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关键词： 色苷酸钠   急性肺动脉高压   低氧   肥大细胞   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学联合分子对接技术探讨肥大细胞(Mast cells,MCs)脱颗粒抑制剂—色苷酸钠(Sodium Cromolyn,SCG)预防低氧性急性肺动脉高压(Acute Pulmonary Hypertension,APH)的作用机制。方法(1)从Swiss Target Predicition、TargetNet、UniProt、OMIM、GeneCards、NCBI gene数据库中获取色苷酸(Cromolyn)治疗APH的靶基因,使用Venny 2.1.0在线工具绘制Venn图并获取交集基因。通过String数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。使用Cytoscape软件对PPI网络进行拓扑分析,使用DAVID数据库做基因本体(Gene Ontology,GO)功能分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,并筛选出相关信号通路,使用Autodock Vina软件进行分子对接分析。(2)给予SD大鼠SCG预处理(100 mg/kg,ig,Bid,3 d),利用低压舱(模拟海拔7000 m,12 h)构建急性低氧动物模型。将SD大鼠随机分为低氧对照组(HC组,12只)和低氧SCG处理组(HSCG组,12只)。将低压舱海拔由7000 m降至3500 m,应用颈外静脉插管术监测肺动脉压(Pulmonary arterial pressure,PAP),通过蛋白质印迹(Western Blot,WB)实验检测FcεRⅠ、SYK、mTOR蛋白和p-mTOR(Ser2448)蛋白在SD大鼠肺组织中的表达水平。结果(1)基于网络药理学分析方法筛选出FcεRⅠ蛋白和mTOR信号通路及核心蛋白FcεRⅠ、SYK、mTOR。FcεRⅠ、SYK、mTOR分别与Cromolyn对接,均具有良好的结合活性,构象较稳定。(2)SD大鼠mPAP结果:与HC组比较,HSCG组的mPAP下降(P<0.05)。(3)肺组织WB结果:与HC组比较,HSCG组SD大鼠肺组织中的FcεRⅠ、SYK、mTOR蛋白和p-mTOR(Ser2448)蛋白表达均下降(P<0.05),p-mTOR(Ser2448)/mTOR亦下降(P<0.05)。结论经SCG预处理,可减弱急性低氧应激SD大鼠肺组织MCs中的FcεRⅠ、SYK、mTOR蛋白和p-mTOR(Ser2448)蛋白表达、降低p-mTOR(Ser2448)/mTOR,致FcεRⅠ、mTOR信号通路的激活水平降低,进而抑制肺组织中MCs的活化脱颗粒过程,减少收缩血管活性物质的释放,达到预防低氧性APH的作用。

关键词： 凉血通瘀方   脑出血急性期   circRNA   网络药理学   转录组学  

摘要： 目的通过研究凉血通瘀方对于自发性高血压大鼠(Spontaneously hypertensive rats,SHR)脑出血急性期环状RNA(circRNA)的作用靶点及可能相关信号通路,探讨凉血通瘀方治疗脑出血急性期的药效机制。方法将SHR分成模型组、实验组及空白组,模型组、实验组构建脑出血SHR模型,并对SHR神经功能损伤进行评分。术后实验组给予凉血通瘀方,模型组、空白组给予等剂量生理盐水,各5天。借助高通量测序技术检测3组SHR脑组织样本中circRNA,对显著差异表达的circRNA进行聚类分析、GO和KEGG富集分析。使用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR,RT-PCR)验证差异倍数排名前5的显著差异circRNA的表达情况。将显著差异表达的circRNA转化为人类同源基因,结合课题组前期筛选的脑出血急性期治疗靶点,得到交集靶点输入Cytoscape软件构建中药-成分-靶点-通路网络。结果测序结果为显著差异表达的circRNA共有150个,其中60个为上调、90个为下调circRNA。RT-PCR验证结果显示前5名circRNA的表达趋势与高通量测序结果一致。网络药理学结果显示,凉血通瘀方中赤芍、大黄、地黄、牡丹皮、石菖蒲和三七6味中药里多种活性成分对应脑出血急性期治疗靶点PRKCA,即CIRI_circ_10530的亲本基因。849条GO富集条目中有CIRI_circ_10530亲本基因分布的共209条;149条KEGG信号通路中CIRI_circ_10530亲本基因分布在62条信号通路中。其中大黄是凉血通瘀方中治疗脑出血急性期的重要中药,山柰酚、大黄素和槲皮素为药效机制的重要活性成分。结论凉血通瘀方干预脑出血急性期的作用机制可能与山柰酚、槲皮素和大黄素等关键活性成分激活PRKCA,并调控PKC影响其关键信号通路有关。

关键词： 高效液相色谱   网络药理学   黄芪   抗氧化   机制  

摘要： 为研究黄芪提取物中抗氧化活性成分及作用机制,使用石油醚、乙酸乙酯、氯仿和正丁醇4种有机试剂分别提取黄芪的有效成分,并通过高效液相色谱(high performance liquid chromatography,HPLC)法进行检测。基于网络药理学研究其抗氧化效果,采用网络药理学多个线上数据库获取黄芪—抗氧化共有靶点并构建蛋白互作网络(protein⁃protein interaction networks,PPI)以及进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。结果表明:黄芪各有机相提取物对·OH、O2-·和DPPH·均有一定的清除能力,黄芪乙酸乙酯相提取物和黄芪氯仿相提取物的清除效果较好,主要的抗氧化活性成分为山奈酚、齐墩果酸和没食子酸。通过线上数据库筛选出黄芪抗氧化靶点136个。GO富集表明这些靶点大多与无机物反应、激素反应、对外来刺激反应有关,KEGG富集分析显示这些靶点与癌症通路、脂质与动脉粥状硬化、缺氧诱导因子信号通路有关。分子对接结果显示,所提取的活性成分抗氧化效果较好。

关键词： 荆防颗粒   血管狭窄   心脏损伤   血栓   急性血瘀   活血化瘀  

摘要： 目的:探讨荆防颗粒的活血化瘀作用。方法:建立3种斑马鱼心血管疾病模型,以三氯化铁、特非那定、花生四烯酸分别建立斑马鱼尾动脉血管狭窄模型、心脏损伤模型及血栓模型,给予荆防颗粒样品溶液进行干预,观察其对尾动脉血管直径、心脏静脉窦-动脉球间距(SV-BA)、心脏红细胞染色面积的影响;以肾上腺素复合冰水应激的方法建立大鼠急性血瘀模型,检测大鼠凝血四项[活化部分凝血活酶时间(APTT)、凝血酶时间(TT)、凝血酶原时间(PT)、纤维蛋白原(FIB)]及血清中血管活性物质[大鼠前列环素(PGI2)、大鼠组织型纤溶酶原激活剂(t-PA)、大鼠纤溶酶原激活物抑制因子(PAI)、血栓素A2(TXA2)]和黏附分子[大鼠血管内皮细胞黏附分子1(VCAM-1)、大鼠细胞间黏附分子1(ICAM-1)]等相关指标的表达。结果:斑马鱼实验结果显示荆防颗粒使斑马鱼尾部血管舒张(P<0.01),显著改善血管狭窄;增加心脏红细胞染色面积(P<0.05,P<0.01),抑制血栓形成;对SV-BA虽有一定的降低趋势,但差异无统计学意义,对斑马鱼心脏损伤未见显著性逆转作用。另外大鼠体内药效实验结果表明荆防颗粒能改善凝血四项指标以及与血瘀相关的血管活性物质及黏附分子表达。在凝血四项方面,荆防颗粒可显著降低FIB含量(P<0.01),提高APTT、PT、TT(P<0.05);在因子检测方面,荆防颗粒可升高PGI2、t-PA含量(P<0.05),降低TXA2、PAI、VCAM-1含量(P<0.05)。结论:荆防颗粒具有活血化瘀作用,可能通过扩张血管、抗血栓、改善凝血功能及调控血管活性物质和黏附分子等相关指标的表达从而发挥活血化瘀功效。

关键词： 右归丸   网络药理学   分子对接   多发性硬化   炎症   髓鞘再生  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接探讨右归丸治疗多发性硬化(multiple sclerosis,MS)的物质基础及作用机制。方法运用TCMSP数据库筛选右归丸中附子、肉桂、熟地黄、枸杞子、山茱萸、山药、杜仲、菟丝子、当归的活性成分及靶标,通过检索文献及BATMAN-TCM数据库获取鹿角胶活性成分及靶标;运用GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库筛选MS疾病靶标;运用Cytoscape软件构建右归丸—药物活性成分—靶标、右归丸药物活性成分—交集靶标以及潜在靶标间互作网络图;对潜在靶标进行基因本体分析(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果右归丸中共获得1281个有效活性成分,得到91个右归丸治疗MS的潜在靶标,这些靶标主要涉及对神经元凋亡过程的负调控、炎症反应等生物学过程,并主要富集在白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路以及低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路上。对主要活性成分β-谷甾醇、豆甾醇及核心靶点丝/苏氨酸蛋白激酶(serine/threonine-protein kinase,AKT1)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(cysteinyl aspartate specific proteinase-3,Caspase-3)、TP53结合蛋白进行分子对接验证,对接得分显示结合活性较好。结论右归丸防治MS的作用可能是通过多个化合物作用于多个分子靶点,其分子机制主要是抑制炎症反应,调控IL-17、TNF和HIF-1等信号通路。

关键词： 胃肠动力障碍   神术散   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:利用网络药理学及分子对接技术,系统分析神术散治疗胃肠动力障碍(GMD)的作用机制,为临床应用和实验提供参考思路。方法:从相关数据库检索并记录神术散的活性成分、靶点和GMD相关基因。使用软件对靶点间的相互作用关系进行拓扑分析,寻找核心靶点,并且对作用靶点进行富集分析和分子对接验证。结果:神术散的活性成分114种,作用靶点253个,与GMD交集靶点119个。相关靶点在各种生物过程、细胞功能方面的富集显著,且与GMD信号通路的关系紧密。交集靶点主要分布在甲状腺、前列腺、松果体、心脏、垂体、肝脏等。结论:神术散的主要药物有效成分可能通过多个靶点和信号通路治疗GMD。

关键词： BOPPPS模式   药理学   混合式教学  

摘要： 在药学专业中,药理学是重要的核心课程,能够为后续临床用药活动的实施打下理论基础。同时,其也是一门内容多、专业性强的课程,学生在学习活动中可能会存在吃力、学习效果不理想的问题。在此情况下,教师可以创新现有的教学模式,引入先进教学理念,在信息技术支撑下开展混合式教学活动,切实提升课程教学水平。在本研究中,将就BOPPPS模式的职业本科院校药理学线上线下混合式教学进行一定的研究。

关键词： 黄芪   病毒性心肌炎   网络药理学   活性成分   作用靶点   信号通路   分子对接  

摘要： 基于网络药理学、分子对接方法探讨黄芪抗病毒性心肌炎可能的作用机制。方法 结合TCMSP和PubChem筛选核对黄芪中的活性成分,采用Swisstargetprediction预测其作用靶点;以“viral myocarditis”为关键词在GeneCards数据库中搜索疾病靶点,采用Cytoscape 3.6.1软件构建黄芪活性成分-抗病毒性心肌炎靶点网络;使用BisoGenet进行蛋白相互作用分析,筛选关键靶点并进行归属;使用DAVID数据库对黄芪抗病毒性心肌炎作用靶点进行GO和KEGG富集分析,通过P-Value筛选出关键通路。获得黄芪中毛蕊异黄酮(calycosin)、山萘酚(kaempferol)、槲皮素(quercetin)等六种关键活性成分,EGFR、MAPK8、BCL2等六个抗心肌炎作用预测靶点及弓形虫(Toxoplasmosis)关键通路。采用分子对接方法对六种关键活性成分与三个抗心肌炎作用预测靶点的亲和力做进一步分析评估,辅助验证网络筛选结果。结果 黄芪活性成分与病毒性心肌炎共有靶点33个,分析得到关键靶点6个,GO分析和KEGG分析得到GO 条目191个、KEGG 通路141条。分子对接获得了六种关键活性成分与六种抗心肌炎作用的预测靶点,结果显示化合物黄芪中属黄酮类的毛蕊异黄酮、山萘酚、槲皮素与EGFR、MAPK8蛋白结合稳定,7-O-甲基-异微凸剑叶莎醇与BCL2蛋白结合较稳定,化合物与蛋白主要作用为氢键和疏水作用。结论 本研究基于网络药理学和分子对接研究初步明确了黄芪“多成分、多靶点”抗病毒性心肌炎的作用机制,发现黄芪的活性成分毛蕊异黄酮、山萘酚、槲皮素等主要通过调控EGFR、MAPK8、BCL2、MAPK14、STAT3、STAT1和弓形虫(Toxoplasmosis)通路途径,发挥抗病毒性心肌炎作用。

关键词： 肛周湿疹   数据挖掘   网络药理学   中药熏洗   用药规律   机制分析  

摘要： 目的:应用数据挖掘和网络药理学方法探讨中药熏洗方治疗肛周湿疹的用药规律及机制。方法:检索中国知网、万方、维普、中国生物医学文献数据库2011年1月1日至2020年12月31日关于中药熏洗治疗肛周湿疹的文献;采用中医传承辅助平台V3.0软件对处方用药频次、药性、药味、归经、组方规律、药物核心组合进行分析。通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索用药规律所得苦参汤中8味药物的活性成分及其对应的药物靶点;运用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)获取肛周湿疹的疾病靶点;使用Venny 2.1.0作图工具映射药物与疾病交集靶点,并构建韦恩图;运用STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件构建靶点蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI),筛选核心作用靶点,构建“药物-活性成分-作用靶点”网络;应用R语言的clusterProfiler包进行基因本体论(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果:共筛选出符合标准的文献386篇,纳入中药处方360首,涉及中药188味;用药频次≥10次的药物共51味,四气分类以寒性为主,五味分类以苦味及辛味为主,药物归经以肝经、胃经及脾经为主;组方规律分析得到高频药对30对,最终演化得到核心组合4个,从用药规律得出苦参汤是治疗肛周湿疹的特效方。共筛选出苦参汤中137个活性成分和224个潜在靶点,与肛周湿疹相关作用靶点24个,经拓扑分析得到3个核心治疗靶点;筛选出槲皮素、木犀草素、山柰酚、金合欢素、苦参碱5个有效活性成分;GO富集分析得到1354个生物学过程、34个细胞组成及71个分子功能;KEGG通路富集分析得到97条信号通路。结论:苦参汤是治疗肛周湿疹的中药古方,苦参汤通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗肛周湿疹的作用。

关键词： 蝉花   肺癌   网络药理学   潜在靶点   分子对接  

摘要： 目的探讨名贵中药蝉花的抗肺癌作用机制。方法通过检索TCMSP、Symmap、SwissTargetPrediction、GeneCards、PubChem等数据库,使用Cytoscape 3.7.2、AutoDock、Pymol等软件开展网络药理学和分子对接分析。结果筛选到4个重要成分和326个潜在靶点。京都基因与基因组百科全书富集靶点数较高的信号通路包括癌症通路、化学致癌-受体激活、神经活性配体-受体相互作用和炎症介质对瞬时受体电位通道的调节等。分子对接验证了4个重要成分和4个关键靶点可自发结合。结论蝉花作用于机体后通过过氧化物酶体增生激活受体、前列腺素内过氧化物合成酶2、淀粉样前体蛋白和蛋白激酶cAMP激活的催化亚基α等关键靶点对肺癌进行干预。