FU;但两者均可明显降低瘤组织荧光强度和三维瘤体体积(P<0.05或P<0.01);HE染色结果显示给药组的瘤体组织坏死病变和范围更大;TUNEL及TUNEL+caspase-1荧光染色显示JK-AG和SD-AG均诱导了瘤体组织细胞凋亡和增加了caspase-1表达;JK-AG和SD-AG均明显增加cleaved-caspase-8、cleaved-caspase-3蛋白以及TNF-α、caspase-8、caspase-9 mRNA表达,降低B淋巴细胞瘤-2基因(Bcl-2)蛋白表达;与JK-AG组相比,SD-AG可明显增加TNF-α、caspase-9、cleaved-caspase-9、肿瘤坏死因子受体1(TNFR1)蛋白表达,还可增加Bcl-2关联X蛋白(Bax)/Bcl-2比值;与SD-AG组相比,JK-AG可明显增加Bax mRNA表达。另外,JK-AG和SD-AG可明显增加NLRP3、caspase-1、cleaved-caspase-1、焦孔素D(GSDMD)、cleaved-GSDMD、IL-18、焦孔素E(GSDME)、GSDME-NT蛋白表达和caspase-1、GSDME mRNA的表达,其中蛋白免疫印迹检测中JK-AG增加cleaved-caspase-1蛋白表达较SD-AG更显著,同时JK-AG增加GSDMD mRNA表达比SD-AG明显;对于GSDME-NT蛋白表达,SD-AG增加比JK-AG明显。以上研究表明,西洋参具有抗胃癌作用,且美国与山东西洋参的药效作用相当,其机制不仅与TNF-α介导的外源性凋亡途径有关,还与诱导细胞焦亡有关,美国与山东西洋参的作用灵敏靶点存在不同。

关键词： 多裂骆驼蓬   阿尔茨海默病   UPLC-Q-TOF-MS/MS技术   网络药理学  

摘要： 本研究通过超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱法(UPLC-Q-TOF-MS/MS)、网络药理学及分子对接技术探讨多裂骆驼蓬抗阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)药效物质基础及作用机制。利用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术对多裂骆驼蓬进行定性研究;结合质谱分析结果,利用SWISS ADME、GeneCards等数据库筛选多裂骆驼蓬活性成分、对应靶点及疾病靶点;利用Venn绘制平台获取交集靶点,并导入STRING在线分析平台和Cytoscope3.9.1软件,进行蛋白质相互作用分析,构建药物-成分-靶点网络;利用AlzDate数据库差异表达模块分析靶点的表达与β-淀粉样蛋白(β-amyloids,Aβ)和微管相关蛋白(Tau)相关病理学的关系;通过DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析;利用Autodock Vina软件实现核心靶点与有效成分分子对接模型的构建。从多裂骆驼蓬中共鉴定出34个主要成分,包括生物碱类10种,黄酮类5种,氨基酸类5种,萜类5种,核苷类2种,酚酸类3种,其他类化合物4种。网络药理学分析结果显示,吴茱萸碱、β-谷甾醇、β-豆甾醇酮和去氢骆驼蓬碱等活性成分可通过作用靶点调节一系列与AD发病机制相关的生物学过程、分子功能和信号通路,进而调节胆碱能系统和功能、减少Aβ损伤、调节微循环及神经元结构和功能发挥治疗AD的作用。分子对接显示有效成分吴茱萸碱、β-谷甾醇、β-豆甾醇酮和去氢骆驼蓬碱与核心靶点MAPK3和STAT3均具有良好的结合活性。该研究初步揭示了多裂骆驼蓬治疗AD的药效物质基础及作用机制,为临床应用和药物开发提供了依据。