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关键词： 降尿酸方   尿酸性肾病   网络药理学   UPLC-Q-TOF/MS  

摘要： 目的探讨降尿酸方对尿酸性肾病的作用机制。方法6只健康SD雄性大鼠分为空白血清组(生理盐水)和含药血清组(72 g/kg降尿酸方浓缩液),给予相应药物,每天2次,连续3 d。采用UPLC-Q-TOF/MS法分析含药血清。通过PubChem和SciFinder数据库获取化合物结构,Swiss Target Prediction数据库以确定靶点,以”Uric acid nephropathy”为关键词在OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库检索获得作用靶点,通过Venny2.1.0平台得到“药物-疾病”交集基因,上传至DAVID库进行GO和KEGG分析,并对结果进行分子对接验证。40只雄性SD大鼠随机分为正常组、正常+降尿酸方组、模型组、降尿酸方组、非布司他组,每组8只,除前2组外,后3组大鼠灌胃给予氧嗪酸钾(1500 mg/kg)和腺嘌呤(50 mg/kg)进行造模;6 h后,降尿酸方组、非布司他组分别灌胃给予360 mg/kg降尿酸方和3.6 mg/kg非布司他,正常组和模型组灌胃给予等量生理盐水,每天1次,连续6周,检测血清SUA、SCr、BUN水平,观察肾脏病理学改变,Western blot法检测靶蛋白表达。结果共得到22个原型成分、378个药物靶点、1587个疾病靶点、126个“药物-疾病”共同靶点,STAT3、SRC、VEGFA等是最可能的作用靶点。GO富集获取470条BP通路、68条CC表达过程、112条MF相关过程。KEGG富集获取信号通路124条。分子对接结果显示最可能的靶点和活性成分结合性良好。与模型组比较,非布司他组和降尿酸方组肾组织病理学改善,Scr、BUN、SUA水平降低(P<0.05,P<0.01),p-STAT3、p-SRC、VEGFA蛋白表达降低(P<0.05,P<0.01)。结论降尿酸方可能通过多靶点、多通路降低尿酸性肾病大鼠模型SUA水平,减轻肾组织病理损伤,改善肾功能。

关键词： 益气扶正方   Lewis肺癌   糖酵解   网络药理学   分子对接   PI3K/Akt信号通路   MAPK信号通路  

摘要： 目的基于网络药理学与实验验证探讨益气扶正方对肺癌细胞增殖的抑制作用。方法通过TCMSP数据库检索益气扶正方中人参、黄芪、茯苓、白术、陈皮的有效化学成分及作用靶点。通过UniProt数据库进行中药靶基因注释转换,运用Cytoscape 3.10.1软件构建“药物有效成分-疾病靶点”交互网络,通过DAVID数据库进行KEGG通路富集分析,使用AutodockVina 1.5.6软件分子对接验证核心靶点和中药活性成分的结合能力,预测中药复方对肺癌的作用机制。选取健康C57BL/6小鼠接种Lewis肺癌瘤株进行造模,小鼠随机分为模型组、中药组、3-BP抑制剂组、中药+3-BP抑制剂组。各组药物干预后,检测荷瘤小鼠瘤质量、瘤体体积、体质量和血清乳酸水平,Western blot法检测小鼠mTOR、p-mTOR、PI3K、p-PI3K、Akt、p-Akt、HIF1α、INSR、AMPKα、p-AMPKα、HK2、PKM2、LDHA蛋白表达。结果共得到药物-疾病共同靶点221个;KEGG通路富集分析结果显示,益气扶正方与PI3K/Akt、MAPK等信号通路关系密切;分子对接结果显示,活性成分和关键靶点均有良好的结合能力。动物实验结果显示,与模型组比较,各给药组荷瘤小鼠瘤体生长得到抑制(P<0.05,P<0.01),血清乳酸水平降低(P<0.05,P<0.01),瘤体组织HK2、PKM2、LDHA蛋白表达降低(P<0.05,P<0.01)。结论益气扶正方抑制Lewis荷瘤小鼠的皮下移植瘤生长,其机制可能与抑制肿瘤细胞糖酵解有关。

关键词： 5,4'-dihydroxyflavone   baicalein   gestational diabetes mellitus   liquiritigenin   neoliquiritin   Polygonati Rhizoma  

摘要： Objective To explore the components and mechanism of Polygonati Rhizoma in treatment of gestational diabetes mellitus by network pharmacology and molecular docking. Methods The active components of Polygonati Rhizoma were screened through the TCMSP, TCMIP, and BATMAN-TCM database, and the potential targets of the active components were screened through the Swiss Target Prediction database. The disease targets of gestational diabetes mellitus were retrieved through GeneCards, DisGeNET, and OMIM. The Venny 2.1 software was used to draw a Venn diagram to obtain the common targets. The STRING database was used to draw the PPI of the intersection targets, and the Cytoscape 3.10.0 software was used to screen the key targets. The Weishengxin online platform was used for GO function and KEGG enrichment analysis. The “drug–component–target–pathway–disease” network diagram was constructed using Cytoscape 3.10.0 and topological analysis was performed. Molecular docking was performed using AutoDock Vina software, and the results were visualized using Pymol 2.4 software. Results 22 Active components of Polygonati Rhizoma and 102 common targets of Polygonati Rhizoma and gestational diabetes mellitus were obtained. The main components of Polygonati Rhizoma in treatment of gestational diabetes mellitus were 5,4'-dihydroxyflavone, baicalein, neoliquiritin, and liquiritigenin, which act on the core targets EGFR, PPARG, ESR1, and PTGS2, regulated the PI3K/Akt signaling pathway, AMPK signaling pathway and other pathways plays a role in treatment of gestational diabetes mellitus. The molecular docking results showed that the active components of Polygonati Rhizoma, 5,4'-dihydroxyflavone, baicalein, neoliquiritin, and liquiritigenin had good binding ability with the key targets EGFR, PPARG, ESR1, and PTGS2. Conclusion Polygonati Rhizoma mainly treats gestational diabetes mellitus by acting on PTGS2, PPARG, ESR1, EGFR targets, and regulating PI3K/Akt signaling pathway, AMPK signaling path

关键词： 药物性肝损伤   抗结核药物   铁死亡   中药   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:利用网络药理学和分子对接分析识别抗结核药物诱导的药物性肝损伤与铁死亡相关的关键基因,并预测相关作用的中药及有效成分。方法:利用PubChem、Swiss Target Prediction平台获得抗结核药物的药物靶点;基于Gene Cards数据库收集药物性肝损伤的疾病靶点,取“疾病-药物”交集靶点,运用Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络关系图,结合CytoHubba插件获得核心靶点。应用DAVID数据库进行基因本体功能(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。通过FerrDb数据库筛选出铁死亡相关的关键基因,利用HERB数据库、TCMSP数据库和对关键基因进行中药及有效成分预测,结合Lipinski五倍率法则和ADMETlab 2.0对有效成分进行成药性及人肝毒性筛选,最后筛选出的有效成分进行分子对接。结果:得到抗结核药物与药物性肝损伤共同作用靶点14个,构建蛋白相互作用网络筛选出GPT、CYP2E1、CYP1A2、NR1H4、ABCB11、SLC10A1、CYP7A1、ABCC2、HIF1A和CASP3等关键靶点。通过FerrDb数据库筛选关键基因HIF1A,以HIF1A为靶点筛选并经筛除后得到具有成药性且无人肝毒性的有效成分血根碱、黄芩甙元和槲皮素,且这3种成分与HIF1A均能稳定结合。结论:血根碱、黄芩甙元和槲皮素可能通过调控HIF1A的表达,影响肝脏细胞的铁死亡达到治疗抗结核药物诱导的药物性肝损伤作用。

关键词： 温肺降浊方   血管性痴呆   学习认知能力   炎症反应   EGFR   MAPK3   IL-17   网络药理学  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接技术及动物实验验证温肺降浊方对血管性痴呆(VaD)的作用。方法在公开数据库中检索温肺降浊方的有效成分和靶点信息,通过GeneCards、DisGeNet基因数据库筛选VaD相关疾病基因,构建蛋白互作网络,进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,运用Autodock软件对核心靶点和药物主要活性成分进行分子对接,最后通过永久性双侧颈总动脉闭塞构建VaD大鼠模型,采用Morris水迷宫评估VaD大鼠学习认知能力,Nissl染色检测海马区神经元损伤情况,Western blot法检测EGFR、MAPK3、IL-17蛋白表达。结果网络药理学结果显示,获得温肺降浊方活性成分作用靶点237个,疾病成分靶点3969个,交集靶点共183个;分析得到治疗关键靶点包括TP53、MAPK14、IL-17、AKT1、MAPK3、MYC、CASP3、STAT1、STAT3、TNF、EGFR;富集分析表明温肺降浊方发挥治疗VaD的潜在作用靶点与氧化应激、对外来生物刺激的反应等生物过程相关,主要涉及IL-17、PI3K/Akt、肿瘤坏死因子TNF信号通路等;分子对接结果显示配体和受体有良好的结合性。动物实验结果显示,温肺降浊方高剂量组可改善VaD大鼠的空间学习记忆能力及海马神经元的病理损伤,降低炎症相关蛋白MAPK3、IL-17蛋白表达,升高EGFR蛋白表达(P<0.05)。结论温肺降浊方可能通过多种化学成分、多靶点途径延缓VaD疾病的发展,其机制可能与抑制炎症反应,增加神经前体细胞的增殖和存活,改善海马神经元损伤,增强认知水平有关。

关键词： 临床药理学   微课   案例教学法   问题导学法   教学效果  

摘要： 目的:明确微课—案例教学法—问题导学法多元化教学模式在临床药理学教学中提升教学效果的作用。方法:选择2018级临床医学专业60名本科生为研究对象,将研究对象随机分为实验组和对照组两组,每组30名。实验组实行多元化教学模式,对照组则实行传统课堂教学模式。通过理论考试测评两种教学模式的教学效果,通过问卷调查学生满意度。结果:实验组理论考试成绩为(80.30±6.73)分,高于对照组的(72.90±8.17)分,实验组在记忆性试题、理解性试题、分析性试题上得分均高于对照组。问卷调查结果显示,实验组对知识点理解掌握程度、提升自主学习能力程度、激发学习兴趣程度及解决实际问题能力评分均高于对照组。结论:微课—案例教学法—问题导学法多元教学模式能够提升临床药理学教学效果,学生对该模式满意度较高。

关键词： 新安医学   消渴   数据挖掘   网络药理学   用药规律   作用机制  

摘要： 目的挖掘新安医家治疗消渴的用药规律,并分析核心处方中药物的作用机制。方法收集新安医学著作中治疗消渴的处方,使用SPSS Modeler 18.0软件进行配伍关联规则以及复杂网络分析,获得核心药物处方,并利用SPSS Statistics 25.0软件进行高频中药聚类分析。通过BATMAN-TCM数据库提取核心药物的有效活性成分及作用靶点;GeneCards数据库检索糖尿病基因靶点,获取交集靶点后,导入STRING在线平台构建蛋白互作网络,使用Cytoscape 3.9.1软件筛选核心基因;并导入DAVID数据库进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共收录有效处方135条,涉及中药184味,药性以寒、平为主;药味以甘、苦、辛为主;主归肺、脾、肾、胃、心经。关联规则挖掘常用药对14对。聚类分析将前20味中药聚为5个聚类组。复杂网络可视化分析形成了由炙甘草、人参、知母、麦冬、茯苓组成的核心处方。筛选出核心处方药物的有效活性成分164个,作用靶点1498个,糖尿病基因靶点1995个,交集靶点404个,提取核心靶点10个,GO功能富集分析共得到涵盖生物过程(BP)1363条,涉及细胞组分(CC)129条,包含分子功能(MF)264条;涉及KEGG信号通路206条。结论新安医家治疗消渴的遣方用药体现了新安医家“标本兼治”的学术思想以及“善用甘寒、辛开苦降、培土生金、固本培元”的治疗思路,为现代中医临床提供了新的糖尿病诊疗思路和启示。

关键词： 木犀草素   骨肉瘤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的通过网络药理学与分子对接技术探究木犀草素治疗骨肉瘤的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取木犀草素的作用靶点,在GeneCards数据库中寻找骨肉瘤的疾病相关靶点,再将作用靶点与疾病靶点相互取交集,得到关键靶点。利用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络图,在Cytoscape中筛选核心靶基因。利用DAVID数据库进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。应用AutoDockTools软件对木犀草素和核心靶点进行分子对接。结果获得木犀草素靶点53个,骨肉瘤疾病靶点5347个,药物与疾病交集靶点49个,核心靶点10个,分别为肿瘤蛋白53(TP53)、蛋白激酶B1(Akt1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤坏死因子(TNF)、半胱天冬酶3(CASP3)、人表皮生长因子受体(EGFR)、人表皮生长因子受体2(ERBB2)、白细胞介素-6(IL-6)、前列腺素内过氧化物酶2(PTGS2)和B细胞淋巴瘤2样蛋白1(BCL2L1)。分子对接结果表明,木犀草素与PTGS2有一定结合能力,与其他核心靶点具有较好的结合活性。结论木犀草素可能通过靶向TP53、Akt1、VEGFA、TNF等关键靶点,调节磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)、白细胞介素-17(IL-17)及晚期糖基化终产物-晚期糖基化终产物受体(AGE-RAGE)等信号通路,从而多靶点、多途径发挥治疗骨肉瘤的作用。

关键词： 健康受试者   药物试验   临床疗效   疗效与安全性   临床试验   不良反应   药理学   试验药物  

摘要： 受试者:“药物试验是在人身上做实验吗?”医生:“其实,‘临床试验’是以人体(患者或健康受试者)为对象的试验,目的是发现或验证某种试验药物的临床疗效、药理学以及其他药效学作用、不良反应,或者试验药物在人体内的吸收、分布、代谢和排泄规律,以确定药物的疗效与安全性的系统性试验。通常分为Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅳ期临床试验。”

关键词： 慢性咳嗽   苓甘五味姜辛汤   数据挖掘   网络药理学   用药规律   作用机制  

摘要： 目的基于数据挖掘和网络药理学分析中药处方治疗慢性咳嗽的用药规律及核心处方药物的作用机制。方法通过筛选北京中医药大学第三附属医院2020年9月—2024年1月专家门诊诊断为慢性咳嗽的患者处方信息,建立数据库,使用Excel 2019、IBM SPSS Statistics 22.0和SPSS Molder 18.0软件对数据进行分析,采用频率统计、关联规则和聚类分析等数据挖掘技术,筛选出关键的中药组合。基于中药系统药理学数据库占分析平台(TCMSP)、OMIM、GeneCards等数据库和Cytoscape软件获得关键作用靶点,进行基因本体(genes ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果共纳入232首处方,包含97味药物,高频中药有干姜、五味子、枇杷叶、清半夏、苦杏仁等,聚类分析可归为4类。处方包含活性成分312个,筛选药物与疾病交集靶点235个,AKT1、IL-6、VEGFA、EGFR、IL-1、MMP-9等是药物作用的关键潜在靶点。涉及生物过程937个、分子功能196个、细胞组成111个和KEGG通路177个。结论该研究初步分析中药治疗慢性咳嗽的组方用药规律及核心处方有效成分槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇、异鼠李素等可作用关键潜在靶点,通过IL-17、TNF、HIF-1、PI3K-Akt、EGFR、病毒感染、Toll样受体信号通路等发挥抗炎、抑菌、调控免疫、降低血管损害等作用,体现了中药复方治疗慢性咳嗽多成分、多位点、多通路的联合作用特点,为后续研究提供理论基础。