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关键词： 抗疲劳   淫羊藿   杜仲雄花   网络药理学   分子对接  

摘要： 通过网络药理学与分子对接探究淫羊藿(Epimedium brevicornu Maxim.)和杜仲雄花(Eucommia ulmoides maleflower)药发挥抗疲劳作用的潜在活性成分及作用机制。利用TCMSP等数据库搜集淫羊藿和杜仲雄花药对的活性成分和靶点,在GeneCards、OMIM等数据库下载抗疲劳相关靶点;利用维恩图获得淫羊藿和杜仲雄花药对抗疲劳靶点后,导入Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。然后,对靶基因进行GO、KEGG富集分析。并采用AutoDockVina软件对活性成分与靶点进行分子对接。“活性成分-靶点-通路”网络显示,淫羊藿和杜仲雄花药对中37个主要活性成分能够作用于79个抗疲劳靶点。KEGG分析富集包括PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。分子对接结果显示,Epimedin C等关键成分与INS、ALB等关键靶点具有良好的结合活性。淫羊藿和杜仲雄花药对能够通过多成分、多靶点、多通路发挥抗疲劳作用。

关键词： 骨关节炎   膝   五福健膝方   肿瘤抑制蛋白p53   网络药理学   动物实验  

摘要： 目的:探讨五福健膝方治疗膝骨关节炎(knee osteoarthritis,KOA)的作用机制。方法:①网络药理学研究。采用网络药理学方法筛选五福健膝方治疗KOA的靶点。②动物实验。将18只10周龄SPF级雄性C57BL/6小鼠随机分为3组,每组6只。模型组和五福健膝方组小鼠采用内侧半月板失稳术在右后肢构建KOA模型,假手术组小鼠仅切开对应区域皮肤和关节囊后缝合。造模手术后第2天,五福健膝方组小鼠以五福健膝方汤剂(生药浓度1.1 g·mL^(-1))灌胃,每次0.6 mL,每天1次,连续灌胃8周;模型组和假手术组小鼠以等量生理盐水灌胃。药物干预结束后,收集小鼠右后肢膝关节,分别进行股骨远端Micro-CT扫描、组织病理学观察(阿尔新蓝-苏木素/橙黄G染色)及免疫组织化学染色。免疫组织化学染色主要针对Ⅱ型胶原蛋白与网络药理学研究确定的核心靶点蛋白,测量Ⅱ型胶原蛋白表达阳性区域的厚度(视为软骨厚度),同时计算核心靶点蛋白阳性细胞百分比。结果:①网络药理学研究结果。通过网络药理学研究确定的五福健膝方治疗KOA的关键靶点基因15个,其中TP53为核心靶点基因,其对应的蛋白为P53蛋白。②动物实验结果。股骨远端Micro-CT检查结果显示,模型组较假手术组骨表面积骨体积比值降低(P=0.028)、骨体积分数升高(P=0.003),五福健膝方组较模型组骨表面积骨体积比值升高(P=0.004)、骨体积分数降低(P=0.048)。膝关节软骨组织阿尔新蓝-苏木素/橙黄G染色显示,模型组小鼠软骨缺失明显,五福健膝方组小鼠软骨丢失较模型组明显改善。免疫组织化学染色结果显示,模型组小鼠膝关节软骨厚度较假手术组减小(P=0.001),五福健膝方组小鼠膝关节软骨厚度较模型组增加(P=0.048);模型组小鼠膝关节软骨组织中P53阳性细胞百分比较假手术组增加(P=0.000),五福健膝方组小鼠膝关节软骨组织中P53阳性细胞百分比较模型组减少(P=0.000)。结论:五福健膝方能够有效延缓KOA模型小鼠的软骨退变,其机制可能与其抑制P53蛋白表达有关。

关键词： 幽门螺杆菌   蒲公英   抑菌活性   网络药理学  

摘要： 目的探讨中药蒲公英对幽门螺杆菌(Hp)的体外抑菌活性及干预Hp感染的作用机制。方法通过体外试验检测蒲公英水煎剂对Hp的最低抑菌浓度(MIC)、最低杀菌浓度(MBC)及最小生物膜清除浓度(MBEC),并进行体外诱导耐药实验;采用网络药理学方法,预测蒲公英干预Hp感染的活性成分和作用靶点,分析其作用机制。结果蒲公英水煎剂对Hp的MIC为25~50 g/L,MBC为50~100 g/L,MBEC为100~200 g/L;经过多轮次诱导,蒲公英水煎剂对菌株S2的MIC仍维持在50 g/L;通过网络药理学分析共筛选出蒲公英抗Hp感染的重要成分29个和重要潜在作用靶点59个,潜在靶点GO功能富集分析包括细胞对化学应激的反应、氧化应激的反应及活性氧的代谢过程等,KEGG通路分析涉及FoxO信号、ErbB信号、PI3K-AKT信号通路等,PPI分析显示核心靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、蛋白激酶Bα(AKT1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)及半胱天冬酶3(CASP3)。结论蒲公英水煎剂对Hp具有一定抑菌活性、且不易产生耐药,蒲公英对干预Hp感染可能具有多成分、多靶点和多通路的作用机制。

关键词： 玉泉胶囊   糖尿病肾病   网络药理学   分子对接   靶点预测   氧化应激   实验验证   作用机制  

摘要： [目的]运用网络药理学和体外实验探讨玉泉胶囊治疗糖尿病肾病的潜在作用机制。[方法]借助中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)和中医药综合数据库(Traditional Chinese Medicine Integrated Database,TCMID)筛选玉泉胶囊有效成分及靶点基因,基因组注释数据平台(Genome Annotation Database Platform,GeneCards)、疾病基因网络(Disease Gene Network,DisGeNET)数据库和治疗靶点数据库(Therapeutic Target Database,TTD)筛选糖尿病肾病的疾病相关基因,STRING 11.5数据库构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,并利用Cytoscape 3.7.2软件可视化,利用Cytoscape 3.7.2软件的CytoHubba和MCODE插件筛选关键化合物与核心靶点,利用R软件(ClusterProfiler包)进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析,利用AutoDock和PyMOL软件进行分子对接验证,最后对网络药理学预测结果进行体外实验验证。[结果]玉泉胶囊抗糖尿病肾病活性成分有177个,活性成分作用靶点共477个,作用于糖尿病肾病的靶点有135个,核心靶点包括丝氨酸/苏氨酸激酶1(serine/threonine kinase 1,AKT1)、白细胞介素-1β(interleukin-1 beta,IL1B)、过氧化氢酶(catalase,CAT)、一氧化氮合酶(nitric oxide synthase 3,NOS3)、瘦素(leptin,LEP)、胰岛素样生长因子1(insulin-like growth factor 1,IGF1)和趋化因子配体2(C-C motif chemokine ligand 2,CCL2);GO富集分析共得到相关条目2557个,其中生物过程1415个、细胞组成657个、分子功能48个;KEGG通路分析结果显示玉泉胶囊作用于糖尿病肾病的靶点富集在66条通路上,其中环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)信号通路、高级糖基化终末产物-受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路在糖尿病并发症中的作用等可能是玉泉胶囊治疗糖尿病肾病的关键通路。分子对接结果显示核心靶点与关键化合物均能较好地结合。实验验证显示,CCL2蛋白水平呈药物剂量依赖性下降,CAT、内皮型一氧化氮合酶(endothelial nitric oxide synthase,eNOs)蛋白水平呈药物剂量依赖性上升。[结论]玉泉胶囊治疗糖尿病肾病具有多成分、多靶点的特点,其机制可能与下调CCL2、上调CAT、eNOs的蛋白表达,抑制糖尿病肾病的氧化应激,调节关键通路相关。

关键词： 环泊酚   无痛胃肠镜   丙泊酚   药理学  

摘要： 环泊酚是一种基于丙泊酚的新型2,6-双取代苯酚衍生物,是中国自主研发的新型镇静麻醉药物。由于其起效快,恢复迅速,无明显药物蓄积,无注射痛,对呼吸和循环的抑制小,不良反应少,且安全性优于丙泊酚,目前被推广应用于无痛胃肠镜检查中。本文对环泊酚的药理学特点、临床应用优势及缺点,及其在无痛胃肠镜检查中的应用现状进行综述,以期挖掘其潜在优势,旨在优化无痛胃肠镜检查中的麻醉管理方案,为环泊酚在临床上的使用提供理论依据。

关键词： 橘皮竹茹汤   网络药理学   分子对接   化疗性呕吐   糖原合酶激酶3β   蛋白激酶B   5-羟色胺   单胺氧化酶A   色氨酸羟化酶  

摘要： 目的:基于网络药理学预测橘皮竹茹汤防治化疗性呕吐(CINV)的活性成分、作用靶点及信号通路,并通过分子对接、动物实验探讨其止呕的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Ctd数据库选取橘皮竹茹汤活性成分,与Uniprot、DisGeNET、GeneCard数据库获取的CINV相关靶点进行拟合筛选。利用Cytoscape软件构建复方活性成分-靶点-疾病网络,String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行网络拓扑学分析。通过Metascape、微生信数据库可视化基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析数据,并获取关键蛋白,利用AutoDock、PYMOL软件进行分子对接验证。最后通过造模和药物对大鼠进行干预后,记录大鼠高岭土摄食量,检测延髓、回肠病理学改变;测定延髓、回肠蛋白激酶B(AKT)、糖原合酶激酶3β(GSK-3β)蛋白含量及呕吐神经递质5-羟色胺(5-HT)、色氨酸羟化酶(TPH)、单胺氧化酶A(MAOA)的表达水平。结果:获取橘皮竹茹汤活性成分141个,79个复方-疾病交集基因,9个核心靶点,其止呕作用可能与诱导AKT胞膜移位,抑制GSK-3在Ser9/21位点磷酸化有关。动物实验显示橘皮竹茹汤可降低化疗性呕吐大鼠的高岭土异嗜量、减轻肠道炎症;上调延髓、回肠AKT水平,抑制GSK-3、表达;抑制延髓、回肠TPH合成酶,促进MAOA代谢酶,从而减少5-HT表达量。结论:橘皮竹茹汤可通过调控AKT/GSK-3β信号通路,抑制回肠、延髓中GSK-3β含量表达,对CINV起防治作用;还可抑制延髓、回肠TPH合成酶,促进MAOA代谢酶分泌,达到止呕功效。

关键词： 锁阳   性功能障碍   网络药理学   分子对接   功效成分   含量测定  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术筛选锁阳治痿弱的功效成分并测定其含量。方法:利用BATMAN-TCM数据库及文献检索获取锁阳的化学成分并筛选出潜在的活性成分;通过PharmMapper和Genecards等数据库筛选潜在活性成分靶标和性功能障碍的靶标;利用STRING数据库获取成分与疾病交集靶标之间的相互关系,构建PPI网络和成分-靶点-通路网络分析锁阳干预性功能障碍的核心靶标;通过Autodock进行核心靶标与活性成分的分子对接,筛选出锁阳治痿弱的功效成分并测定其含量。结果收集并筛选到锁阳的40个潜在的活性成分,通过调节76个潜在靶标参与疾病过程。分子对接结果显示槲皮素、木犀草素、熊果酸、根皮苷4种成分与核心靶点结合能力突出,为锁阳改善性功能障碍的主要物质基础。HPLC测定锁阳中其主要存在形式芦丁、木犀草苷、根皮苷、熊果酸的含量分别为0.331 mg·g^(-1)、0.184 mg·g^(-1)、1.768 mg·g^(-1)、0.017 mg·g^(-1)。结论:芦丁、木犀草苷、熊果酸、根皮苷为锁阳治痿弱的功效成分,建立的HPLC含量测定方法简便、稳定、可靠。

关键词： 肠癌   严光俊   数据挖掘   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:通过数据挖掘探讨严光俊教授治疗肠癌的组方规律和有效方剂,采用网络药理学分析其核心药物的潜在作用机制。方法:收集2022年1月1日至2022年12月31日严教授治疗肠癌的有效处方,运用SPSS Modeler18.0筛选挖掘其用药规律,运用网络药理学分析核心药物的潜在作用机制。结果:纳入100首中药方剂,涉及141味中药,药物归经以肝、脾经为主,性味以温寒、甘苦居多,茯苓、白术、白花蛇舌草、黄芪、白英、党参、熟地黄为其核心药物。核心药物主要通过调控细胞凋亡、信号传导、细胞增殖等生物过程,调节磷脂酰肌醇-3-激酶/丝苏氨酸蛋白激酶(PI3K/AKT)信号通路、表皮生长因子受体(EGFR)酪氨酸抑制剂耐药、晚期糖基化终产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、蛋白聚糖等通路发挥作用。结论:严教授治疗肠癌以“通痞消积”为基本治则,从肝脾论治,以健脾益气为主,理气疏肝为辅,兼顾养血益肾,并针对“瘀”“痰”“湿”“寒”“毒”等兼证灵活加减用药。其核心药物通过多成分、多靶点、多通路的作用机制对肠癌发挥治疗作用。

关键词： 柴桂颗粒   网络药理学   分子对接   质量标准  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接研究柴桂颗粒的作用机制,并建立质量标准。方法:通过网络药理学方法筛选柴桂颗粒的主要活性成分,探索治疗类风湿性关节炎的有效靶基因位点,对活性成分与主要靶点的结合能力进行分子对接验证。同时以对该方的网络药理学及分子对接、主要化学成分研究为依据进一步确定含量测定指标成分,采用薄层鉴别(TLC)法对葛根、防风、陈皮、蜜麻黄、羌活、法半夏进行定性鉴别;采用高效液相色谱法(HPLC)法测定葛根素含量。结果:筛选得到槲皮素、3beta-Hydroxy-24-methylene-8-lanostene-21-oic acid、柚皮素等活性化合物,SRC、TP53、MAPK1等关键靶点,通过调控脂质和动脉粥样硬化等通路协同治疗类风湿关节炎;分子对接显示关键靶点与活性成分大多具有较好的结合能力。TLC鉴别斑点清晰,阴性无干扰;葛根素在0.156~0.46 mg·g^(-1)浓度范围内线性关系良好。结论:本研究通过网络药理学方法筛选柴桂颗粒的主要活性成分及靶点,为质量标准提供依据。本研究确定的检测方法简便可靠、专属性强,为后续制剂的进一步研究和临床应用提供基础。

关键词： 宁动颗粒   抽动-秽语综合征   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨宁动颗粒治疗抽动-秽语综合征(Tourette Syndrome,TS)的作用机制。方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BETMAN-TCM数据库检索宁动颗粒各中药的活性成分及其作用靶点,通过OMIM、DrugBank、GeenCards数据库检索TS相关疾病靶点,将两者取交集,获得宁动颗粒治疗TS的关键靶点,将关键靶点导入STRING数据库,获取蛋白质相互作用信息,利用Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并进行可视化分析,获得核心靶点。运用Metascape数据库对核心靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用AutoDock Vina软件对宁动颗粒治疗TS的有效核心靶点与宁动颗粒中中药对应的活性成分进行分子对接,并进行可视化展示。结果:获取宁动颗粒活性成分180个,共对应643个靶点基因、TS相关靶点1 085个,关键靶点有128个,对关键靶点进行PPI网络构建并进行拓扑分析,根据度值大于平均值共筛选出39个核心靶点。KEGG通路分析主要涉及神经活性配体-受体相互作用、多巴胺能突触、5-羟色胺能突触、钙信号通路、环磷酸腺苷(Cyclic Adenosine Monophosphate,cAMP)信号通路、白细胞介素(Interleukin,IL)-17信号通路等。溶质载体家族6成员3(Solute Carrier Family 6 Member 3,SLC6A3)与豆甾醇亲和力最高,其次是SLC6A3和槲皮素、溶质载体家族6成员4(Solute Carrier Family 6 Member 4,SLC6A4)和球豆碱、FOS原癌基因(Fos Proto-Oncogene,FOS)和槲皮素等。这些可能是宁动颗粒治疗TS的重要活性成分。结论:宁动颗粒可通过“多成分-多靶点-多通路”发挥神经保护、抗炎、免疫应答等作用,从而治疗TS。