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关键词： 人参皂苷Rg1   心肌缺血再灌注损伤   网络药理学   分子对接   磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶通路  

摘要： 目的 利用网络药理学、分子对接技术与体外实验的方法研究人参皂苷Rg1治疗心肌缺血再灌注损伤(myocardial ischemia-reperfusion injury, MIRI)的潜在作用机制。方法 借助Swiss Target Prediction、Drug Bank、Pharm Mapper数据库查找人参皂苷Rg1潜在作用靶点,借助Disgenet、Genecard、OMIM查找MIRI的疾病靶点,借助韦恩图获取共同靶点;借助STRING数据库和Cytoscape v.3.7.0软件构建可视化的蛋白互作网络模型并筛选出核心靶点,将核心靶点导入DAVID数据库进行GO功能和KEEG通路富集分析,预测人参皂苷Rg1治疗MIRI的潜在作用机制;借助AutoDock vina软件将核心靶点进行分子对接;利用H9c2细胞进行糖氧剥夺6小时后复氧18小时模拟体内MIRI过程;Annexin V-FITC/PI双染法检测细胞凋亡率;蛋白免疫印迹法检测丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶(serine/threonine-protein kinase, Akt)、热休克蛋白90α(heat shock protein HSP 90-alpha, HSP90AA1)、淋巴细胞瘤-2基因(B-cell lymphoma-2,Bcl-2)蛋白的表达。结果 人参皂苷Rg1的潜在作用靶点有147个,MIRI的疾病靶点有2357个,共同靶点有38个;PPI结果筛选出的核心靶点有信号转导及转录激活蛋白3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、Akt1、HSP90AA1、Akt2、一氧化氮诱导合成酶(nitric oxide synthase, inducible, NOS2)、成纤维细胞生长因子2、细胞因子信号传导抑制剂3、凋亡调节因子、72 kDa IV型胶原酶;GO分析富集条目183条,分子功能30条,生物学过程130条,细胞组份23条;KEEG通路富集分析涉及磷脂酰肌醇3-激酶/Akt信号通路、肿瘤信号通路、Rap1信号通路、肿瘤相关病毒感染通路、化学致癌受体活化通路、Relaxin信号通路、化学致癌受体活化通路机制;分子对接结果显示人参皂苷Rg1与核心靶蛋白STAT3、Akt1、HSP90AA1、Akt2、NOS2均能稳定对接;体外实验结果显示,与模型组相比较,人参皂苷Rg1组的细胞凋亡率显著下降(P<0.05);蛋白免疫印迹法结果显示,与模型组相比较,人参皂苷Rg1组的Akt、抗凋亡蛋白Bcl-2增加,HSP90AA1下降(P<0.05)。结论 人参皂苷Rg1治疗MIRI的作用机制主要与激活PI3K/Akt信号通路,调节Akt、HSP90AA1、Bcl-2蛋白表达量有关。

关键词： 石菖蒲   临床应用   药理学   α-细辛醚   β-细辛醚  

摘要： 石菖蒲有开窍豁痰、醒神益智、化湿开胃等功效,其临床主要运用于健忘、神志昏迷、胃脘胀痛、耳鸣、耳聋、感染、抑郁焦虑等。现代药理学研究靶点为抗氧化、改善认知、改善细胞凋亡、抗癫痫、神经保护、抑制胃肠收缩、抗菌、抗肿瘤等等。对神经系统、消化系统、五官系统等疾病,药理活性显著,临床运用广泛。煎剂用量为3~30 g,在临床使用中还需要考虑到辨证论治,进行合理运用。本文通过总结石菖蒲的临床运用和药理学研究,以期为石菖蒲的临床和进一步研究提供参考。Acorus tatarrinowii Schott has the effect of opening the orifices and expelling phlegm, awakening the mind and wisdom, dissolving dampness and opening the stomach, etc. Its clinical application is mainly used in amnesia, delirium, gastric distension, tinnitus, deafness, infection, depression and anxiety. Modern pharmacological research targets for antioxidant, improve cognition, improve apoptosis, anti-epilepsy, neuroprotection, inhibit gastrointestinal contraction, antibacterial, anti-tumour and so on. It has significant pharmacological activity and wide clinical use in diseases of the nervous system, digestive system, and five sensory systems. The dosage of the decoction is 3~30 g, and it also needs to take into account the identification and treatment for rational application in clinical use. This paper summarizes the clinical use and pharmacological study of Acorus tatarrinowii Schott, with a view to providing reference for the clinical and further study of Acorus calamus.

关键词： 痛风   高尿酸血症   数据挖掘   网络药理学   四妙散  

摘要： 目的:运用数据挖掘和网络药理学探究中药内服治疗痛风的遣方用药规律及其作用机制。方法:数据挖掘收集中药内服治疗痛风的方剂,并对其进行中药频次分析、关联规则和聚类分析,总结用药规律和核心药对。通过网络药理学预测药物和疾病的作用靶点,获取核心靶点及核心通路。结果:共筛选出文献204篇,涉及方剂210个,用药总频次为2415次,得到高频药物30味(频次≥20),得到关联规则8条,有效聚类群4个,最终获取9味核心药物;通过网络药理学分析得核心药物参与治疗痛风靶点95个,核心靶点12个,核心通路10条。结论:数据挖掘显示痛风的中医辨证以湿热蕴结型为主,治疗上多用清热祛湿的中药;网络药理学预测了核心药物治疗痛风的关键机制。

关键词： 马齿苋   肝损伤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学及分子对接技术探讨马齿苋改善肝损伤的有效活性成分及分子机制。方法通过Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology(TCMSP)数据库检索马齿苋的活性化合物及相关靶点;GeneCards、On⁃line Mendelian Inheritance in Man(OMIM)数据库收集肝损伤的相关靶点;通过Venny 2.1.0网站筛选马齿苋与肝损伤的共表达靶点。运用Cytoscape 3.9.1软件和Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins数据库构建马齿苋活性成分与肝损伤共表达靶点的“药物-主要活性成分-共表达靶点-疾病”网络以及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图。通过the Database for Annotation,Visu⁃alization and Integrated Discovery数据库对共表达靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)富集和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encycloppedia genes and genomes,KEGG)通路注释分析,阐述马齿苋改善肝损伤的作用通路及分子作用机制。通过CB-Dock在线分子对接网站验证马齿苋有效活性成分与关键靶点之间的关系。结果从TCMSP数据库中筛选出10种马齿苋活性化合物及其对应的78个靶点,从GeneCards和OMIM数据库中筛选出1489个肝损伤的相关靶点,通过Venny 2.1.0网站找到54个马齿苋活性成分与肝损伤的共表达靶点。通过Cytoscape 3.9.1软件获得“药物-主要活性成分-共表达靶点-疾病”网络并找出马齿苋改善肝损伤的主要活性成分,在PPI网络图中得到关键靶点为TNF、IL6、IL1B、MMP9、CASP3、IL10、PPARG。GO富集分析结果显示马齿苋主要对转录、凋亡等生物过程起调节作用,通过KEGG通路分析筛选出与马齿苋改善肝损伤关系密切的通路为Non-alcoholic fatty liver disease通路,并且其重要的靶点有TGFB1,INSR,TNF,TNFRSF1A,IL1A,CASP7,IL6,MAPK8,CASP8,IL1B,CASP3,PPARG和PPARA。分子对接结果表明,马齿苋中主要活性成分β-胡萝卜素、槲皮素与核心靶点TNF、CASP3、PPARG稳定结合。结论马齿苋中的β-胡萝卜素、槲皮素通过与TNF、CASP3、PPARG结合调节Non-alcoholic fatty liver disease等信号通路发挥改善肝损伤的作用。

关键词： 网络药理学   分子对接   三七   肝纤维化   作用机制  

摘要： 目的:三七治疗肝纤维化的网络药理学研究。方法:从TCMSP数据库获取三七的主要活性成分,借助Pubchem数据库获得其对应靶点,经DisGeNET和GeneCards数据库筛选肝纤维化相关疾病靶点,利用Venny 2.1.0获取三七和肝纤维化的共同作用靶点,并将其导入STRING数据库绘制蛋白相互作用(PPI)网络图,利用Cytoscape 3.10.0软件中CytoHubba插件筛选hub基因。通过Autodock Tools 1.5.7软件将主要活性成分quercetin、DFV与度值前5位的Hub基因进行分子对接验证,并使用David平台对共同作用靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:共得到三七8个主要活性成分及其245个潜在作用靶点,肝纤维化1176个相关靶点,取交集得共同靶点78个。核心靶点包括蛋白激酶B1(AKT1)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、表皮生长因子受体(EGFR)等。GO和KEGG分析得到生物学过程340条、细胞成分47条、分子功能106条、信号通路99条。分子对接结果显示,三七的主要活性成分能够很好地与核心靶点结合。结论:三七能通过多成分、多靶点及多通路参与肝纤维化的治疗。

关键词： 枳术丸   非酒精性脂肪性肝病   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术研究枳术丸在治疗非酒精性脂肪性肝病(Non-Alcoholic Fatty Liver Disease,NAFLD)可能的作用靶点和机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出枳术丸的活性成分及其对应的靶点。采用Disgenet、GeneCards及OMIM数据库预测NAFLD相关靶点,聚焦共同靶标,得到枳术丸治疗NAFLD的关键靶点,将已确认的关键靶点输入STRING数据库进行分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,并通过Cytoscape 3.8.0软件可视化。采用Metascape数据库对关键靶点进行基因本体论(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过AutoDock Vina进行分子对接验证,利用PyMOL软件对结合能较低的结果进行可视化展示。结果:共获得枳术丸靶点125个、NAFLD靶点1 506个,药物、疾病共同靶点51个,核心靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、肿瘤蛋白p53、肿瘤坏死因子、白细胞介素-6,可能通过IL-17、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B、缺氧诱导因子-1信号通路等作用于NAFLD。分子对接结果显示核心靶点与药物成分之间亲和力较强。结论:通过这些研究可初步了解到枳术丸治疗NAFLD的重要活性成分和可能的作用方式,为药物效能、作用机制及实际应用等的进一步研究提供科学依据。

关键词： 活血祛瘀   丹参   脂肪肝   数据挖掘   网络药理学  

摘要： 目的基于数据挖掘和网络药理学探讨活血祛瘀法治疗代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)的用药规律及代表药物的作用机制。方法检索中国知识资源总库(CNKI)、中国学术期刊数据库(万方数据)、中文科技期刊数据库(VIP)、中国生物医学文献数据库(CBM)建库至2023年6月1日活血祛瘀法治疗MAFLD的随机对照试验,利用古今医案云平台V2.3.7进行中药频次、关联规则及聚类分析。选取核心中药丹参进行网络药理学分析,基于TCMSP数据库筛选活性成分与靶点,检索GeneCards、OMIM等数据库获取疾病靶点,预测丹参治疗疾病的潜在作用基因,采用R语言4.0.3、Cytoscape3.7.1与STRING数据库进行通路分析、构建网络图,采用AutoDuck Vina 1.1.2和PyMOL2.3.0软件进行分子对接验证。结果共纳入处方126首,涉及中药182味,丹参为使用频次最高的中药;用药药性以温、微寒、寒、平、微温为主,药味以辛、甘、苦为主,归经以肝经、脾经、肺经、胃经为主;活血祛瘀法核心配伍药物为丹参、山楂、泽泻、柴胡等,聚类分析得到4个聚类方。选取丹参作为代表药进行网络药理学分析。丹参存在65个活性成分,并可能通过RELA、EGFR、VEGFA等关键靶点及脂质与动脉粥样硬化、PI3K-Akt等通路发挥治疗MAFLD的作用。预测成分与对应靶点蛋白结合性好。结论本研究总结了活血祛瘀方药治疗MAFLD的配伍规律,其代表药丹参可通过多靶点、多通路治疗MAFLD。

关键词： 知识图谱   一流课程   药学   实验药理   课程思政  

摘要： 目的:探讨运用知识图谱赋能实验药理学课程的数字化建设及其应用效果。方法:选取药物制剂专业本科生为研究对象,2020级作为试验组,2018级作为对照组,通过课程考核和问卷调查对教学效果进行评价。结果:试验组学生的课程考核成绩显著高于对照组,满意度也明显提高。结论:知识图谱的建设与应用能够有力推动实验药理学课程教学改革,且效果显著。

关键词： 补肺丸   体内成分   HPLC-Q-TOF-MS/MS   网络药理学   肺病治疗潜能   新型冠状病毒感染恢复期  

摘要： 该研究基于血清化学、药物体内分布、网络药理学等方法探讨补肺丸在肺系疾病的应用功能,并挖掘潜在的药理学功能。大鼠灌胃给药补肺丸后,通过HPLC-Q-TOF-MS/MS研究补肺丸体内成分,比较复方提取物、给药后含药血清、组织样本及空白样本,从大鼠血清中发现入血成分共56个,其中首次发现neocyclomorusin、asterinin A、neoisostegane、goimisin R、frehmaglutoside H等成分可以经口服吸收入血,相关成分还可分布于心、肝、脾、肺、肾、脑脊液、胰腺不同脏器。经网络药理学分析,发现ALB、IL6、AKT1、TNF、EGFR、ESR1、JUN、HSP90AA1等81个核心靶点,参与PI3K-AKT、MAPK、VEGFA、AGE-RAGE等信号通路。补肺丸可能通过介导靶点通路的参与抑制炎症反应、氧化应激、影响代谢、调节免疫功能等机制,干预DO富集的慢性阻塞性肺病、肺纤维化、肺炎等主要的肺部疾病,以及慢性阻塞性肺病并发症,如糖尿病、抑郁等,及新型冠状病毒感染恢复期气短乏力、身体疼痛等表型,相关活性具有开发价值,有待进一步研究。