课程文献中心 更多>>

关键词： 网络药理学   分子对接   实验验证   芪归抵挡汤   糖尿病肾病   补虚通络法   PI3K/Akt信号通路  

摘要： 目的探究芪归抵挡汤干预糖尿病肾病(Diabetic kidney disease,DKD)的作用机制。方法借助网络药理学方法,获取芪归抵挡汤治疗DKD的潜在作用成分及靶点。结合分子对接技术,模拟核心靶点与关键成分的对接模式。最后观察芪归抵挡汤对db/db小鼠的影响,从体内实验层面验证该方抗DKD的作用机制。结果共获得117个潜在活性成分,427个药物靶点和2151个疾病靶点。KEGG富集分析183个交集靶点发现磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3 kinase,PI3K)/蛋白激酶B(Protein kinase B,PKB/Akt)信号通路可能是作用途径之一。分子对接揭示AKT1、TNF与常春藤皂苷元、豆甾醇、β-谷甾醇具有较强结合力。体内研究结果显示芪归抵挡汤可改善db/db小鼠一般情况、肾功能和血糖、血脂水平,逆转肾脏损伤病变,并能显著下调PI3K、p-Akt和肿瘤坏死因子-α(Tumor necrosis factor-α,TNF-α)蛋白表达。结论芪归抵挡汤具有调控糖脂代谢及炎症反应的作用,抑制PI3K/Akt信号通路活化可能是其发挥作用的重要机制。

关键词： 结直肠腺瘤   连夏散结汤   网络药理学   动物实验   Wnt/β-catenin信号通路   小鼠  

摘要： 目的:探讨连夏散结汤干预结直肠腺瘤(CRA)的效果,并探究其潜在作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选连夏散结汤的主要有效成分和作用靶点。通过人类基因数据库(GeneCards)、人类孟德尔遗传靶点数据库(OMIM)获取CRA相关的疾病靶点。通过韦恩图获得两者的共同靶标,使用蛋白相互作用数据库(String)构建蛋白相互作用(PPI)网络,并用Cytoscape 3.9.1建立连夏散结汤“药物-成分-疾病-靶点”网络。借助Metascape网站对交集基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因百科组全书(KEGG)富集分析。采用连夏散结汤干预CRA小鼠模型,并对关键信号通路进行验证。结果:分别获取连夏散结汤活性成分235个,相关靶点4645个,收集连夏散结汤与CRA的共同靶点170个,PPI拓扑分析获得39个核心基因,通过GO及KEGG富集分析得到Wnt/β-catenin信号通路为连夏散结汤干预CRA的关键通路。动物实验结果表明,模型组小鼠结直肠长度低于空白组(P<0.01),结直肠质量、肠道腺瘤数量高于空白组(P<0.01);模型组小鼠4、6、8周体质量均低于空白组,DAI评分高于空白组(P<0.05);模型组小鼠结肠组织中β-catenin mRNA、c-myc mRNA、cyclinD1m RNA相对表达量及β-catenin、c-myc、cyclinD1蛋白相对表达量均高于空白组(P<0.01);连夏散结汤中、高剂量组小鼠结直肠长度高于模型组(P<0.01);阿司匹林组及连夏散结汤低、中、高剂量组小鼠体质量高于模型组,DAI评分低于模型组,结直肠质量、肠道腺瘤数量、结肠组织中β-catenin m RNA、c-myc mRNA、cyclinD1 mRNA相对表达量及β-catenin、c-myc、cyclinD1蛋白相对表达量均低于模型组(P<0.05或P<0.01)。结论:连夏散结汤可能通过抑制Wnt/β-catenin信号通路的异常表达干预CRA的形成。

关键词： 非小细胞肺癌   仙茅   顺铂   细胞凋亡   Caspase3   Caspase9  

摘要： 目的:探讨中药仙茅对肺癌细胞顺铂化疗的增敏作用机制。方法:运用网络药理学和分子对接技术筛选仙茅对非小细胞肺癌的主要凋亡蛋白;CCK-8法检测细胞增殖率;蛋白印迹法检测仙茅、顺铂单用及联用后肺癌细胞(A549)中Caspase3和Caspase9蛋白表达量;流式细胞术检测细胞总凋亡率;细胞划痕和细胞侵袭实验检测细胞迁移和侵袭能力。结果:100~1500μg/mL剂量浓度的仙茅水提液对A549细胞增殖率无明显抑制作用,联用组较顺铂单用组对A549细胞的抑制作用显著增强;与对照组相比,仙茅组、联用组Caspase3和Caspase9蛋白表达量、细胞总凋亡率以及细胞迁移侵袭抑制率显著升高,顺铂组Caspase3、Caspase9蛋白表达量、细胞总凋亡率显著升高;与顺铂单用组相比,仙茅组、仙茅联用顺铂组Caspase3和Caspase9蛋白表达、细胞总凋亡率以及细胞迁移侵袭抑制率显著升高。结论:仙茅、顺铂、仙茅联用顺铂可以诱导A549细胞凋亡,与仙茅联用增强了顺铂对A549细胞凋亡的诱导作用,其作用机制与凋亡相关蛋白Caspase3、Caspase9有关。同时,联用仙茅后顺铂对A549细胞增殖率及迁移侵袭能力的抑制作用也更加显著。

关键词： 类风湿性关节炎   骨破坏   三百棒   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的通过网络药理学及体外实验探讨三百棒(Toddalia asiatica,TA)对类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)骨破坏的影响及可能的作用机制。方法使用网络药理学分析TA抗RA骨破坏的有效成分及作用靶点;利用AutoDock和PyMOL软件进行分子对接。体外培养MC3T3-e1细胞,通过CCK-8检测三百棒醇提物(Toddalia asiatica alcohol extract,TAAE)对细胞活力的影响,并筛选出合适的药物浓度及干预时间;用成骨诱导培养基诱导成骨细胞模型,ALP染色、活性检测及茜素红染色检测其成骨分化情况;Western blot检测通路相关蛋白Wnt3a、β-catenin蛋白的表达,并采用通路抑制剂DKK-1进一步验证TAAE是否通过Wnt/β-catenin信号通路调控成骨细胞分化。结果共筛选出TA抗RA骨破坏的靶点158个,核心靶点56个。KEGG信号通路富集主要有癌症通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B信号通路、cAMP信号通路。CCK-8检测结果显示:1 g·L^(-1)TAAE可显著提高细胞存活率;ALP染色及ALP活性检测结果示:TAAE能显著增加成骨诱导培养基诱导的细胞的染色阳性率及ALP活性;Western blot检测结果显示:TAAE可增加Wnt3a、β-catenin蛋白的表达;使用DKK-1抑制剂后上述蛋白的表达降低。结论TAAE可通过Wnt/β-catenin信号通路调控成骨细胞分化以达到治疗RA骨破坏的作用。

关键词： 抗心绞痛药   硝酸甘油   教学设计   护理药理学  

摘要： 护理药理学是护理专业的一门专业基础课,是连接基础与临床的桥梁学科,但因其各章节知识点之间相对独立,需要记忆的内容较多且原理抽象难理解,学生反馈学习难度较大。本文旨在以抗心绞痛药硝酸甘油的课程教学设计为例,对护理药理学课程改革作出初步探讨,转变传统教学模式,为促进专业课程教学的改革与发展提供参考。

关键词： 守正代茶饮   增强免疫力   网络药理学   分子对接   PI3K-Akt/NF-κB通路  

摘要： 目的:采用网络药理学和体内试验研究守正代茶饮对正常小鼠免疫增强的潜在作用机制。方法:通过TCMSP、Swiss Target Prediction数据库获取守正代茶饮的活性成分及对应靶标;GeneCards数据库得到免疫相关靶点并与药物靶点取交集;通过STRING和DAVID数据库,对交集靶点进行PPI网络分析和GO、KEGG富集分析,于Cytoscape 3.9.1构建“守正代茶饮-潜在活性化合物-靶点”和“成分-靶点-通路”网络,AutoDock Tools进行分子对接验证。小鼠碳廓清试验、迟发型变态反应试验、血清溶血素试验及Western Blot对部分靶点进行验证。结果:守正代茶饮的活性成分108种,增强免疫力交集靶点114个,核心成分为槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、豆甾醇、木犀草素等;关键靶点为PTGS2、HSP90AB1、PRKACA、RELA、Akt1等;主要参与药物的应答、基因表达的正调节、凋亡过程的负调控、TNF、PI3K-Akt、IL-17等生物过程和信号通路;关键靶点和核心成分亲和力较强。动物试验结果显示,与空白组比较,守正代茶饮低、中、高剂量组增强小鼠迟发型变态反应水平;中、高剂量组改善巨噬细胞吞噬活性;中、高剂量组p-PI3K、p-Akt、p-P65蛋白表达均上调(P<0.01)。结论:守正代茶饮具有增强免疫力的功能,可能通过PI3K-Akt/NF-κB信号通路促进免疫活性物质的释放,发挥免疫调节作用。

关键词： 早发性卵巢功能不全   葛根素   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:采用网络药理学及分子对接技术探究葛根素治疗早发性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、STITCH数据库、SwissTargetPrediction数据库、Sea数据库和比较毒理基因组学数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)检索葛根素的潜在作用靶点;利用在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)和DisGeNet数据库检索获得早发性卵巢功能不全相关基因靶点;利用Cytoscape软件构建葛根素治疗POI的化合物-靶点-疾病网络,通过STRING平台构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络,并利用核心靶基因导入基因功能注释数据库(the database for annotation visualization and integrated discovery,DAVID)进行基因本体论(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genesand genomes,KEGG)信号通路富集分析;利用AutoDock Vina以及PyMol对葛根素与核心靶点进行分子对接验证。结果:共获得176个葛根素潜在作用靶点,478个P0I相关基因;葛根素治疗P0I的潜在靶点共54个,核心靶点29个,包括Akt1、IL-6、VEGFA、EGF、MAPK1、IGF1、TNF、ESR1、TGFB1、ALB等靶点;GO和KEGG富集分析显示生物过程及信号通路主要集中于细胞增殖、炎症反应、免疫反应、对雌二醇的反应、生殖细胞发展、PI3K-Akt信号通路、FoxO信号通路、TGFβ信号通路、mTOR信号通路、雌激素信号通路、催乳素信号通路等;分子对接结果显示葛根素与靶蛋白具有较好结合活性及较稳定构象。结论:葛根素治疗POI具有多成分、多靶点、多通路特点。

关键词： 强直性脊柱炎   杨氏家藏方   趁痛散   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接探究趁痛散治疗强直性脊柱炎的作用机制。方法:通过TCMSP等4个数据库获取趁痛散药物信息,通过GeneCards等5个数据库筛选已知的强直性脊柱炎靶点;利用Cytoscape等工具构建Venny图、相关网络图;利用DAVID对交集靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析,并借助微生信对结果可视化;从PDB中获得靶蛋白导入Autodock,进行虚拟分子对接分析。结果:经过筛选趁痛散共有103个中药成分作用于99个交集靶点;构建PPI网络图筛选3个核心靶点;构建中药-靶点网络图筛选3个中药成分;GO功能分析主要涉及对外反应等;KEGG富集分析得到IL-17信号通路等关键通路;分子对接结果表明,趁痛散中的槲皮素等与血清白蛋白等有较好的结合能力。结论:研究预测了趁痛散对强直性脊柱炎的可能作用机制,但还须后续研究验证。

关键词： 中医传承辅助平台   中医药疗法   网络药理学   分子机制  

摘要： 目的借助中医传承辅助平台整理中医药治疗慢性胃炎的用药规律,结合网络药理学分析中医药治疗慢性胃炎的作用机制。方法检索2010年1月至2024年6月与中医药治疗慢性胃炎有关的临床文献1214篇,应用中医传承辅助平台2.5软件对文献数据进行统计分析、关联分析,归纳中医药治疗慢性胃炎的潜在有效药物组合及用药特点,对核心药物组合用于慢性胃炎的主要有效成分、信号通路及作用靶点加以分析。结果共检索出有效处方28手,处方中涵盖中药116味,应用频次前20位以补气药、理气药、利水渗湿类药物为主,支持度≥10、置信度≥0.6的中药核心组合为甘草-党参-香附;甘草-党参-香附组合中涉及20个有效成分、35个核心靶点,7个信号通路,核心成分为槲皮素、山柰酚、黄芩素、7-甲氧基-2-甲基异黄酮等。结论中医药治疗慢性胃炎以补中益气类、疏肝理气、利水渗湿类中药为主,中药核心药物组合“甘草-党参-香附”可能利用炎症反应、细胞对非生物刺激的响应及细胞凋亡相关通路等多种信号通路参与慢性胃炎的治疗进程。

关键词： 网络药理学   健脾化浊汤   血脂异常   信号通路   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接方法探讨健脾化浊汤精简方治疗血脂异常的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选健脾化浊汤精简方的活性成分,利用成分靶点预测数据库(SwissTargetPrediction)、药物数据库(DrugBank)、中药分子机理的生物信息学分析工具(Batman-TCM)筛选复方成分靶点,利用治疗靶点数据库(TTD)等8个数据库和1个基因表达综合数据库(GEO)的Affymetrix基因芯片获得血脂异常的靶点,采用Cytoscape 3.2.1绘制“活性成分-治疗靶点”和“成分靶点-疾病靶点”网络,STRING网站构建蛋白质相互作用网络,使用R语言软件进行靶点基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后利用iGEMDOCK进行分子对接验证。结果:筛选出健脾化浊汤精简方活性成分70个、治疗靶点109个,核心靶点包括胰岛素、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)、前列腺素内过氧化物合酶2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、淀粉样前体蛋白(Amyloid Precursor Protein,APP)、雌激素受体1(Estrogen Receptor 1,ESR1)等。通过KEGG富集分析预测,健脾化浊汤精简方治疗血脂异常涉及的信号通路主要有磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(Peroxisome Proliferator-Activated Receptor,PPAR)信号通路、Rap1信号通路、胰岛素抵抗通路、缺氧诱导因子-1(Hypoxia Inducible Factorr 1,HIF-1)信号通路等。分子对接结果表明,健脾化浊汤精简方中主要活性成分与核心作用靶点具有较为稳定的结合活性。结论:通过对健脾化浊汤精简方治疗血脂异常的活性成分、关键靶点和相关通路的研究,认为健脾化浊汤精简方可能主要通过调节胰岛素分泌、改善胰岛素抵抗、调节脂蛋白代谢相关受体和酶、抑制胆固醇吸收等机制发挥调节血脂的作用,为未来药理学及临床研究提供了思路。