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关键词： L-茶氨酸   细胞因子分泌   网络药理学   免疫调节   信号通路  

摘要： 目的利用网络药理学方法预测L-茶氨酸调节细胞因子分泌的可能机制。方法Swiss Target Prediction和TargetNet数据库预测L-茶氨酸的作用靶点,GeneCards数据库、TTD数据库和OMIM数据库预测免疫细胞因子分泌相关靶点,在线工具Venny 2.1求两者的交集靶点,对交集靶点进行PPI分析以及GO富集分析和KEGG富集分析。结果网络药理学结果显示,L-茶氨酸和免疫细胞因子分泌之间的共同靶点81个。其中,IL-1B、TLR4、NFκB1、MMP9、EGFR、JUN等核心靶点可能参与了L-茶氨酸的作用。KEGG富集分析进一步表明,L-茶氨酸的作用可能与雌激素信号通路、松弛素信号通路、cAMP信号通路和cGMP-PKG信号通路有关。结论L-茶氨酸调节细胞因子分泌的机制可能与L-茶氨酸作用于IL-1B、TLR4、NFκB1、MMP9、EGFR、JUN等靶点进而调节雌激素信号通路、松弛素信号通路、cAMP信号通路和cGMP-PKG信号通路有关。

关键词： 引火汤   围绝经期抑郁症   网络药理学   神经炎症   小胶质细胞活化   TNF-α   IL-1β   NF-κB  

摘要： 目的 基于网络药理学探讨引火汤(Yinhuo decoction,YHD)治疗围绝经期抑郁症(perimenopausal depression,PMD)的潜在机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中医药综合数据库(TCM-ID)筛选YHD的活性成分及作用靶点,通过GeneCards数据库和Drugbank数据库筛选PMD疾病相关靶点,使用蛋白质相互作用数据库(STRING)得到疾病靶点和成分靶点的交集基因,利用Cytoscape软件筛选出核心靶点,并构建活性成分-核心靶点-疾病网络。小鼠分为假手术组(sham组)、模型组(PMD组)、引火汤组(YHD组)和雌二醇组(E_(2)组),每组12只。采用卵巢切除法结合慢性不可预见性温和刺激方法建立PMD模型。sham组摘取同样大小脂肪团代替卵巢;YHD组和E_(2)组造模结束后分别给予引火汤和戊酸雌二醇溶液21 d。通过糖水偏好实验和旷场实验检测各组小鼠行为学变化;免疫荧光染色小胶质细胞标志蛋白Iba-1观察各组小鼠海马区小胶质细胞活化水平;ELISA法检测各组小鼠海马中TNF-α和IL-1β水平。结果 共筛选出YHD活性成分对应靶点620个,疾病靶点994个,成分靶点与疾病靶点的交集靶点253个,核心靶点47个,包括TNF-α、IL-1β、NF-κB等。通过Cytoscape3.7.1软件构建“引火汤活性成分-核心靶点-疾病”网络,并得到引火汤的核心成分为戈米辛R、5-羟甲基糠醛、二氢高异黄酮B、12-羟甲基糠醛、麦冬二氢高异黄酮A等。动物实验结果表明,与sham组比较,E_(2)组和YHD组小鼠糖水偏好率、中央区域活动路程比值、直立次数和中央区域活动路程明显增加(P<0.01);与PMD组相比,E_(2)组和YHD组小鼠活化的小胶质细胞形态趋于正常生理状态,Iba-1表达减少(P<0.01),海马区TNF-α和IL-1β含量降低(P<0.01)。结论 YHD可以通过降低PMD小鼠海马区Iba-1、TNF-α、IL-1β表达水平,抑制小胶质细胞过度活化而发挥抗抑郁作用。

关键词： 蚕茸柱天胶囊   早泄   网络药理学   分子对接模拟  

摘要： 目的通过网络药理学以及分子对接技术对蚕茸柱天胶囊治疗阳痿(erectile dysfunction,ED)的作用机制进行研究。方法通过TCMSP收集蚕茸柱天胶囊中的活性成分及相应靶点蛋白,在GeneCards中检索ED的相关疾病靶点。通过Venny 2.1将活性成分及疾病靶点取交集。通过Cytoscape 3.9.1建立交集靶点-活性成分蛋白互作网络。应用Metascape对交集靶点进行KEGG富集处理及GO分析。最终采用Pymol和Autodocktool进行分子对接,以验证网络药理学结果。结果在TCMSP中收集了11种中药成分及相应靶点蛋白。通过GeneCards检索到1973个疾病靶点,通过Venny2.1获得交集靶点161个。通过Cytoscape 3.9.1建立PPI网络。分子对接结果表明活性成分与疾病靶点间有良好的结合能力,说明网络药理学结果具有一定可靠性。结论蚕茸柱天胶囊中多种活性成分可通过多途径、多靶点对ED发挥治疗作用。

关键词： 瓦草皂苷   肿瘤   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接和体外实验分析瓦草皂苷抗肿瘤的活性成分及其与肿瘤相关的疾病靶点和路径,探究瓦草皂苷抗肿瘤作用机制。方法采用网络药理学预测瓦草皂苷抗肿瘤的关键成分及潜在靶点,并用分子对接技术进行验证。之后通过体外细胞实验验证瓦草中活性皂苷类成分对多种肿瘤细胞的抑制作用。结果基于网络药理学筛选得到瓦草皂苷8种活性成分,16个药物-疾病共同作用靶点。GO富集分析得到肿瘤相关的11个细胞组分(CC),35个生物学过程(BP)及16个分子功能(MF),KEGG富集分析得到与肿瘤相关的7条通路(P<0.05),包含氮代谢信号通路、癌症通路等。分子对接显示sinocrassulosideⅨ与关键靶点具有良好结合活性。体外实验表明,瓦草的皂苷类化合物具有显著的抑制肿瘤生长的作用。结论瓦草皂苷类成分具有显著的体外抗肿瘤作用,其可能通过氮代谢信号通路、癌症通路等通路及相关靶点发挥作用。本研究结果为瓦草抗肿瘤机制研究及临床应用提供了一定理论依据。

关键词： 网络药理学   阿尔茨海默症   分子对接   白芍  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接策略预测中药白芍延缓阿尔茨海默症(Alzheimer's disease,AD)的活性成分、潜在作用靶点和机制,为白芍防治AD的应用提供依据。方法:TCMSP数据库用于查询白芍的化学成分和靶点,通过Gene Cards数据库查找AD相关蛋白靶点,分别将白芍和AD作用靶点,输入Venny 2.1.0网站,得到白芍与AD的交集靶点,并绘制Venny图,将交集靶点导入String数据库下的Multiple proteins,绘制PPI网络图,再将交集靶点导入Cytoscape_v3.6.0,分析度值,筛选出度值排名靠前的化合物和靶点,并输出为活性化合物-关键靶点网络图,后将交集靶点导入DAVID网站,进行基因本体(gene ontology,GO)和(Kyoto Encyclopedia of GenesandGenomes,KEGG)分析,最后采用分子对接技术验证白芍延缓AD的作用靶点。结果:从白芍中筛选出15个化学成分,交集靶点208个,GO和KEGG分析主要涉及到DNA和RNA缺陷、神经元功能障碍、病理性蛋白质聚集、氧化应激、炎症反应。分子对接结果表明芍药苷(paeoniflorin,PF)、芍药内酯苷(albiflorin,AL)、儿茶素[(+)-catechin,CT]分别与HSP90AA1、SRC、EGFR结合活性较好。结论:白芍能够通过抑制Aβ蛋白的沉积及Tau蛋白的聚集、抑制炎症反应及氧化应激、保护神经元等达到延缓AD的作用,其潜在分子机制可能是通过白芍关键成分下调SRC、上调HSP90AA1以及下调EGFR实现,为白芍防治AD的临床应用提供了新思路。

关键词： 网络药理学   阿魏   九香虫   胃癌   信号通路  

摘要： 目的 通过网络药理学方法探讨阿魏、九香虫治疗胃癌的作用机制。方法 利用中药综合数据库(Traditional Chinese Medicines Integrated Database,TCMID)与文献检索获取阿魏、九香虫的活性成分,将化学活性成分导入PubChem统一格式。利用SwissTargetPrediction数据库预测活性成分靶点,利用比较毒物基因组学数据库(Compargtive Toxicogenomics Database,CTD)获取胃癌靶点,并与药物所对应的靶点比较,筛选出共同部分,然后采用Cytoscape3.8.0软件搭建“药物-成分-靶点-疾病”网络。通过String数据库获取共有靶点之间的相互作用关系,并筛选出关键靶点。将共有靶点导入注释、可视化和集成数据库(the Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery,DAVID)进行基因本体(gene ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果 从阿魏中获得抗胃癌相关活性成分15个,九香虫21个,从阿魏、九香虫中发现共同作用于胃癌的靶点112个。获得丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPK)、蛋白激酶B1(protein kinase B1,AKT1)、热休克蛋白90α家族A类成员1(heat shock protein 90α family class A member 1,HSP90AA1)、信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、SRC基因等5个与胃癌相关的关键靶点,与胃癌密切联系的通路有磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3-kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)信号通路、MAPK信号通路、细胞周期通路等。结论 阿魏、九香虫能够影响小血管生成,抑制细胞增殖、分化,促进细胞凋亡,可能通过抑制细胞周期G1期、G2/M期来发挥抗胃癌作用。

关键词： 黄芪   雷公藤   原发性膜性肾病   作用机制   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术研究“黄芪-雷公藤”药对治疗原发性膜性肾病(Primary Membrous Nephropathy,PMN)的作用,并阐明其机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选“黄芪-雷公藤”药物的活性成分,再通过TCMSP、SwissTargetPrediction和pharmmapper数据库筛选其作用靶点,通过GeneCards和OMIM数据库检索与PMN相关的靶点,并获取药物和疾病的交集靶点。通过STRING数据库对得到的靶点进行蛋白质相互作用分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选出核心靶点。接着利用Metascape数据库进行生物信息富集分析。最后通过AutoDock软件进行分子对接,并采用Pymol软件对对接结果进行可视化分析。结果:共筛选出65种药物活性成分及474个作用靶点,与PMN相关靶点进行映射,获得271个交集靶点。通过PPI网络进一步筛选获得10个核心靶点,包括肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)等。将药物活性成分和核心靶点进行分子对接,对接结果提示两者之间具有较好的结合活性。结论:本研究所得的初步结果清楚地揭示了“黄芪-雷公藤”药对在治疗PMN中的作用机制,为我们深入了解该药物在PMN治疗中的效果提供了关键性线索。这一发现不仅为进一步探究该药对在治疗PMN过程中的具体作用机制提供了重要依据,同时也为我们评估其疗效和可能的不良反应提供了指导。这样的研究方向有望为未来制订更为有效的治疗方案和药物设计提供科学依据,从而更好地帮助患者缓解病情、提高生活质量。

关键词： 车前子   高尿酸血症   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨车前子治疗高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)的作用机制,以期为车前子治疗高尿酸血症的研究提供思路。方法:根据前期对车前子入血成分研究结果确定车前子的潜在药效成分,结合药物靶点数据库(TTD)、人类在线孟德尔遗传(OMIM)数据库、GeneCards数据库筛选高尿酸血症的作用靶点,进而确定成分与疾病的交集核心靶点,利用Cytoscape 3.8.0软件构建“成分靶点疾病网络”,并对靶点进行GO富集分析与KEGG通路富集分析,再采用分子对接技术与实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术对结果进行验证。结果:共得到85个成分与疾病的交集靶点,包括胱天蛋白酶3(CASP3)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、白细胞介素-6(IL-6)、雌激素受体1(ESR1)等,GO富集分析在生物过程、细胞组分和分子功能三个层面上分别得到56、15和18个GO功能条目,KEGG通路富集分析得到肿瘤坏死因子、代谢信号转导、胰岛素抵抗、缺氧诱导因子-1等信号通路。分子对接结果显示主要活性成分与核心靶蛋白间的结合性能较好;RT-qPCR结果表明,与模型组比较,车前子给药组大鼠肾脏组织中Ras与p38 mRNA的表达水平显著升高,差异有统计学意义(P<0.01)。结论:本研究建立了车前子干预高尿酸血症的“成分靶点通路”网络,为系统阐释车前子治疗高尿酸血症的分子机制提供了参考。

关键词： β-石竹烯   药理学   研究进展  

摘要： β-石竹烯(β-caryophyllene,BCP)是一种双环倍半萜植物化合物,具有镇痛、抗炎、抗肿瘤等药理作用。本文对BCP在药理学研究领域的最新进展进行了综述,概述了它的基本药理作用,突出了其保护神经系统、保护心肌、改善肥胖、防治糖尿病及其并发症、保护肝脏、肾脏、肠道屏障等方面的潜在应用价值,为BCP的药物开发提供参考。

关键词： 人文素养   课程思政   学科任务   《药理学》  

摘要： 为强化学生的人文素养,实现立德树人的根本任务,开展医学院校《药理学》课程思政建设。通过剖析《药理学》教学现状及存在的问题,提出课程建设路径。分别从教学目标、教学内容和教学方式上进行改革,融入爱国主义教育、民族情怀教育、遵纪守法教育、职业道德教育、科研精神教育以及创新精神教育,运用各种教学方法与资源,有效地激发学生学习的主动性和自觉性,为将学生培养成有担当、有情怀、符合临床发展需要的合格临床工作者服务。